Heatmap: Cluster_51 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00043 (ZDS)	1.8	2.28	-	-	-	-	-	-	0.21	1.29	-	-	-	2.77	-1.1	-	-	-	-	-	-	-	1.34	0.4	0.8	-	-	0.68	1.85	-
Spov3_C0002.00023 (CRK8)	0.25	0.52	-0.74	-0.54	0.42	0.28	0.1	-0.38	-0.21	0.55	-0.04	0.16	0.53	1.04	-0.86	0.52	0.62	-0.24	-2.1	-0.86	-0.1	-0.6	-0.27	-0.36	0.02	-0.2	-0.13	-0.1	-0.32	-0.19
Spov3_C0002.00141	0.44	0.44	-0.1	-0.13	0.84	-0.04	-0.12	-0.21	-0.48	-0.14	-0.71	-0.78	-0.15	1.35	0.06	-0.5	-0.35	0.21	-0.62	-0.52	-0.17	-0.45	0.48	-0.2	-0.36	-0.5	-0.58	0.08	0.59	-0.03
Spov3_C0009.00076 (IRR)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.17	-	-	-
Spov3_C0010.00049	-0.43	0.3	-1.6	-2.83	0.0	1.49	0.35	-0.65	-1.12	-0.6	-0.57	-0.09	-0.5	2.42	-0.36	-0.02	-0.45	-0.22	-0.49	-0.18	-0.11	0.11	-2.29	0.23	-1.16	-0.04	-0.57	-0.13	-0.19	-0.27
Spov3_C0010.00070	-0.89	0.14	-2.04	-2.57	-0.05	1.3	0.18	-1.73	-0.71	-0.56	-0.77	-0.3	0.12	2.46	0.44	0.58	-0.37	-0.04	-0.84	-0.43	-1.15	-0.36	-2.19	0.02	-0.2	-0.1	-0.4	-0.22	-0.19	0.17
Spov3_C0014.00049	-	-	-	-	1.41	1.96	-	-	-	-	-	-	-	4.22	-0.58	0.63	-	-	-	-	-	-	0.96	-0.62	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0019.00019 (HIPP24)	-2.94	-1.18	-3.23	-4.28	0.04	2.03	-0.48	-1.65	-2.87	-1.18	-1.8	-0.7	-0.89	3.59	0.25	0.15	-0.75	-1.57	-1.28	-1.26	-0.39	-0.58	-2.58	-0.15	-2.24	-0.52	-1.88	-1.64	-1.66	-0.56
Spov3_C0025.00025 (HSD1)	0.02	-0.31	-0.82	-1.24	0.19	1.68	-0.29	-1.59	-0.86	-0.72	-0.44	-1.14	-1.4	3.04	-1.06	-0.05	-1.8	-1.76	-1.07	-1.0	-0.55	-0.34	-0.96	0.75	-1.13	-0.94	-0.83	0.61	-1.32	-0.73
Spov3_C0033.00031 (BBD2)	0.01	0.09	-0.65	-1.21	0.23	0.37	0.1	-0.78	-0.36	-0.19	-0.42	-0.24	-0.33	2.12	0.28	0.07	-0.23	0.43	-0.42	-0.29	-0.25	-0.15	0.01	0.01	-0.52	-0.28	-0.48	-0.31	-0.21	-0.63
Spov3_C0052.00003 (PBL34)	-	-	-	1.74	-	-	-	-	-	1.78	1.78	-	-	3.82	-	-	-	-	-	-	1.68	-	-	-	-	-	1.3	-	-	-
Spov3_C0052.00013	-0.26	0.1	-0.54	-0.75	0.09	0.25	-0.02	-0.46	-0.47	-0.24	-0.24	-0.21	0.04	1.61	0.4	0.35	0.31	0.29	-0.1	-0.31	-0.16	-0.16	-0.35	-0.03	-0.32	-0.17	-0.18	-0.15	-0.43	-0.11
Spov3_C0154.00002 (DND1)	0.06	-0.01	-0.72	-1.08	-0.08	0.46	-0.06	-0.09	-0.83	-0.6	-0.5	-0.42	0.4	2.06	0.09	-0.11	-0.03	0.59	-0.23	-0.7	-0.35	-0.39	-0.47	-0.16	-0.31	-0.34	-0.41	0.11	-0.34	0.27
Spov3_C0193.00002 (HAI1)	-1.37	0.05	-1.63	-3.34	-0.26	0.78	-0.22	-0.42	-0.67	-0.41	-1.05	0.04	-0.57	2.26	0.81	0.3	-0.47	0.43	-1.23	-1.02	-0.33	-1.05	1.18	0.13	-0.7	-0.21	-1.46	-0.19	-0.09	0.47
Spov3_chr1.00037 (RLK1)	0.53	-0.01	-0.31	-0.44	0.42	0.28	0.11	-1.33	-0.82	-0.49	-0.55	-0.71	0.55	1.88	0.43	0.02	-0.07	0.88	-0.68	-0.56	-0.55	-0.61	0.31	-0.61	-0.47	-0.62	-0.68	-0.46	-0.18	-0.02
Spov3_chr1.00156 (BMY7)	-0.05	-0.31	-1.02	-1.51	-0.37	0.76	0.14	-1.29	-0.86	-0.37	-0.6	-0.52	0.26	1.95	0.51	0.39	0.1	0.47	-0.51	-0.62	-0.26	-0.39	0.56	-0.17	-0.42	-0.39	-0.52	-0.25	-0.44	0.46
Spov3_chr1.00493 (GPAT2)	-0.89	-0.02	-2.29	-3.53	0.14	0.43	-0.38	-0.66	-2.23	-1.14	-1.46	-1.05	-0.03	2.69	0.26	0.42	0.2	0.56	-0.28	-0.52	0.12	-0.06	-0.4	0.28	-0.6	-0.0	-0.38	-1.15	-0.56	0.15
Spov3_chr1.00572	-0.31	-0.14	-0.1	0.17	-0.06	0.09	-0.16	0.17	-0.03	-0.13	-0.13	-0.2	0.11	0.87	0.2	0.17	0.09	-0.1	-0.16	-0.25	-0.16	-0.21	0.14	-0.05	-0.05	-0.08	-0.21	0.0	-0.07	0.05
Spov3_chr1.00622 (TBL16)	-0.04	-0.02	-0.46	-0.63	0.43	0.04	-0.01	-0.11	-0.45	-0.18	-0.28	-0.32	0.1	0.88	0.15	-0.09	0.01	0.45	-0.05	-0.28	-0.06	-0.05	0.33	0.0	-0.0	-0.06	0.13	0.09	-0.23	-0.21
Spov3_chr1.01072	0.66	0.35	-0.24	-0.82	0.28	0.26	-0.69	-0.74	-0.51	-0.14	-0.84	-0.88	0.61	1.97	0.79	-0.01	0.08	1.52	-0.7	-0.81	-0.86	-1.09	-0.33	-0.63	-1.03	-0.65	-0.52	-0.93	-0.51	-0.83
Spov3_chr1.01556 (GOXL2)	-0.59	-0.66	-0.97	-1.9	0.93	0.87	0.28	-1.49	-1.31	-0.9	-0.83	-0.82	0.24	2.71	0.25	0.26	-0.49	0.51	-2.19	-1.33	-0.84	-1.18	0.84	-0.14	-0.42	-0.68	-1.16	-0.63	-0.83	-0.06
Spov3_chr1.01824 (ATL15)	-	0.2	-	-	-0.06	0.79	-1.01	-	-	1.14	-	-	-	4.03	-	-	0.65	-0.16	-	-	-	-	-1.06	-0.08	-	-0.1	-	0.8	-	-0.94
Spov3_chr1.02765	-0.21	-0.04	-0.78	-1.2	0.21	0.6	-0.55	-0.25	-0.56	0.17	-0.48	-0.55	-0.4	1.89	0.18	0.24	0.26	0.59	-0.28	-0.72	-0.02	-0.07	-0.93	-0.1	-0.4	0.23	-0.34	0.01	-0.42	-0.08
Spov3_chr1.03438 (HAK1)	-0.19	-0.13	-0.1	-0.76	0.42	-0.13	-0.05	0.32	-0.21	-0.08	-0.48	-0.49	0.84	1.93	0.69	-0.18	-0.34	0.55	-0.56	-0.82	-0.47	-0.54	0.27	-0.63	-0.77	-0.59	-0.46	-0.26	-0.23	-1.14
Spov3_chr1.03489 (AtFDB21)	-0.13	-0.47	-1.14	-1.72	-0.45	0.56	0.02	-1.39	-0.92	-0.27	-0.74	-0.41	0.38	1.87	0.4	0.24	0.13	0.52	-0.51	-0.68	-0.02	-0.2	0.58	0.14	0.15	-0.06	-0.39	-0.44	-0.86	0.5
Spov3_chr1.03673	0.28	-0.06	-0.52	-1.01	0.29	-0.15	-0.08	-0.48	-0.86	-0.47	-1.05	-0.61	-0.04	2.53	-0.0	0.07	-0.35	0.88	-0.52	-0.47	-0.51	-0.65	-0.06	-0.32	-0.88	-0.8	-1.03	-0.23	-0.23	0.24
Spov3_chr1.04155 (BAC2)	-0.23	0.66	-0.68	-1.44	0.26	0.26	0.03	-1.77	-0.45	-0.33	-0.19	-0.03	-0.77	2.33	0.17	-0.31	-0.93	0.38	-0.25	-0.1	0.14	-0.05	-1.3	0.07	-0.64	0.05	-0.49	-0.05	-0.47	-0.44
Spov3_chr1.04234	-	-0.34	-	-	1.0	-0.1	-	-	-	-0.42	-	-	-	4.43	-	-	-	0.84	-	-	-	-	-	-	-	-0.81	-	-	-	0.69
Spov3_chr1.04421 (NLP2)	0.17	0.04	-0.36	-0.98	0.33	0.02	-0.0	-0.17	-0.71	-0.41	-0.31	-0.28	0.01	2.21	0.22	-0.2	-0.42	-0.0	-0.4	-0.14	-0.46	-0.24	-0.45	0.07	-0.52	-0.37	-0.45	0.09	0.07	-0.6
Spov3_chr1.04720	0.59	0.2	-0.06	-1.05	0.35	0.59	0.45	-0.46	0.13	0.04	-0.38	-0.16	-0.76	1.24	0.61	0.17	-0.19	-0.28	-0.41	-0.29	-0.44	-0.27	-0.03	-0.14	-0.27	-0.36	-0.21	-0.26	0.29	-1.3
Spov3_chr1.05058 (AAE13)	-0.21	-0.03	-0.06	-0.36	1.05	-0.01	-0.48	-0.24	-0.21	0.43	-0.52	-0.4	0.15	1.47	-0.01	-0.39	-0.38	0.3	-0.64	-1.1	-0.56	-0.63	0.96	-0.64	-0.53	-0.4	-0.32	0.4	0.4	-0.78
Spov3_chr2.00042	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.00551 (SVB5)	-0.42	-1.15	0.1	0.43	0.19	0.65	-0.07	0.41	-0.08	-0.12	0.05	0.01	0.97	1.3	0.33	-0.03	0.14	0.47	-0.27	-0.27	-0.14	-0.42	-0.4	-0.33	-0.52	-0.72	-0.63	-0.91	-0.68	-1.47
Spov3_chr2.00562	0.05	-2.11	-2.14	-1.17	-0.83	0.09	0.02	-3.08	-0.38	0.63	-0.87	0.32	-0.54	3.24	-2.28	-	0.03	1.52	-	0.34	-0.87	-3.43	1.31	-2.38	-1.26	-1.06	-1.64	-3.18	-0.83	-1.09
Spov3_chr2.00590 (ADCS)	0.1	0.23	-0.58	-1.06	-0.13	0.44	0.26	-0.29	-0.67	-0.32	-0.54	-0.32	0.03	1.69	0.47	0.33	0.08	0.38	-0.32	-0.2	-0.2	-0.01	-0.24	0.02	-0.31	-0.13	-0.42	-0.31	-0.42	-0.43
Spov3_chr2.00675	0.63	0.53	0.23	-0.23	0.77	-0.32	-0.58	-0.49	-0.54	-0.21	-0.69	-0.3	-0.08	1.83	0.1	-0.3	-0.62	0.21	-0.74	-0.74	-0.68	-0.63	0.12	-0.34	-0.39	-0.56	-0.29	0.09	0.37	-0.05
Spov3_chr2.00771 (PHT4;2)	0.42	0.52	-0.08	-0.61	0.36	0.33	0.1	-0.53	-0.36	-0.43	-0.44	-0.46	0.03	1.5	0.37	0.08	0.03	0.64	0.02	-0.15	-0.1	-0.11	-1.04	-0.24	-0.69	-0.21	-0.25	-0.22	-0.61	-0.69
Spov3_chr2.00802	-0.11	-0.21	0.11	-0.08	0.25	0.65	-0.21	-0.33	-0.04	0.03	-0.32	-0.2	0.1	1.94	0.12	0.27	0.16	-0.4	-0.27	-0.45	-0.1	-0.41	-0.98	-0.3	-0.42	-0.35	-0.29	-0.17	-0.33	-1.21
Spov3_chr2.00988 (TRFL10)	0.8	0.82	0.55	-0.93	1.47	0.17	-1.12	-1.06	-3.13	-4.17	-4.13	-2.59	-0.46	2.87	0.22	-1.46	-3.22	-0.51	-3.41	-4.26	-4.54	-2.79	2.33	-	-2.24	-2.8	-3.29	-2.26	-0.24	1.02
Spov3_chr2.01176	-0.18	-0.09	-0.48	-0.74	0.29	0.35	0.0	-0.29	-0.26	-0.29	-0.11	0.01	-0.16	1.71	0.4	0.31	0.27	-0.3	-0.13	-0.05	-0.15	-0.1	-0.39	0.25	-0.21	-0.22	-0.22	-0.29	-0.75	-0.82
Spov3_chr2.01546 (SSA)	-1.23	-0.69	-1.71	-2.01	-0.21	0.8	-0.56	-1.37	-1.33	-0.42	-1.11	-0.95	-0.35	3.05	0.11	0.21	0.01	1.14	-0.57	-0.58	-0.26	-0.26	-0.53	-0.21	-1.42	-0.09	-0.61	-1.12	-1.64	-0.39
Spov3_chr2.01607	-0.1	-0.12	-0.13	-0.09	0.03	0.05	-0.09	0.11	-0.14	-0.3	-0.13	-0.05	-0.11	1.11	0.24	0.02	0.07	0.33	-0.15	-0.12	-0.16	-0.2	0.02	-0.11	-0.11	-0.17	-0.1	-0.15	-0.29	0.05
Spov3_chr2.01721 (LGT9)	3.47	-	-	-	1.14	-	-	-	-	-	-	-	-	3.24	-	-	-	2.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.01901	-0.58	-0.44	-0.35	-0.39	0.21	0.63	0.16	0.2	-0.25	0.0	-0.3	-0.13	0.08	1.29	0.19	0.2	0.2	0.01	-0.15	0.0	-0.21	-0.35	-0.27	-0.05	-0.4	-0.34	-0.37	-0.28	0.16	-0.08
Spov3_chr2.02350	-1.91	-3.99	-4.21	-3.02	1.4	1.32	-1.85	-0.46	-1.02	-0.6	-2.96	-1.35	0.65	3.58	0.43	-1.39	-1.65	1.18	-3.14	-2.23	-1.53	-4.16	0.37	-3.18	-3.1	-2.61	-1.33	-1.36	-1.67	-1.82
Spov3_chr2.02656 (PFK2)	-4.75	-2.11	-3.36	-3.14	0.06	1.23	-0.26	-0.89	-2.83	-1.8	-2.02	-1.76	-0.1	3.18	0.6	0.8	0.66	0.82	-0.99	-1.8	-0.3	-0.18	-0.56	0.05	-1.75	-0.96	-1.49	-1.92	-2.32	0.46
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Spov3_chr6.01521 (AtHMP44)	0.48	0.04	-1.54	-2.48	0.49	-0.39	-1.16	-0.89	-2.24	-1.14	-2.15	-1.32	-0.22	3.17	-0.13	-0.87	-0.79	1.12	-1.08	-0.73	-0.9	-0.75	-0.23	-0.64	-1.32	-0.87	-1.16	-0.47	-0.52	1.01
Spov3_chr6.01534	0.36	-0.5	0.18	-1.85	0.74	0.04	0.51	-	0.58	-1.01	-0.24	-0.16	1.4	2.05	-0.42	0.65	-0.06	-	-0.59	-1.79	-2.66	-1.29	-1.81	-1.47	0.95	-0.17	1.58	-0.83	-	-2.66
Spov3_chr6.01553	-2.25	-0.05	-2.28	-3.44	0.8	1.13	-0.21	-1.39	-0.81	0.12	-0.78	-0.14	-1.04	2.55	0.24	0.54	0.23	-0.76	-0.34	-0.18	0.3	0.02	-3.16	0.0	-1.11	0.24	-0.28	-0.32	-1.18	-0.49
Spov3_chr6.01673 (DDB1B)	0.93	0.32	-0.21	-0.81	-	0.23	-	-	-0.09	1.83	-	-0.82	1.01	2.78	-0.11	-	0.38	-	-	-	1.15	-	0.67	-0.45	-0.54	-	-	0.23	0.0	-0.61
Spov3_chr6.01955 (ATRAB)	-0.25	-0.13	-0.57	-1.16	0.46	0.46	-0.02	-0.27	-0.72	-0.31	-0.55	-0.39	-0.12	1.94	0.4	-0.0	-0.01	0.9	-0.25	-0.35	-0.26	-0.29	-0.26	-0.16	-0.39	-0.29	-0.31	-0.01	-0.44	-0.64
Spov3_chr6.02253	-0.16	-0.2	-0.56	-0.38	0.24	0.2	0.01	-0.39	-0.45	-0.27	-0.46	-0.29	0.27	1.23	0.18	0.03	0.31	0.5	-0.48	-0.31	-0.14	-0.05	0.38	-0.03	-0.09	-0.16	-0.06	0.05	-0.25	-0.15
Spov3_chr6.02655 (CASPL2B1)	-0.05	0.06	-0.76	-1.18	-0.04	0.98	0.14	-0.23	-0.93	-0.28	-0.53	-0.36	-0.22	1.92	0.38	0.45	0.23	-0.48	-0.13	-0.4	-0.06	0.0	-0.91	-0.13	-0.51	-0.02	-0.22	-0.26	-0.75	-0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.