Heatmap: Cluster_170 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.27 0.3 0.25 0.3 0.47 0.4 0.28 0.26 0.27 0.31 0.29 0.3 0.31 0.46 0.37 0.33 0.28 0.41 0.27 0.25 0.24 0.26 1.0 0.25 0.29 0.28 0.29 0.27 0.35 0.37 0.35
0.27 0.2 0.19 0.15 0.14 0.16 0.08 0.04 0.09 0.09 0.08 0.08 0.12 0.08 0.08 0.1 0.07 0.29 0.07 0.08 0.11 0.11 1.0 0.06 0.09 0.11 0.09 0.09 0.08 0.07 0.06
0.27 0.25 0.24 0.18 0.37 0.32 0.18 0.18 0.16 0.15 0.16 0.14 0.22 0.55 0.36 0.19 0.15 0.37 0.24 0.14 0.16 0.16 1.0 0.17 0.17 0.15 0.16 0.15 0.33 0.26 0.25
0.18 0.14 0.37 0.6 0.03 0.03 0.05 0.04 0.06 0.05 0.06 0.08 0.29 0.0 0.01 0.02 0.03 0.08 0.01 0.04 0.05 0.02 1.0 0.02 0.05 0.04 0.05 0.05 0.03 0.03 0.06
0.31 0.2 0.2 0.21 0.46 0.29 0.12 0.09 0.16 0.13 0.19 0.15 0.15 0.31 0.24 0.16 0.12 0.4 0.18 0.11 0.14 0.15 1.0 0.13 0.15 0.13 0.13 0.11 0.2 0.15 0.16
0.34 0.36 0.37 0.37 0.46 0.42 0.3 0.29 0.31 0.3 0.34 0.3 0.4 0.57 0.48 0.37 0.33 0.51 0.35 0.29 0.3 0.32 1.0 0.26 0.29 0.31 0.33 0.3 0.36 0.33 0.39
0.37 0.32 0.28 0.27 0.39 0.37 0.31 0.28 0.27 0.26 0.26 0.23 0.27 0.44 0.43 0.25 0.26 0.34 0.31 0.28 0.25 0.25 1.0 0.26 0.29 0.28 0.27 0.29 0.29 0.33 0.36
0.57 0.58 0.6 0.55 0.44 0.43 0.41 0.44 0.36 0.38 0.39 0.43 0.58 0.35 0.35 0.45 0.49 0.43 0.37 0.42 0.42 0.43 1.0 0.41 0.46 0.48 0.45 0.49 0.44 0.43 0.41
0.24 0.25 0.23 0.26 0.38 0.29 0.1 0.08 0.13 0.13 0.18 0.13 0.14 0.33 0.23 0.19 0.14 0.33 0.19 0.14 0.16 0.15 1.0 0.14 0.14 0.17 0.19 0.14 0.17 0.19 0.19
0.48 0.39 0.45 0.25 0.1 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.05 0.06 0.08 0.04 0.04 0.4 0.04 0.04 0.03 0.03 1.0 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04
0.62 0.55 0.54 0.37 0.28 0.29 0.36 0.29 0.3 0.33 0.3 0.33 0.64 0.2 0.17 0.45 0.51 0.38 0.28 0.32 0.26 0.32 1.0 0.33 0.36 0.35 0.27 0.31 0.23 0.3 0.29
0.4 0.39 0.46 0.24 0.04 0.04 0.12 0.09 0.08 0.07 0.08 0.09 0.08 0.01 0.01 0.08 0.07 0.19 0.06 0.06 0.07 0.06 1.0 0.05 0.07 0.11 0.06 0.1 0.09 0.09 0.1
0.33 0.24 0.28 0.2 0.12 0.26 0.12 0.09 0.07 0.07 0.08 0.06 0.1 0.15 0.09 0.09 0.08 0.09 0.1 0.08 0.1 0.1 1.0 0.09 0.11 0.1 0.09 0.12 0.14 0.11 0.11
0.39 0.34 0.41 0.31 0.19 0.31 0.27 0.17 0.15 0.16 0.17 0.14 0.28 0.14 0.12 0.21 0.21 0.21 0.15 0.16 0.21 0.22 1.0 0.18 0.22 0.24 0.23 0.26 0.2 0.19 0.16
0.45 0.39 0.38 0.25 0.24 0.16 0.15 0.16 0.11 0.11 0.11 0.1 0.14 0.2 0.19 0.14 0.14 0.24 0.11 0.12 0.15 0.13 1.0 0.13 0.15 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.18
0.38 0.2 0.33 0.27 0.14 0.15 0.12 0.12 0.09 0.09 0.1 0.09 0.12 0.1 0.11 0.08 0.08 0.18 0.1 0.07 0.08 0.09 1.0 0.09 0.09 0.09 0.1 0.08 0.11 0.1 0.1
0.57 0.67 0.56 0.42 0.29 0.31 0.37 0.32 0.28 0.3 0.3 0.35 0.8 0.3 0.36 0.47 0.48 0.65 0.26 0.33 0.34 0.32 1.0 0.33 0.35 0.37 0.33 0.38 0.23 0.26 0.44
0.66 0.46 0.53 0.35 0.38 0.39 0.3 0.23 0.28 0.26 0.27 0.25 0.33 0.34 0.35 0.36 0.36 0.36 0.3 0.29 0.31 0.32 1.0 0.26 0.3 0.33 0.33 0.36 0.25 0.21 0.23
0.25 0.23 0.26 0.31 0.5 0.4 0.21 0.16 0.24 0.23 0.26 0.2 0.21 0.45 0.39 0.23 0.18 0.45 0.27 0.19 0.24 0.21 1.0 0.19 0.18 0.22 0.22 0.21 0.3 0.25 0.28
0.28 0.27 0.21 0.12 0.06 0.24 0.09 0.06 0.05 0.09 0.05 0.06 0.16 0.0 0.04 0.1 0.09 0.14 0.1 0.06 0.09 0.08 1.0 0.07 0.07 0.12 0.07 0.1 0.07 0.1 0.08
0.41 0.34 0.39 0.18 0.16 0.16 0.1 0.08 0.1 0.08 0.11 0.1 0.17 0.17 0.12 0.14 0.13 0.34 0.12 0.09 0.1 0.12 1.0 0.13 0.13 0.11 0.12 0.1 0.14 0.19 0.26
0.3 0.32 0.28 0.26 0.35 0.41 0.25 0.29 0.2 0.19 0.22 0.2 0.26 0.43 0.4 0.3 0.24 0.31 0.23 0.19 0.22 0.23 1.0 0.21 0.22 0.22 0.24 0.21 0.29 0.28 0.31
0.34 0.53 0.33 0.29 0.32 0.37 0.25 0.24 0.16 0.17 0.17 0.15 0.17 0.24 0.25 0.23 0.19 0.12 0.19 0.15 0.15 0.15 1.0 0.13 0.14 0.13 0.15 0.19 0.15 0.15 0.11
0.44 0.63 0.36 0.23 0.18 0.23 0.37 0.27 0.18 0.25 0.28 0.25 0.64 0.23 0.24 0.31 0.39 1.0 0.17 0.33 0.23 0.23 0.98 0.34 0.31 0.23 0.28 0.29 0.18 0.32 0.5
0.68 0.29 0.44 0.27 0.15 0.42 0.07 0.05 0.12 0.1 0.16 0.07 0.26 0.14 0.18 0.34 0.18 0.14 0.13 0.16 0.15 0.21 1.0 0.1 0.15 0.27 0.19 0.1 0.19 0.12 0.14
0.35 0.38 0.39 0.39 0.53 0.5 0.36 0.42 0.31 0.32 0.33 0.31 0.43 0.55 0.42 0.36 0.33 0.57 0.38 0.3 0.32 0.35 1.0 0.33 0.33 0.33 0.33 0.3 0.47 0.43 0.52
0.17 0.17 0.43 0.5 0.1 0.09 0.05 0.07 0.1 0.09 0.13 0.11 0.08 0.04 0.03 0.07 0.06 0.06 0.05 0.04 0.07 0.08 1.0 0.07 0.08 0.1 0.07 0.06 0.11 0.12 0.11
0.43 0.52 0.3 0.44 0.4 0.25 0.11 0.07 0.18 0.22 0.22 0.24 0.2 0.1 0.12 0.13 0.12 0.56 0.07 0.12 0.13 0.11 1.0 0.12 0.15 0.16 0.15 0.1 0.17 0.24 0.33
0.23 0.53 0.12 0.04 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0 0.03 0.01 0.24 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.05 0.05 0.03 0.01 0.01 0.07 0.09 0.13
0.23 0.23 0.26 0.23 0.38 0.4 0.21 0.23 0.16 0.18 0.19 0.19 0.34 0.34 0.3 0.27 0.24 0.27 0.23 0.17 0.18 0.21 1.0 0.2 0.22 0.21 0.21 0.22 0.31 0.31 0.43
0.2 0.12 0.42 0.45 0.04 0.04 0.02 0.01 0.05 0.05 0.06 0.05 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.05 0.01 0.02 0.03 0.02 1.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.03
0.57 0.57 0.44 0.31 0.23 0.17 0.09 0.07 0.14 0.14 0.16 0.14 0.18 0.17 0.15 0.14 0.12 0.61 0.12 0.12 0.1 0.1 1.0 0.1 0.12 0.13 0.13 0.11 0.18 0.21 0.25
0.16 0.17 0.29 0.38 0.11 0.25 0.09 0.13 0.07 0.11 0.1 0.1 0.21 0.1 0.1 0.17 0.13 0.26 0.09 0.09 0.1 0.1 1.0 0.08 0.1 0.12 0.09 0.12 0.08 0.07 0.15
0.33 0.3 0.2 0.19 0.32 0.31 0.21 0.22 0.17 0.16 0.17 0.15 0.21 0.42 0.37 0.2 0.17 0.38 0.23 0.16 0.19 0.18 1.0 0.19 0.19 0.19 0.21 0.21 0.22 0.2 0.21
0.29 0.29 0.32 0.29 0.27 0.35 0.29 0.3 0.21 0.2 0.21 0.21 0.3 0.48 0.38 0.26 0.25 0.23 0.26 0.21 0.22 0.21 1.0 0.22 0.23 0.22 0.22 0.23 0.26 0.24 0.27
0.16 0.11 0.13 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.25 0.25 0.23 0.2 0.43 0.26 0.13 0.09 0.15 0.15 0.16 0.16 0.19 0.39 0.3 0.19 0.18 0.36 0.21 0.16 0.16 0.17 1.0 0.13 0.14 0.17 0.16 0.16 0.19 0.2 0.22
0.14 0.1 0.1 0.15 0.48 0.22 0.04 0.03 0.08 0.09 0.09 0.06 0.08 0.24 0.23 0.1 0.05 0.4 0.09 0.04 0.07 0.07 1.0 0.06 0.07 0.06 0.07 0.07 0.13 0.13 0.11
0.14 0.12 0.13 0.18 0.4 0.3 0.16 0.16 0.13 0.11 0.15 0.09 0.1 0.28 0.3 0.14 0.07 0.42 0.16 0.08 0.1 0.12 1.0 0.09 0.1 0.09 0.1 0.1 0.21 0.16 0.14
0.29 0.34 0.26 0.13 0.35 0.32 0.24 0.23 0.15 0.13 0.15 0.12 0.18 0.4 0.3 0.19 0.17 0.15 0.1 0.12 0.15 0.15 1.0 0.16 0.16 0.15 0.15 0.08 0.28 0.27 0.35
0.34 0.33 0.36 0.14 0.25 0.07 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.07 0.07 0.27 0.07 0.05 0.04 0.18 0.06 0.01 0.03 0.01 1.0 0.03 0.07 0.05 0.04 0.03 0.08 0.07 0.07
0.45 0.29 0.5 0.39 0.22 0.25 0.17 0.14 0.35 0.31 0.22 0.35 0.28 0.2 0.22 0.27 0.23 0.31 0.19 0.23 0.21 0.23 1.0 0.2 0.24 0.27 0.24 0.27 0.26 0.23 0.27
0.42 0.42 0.49 0.29 0.37 0.13 0.08 0.07 0.09 0.14 0.09 0.13 0.15 0.23 0.09 0.09 0.07 0.47 0.05 0.08 0.11 0.07 1.0 0.08 0.1 0.07 0.09 0.09 0.23 0.26 0.33
0.23 0.21 0.27 0.24 0.31 0.26 0.17 0.15 0.18 0.2 0.18 0.17 0.18 0.37 0.3 0.21 0.19 0.17 0.21 0.17 0.15 0.17 1.0 0.16 0.13 0.15 0.16 0.14 0.23 0.24 0.22
0.21 0.17 0.28 0.24 0.03 0.04 0.04 0.01 0.05 0.06 0.06 0.05 0.06 0.0 0.01 0.04 0.03 0.19 0.01 0.02 0.03 0.03 1.0 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.04 0.05 0.03
0.54 0.4 0.48 0.3 0.23 0.22 0.11 0.11 0.14 0.13 0.16 0.17 0.22 0.14 0.11 0.13 0.14 0.22 0.13 0.13 0.15 0.16 1.0 0.14 0.16 0.15 0.14 0.17 0.14 0.14 0.18
0.54 0.32 0.33 0.22 0.14 0.15 0.05 0.02 0.09 0.05 0.11 0.06 0.07 0.15 0.1 0.06 0.05 0.71 0.12 0.08 0.09 0.05 1.0 0.02 0.1 0.14 0.14 0.06 0.07 0.06 0.06
0.46 0.3 0.46 0.3 0.13 0.12 0.1 0.13 0.11 0.13 0.14 0.14 0.2 0.13 0.13 0.14 0.12 0.19 0.12 0.11 0.12 0.13 1.0 0.12 0.13 0.13 0.12 0.11 0.13 0.16 0.24
0.26 0.23 0.32 0.36 0.31 0.3 0.19 0.17 0.18 0.17 0.19 0.16 0.19 0.29 0.26 0.2 0.17 0.21 0.22 0.14 0.16 0.16 1.0 0.15 0.16 0.16 0.17 0.17 0.18 0.19 0.19
0.26 0.26 0.28 0.29 0.41 0.33 0.18 0.14 0.22 0.23 0.24 0.19 0.17 0.41 0.36 0.21 0.16 0.34 0.22 0.17 0.19 0.2 1.0 0.18 0.18 0.19 0.2 0.16 0.29 0.27 0.28
0.32 0.31 0.38 0.33 0.41 0.42 0.35 0.4 0.26 0.27 0.3 0.28 0.34 0.55 0.47 0.33 0.31 0.5 0.32 0.26 0.29 0.28 1.0 0.26 0.28 0.28 0.29 0.27 0.3 0.31 0.35
0.21 0.17 0.17 0.2 0.3 0.23 0.11 0.13 0.12 0.07 0.13 0.08 0.14 0.44 0.34 0.13 0.15 0.29 0.11 0.08 0.11 0.09 1.0 0.06 0.08 0.09 0.1 0.09 0.14 0.12 0.23
0.26 0.23 0.23 0.14 0.11 0.14 0.13 0.02 0.11 0.11 0.09 0.11 0.09 0.01 0.01 0.08 0.1 0.08 0.07 0.12 0.12 0.13 1.0 0.06 0.12 0.15 0.12 0.16 0.06 0.05 0.03
0.3 0.25 0.34 0.3 0.13 0.16 0.15 0.08 0.14 0.12 0.15 0.13 0.17 0.07 0.08 0.15 0.13 0.13 0.09 0.11 0.15 0.14 1.0 0.1 0.13 0.16 0.13 0.16 0.1 0.1 0.12
0.23 0.23 0.19 0.13 0.26 0.22 0.11 0.13 0.14 0.09 0.13 0.11 0.18 0.3 0.27 0.15 0.15 0.33 0.16 0.11 0.11 0.15 1.0 0.11 0.1 0.15 0.14 0.1 0.18 0.19 0.16
0.31 0.22 0.32 0.2 0.09 0.1 0.13 0.09 0.13 0.11 0.13 0.14 0.15 0.01 0.01 0.1 0.09 0.05 0.04 0.08 0.08 0.12 1.0 0.09 0.14 0.15 0.1 0.12 0.1 0.13 0.15
0.2 0.17 0.29 0.29 0.08 0.09 0.04 0.04 0.08 0.09 0.09 0.1 0.12 0.07 0.07 0.07 0.06 0.1 0.06 0.05 0.05 0.05 1.0 0.07 0.07 0.06 0.07 0.05 0.08 0.12 0.19
0.48 0.3 0.46 0.6 0.25 0.25 0.16 0.11 0.2 0.27 0.25 0.28 0.32 0.16 0.2 0.23 0.28 0.23 0.13 0.18 0.26 0.22 1.0 0.17 0.25 0.28 0.25 0.29 0.22 0.25 0.48
0.18 0.16 0.13 0.11 0.33 0.23 0.13 0.1 0.11 0.11 0.12 0.13 0.21 0.38 0.26 0.17 0.16 0.36 0.16 0.12 0.14 0.15 1.0 0.09 0.13 0.14 0.13 0.16 0.11 0.08 0.1
0.22 0.32 0.3 0.27 0.23 0.17 0.11 0.08 0.06 0.06 0.07 0.07 0.11 0.17 0.14 0.13 0.13 0.15 0.1 0.08 0.11 0.1 1.0 0.07 0.09 0.1 0.12 0.08 0.11 0.09 0.09
0.06 0.12 0.32 0.39 0.01 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.02 0.04 0.0 0.07 1.0 0.01 0.02 0.06 0.02 0.03 0.13 0.07 0.07
0.22 0.19 0.24 0.29 0.34 0.3 0.13 0.09 0.21 0.19 0.22 0.17 0.18 0.37 0.31 0.17 0.14 0.31 0.18 0.14 0.17 0.15 1.0 0.14 0.15 0.18 0.17 0.13 0.25 0.24 0.25
0.36 0.32 0.28 0.26 0.56 0.37 0.2 0.18 0.26 0.27 0.32 0.24 0.23 0.39 0.38 0.34 0.25 0.53 0.25 0.22 0.25 0.24 1.0 0.23 0.26 0.22 0.26 0.26 0.28 0.25 0.25
0.42 0.36 0.38 0.21 0.15 0.18 0.26 0.26 0.13 0.12 0.11 0.15 0.36 0.13 0.1 0.16 0.2 0.27 0.18 0.14 0.19 0.2 1.0 0.21 0.2 0.18 0.23 0.25 0.29 0.2 0.36
0.29 0.21 0.27 0.28 0.12 0.24 0.2 0.27 0.09 0.13 0.12 0.14 0.14 0.07 0.1 0.16 0.13 0.09 0.18 0.15 0.19 0.17 1.0 0.13 0.14 0.18 0.15 0.17 0.15 0.09 0.07
0.16 0.24 0.18 0.13 0.15 0.24 0.15 0.15 0.08 0.05 0.1 0.06 0.12 0.3 0.12 0.11 0.06 0.17 0.14 0.06 0.09 0.11 1.0 0.12 0.12 0.1 0.12 0.06 0.22 0.19 0.33
0.54 0.54 0.51 0.46 0.35 0.45 0.45 0.5 0.37 0.34 0.35 0.35 0.3 0.47 0.44 0.35 0.34 0.26 0.33 0.32 0.34 0.33 1.0 0.33 0.37 0.34 0.34 0.3 0.36 0.35 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)