Heatmap: Cluster_15 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.21 -0.33 0.34 0.63 -0.59 -0.47 -0.08 0.45 0.28 0.01 0.29 0.18 0.15 -2.0 -0.15 0.04 0.21 -1.24 0.11 0.05 0.07 0.09 -0.44 -0.24 0.14 0.14 0.25 0.09 -0.01 0.16
0.08 -0.09 0.2 0.43 -0.06 -0.21 -0.2 0.36 -0.1 -0.0 0.1 -0.04 0.05 -0.37 -0.14 -0.08 0.05 -0.18 -0.17 -0.2 -0.1 -0.11 0.02 -0.22 -0.08 -0.07 0.13 0.28 0.12 0.23
-0.2 -0.11 0.1 0.44 -0.47 -0.41 0.02 0.44 0.02 0.04 0.19 0.2 0.24 -1.05 -0.11 0.07 0.14 -0.95 -0.07 -0.07 0.05 -0.05 -0.09 0.11 0.1 0.03 0.18 0.2 -0.01 0.05
0.02 0.14 0.29 0.76 0.11 -0.33 -0.41 0.43 -0.09 0.11 -0.11 -0.1 0.02 -0.8 -0.18 -0.18 0.06 -0.46 -0.35 -0.31 -0.1 -0.08 0.02 -0.44 0.03 -0.04 0.15 0.3 0.37 0.2
-0.28 -0.35 0.31 0.85 0.04 -0.52 -0.12 0.78 -0.04 0.06 -0.14 -0.1 0.36 -1.24 -0.39 -0.11 -0.18 -0.65 -0.45 -0.32 -0.2 0.09 -0.15 -0.23 0.14 0.09 0.19 0.34 0.23 0.31
-0.31 -0.27 0.4 1.09 -0.36 -0.33 -0.26 0.85 -0.32 -0.54 -0.04 -0.32 0.48 -1.58 0.07 0.09 0.26 -0.58 -0.12 -0.09 -0.06 -0.04 0.28 -0.42 0.01 -0.14 0.19 0.12 -0.21 -0.05
-0.19 -0.05 0.32 0.79 -0.35 -0.43 -0.23 0.75 -0.05 -0.13 0.01 -0.02 0.05 -1.79 -0.27 -0.02 0.16 -1.08 -0.11 -0.16 0.05 -0.05 -0.34 -0.26 0.15 0.07 0.3 0.26 0.11 0.48
-0.14 -0.06 0.14 0.59 -0.37 -0.37 -0.31 0.91 -0.16 -0.14 -0.01 -0.07 0.28 -0.6 0.25 0.1 0.19 -0.6 -0.38 -0.37 -0.12 -0.1 0.52 -0.52 -0.1 -0.14 0.04 0.11 -0.03 0.23
-0.02 0.01 0.47 0.91 -0.49 -0.67 -0.71 0.68 0.26 0.22 0.27 0.16 -0.12 -1.92 -0.57 -0.2 -0.02 -1.58 -0.24 -0.3 -0.06 -0.16 -0.31 -0.34 0.21 0.17 0.35 0.49 0.27 0.23
-0.1 -0.17 0.52 1.08 -0.38 -0.49 -0.62 0.9 0.15 0.12 0.16 0.0 -0.08 -2.98 -0.64 -0.27 -0.12 -1.64 -0.35 -0.29 -0.11 -0.2 -0.28 -0.48 0.26 0.23 0.41 0.67 0.21 0.21
-0.19 -0.18 0.24 0.72 -0.27 -0.17 -0.2 0.52 -0.25 -0.32 -0.01 -0.18 0.26 -0.81 0.08 0.22 0.28 -0.37 -0.07 -0.11 0.03 -0.01 0.15 -0.21 0.14 0.05 0.23 0.02 -0.25 -0.19
-0.16 -0.17 0.22 0.48 -0.39 -0.25 -0.0 0.69 0.18 -0.08 0.2 0.1 0.13 -1.01 0.02 0.03 0.16 -0.91 -0.14 -0.06 -0.02 -0.08 -0.18 -0.23 0.05 -0.03 0.06 0.18 0.04 0.16
-0.02 0.18 0.67 1.2 -0.44 -0.56 -1.08 0.92 0.27 0.13 0.06 0.06 -0.44 -2.02 -0.76 -0.25 -0.27 -1.1 -0.53 -0.82 -0.15 -0.2 -0.6 -0.56 0.01 0.11 0.26 0.79 0.4 0.51
-0.17 -0.21 0.3 0.75 -0.24 -0.47 -0.33 0.93 -0.47 -0.32 -0.12 -0.33 0.49 -1.01 -0.08 -0.02 0.05 -0.21 -0.19 -0.16 -0.26 -0.08 0.53 -0.5 0.02 -0.06 0.05 0.06 -0.01 0.42
-0.08 -0.21 0.27 0.6 -0.22 -0.41 -0.25 0.66 -0.1 -0.22 0.04 -0.23 0.25 -0.52 0.06 0.02 0.1 -0.38 -0.07 0.02 0.01 -0.07 0.33 -0.35 -0.0 -0.27 0.07 -0.03 -0.0 0.22
-0.1 -0.05 0.21 0.72 -0.15 -0.31 -0.33 0.28 -0.11 -0.15 0.01 -0.07 0.11 -0.87 0.05 0.03 0.15 -0.27 -0.2 -0.19 0.05 -0.05 0.34 -0.18 0.06 0.09 0.17 0.07 -0.1 0.06
-0.16 -0.03 0.16 0.71 -0.14 -0.3 -0.3 0.29 -0.15 -0.26 -0.0 -0.01 0.24 -1.01 0.16 0.18 0.25 -0.58 -0.06 -0.25 0.08 -0.03 0.34 -0.13 0.14 0.02 0.15 -0.01 -0.11 -0.09
-0.16 -0.11 0.22 0.75 -0.28 -0.34 -0.24 0.46 -0.18 -0.24 -0.04 -0.16 0.3 -0.59 0.05 0.14 0.18 -0.49 -0.0 -0.08 0.05 -0.01 0.2 -0.06 0.18 -0.01 0.18 0.11 -0.24 -0.41
-0.27 -0.2 0.27 0.61 -0.58 -0.59 -0.21 0.58 0.25 0.24 0.37 0.26 0.38 -2.32 -0.52 -0.1 -0.05 -0.99 -0.21 -0.17 0.15 -0.01 -0.33 -0.43 0.34 0.21 0.35 0.23 -0.06 0.25
-0.15 -0.08 0.4 1.22 0.1 -0.49 -1.2 1.0 -0.32 -0.13 -0.19 -0.33 0.2 -0.63 -0.16 -0.02 -0.06 -0.22 -0.64 -0.7 -0.29 -0.14 -0.14 -0.64 -0.36 -0.11 0.14 0.29 0.49 0.53
0.03 0.09 0.11 0.36 -0.17 -0.26 -0.14 0.4 -0.1 -0.07 0.04 -0.04 0.14 -0.5 0.03 -0.04 0.05 -0.54 -0.21 -0.23 -0.15 -0.01 0.05 -0.17 -0.04 0.02 0.13 0.34 0.25 0.18
-0.08 -0.08 0.41 0.64 -0.12 -0.33 -0.29 0.16 0.09 0.02 0.19 0.03 0.12 -2.02 -0.08 -0.01 0.16 -0.97 -0.08 0.01 -0.0 0.01 0.05 -0.48 0.22 0.19 0.25 0.16 0.03 0.09
0.08 -0.07 0.35 0.44 -0.11 -0.33 -0.06 0.49 0.28 0.01 0.13 0.1 -0.08 -1.5 -0.16 -0.13 -0.09 -1.27 -0.14 -0.12 -0.12 -0.09 0.01 0.07 0.16 -0.04 0.13 0.41 0.28 -0.07
-0.15 -0.22 0.23 0.67 -0.3 -0.18 -0.13 0.84 -0.37 -0.37 -0.04 -0.1 0.27 -0.93 0.01 0.07 0.22 -0.38 -0.21 -0.14 -0.04 0.0 0.16 -0.37 0.08 -0.02 0.1 0.18 -0.13 0.15
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-0.42 -0.29 0.22 0.8 -0.1 -0.07 -0.08 0.67 -0.3 -0.39 -0.04 -0.29 0.41 -1.16 0.19 0.31 0.34 -0.3 -0.13 -0.05 -0.08 0.04 0.17 -0.24 0.01 -0.13 0.14 -0.2 -0.28 -0.07
-0.29 -0.23 0.35 0.61 -0.23 -0.4 0.04 0.56 0.25 0.09 0.19 0.13 0.12 -1.74 -0.35 -0.23 -0.08 -1.21 -0.06 -0.19 -0.04 -0.01 -0.22 -0.12 0.15 -0.04 0.21 0.48 0.24 0.18
-0.13 0.02 0.23 0.75 -0.17 -0.48 -0.4 0.12 0.03 -0.16 0.14 0.02 0.44 -0.78 -0.25 -0.27 -0.06 -0.08 -0.37 -0.37 0.06 -0.21 -0.37 -0.37 -0.05 0.02 0.24 0.19 0.44 0.66
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0.01 0.1 0.12 0.45 -0.16 -0.3 -0.62 -0.06 -0.12 -0.14 -0.04 -0.1 -0.13 -0.34 0.19 0.19 0.22 -0.3 -0.09 -0.23 0.2 0.12 0.21 -0.24 0.03 0.11 0.26 0.13 -0.03 0.07
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Spov3_chr2.01197 (HSP60-3A)
-0.08 0.06 0.41 1.12 -0.11 -0.8 -0.85 0.13 -0.08 0.07 -0.02 -0.23 0.25 -2.42 -0.57 -0.19 0.06 -0.28 -0.34 -0.47 0.12 -0.01 -0.13 -0.47 0.07 0.22 0.42 0.43 0.39 0.38
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.