1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_121 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.44 0.27 0.19 -0.46 0.23 -0.11 -0.3 0.16 -0.54 -0.03 0.19 -0.68 0.45 0.67 -0.31 -0.27 0.05 0.88 -0.54 -0.6 -0.22 0.1 0.62 0.13 -0.39 -0.27 -0.12 -0.11 -1.09 0.53
- - - - - 2.27 - - - - - - - - - 3.41 - - - 3.27 - - - - - - - - - 2.29
- -0.4 - 0.67 0.02 -0.8 0.21 - -0.59 -0.62 -1.4 -1.7 - 1.95 - 1.36 -0.59 0.69 -1.42 -0.72 0.65 -0.07 2.11 0.19 -0.03 - - - 1.44 0.65
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.83 - - - - - 3.45 - 3.52 - - - - - - - - - - - 2.03 - -
- - - - - - - - - - 3.13 - - - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - -
0.73 - - - - - - - - - - - 3.44 - - 3.86 - - - - - - - - - - - - 1.59 -
- - - - - 1.93 - 2.32 - - - - - - 2.01 3.16 - - - 2.02 - - - - - 2.05 - - - -
- 3.65 - - - - - - - - - - - - - 2.89 - - - - - - 3.32 - - - - - - -
- - - - - - 3.07 - - - - - - - - 3.87 - - - - - - 2.8 - - - - - - -
- - 1.27 1.21 0.32 - - - - 1.93 - 1.28 - - 0.21 1.93 - 0.13 - 2.77 - - 1.32 - - 0.05 - - 0.48 -
- 0.84 -0.21 -0.53 0.91 - -0.21 - 0.78 -1.22 - -1.28 1.92 -0.18 -1.29 1.93 -0.24 - -1.11 0.27 - 1.38 0.72 - -1.35 -0.22 0.44 - - 1.63
- - - 2.06 - - - - - - - - - - - 3.26 2.38 - - - - - 2.61 - - - - - 2.31 -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - 3.08 - - - - 2.54 - - - - - 2.39 -
- - - - - - - - - - - - - - 2.84 - 3.43 - 2.46 2.72 - - - - - - - - - -
- 2.56 - - - - - - - - - - -0.56 - - 4.28 - - - - - - - - - - - - - 1.99
- - 1.2 - - - -0.13 2.05 0.34 - - 0.04 1.09 - 0.97 1.64 -0.01 1.45 1.21 - - - 1.23 - - - - 1.9 - 0.05
- - - - - - - 1.86 - - - - - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.38 - - - - - 3.44 - - 3.32 - - - - - - - - - - - - - 1.99
- - - - - - - - 0.69 1.18 - - - 1.48 - 3.28 - 1.7 - 0.22 - - - - 0.16 1.72 - - 1.66 0.74
-0.02 - - 1.86 - -0.43 - - -0.08 1.0 - -0.03 1.02 1.45 0.79 1.92 1.09 -0.19 0.85 1.47 -0.02 - -0.12 - - -0.01 - - - -
-0.36 - -2.26 - 0.73 - - 1.22 - - 1.67 -1.03 - - - - - 2.44 1.95 - -1.08 1.49 -21.68 - -0.66 0.66 - 2.03 - 1.31
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
2.0 2.06 - - - - 2.05 - - - - 1.86 - - - 3.47 - - - 1.6 - - - - - - - - - -
1.25 0.27 - - 0.07 - - 0.19 0.2 0.17 - 0.19 1.38 1.21 1.07 1.27 1.37 1.04 1.51 - -0.08 -0.03 - - 0.04 -0.08 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
0.61 1.5 - - -1.05 -0.13 - -0.91 - - - 0.77 0.33 1.1 -0.97 - 0.7 1.34 - - -0.03 - 1.73 - 0.75 -0.92 - - 1.65 2.11
- - - - 2.97 - - - - - - 1.96 - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - 1.92
- - - - - 0.5 - - - 1.76 - - - 0.53 - 3.0 - 0.43 - - - 0.41 0.48 - - - - 0.73 2.8 1.6
- -1.2 0.18 0.35 1.35 -1.48 0.41 -1.26 -1.12 - - -1.4 -0.38 -1.48 - 1.04 - 2.02 1.44 -0.34 0.07 -1.6 0.67 0.28 -0.42 0.66 -0.63 1.91 - -
-0.03 1.46 0.46 1.34 0.01 0.32 -1.73 -2.53 -1.89 -1.61 -1.61 -1.85 -1.16 1.1 -0.97 -0.04 0.09 -2.52 0.69 -3.02 -1.22 - 0.29 -0.3 1.28 0.23 -0.57 1.42 0.61 -1.1
- - - - 0.27 0.97 -1.25 0.25 -1.23 - -0.18 -0.38 1.12 1.33 -1.3 - 1.53 0.61 1.17 2.58 - 1.32 - - 0.23 -1.2 - -0.17 - -1.26
1.73 1.42 - - 0.73 -0.43 - - - -0.26 -0.16 - 2.48 -0.32 0.64 0.13 - - - - 0.49 - - - - 1.24 -0.17 1.33 1.21 0.45
- - 0.46 -1.47 1.47 - 0.38 - -1.01 0.49 0.06 -0.07 1.7 2.16 0.82 0.29 -0.94 -0.28 1.24 - -1.35 0.28 - -1.24 -0.22 -0.27 - -0.96 0.72 -
0.7 0.38 0.57 0.05 -0.49 -0.54 -0.58 -1.21 0.39 -1.31 0.31 -1.49 0.26 -2.0 -1.51 -0.63 -1.84 -0.32 0.6 -0.35 -1.15 -0.5 0.38 0.14 0.76 0.52 0.9 -0.76 0.88 0.94
- 0.28 1.73 - 1.17 0.94 - 1.17 - - 0.28 - - 1.67 - 1.74 0.23 - -0.12 -0.13 - - 0.09 - - - - 2.31 0.3 0.05
- 3.3 - - - - - - - - - - 2.38 - - 3.26 - - - - - 2.43 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.37 - - - - - - - - 3.33 - - - - 3.27
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
1.03 -1.09 0.23 - 0.73 0.98 -0.34 -1.09 - 1.16 -0.0 -1.3 0.86 1.11 0.7 -0.15 -0.97 - 0.1 - -1.24 0.67 -1.08 0.23 - -0.24 - 1.67 -0.36 0.29
- - - - - -9.34 - - - - - - - 4.2 - 3.53 - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.76 - 1.8 - - 0.75 - - 1.03 - - - - 2.85 - 0.65 - - 0.44 1.78 - - - 1.75 - 2.05 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.5 - - - - - - - - - - - 2.26 2.33 - - - - - - - - 3.15 - - - - -
- - - - - 1.08 0.45 0.18 - 0.41 1.49 - - - - 2.96 - - 1.25 - 0.0 0.12 - - - 1.37 - 1.49 1.32 0.19
- 2.7 - - - - - - - - - - 2.65 2.55 - - 2.68 - - - - 2.33 - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.56 - 1.32 - 2.41 2.41 - - - - - 3.12 - - 1.53 - 1.24 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.53 2.02 - - - - - 2.99 - - 2.69 - - - -
0.25 -1.69 0.47 -1.73 -0.93 -1.93 0.3 1.09 - - -0.35 -0.5 0.92 1.04 -0.52 0.38 -0.14 -0.04 -1.28 -0.17 0.74 0.27 1.49 0.27 -1.91 -2.26 0.12 - 0.37 1.21
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.75 - - - - - - 0.94 - - 2.85 - 2.14 - - - - 2.51 - 2.88 - - - 0.8 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- 0.01 1.23 -1.8 - -1.27 -0.92 - -1.2 -0.42 -0.3 - 1.91 -0.31 -0.53 1.29 -1.5 -1.64 0.67 -0.75 - - 0.87 -0.7 0.8 - 1.57 0.37 0.31 1.66
- - - - - - - - - - - - - - - 4.35 - - - - - 3.27 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
1.09 2.51 - - 1.62 -1.13 - - - -1.14 1.6 -2.26 3.05 - - 1.14 - - - - - - - - - - 2.17 - - -
- - - - - - - - - 1.21 - - 3.88 1.08 - 2.77 - - 0.91 - - - 1.12 - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.43 - - - - - 2.48 - 2.3 - - - 2.22 - - - - 2.13 - - 2.35
- - - - - - - 1.83 - - - 1.91 2.0 1.93 - 1.94 - 1.75 - - - - - 2.11 1.75 - - - - -
- - - - - 2.52 1.05 - 1.09 - - - - 2.21 0.94 3.1 - - - - - - - - - - 2.31 - - -
0.04 2.41 -0.25 - - - -0.1 - 1.31 1.03 - - 0.25 1.46 -0.07 - 2.71 - - - 2.06 - - - - - - - - 0.82
- - -1.79 - - -1.62 - - - - - - - - - 4.88 - - - - - - - - - - - - - -
-0.63 -0.12 -0.59 -0.46 0.4 -0.01 0.11 0.29 0.33 0.27 -0.22 0.19 -0.23 -0.31 -0.13 0.46 0.0 -0.51 -0.01 1.13 -0.6 -1.11 0.37 -0.35 -0.18 0.67 0.54 -0.66 -0.26 -0.85
- - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - 3.82 - - - - - - -
-24.93 -25.08 1.12 - - - - - -22.17 - - - - 2.99 - 3.91 1.4 - - - - - 1.14 - - -23.54 - - - -
- 0.62 - - 0.42 - 1.59 - 0.73 0.37 - - 2.57 - 0.63 2.82 0.55 - - - 0.38 1.26 - - - - - - 0.56 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - 1.71 2.26 2.2 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
0.51 -0.25 0.7 0.23 - -0.03 -0.29 -0.82 -0.79 -0.74 0.63 -0.81 1.21 - 0.43 1.23 1.01 0.35 -1.05 0.45 - 0.79 - -1.95 -1.94 1.07 -0.72 -0.18 -1.73 0.99
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
1.03 -0.15 0.21 0.69 0.35 -2.68 -0.13 0.66 0.21 0.5 -0.84 -1.38 0.07 -2.17 -1.47 -2.79 0.49 1.22 1.71 0.19 -1.4 -0.74 - - 0.12 0.66 -0.16 0.6 -0.56 -2.18
- - 3.44 - - - - - - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - 3.17
- -0.55 - - 0.35 0.78 -0.52 -0.77 - - - 0.34 - 2.09 1.93 3.43 - -0.79 - - - - - -0.75 - -0.86 - 1.06 -0.88 -0.93
- - 1.22 - - - 1.07 1.19 - - - - 1.37 - - 2.31 1.35 - - 3.23 - - - - - - - - - 1.94
1.1 0.08 -0.52 1.49 -0.79 0.02 -1.56 - -1.4 -0.31 - -2.48 -0.35 0.41 0.71 1.29 -0.02 -2.58 -1.65 0.07 -0.39 0.5 - 0.29 -0.02 0.47 -0.39 1.36 0.55 -0.51
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
2.52 - - - - - - - - - - - - 2.26 - 3.86 - - - - - - - - - - - 2.32 - -
Spov3_chr6.02320 (GGCT2;1)
 - 1.7 - 0.05 -0.09 0.68 - - - - 0.02 - 1.54 0.9 -0.21 -0.11 1.96 -0.31 - - - - 1.83 0.78 -0.09 -0.2 - - 0.96 0.9
- - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.65 - 2.49 - - - - - - - - - - - 3.56
1.24 1.3 1.19 - - - - - - - - - - 3.18 - 2.94 - - - - - 2.07 - - - 1.01 - - - -
- - - - 3.25 - - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_chr6.02933 (GA20OX4)
 - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - -
- 0.54 - 0.23 - - 0.99 0.8 - -1.47 0.42 -0.33 1.65 1.35 0.0 1.38 -0.92 -1.4 0.08 -1.34 -0.41 -0.47 0.5 -1.06 - 0.09 0.42 - 0.32 1.32
- - - - - - - - 2.8 - - 0.96 - - - 2.35 - - 2.13 - 0.54 - - 1.78 - - - - - 2.75
- - - - - - 1.7 - - 2.37 - - - - - 3.21 - - 2.09 - - 2.15 - - - 1.88 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - - - 3.86 - - - - - - - -
0.76 - - 1.2 -0.35 - -0.25 0.67 - - 1.31 -0.43 1.24 2.27 - 1.28 - - 1.08 -0.59 0.53 - - -0.58 - 0.58 - 1.46 -0.3 -
-0.53 -0.56 0.34 1.63 -1.0 - -0.83 - - 1.12 - 0.87 -0.55 2.43 -0.77 2.24 -0.47 - 0.29 0.28 - - - - - - 0.12 0.49 - 1.12
- - - - 3.05 - - - - - - - - - - 3.56 - - - - - - - - - 3.31 - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.