1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_94 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
3.27 0.0 0.57 2.21 0.97 0.32 0.4 0.35 2.69 0.35 0.83 0.0 0.0 0.0 0.43 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0
0.65 0.22 0.26 0.27 0.29 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.09 0.01 0.03 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.03 0.18 0.0 0.23 0.02 0.0 0.0 0.03
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.25 0.25 0.0 0.0 0.28 0.82 0.0 0.0 0.25 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
2.29 1.03 0.0 0.63 0.49 0.96 0.0 0.0 0.14 0.27 0.0 0.13 0.25 0.41 0.0 0.91 0.39 0.23 0.23 0.33 0.43 0.27 0.0 0.0 0.7 0.31 0.88 0.09 0.63 0.45 0.0
0.71 0.08 0.0 0.0 0.43 0.19 0.15 0.08 0.0 0.05 0.0 0.07 0.6 0.08 0.0 0.09 0.49 0.13 0.22 0.06 0.05 0.45 0.26 0.11 0.0 0.0 0.09 0.06 0.21 0.18 0.04
4.48 0.0 0.0 1.48 4.01 0.25 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.36 1.43 0.33 1.19 1.16 4.5 0.0 0.0 0.86 0.48 0.31 1.03 0.0 1.19 0.27 1.04 0.0 0.93
0.22 0.0 0.08 0.0 0.01 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.38 5.43 5.58 2.55 1.62 3.96 3.18 3.66 2.81 4.4 0.81 3.48 2.65 0.47 3.41 2.07 0.94 6.96 4.19 3.8 5.09 1.69 3.28 3.12 0.3 4.83 0.69 1.76 1.82 2.15 3.28
0.06 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
3.5 2.34 6.38 1.31 2.19 0.8 0.36 0.0 1.04 0.31 2.01 0.99 2.07 3.13 0.4 0.82 0.89 1.06 5.99 0.0 0.36 1.4 3.14 0.37 0.0 5.43 0.0 0.68 2.22 5.19 2.54
1.06 0.6 0.61 0.27 0.02 0.14 0.4 0.61 0.0 0.08 0.1 0.13 0.56 0.0 0.04 0.04 0.17 0.08 0.03 0.08 0.21 0.18 0.1 0.12 0.16 0.07 0.13 0.57 0.02 0.1 0.11
0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 0.0 0.06 0.03 0.05 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.05 0.1
0.29 0.02 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.17 0.01 0.0 0.03 0.08 0.04 0.06 0.04 0.1 0.01 0.03 0.03 0.18 0.06 0.04 0.0 0.01 0.02 0.0 0.1 0.0
0.7 1.21 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.42 0.0 0.48 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.15 0.09 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.16 0.02 0.06 0.0 0.0 0.04 0.01 0.06 0.08 0.0 0.04 0.0 0.03 0.04 0.0 0.16 0.12 0.06
0.08 0.0 0.07 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01 0.0 0.06 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06
0.48 0.15 0.11 0.1 0.23 0.18 0.27 0.1 0.14 0.07 0.16 0.09 0.01 0.04 0.15 0.08 0.07 0.09 0.2 0.12 0.09 0.09 0.08 0.28 0.22 0.15 0.12 0.18 0.21 0.11 0.1
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.15 0.04 0.0 0.25 0.0 0.0 0.1 0.15 0.37 0.15 0.26 0.24 0.18 0.05 0.18 0.0 0.0 0.13 0.13 0.17 0.34 0.01 0.2 0.0 0.13 0.3 0.0 0.04 0.04 0.13
1.92 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.72 0.37 0.0 0.0 1.43 0.34 0.0 0.0 0.0 1.24 0.27 0.99 0.0 0.37 0.64 0.0 0.0 0.0
1.05 0.0 0.28 0.64 0.19 0.53 0.56 0.0 0.17 0.0 0.2 0.0 0.0 0.33 0.42 0.0 0.09 0.0 0.11 0.23 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.1 0.14 0.17 0.1 0.08
1.18 0.15 0.69 0.45 0.13 0.24 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.07 0.0 0.27 0.14 0.25
0.16 0.03 0.05 0.03 0.05 0.05 0.0 0.02 0.05 0.09 0.03 0.09 0.12 0.04 0.02 0.04 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.06 0.02 0.06 0.06 0.03 0.01 0.09
0.17 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.2 0.11 0.16 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.07 0.02 0.03 0.0 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09
0.68 0.05 0.0 0.19 0.23 0.78 0.2 0.37 0.33 0.57 0.17 0.28 0.21 0.47 0.72 0.04 0.15 0.25 0.52 0.26 0.0 0.26 0.26 0.23 0.04 0.23 0.11 0.2 0.24 0.62 0.23
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.54 12.1 6.77 11.06 6.38 6.28 7.83 9.02 6.71 11.5 10.07 5.41 7.06 5.88 10.05 4.27 4.02 18.68 11.52 5.41 6.02 7.16 2.61 6.43 6.59 11.96 8.96 4.49 6.34 8.05 3.52
1.12 0.5 0.0 0.0 0.11 0.57 0.16 0.16 0.0 0.54 0.5 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.24 0.0 0.0 0.11 0.0 0.27 0.1 0.0
0.45 0.0 0.07 0.07 0.05 0.0 0.18 0.22 0.05 0.0 0.18 0.2 0.06 0.2 0.07 0.0 0.46 0.0 0.1 0.11 0.05 0.35 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.06 0.12 0.11 0.17
4.71 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.51 0.68 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0
0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.24 0.96 1.14 0.29 0.42 0.33 1.27 1.45 0.78 0.63 0.66 0.93 0.72 0.36 0.74 0.31 0.52 0.78 0.77 0.79 0.86 0.66 0.21 0.63 0.64 0.54 0.51 0.49 0.59 0.55 0.92
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.28 0.03 0.0 0.28 0.05 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.32 0.05 0.0 0.07 0.06 0.06 0.08 0.05 0.31 0.07 0.02 0.06 0.0 0.05 0.12 0.0 0.15 0.03 0.4 0.03 0.0
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.24 0.0 0.23 0.0 0.32 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0
0.15 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.22 0.0 0.03 0.0 0.07 0.03 0.0 0.12 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.04
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03
2.45 0.55 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.33 0.0 0.89 0.0 0.0 0.86 0.0 1.66 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0
0.17 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.07 0.04 0.01 0.05 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.11 0.06 0.16
0.77 0.4 0.2 0.11 0.17 0.13 0.23 0.09 0.14 0.02 0.07 0.17 0.0 0.0 0.0 0.22 0.27 0.06 0.14 0.16 0.1 0.12 0.0 0.19 0.09 0.26 0.27 0.3 0.23 0.09 0.07
0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.03 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.2 0.06 0.0 0.0 0.0 0.52 0.17 0.08 0.0 0.17 0.2 0.23
0.12 0.11 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.72 0.09 0.0 0.26 0.51 0.38 0.32 0.34 0.48 0.24 0.08 0.08 0.08 0.29 0.18 0.23 0.18 0.16 0.39 0.14 0.14 0.08 0.28 0.15 0.83 0.07 0.0 0.29 0.16 0.46 0.2
9.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.08 0.61 0.0 0.0 0.0 1.79 0.91 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35
0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
1.6 0.07 0.0 0.22 0.45 0.92 0.37 0.53 0.42 0.8 0.4 0.95 0.37 1.13 1.21 0.32 0.13 1.38 0.71 1.14 0.82 0.49 0.74 1.61 0.68 0.54 0.7 0.44 0.47 0.12 0.0
1.9 0.71 1.33 1.25 0.15 0.06 0.56 0.34 0.2 0.12 0.18 0.03 0.65 0.07 0.2 0.16 0.21 1.43 0.19 0.07 0.19 0.03 0.61 0.1 0.44 0.14 0.25 0.16 0.1 0.09 0.04
0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.7 0.0 0.0 0.0 0.9 0.88 0.2 0.17 0.0 0.0 1.24 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.15 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.16 0.23 0.0 0.04 0.0 0.24 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.2 0.1 0.09 0.43 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.09 0.17 0.0 0.52 0.3 0.11 0.0 0.15 0.44 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.09 0.08 0.64
0.62 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.07 0.0 0.0 0.34 0.06 0.0 0.0 0.0 0.27 0.59 0.0 0.0 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.34 0.28 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0
0.33 0.36 0.13 0.22 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0
0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.24 0.04 0.06 0.09 0.08 0.15 0.15 0.1 0.26 0.11 0.17 0.08 0.11 0.05 0.06 0.06 0.01 0.18 0.2 0.04 0.13 0.02 0.12 0.13 0.05 0.15 0.15 0.17 0.19 0.29
8.98 5.19 3.85 2.95 4.61 2.6 8.93 11.33 3.16 2.3 3.19 4.63 3.01 6.99 5.64 1.92 1.71 2.2 2.87 0.3 1.63 5.54 2.62 4.45 4.76 1.3 5.12 3.89 6.05 4.67 6.1
0.63 0.38 0.0 0.02 0.04 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.03 0.22 0.1 0.11 0.02 0.0 0.09 0.0 0.03 0.03 0.0 0.13 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.08 0.13
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.0 0.52 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.2 0.0 0.0 1.63 0.0 0.62 0.82 1.56 0.66 0.34 1.58 1.06 1.93 1.7 0.86 3.55 1.54 3.06 2.51 1.16 1.11 0.0 6.27 4.21 1.8 0.0 1.82 0.73 0.88 3.08 9.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)