Heatmap: Cluster_199 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_320.1 (TOPP4)	-0.13	-0.36	-0.18	-0.22	0.04	0.12	-0.2	-0.23	-0.44	-0.37	-0.21	-0.31	0.01	0.97	0.55	-0.12	-0.26	0.31	-0.18	-0.49	-0.36	-0.31	1.56	-0.39	-0.36	-0.27	-0.27	-0.35	-0.12	-0.13	0.2
Lsat_1_v5_gn_0_32500.1 (CPY)	-1.51	-1.09	-0.81	-0.79	0.31	-0.18	0.13	-0.7	-0.03	0.15	0.05	-0.15	-0.53	1.03	0.87	-0.11	0.26	-0.12	0.13	-0.63	-0.7	-0.8	1.85	-0.8	-0.78	-0.44	-0.28	-0.77	-0.02	0.37	0.56
Lsat_1_v5_gn_0_40241.1 (TIPSY1)	-0.61	-0.73	-0.88	-0.73	0.13	0.17	-0.21	-0.1	-0.23	-0.23	-0.2	-0.09	0.39	0.54	0.45	-0.14	-0.08	0.18	-0.0	-0.14	-0.25	-0.09	1.2	-0.1	-0.1	-0.17	-0.22	-0.2	-0.02	0.06	0.53
Lsat_1_v5_gn_0_5341.1 (DA3)	-0.26	-0.48	-0.48	-0.44	0.22	0.12	-0.23	-0.09	-0.6	-0.44	-0.45	-0.38	0.45	0.61	0.47	-0.1	-0.18	0.46	-0.29	-0.45	-0.4	-0.39	1.56	-0.35	-0.29	-0.26	-0.35	-0.27	0.06	-0.02	0.55
Lsat_1_v5_gn_0_621.1	-0.42	-0.45	-0.76	-0.76	0.2	0.3	-0.06	0.05	-0.33	-0.44	-0.14	-0.38	0.44	0.62	0.28	-0.1	-0.2	0.04	-0.04	-0.45	-0.24	-0.09	1.17	-0.11	-0.11	-0.18	-0.12	-0.16	0.07	0.1	0.49
Lsat_1_v5_gn_0_8140.1	-0.29	-0.54	-0.5	-0.42	0.35	0.14	-0.25	-0.15	-0.32	-0.5	-0.22	-0.37	0.2	0.56	0.27	-0.47	-0.34	0.68	-0.15	-0.37	-0.31	-0.31	1.61	-0.19	-0.1	-0.3	-0.28	-0.37	-0.13	-0.01	0.47
Lsat_1_v5_gn_1_105061.1	-0.06	-0.09	-0.07	-0.69	0.51	0.12	-0.57	-0.52	-0.33	-0.76	-0.43	-0.37	0.02	0.95	0.79	-0.08	-0.26	-0.58	-0.33	-0.59	-0.57	-0.75	1.83	-0.74	-0.48	-0.2	-0.73	-0.87	-0.36	0.08	1.12
Lsat_1_v5_gn_1_12220.1 (RPB1)	-0.64	-0.49	-0.7	-0.5	0.18	-0.0	-0.49	-0.42	-0.33	-0.38	-0.22	-0.33	0.02	0.93	0.68	0.1	-0.15	0.7	-0.11	-0.4	-0.37	-0.3	1.35	-0.41	-0.4	-0.31	-0.3	-0.61	0.23	0.15	0.61
Lsat_1_v5_gn_1_12460.1 (RanBPM)	-0.03	-0.33	-0.36	-0.17	0.27	0.08	-0.25	-0.28	-0.33	-0.29	-0.15	-0.21	0.22	0.57	0.37	-0.08	-0.24	0.38	-0.13	-0.32	-0.24	-0.21	1.03	-0.34	-0.16	-0.18	-0.3	-0.17	0.13	0.07	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_124800.1 (ENDO4)	-0.91	-0.7	-1.2	-0.97	0.16	0.13	-0.35	-0.13	-0.57	-0.69	-0.53	-0.7	0.06	0.92	0.55	-0.17	-0.31	1.03	0.19	-0.44	-0.48	-0.32	1.55	-0.45	-0.37	-0.15	-0.08	-0.48	0.24	0.2	0.61
Lsat_1_v5_gn_1_3200.1	-0.34	-0.45	-0.5	-0.35	-0.2	-0.07	-0.1	-0.11	-0.47	-0.41	-0.51	-0.25	0.07	0.85	0.68	-0.3	-0.13	0.91	-0.07	-0.39	-0.42	-0.32	1.34	-0.26	-0.41	-0.35	-0.09	-0.3	0.05	-0.01	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_40321.1	-0.65	-0.75	-0.95	-1.01	0.6	0.34	-0.96	-0.54	-0.74	-0.8	-0.47	-0.62	0.14	1.34	0.66	-0.1	-0.49	0.72	-0.18	-0.86	-0.73	-0.66	1.82	-0.54	-0.46	-0.43	-0.47	-0.68	0.23	0.25	0.72
Lsat_1_v5_gn_1_6760.1 (TRN1)	-0.6	-0.49	-0.63	-0.52	0.22	0.17	-0.2	-0.02	-0.26	-0.28	-0.1	-0.24	0.64	0.5	0.18	0.18	0.07	0.24	-0.21	-0.33	-0.31	-0.18	1.11	-0.24	-0.28	-0.18	-0.32	-0.05	0.06	-0.01	0.42
Lsat_1_v5_gn_2_113081.1 (CPY)	-1.27	-1.08	-0.69	-0.54	0.02	-0.35	-0.39	-0.89	-0.29	-0.17	-0.12	-0.15	-0.41	0.79	1.0	-0.12	-0.15	0.1	0.23	-0.27	-0.44	-0.61	2.08	-0.77	-0.43	-0.28	-0.2	-1.05	-0.09	0.37	0.54
Lsat_1_v5_gn_2_133820.1	-1.33	-1.27	-1.25	-0.9	0.26	0.64	-0.77	-0.36	-0.29	-0.48	-0.07	-0.47	-0.15	0.98	0.63	0.04	-0.49	0.27	-0.19	-0.45	-0.33	-0.42	1.69	0.07	-0.19	-0.23	-0.2	-0.62	-0.07	0.22	0.82
Lsat_1_v5_gn_2_36161.1 (DGS1)	-1.07	-0.82	-1.18	-0.95	0.21	0.24	-0.25	0.21	-0.67	-0.56	-0.72	-0.14	0.42	0.62	0.52	-0.03	-0.19	0.43	0.18	-0.27	-0.27	-0.25	1.52	-0.26	-0.29	-0.12	-0.33	-0.24	0.15	0.1	0.52
Lsat_1_v5_gn_2_38680.1 (BPM4)	-0.36	-0.45	-0.32	-0.34	0.47	0.11	-0.22	-0.17	-0.37	-0.31	-0.47	-0.49	0.35	0.51	0.42	-0.09	-0.24	0.5	-0.26	-0.49	-0.22	-0.23	1.37	-0.47	-0.25	-0.27	-0.34	-0.25	0.2	0.11	0.41
Lsat_1_v5_gn_2_39660.1 (NPGR2)	-1.35	-0.95	-0.81	-1.25	0.33	0.14	-0.89	-1.14	-0.45	-0.42	-0.39	-0.5	0.05	1.19	0.79	-0.08	-0.4	0.92	-0.02	-0.4	-0.44	-0.42	1.91	-0.59	-0.46	-0.43	-0.45	-0.7	0.14	0.13	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_73101.1 (PILS3)	-2.47	-	-	-	0.57	-0.35	-4.78	-2.99	-3.8	-	-	-5.2	1.11	1.97	0.11	-4.0	-5.37	-1.15	-	-4.39	-2.37	-2.11	4.13	-1.7	-0.91	-5.36	-2.38	-5.42	-1.63	-1.15	-0.34
Lsat_1_v5_gn_2_73920.1 (RRP44A)	-0.68	-0.66	-0.83	-0.71	0.01	0.1	-0.1	0.24	-0.41	-0.44	-0.27	-0.25	0.49	0.62	0.38	0.13	-0.08	-0.09	-0.22	-0.32	-0.22	-0.12	1.32	-0.27	-0.16	-0.13	-0.19	-0.16	0.04	0.03	0.67
Lsat_1_v5_gn_2_75940.1 (TRA1b)	-0.55	-0.47	-0.53	-0.43	0.27	0.01	-0.76	-0.83	-0.34	-0.26	-0.22	-0.32	0.07	0.91	0.51	-0.09	-0.41	0.08	-0.17	-0.59	-0.51	-0.43	1.87	-0.52	-0.44	-0.36	-0.42	-0.54	0.27	0.34	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_77901.1	-4.21	-2.16	-2.83	-1.78	0.52	-0.58	-1.64	-1.32	-0.41	-0.03	-0.03	-0.22	-1.16	1.32	1.32	-0.46	-0.61	-2.74	-0.43	-0.51	-0.73	-1.36	2.98	-0.32	-1.09	-1.64	-0.51	-1.52	0.07	0.16	0.86
Lsat_1_v5_gn_2_86240.1 (PDH2)	-2.35	-1.93	-1.93	-1.78	-1.91	-1.32	-1.51	-1.32	-1.3	-1.02	-0.94	-0.71	-0.87	1.97	1.15	-0.13	-0.74	-2.2	-0.69	-0.86	-0.7	-1.27	3.58	-1.28	-1.15	-0.91	-1.32	-1.61	-0.74	-0.87	-0.42
Lsat_1_v5_gn_2_87981.1	-0.93	-1.11	-0.81	-0.61	-0.1	0.03	-0.49	-0.64	-0.24	-0.29	-0.25	-0.2	0.01	0.79	0.63	0.07	-0.1	0.4	-0.02	-0.13	-0.16	-0.18	1.66	-0.23	-0.32	-0.25	-0.36	-0.48	0.15	0.18	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_88681.1	-0.69	-0.85	-0.87	-0.6	0.07	0.15	-0.15	-0.18	-0.2	-0.29	-0.34	-0.18	0.47	0.45	0.34	0.04	0.08	0.42	-0.01	-0.14	-0.17	-0.12	1.25	-0.19	-0.17	-0.17	-0.21	-0.19	0.02	0.05	0.44
Lsat_1_v5_gn_2_89140.1 (CUL3)	-0.3	-0.39	-0.49	-0.36	0.35	0.27	-0.12	-0.03	-0.33	-0.37	-0.28	-0.34	0.06	0.6	0.38	0.07	-0.15	0.46	0.05	-0.34	-0.25	-0.1	1.13	-0.37	-0.26	-0.3	-0.15	-0.35	0.06	0.05	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_100.1	-0.2	-0.18	-0.24	-0.27	0.31	0.14	-0.47	-0.61	-0.24	-0.24	-0.1	-0.21	0.09	0.63	0.39	0.01	-0.11	0.41	-0.06	-0.33	-0.27	-0.22	0.92	-0.37	-0.25	-0.21	-0.16	-0.27	0.22	0.23	0.37
Lsat_1_v5_gn_3_1160.1	-0.78	-0.77	-0.82	-0.59	-0.22	0.05	-0.25	0.1	-0.45	-0.28	-0.33	-0.17	0.55	0.44	0.41	0.11	-0.12	0.13	-0.15	-0.24	-0.21	-0.05	1.4	-0.13	-0.07	-0.18	-0.3	-0.17	-0.06	-0.08	0.78
Lsat_1_v5_gn_3_24221.1 (OXA1)	-3.69	-3.9	-2.41	-2.75	0.13	-0.55	-1.38	-2.28	-0.17	-0.19	-0.39	-0.4	-0.77	0.22	0.76	-0.09	-0.14	0.45	-0.31	-0.13	-0.45	0.03	3.14	-1.6	-0.86	-0.68	0.2	-2.32	-0.26	-0.38	0.56
Lsat_1_v5_gn_3_35400.1 (ART1)	-0.16	-0.27	-0.51	-0.26	0.22	0.04	-0.33	-0.57	-0.25	-0.32	-0.16	-0.19	0.0	0.87	0.52	-0.1	-0.23	0.52	0.03	-0.44	-0.31	-0.32	1.1	-0.37	-0.32	-0.24	-0.32	-0.39	0.24	0.22	0.42
Lsat_1_v5_gn_4_105560.1 (ELF5)	-0.62	-0.71	-0.57	-0.56	-0.04	0.03	-0.2	-0.09	-0.44	-0.54	-0.21	-0.35	0.18	0.66	0.48	0.05	-0.11	0.64	0.07	-0.26	-0.14	-0.17	1.34	-0.27	-0.09	-0.15	-0.23	-0.4	0.13	0.01	0.36
Lsat_1_v5_gn_4_133320.1 (BGLC3)	-0.39	-0.33	-0.94	-1.32	0.31	0.19	-0.33	-0.41	-0.56	-0.38	-0.33	-0.28	0.38	0.47	0.56	-0.16	-0.06	0.28	0.01	-0.31	-0.16	-0.04	1.49	-0.22	-0.05	-0.04	-0.13	-0.03	-0.13	-0.2	0.4
Lsat_1_v5_gn_4_142920.1 (MyoB3)	-2.06	-2.07	-1.23	-1.73	-0.01	-0.34	-1.32	-0.99	-0.68	-0.68	-0.02	-0.36	-0.4	1.2	1.02	-0.14	-0.21	1.04	-0.4	-0.76	-0.41	-0.36	2.38	-0.53	-0.78	-0.48	-0.04	-1.19	0.25	0.37	0.29
Lsat_1_v5_gn_4_158041.1	-0.03	-0.54	0.32	-0.11	0.13	-0.62	-2.7	-3.96	-2.14	-1.1	-2.01	-1.07	-0.52	2.11	0.29	-1.75	-2.06	1.67	-0.79	-1.63	-2.11	-2.09	2.99	-1.65	-1.91	-1.9	-1.26	-1.76	-1.02	-0.83	0.92
Lsat_1_v5_gn_4_184861.1 (YSL6)	-0.63	-0.73	-0.76	-0.87	-0.01	-0.02	-0.05	0.33	-0.31	-0.4	-0.26	-0.3	0.18	1.19	0.73	-0.06	-0.15	0.19	-0.16	-0.5	-0.56	-0.53	1.46	-0.31	-0.31	-0.54	-0.37	-0.7	-0.01	0.13	0.7
Lsat_1_v5_gn_4_21781.1	-2.28	-1.7	-0.63	-2.09	-0.66	-1.06	-1.14	-1.32	-0.39	-0.74	-0.83	-0.08	1.16	0.57	0.48	-0.53	-0.17	1.31	0.11	-0.41	-0.92	-1.26	2.52	-0.42	-1.98	-0.64	-0.73	-0.84	-0.65	0.02	1.39
Lsat_1_v5_gn_4_55821.1 (MAGL1)	-1.07	-1.21	-1.36	-1.72	0.41	0.56	0.03	0.01	-0.5	-0.53	-0.55	-0.55	0.34	0.81	0.49	-0.07	-0.1	0.92	0.08	-0.25	-0.26	-0.0	1.53	-0.34	-0.06	-0.23	-0.15	-0.22	-0.35	-0.28	0.02
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.