Heatmap: Cluster_20 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00041	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0003.00002 (HIP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0004.00177	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0007.00027 (PSI-H)	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0007.00111	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0013.00007	0.0	0.71	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Spov3_C0033.00011 (SDHAF2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.84	0.0
Spov3_C0037.00001 (IF1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0038.00023 (NDF1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0058.00004	0.37	0.35	0.3	0.42	0.69	0.59	0.38	0.53	0.46	0.73	0.42	0.43	0.34	0.91	0.97	0.49	1.0	0.62	0.49	0.53	0.43	0.83	0.42	0.33	0.3	0.39	0.4	0.46	0.22	0.49
Spov3_C0246.00001 (PRP40A)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C1076.00002	0.0	0.07	0.11	0.0	0.14	0.41	0.0	0.07	0.24	0.36	0.39	0.07	0.13	0.14	1.0	0.0	0.09	0.2	0.0	0.12	0.0	0.06	0.28	0.38	0.17	0.14	0.0	0.0	0.0	0.07
Spov3_C1346.00002	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.00706	0.14	0.19	0.26	0.06	0.21	0.36	0.26	0.05	0.13	0.14	0.24	0.39	0.21	0.53	1.0	0.6	0.26	0.29	0.42	0.28	0.34	0.35	0.11	0.1	0.32	0.14	0.21	0.23	0.14	0.26
Spov3_chr1.02997	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.03324 (DAAR2)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93
Spov3_chr1.03954	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.04054	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.88	0.19	0.0	0.17	0.0	1.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.15	0.37	0.22	0.18	0.0
Spov3_chr1.04082 (BRH1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.04114 (MCTP4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0
Spov3_chr2.01996	0.3	0.0	0.0	0.0	0.2	0.22	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.25	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.92	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.23
Spov3_chr2.02275 (PTS)	0.0	0.69	0.39	1.0	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.72
Spov3_chr2.03121 (4CL3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.03478	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.03606	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.32	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.13	0.21	0.13	0.11	0.0	0.1	0.0	0.0	0.11	0.12	0.09	0.0	0.0	0.11
Spov3_chr2.03729 (MEKK4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.04535	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37
Spov3_chr2.04771 (PCNA2)	0.0	0.4	0.0	0.0	0.67	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.37	0.0	1.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05501 (bZIP69)	0.0	0.0	0.0	0.6	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05590 (CUV)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.00319	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.00993	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.41
Spov3_chr3.01217	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.91
Spov3_chr3.01296 (E37)	0.75	0.08	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.12	0.22	0.15	0.0	1.0	0.85	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.73	0.53	0.0	0.02	0.0	0.02	0.44	0.0
Spov3_chr3.01800	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0
Spov3_chr3.02008 (MEE11)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.02156 (PP2C.D4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.02641	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.18	1.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.14	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Spov3_chr3.02651 (VCR)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31
Spov3_chr4.00285	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0
Spov3_chr4.00622 (E2FB)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.01002	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.01138	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.01207	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.01627 (EXO70C1)	0.0	0.19	0.19	0.15	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.18	0.16	1.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.35	0.48	0.59	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71
Spov3_chr4.02187	0.11	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.21	0.12	0.0	0.11	0.24	0.14	0.72	0.11	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.11	1.0
Spov3_chr4.02649	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.02971	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.01999 (RPL7A)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.02932	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.03266	0.02	0.42	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.25	0.12	0.28	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Spov3_chr5.03754	0.43	0.45	0.32	0.51	0.68	0.68	0.44	0.6	0.55	0.65	0.5	0.4	0.42	0.97	1.0	0.54	0.85	0.55	0.48	0.51	0.46	0.95	0.38	0.36	0.31	0.47	0.42	0.55	0.24	0.56
Spov3_chr5.03803	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.01694 (SNX2b)	0.0	0.96	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.02234	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.73	0.69	0.2	1.0	0.33	0.76	0.0	0.55	0.16	0.0	0.17	0.0	0.19	0.0	0.22	0.19	0.0
Spov3_chr6.02991	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_S02.00044	0.0	0.0	0.22	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0
Spov3_S04.00007	0.0	0.0	0.0	0.08	0.15	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.34	0.33	1.0	0.31	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0
Spov3_S04.00032	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_S04.00076	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Spov3_S12.00046 (HSP91)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_S14.00004 (CGE1)	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)