Heatmap: Cluster_195 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.03 -0.23 0.01 -0.0 -0.11 0.42 0.02 -0.05 -0.3 -0.5 -0.23 -0.27 -0.19 0.91 0.91 0.28 0.12 -0.35 0.35 -0.11 -0.15 0.06 -1.02 -0.28 -0.15 0.02 -0.07 0.18 -0.23 -0.32 -0.25
-0.64 -0.78 -0.68 -0.42 0.68 0.28 -0.49 -0.72 -0.12 0.15 -0.26 -0.33 -0.12 1.18 0.84 0.01 -0.31 0.94 -0.22 -0.4 -0.34 -0.37 0.3 -0.37 -0.54 -0.07 -0.2 -0.76 0.39 0.05 0.35
-5.81 -4.79 -3.64 -3.81 0.3 0.06 -0.1 -1.05 -0.7 -0.64 0.23 -0.06 -0.95 1.53 2.12 0.83 0.21 0.02 0.96 0.17 -0.17 -0.94 -3.27 -2.11 -0.98 0.21 0.65 -2.09 0.57 0.38 -0.09
-0.65 -0.44 -0.2 0.1 -0.22 -0.26 0.01 0.21 -0.57 -0.44 -0.25 -0.32 -0.2 1.5 1.31 0.11 0.22 -0.69 0.74 0.07 -0.11 -0.08 -3.95 -0.06 -0.25 -0.09 -0.12 -0.14 -0.28 -0.55 -0.02
-0.09 -0.04 -0.05 0.41 -0.04 0.18 0.04 0.01 -0.89 -0.87 -0.6 -0.74 -0.73 1.38 1.16 -0.05 0.14 -1.49 1.15 -0.14 -0.11 0.11 -7.91 -0.15 -0.2 0.09 0.21 0.22 0.14 -0.67 -1.2
-0.82 -0.45 -0.36 -0.42 -0.07 -0.27 0.01 -0.4 0.31 0.25 0.42 0.01 -0.8 1.11 1.17 -0.07 0.14 -0.98 0.37 -0.18 0.05 -0.01 -1.26 -0.28 -0.18 -0.07 0.32 -0.36 0.17 0.0 -0.19
0.07 0.53 0.37 -0.1 0.07 0.18 -0.49 -0.97 -0.41 -0.29 -0.22 -0.23 0.27 1.09 0.64 -0.18 -0.36 0.17 0.2 -0.39 -0.26 -0.19 0.22 -0.55 -0.37 -0.08 0.06 -0.5 0.01 -0.21 0.14
-1.03 -0.79 -0.88 -0.71 -0.55 -0.32 0.36 0.21 -0.5 -0.4 -0.54 -0.35 0.06 1.6 1.35 0.15 0.44 -0.58 0.99 0.19 0.02 0.04 -3.59 -0.08 -0.21 -0.12 -0.11 0.07 -0.55 -0.58 -0.22
-0.24 -0.04 -0.27 -0.25 0.35 0.04 -0.4 -0.75 -0.29 -0.33 -0.33 -0.35 0.05 0.87 0.79 0.41 0.35 0.61 0.04 -0.02 -0.16 -0.1 -0.06 -0.28 -0.21 -0.0 0.05 0.1 -0.33 -0.26 -0.46
-0.0 0.21 0.21 0.19 0.09 -0.14 -0.18 -0.03 -0.11 0.11 -0.4 -0.06 -1.21 0.73 1.01 0.21 0.32 -0.46 0.6 0.08 -0.25 -0.23 -4.01 -0.85 -0.41 -0.16 0.09 -0.66 0.56 0.39 -0.47
-0.32 -0.15 0.04 -0.07 0.11 0.08 -0.15 -0.48 -0.42 -0.37 -0.33 -0.23 0.05 1.38 1.04 0.48 0.23 -1.45 0.64 0.18 0.07 0.28 -3.33 -0.4 -0.32 -0.19 -0.16 -0.39 0.02 -0.45 -0.23
-0.25 -0.02 0.22 -0.49 0.6 0.64 -0.13 -0.21 -0.59 -0.67 -0.25 -0.73 -1.21 1.59 0.95 0.68 0.01 -0.48 0.52 -0.28 -0.4 0.17 -3.34 -0.8 -0.35 -0.14 0.02 0.15 0.12 -0.67 -0.58
0.41 0.55 0.27 -0.21 0.53 0.4 -0.63 -1.27 -0.75 -0.83 -0.61 -0.82 -0.15 1.3 1.01 0.29 0.18 -0.49 0.74 -0.22 -0.15 -0.18 -1.81 -0.56 -0.35 -0.11 -0.09 -0.13 -0.02 -0.17 -0.33
-1.39 -2.11 0.0 0.71 -0.01 -0.53 0.07 -0.05 -0.24 0.42 0.31 0.63 -0.36 1.93 1.27 0.17 0.56 -1.97 0.11 0.19 0.38 0.09 -3.54 -2.47 -2.01 -2.2 -2.11 -0.92 1.06 -0.2 -2.58
-2.12 -1.75 -1.58 -0.66 0.45 0.3 -0.54 -0.32 0.3 0.07 0.3 0.19 -0.26 0.54 1.02 0.38 -0.14 0.48 -0.07 0.01 -0.06 -0.17 -1.84 0.07 -0.3 -0.04 0.07 -0.39 0.5 0.6 0.27
-1.64 -1.13 -0.92 -0.8 0.23 -0.07 -0.17 -0.61 -0.14 -0.29 0.09 0.15 -0.38 0.93 1.57 0.2 0.19 0.25 0.73 0.15 -0.34 -0.87 -1.73 -0.51 -0.29 0.14 0.33 -0.69 0.2 0.46 -0.02
-1.08 -0.93 -0.54 -0.57 0.52 0.63 -0.22 -0.6 -0.54 -0.45 -0.29 -0.3 0.37 1.12 0.9 0.18 0.23 -1.18 0.58 0.0 -0.18 0.0 -1.72 0.05 0.04 -0.04 -0.13 0.23 -0.11 -0.24 0.52
-0.27 -0.38 -0.02 0.11 -0.75 -0.24 -0.56 -0.62 -0.25 -0.18 -0.06 -0.39 -0.86 1.56 1.42 0.06 -0.16 -1.97 0.66 -0.0 -0.14 0.15 -3.57 -0.08 -0.13 -0.02 0.17 -0.47 0.25 0.13 0.13
-0.67 -0.47 0.19 0.02 -0.93 -0.3 -0.57 -0.64 -0.06 -0.14 -0.06 -0.35 -0.83 1.5 1.52 0.14 -0.07 -2.02 0.72 0.06 -0.09 0.0 -4.18 -0.21 -0.22 -0.14 0.26 -0.64 0.34 0.12 0.24
-0.02 -0.63 -0.23 0.15 0.91 0.27 -0.31 -0.51 -0.27 -0.24 -0.13 -0.42 -0.81 1.37 1.15 0.14 -0.1 0.32 -0.01 -0.52 -0.56 -0.69 -0.91 -0.42 -0.53 -0.29 -0.17 -0.84 0.25 0.25 0.3
-0.61 -1.3 -1.63 -1.88 0.87 0.55 -0.07 -0.35 -0.58 -0.59 -0.71 -0.72 -0.81 1.84 1.2 0.25 0.26 0.3 0.8 0.14 0.32 0.37 -2.79 -0.39 -0.14 -0.04 0.07 0.14 -0.76 -1.45 -1.27
0.21 0.5 -0.14 -0.77 0.21 0.34 -0.2 -0.3 -0.21 -0.3 -0.17 -0.19 -0.2 0.75 0.57 0.2 0.14 -0.88 0.22 -0.24 -0.02 0.02 -1.35 -0.22 -0.11 0.0 -0.01 -0.16 0.32 0.34 -0.05
-0.15 -0.05 -0.24 0.0 0.39 0.37 0.13 -0.71 -0.41 -0.11 -0.15 0.15 0.27 0.78 0.77 0.23 0.11 -0.54 0.5 0.01 0.08 0.15 -2.87 -0.44 -0.51 0.01 -0.18 0.1 0.02 -0.48 -0.23
-0.6 -1.68 -2.13 -0.65 0.45 1.03 -0.02 -0.91 -1.25 -0.82 -0.96 -0.06 -0.19 1.94 1.52 0.27 0.32 -0.17 0.71 0.05 -0.27 0.48 -4.74 -1.97 -0.46 0.63 0.12 1.03 -3.69 -3.25 -3.47
-1.8 -1.35 -1.0 -1.04 0.17 0.18 -0.32 -0.85 0.41 0.07 -0.09 0.25 -0.76 1.12 1.32 0.25 0.44 -0.18 0.29 0.06 -0.51 -0.39 -2.92 0.02 -0.3 0.0 -0.17 -0.5 0.59 0.64 0.24
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-0.76 -0.93 -0.67 -0.26 0.18 0.12 0.3 0.24 -0.4 -0.31 -0.42 -0.29 0.24 1.33 1.09 0.08 0.34 -1.06 0.55 -0.05 -0.15 -0.09 -2.39 -0.11 -0.22 -0.2 -0.13 -0.04 0.0 -0.09 0.11
-1.13 -0.99 -0.86 -0.65 -0.22 -0.07 0.18 -0.06 -0.34 -0.29 -0.43 -0.11 0.6 1.53 1.0 0.27 0.77 -2.09 0.49 -0.05 -0.21 -0.15 -2.5 -0.15 -0.03 -0.43 -0.14 0.08 0.14 0.02 0.15
0.19 0.04 -0.34 -0.25 0.51 0.36 -0.24 -0.34 -0.57 -0.63 -0.53 -0.71 -0.32 1.45 1.01 0.1 -0.09 0.59 0.22 -0.4 -0.35 -0.29 -1.55 -0.38 -0.13 -0.16 -0.01 -0.65 -0.08 0.06 0.14
-0.74 -0.81 0.09 0.14 -0.11 0.18 -0.04 -0.01 -0.14 -0.05 0.02 -0.03 -0.22 1.15 0.91 0.39 0.16 -0.54 0.25 -0.06 0.01 0.07 -1.45 -0.44 -0.36 -0.15 -0.18 -0.25 0.26 -0.04 -0.31
-0.6 0.03 -0.64 -1.09 0.73 0.52 -0.33 -0.53 -0.39 -0.43 -0.3 -0.63 -0.2 1.35 0.84 0.32 -0.07 -0.03 0.07 -0.38 -0.3 -0.22 -0.85 -0.42 -0.39 -0.24 -0.23 -0.87 0.67 0.56 0.47
-3.23 -4.75 -4.39 -4.55 0.97 0.51 -0.18 -1.81 -0.07 -0.99 0.19 -0.94 -4.29 2.34 2.33 0.36 -0.37 -0.52 1.11 -0.62 -0.53 -0.68 -1.88 -3.36 -1.88 -0.13 0.84 -2.01 0.38 0.08 -3.22
-0.33 -0.3 -0.29 -0.25 0.57 0.17 -0.75 -0.66 -0.3 -0.31 -0.27 -0.39 0.38 1.09 0.71 -0.01 -0.26 0.65 -0.4 -0.5 -0.21 -0.17 0.07 -0.42 -0.35 0.06 -0.14 -0.27 0.46 0.11 0.22
-1.28 -1.02 -0.7 -0.47 0.27 -0.19 0.02 -0.13 0.13 0.17 0.46 0.07 -0.64 1.08 1.63 0.42 0.22 -1.68 0.57 0.03 -0.15 -0.37 -4.81 -0.72 -0.54 0.16 0.44 -0.83 -0.01 0.27 -0.55
-2.08 -2.29 -1.51 -1.1 -0.74 -0.18 -0.28 -0.53 -0.3 -0.26 -0.61 -0.75 -0.8 1.92 1.82 0.48 0.55 -1.23 1.0 0.48 0.12 0.12 -4.55 0.06 -0.26 -0.37 -0.12 -0.09 -0.08 -0.43 -0.19
-0.45 -0.07 -0.29 -0.67 0.73 0.71 -2.23 -1.64 -1.02 -0.91 -0.6 -0.67 0.34 1.75 0.97 0.32 -0.37 0.64 0.25 -0.9 -0.54 -0.25 -2.88 -0.47 -0.43 -0.36 -0.06 -0.78 0.54 0.36 0.73
-0.55 -0.26 -0.94 -0.99 0.41 0.67 -0.18 -0.33 -0.79 -0.79 -0.45 -0.67 -0.07 1.53 1.11 0.61 0.24 -0.57 0.09 -0.36 0.03 0.19 -2.91 -0.34 -0.02 0.44 0.4 0.3 -0.44 -0.57 -0.43
- - -3.0 -1.41 -0.1 0.32 -0.03 -1.58 0.28 -1.54 -0.13 0.68 -1.91 1.37 1.39 1.22 0.47 -1.58 1.4 -0.02 0.08 -1.18 -0.59 -1.75 -0.74 0.51 1.4 -1.61 0.29 -0.63 -1.11
0.32 0.43 -0.1 -0.4 0.15 0.03 0.04 -0.34 -0.14 -0.32 -0.58 -0.58 -1.08 1.77 1.38 0.08 -0.04 -2.4 0.59 0.27 -0.02 -0.03 -4.96 -0.66 -0.29 0.02 0.2 0.15 -0.52 -1.0 -1.31
-0.58 -0.82 -0.62 -0.6 -0.5 0.11 -0.19 -0.73 -0.15 -0.53 -0.11 -0.41 -0.67 1.35 1.28 0.78 0.55 -0.36 0.43 0.23 0.15 0.21 -2.41 -0.11 -0.24 -0.2 0.02 -0.34 0.08 0.03 -0.19
-0.78 -1.1 -0.2 -0.78 0.94 0.89 -0.44 -0.48 -0.7 -0.29 0.14 -0.34 -0.99 1.46 1.41 0.85 0.1 -0.28 0.11 -0.06 0.68 0.2 -2.88 -1.14 -0.94 0.13 -0.03 0.45 -0.73 -1.64 -3.65
-0.89 -0.51 -1.04 -1.29 -0.46 0.09 -0.21 -0.38 -0.7 -0.95 -0.45 -0.81 0.68 1.8 1.48 0.81 0.73 -2.45 -0.27 -0.02 -0.13 -0.01 -1.76 -0.2 -0.28 -0.15 0.07 -0.04 -0.48 -0.41 0.53
-3.13 -2.91 -3.66 -6.1 0.52 -0.13 0.03 -1.15 -0.4 -0.33 -0.75 -0.35 -1.9 0.91 1.83 0.38 0.4 -3.15 1.12 0.36 0.11 0.96 - -0.54 0.34 0.48 0.64 -0.24 -0.04 0.48 -0.18
-1.73 -0.83 -0.46 -0.3 -0.36 -0.53 0.05 -0.31 0.07 0.01 -0.02 0.1 0.2 0.9 1.3 0.49 0.47 -0.93 0.46 0.11 0.02 -0.36 -3.22 -0.38 -0.11 0.12 0.23 -0.59 -0.19 0.55 0.08
-1.49 -1.37 -1.59 -0.31 0.74 0.08 -0.41 -0.72 0.43 0.16 0.25 0.05 -0.87 0.64 0.9 0.22 -0.2 0.48 -0.07 -0.08 -0.4 -0.44 0.11 -0.38 -0.5 -0.53 -0.02 -0.45 0.75 0.78 0.22
-0.12 -0.26 0.11 0.37 0.25 0.05 -0.36 -0.43 -0.34 -0.16 -0.23 -0.36 -0.55 0.96 0.62 0.11 0.11 -0.44 0.28 -0.01 0.03 0.03 -0.35 -0.36 -0.21 0.12 -0.1 0.12 0.23 -0.05 -0.28
- - - - 0.72 -0.03 -0.36 -1.98 0.36 -1.31 0.57 -1.16 - 1.79 1.68 0.11 -0.39 1.25 1.07 -0.27 -0.43 -0.04 - -3.55 -0.44 0.63 0.85 -2.76 0.88 0.84 -2.09
-0.91 -0.15 -0.17 -0.28 0.28 0.36 -0.09 0.01 -0.49 -0.64 -0.67 -0.53 0.0 1.63 1.63 0.52 0.07 -0.35 0.22 -0.5 -0.75 -0.69 -0.94 -0.77 -0.6 -0.38 -0.38 -0.68 0.28 0.1 -0.03
-1.1 -0.39 -0.57 -0.04 -0.06 0.22 0.11 0.6 -0.05 -0.19 0.01 -0.0 -0.84 1.61 1.14 -0.15 -0.22 -2.68 0.5 -0.04 -0.16 0.1 -5.94 0.12 0.01 -0.04 0.06 -0.02 -0.34 -0.82 0.05
-0.7 -0.15 -0.57 -0.53 0.48 0.24 -0.26 -0.77 -0.53 -0.55 -0.36 -0.55 -0.08 1.51 1.68 0.53 0.46 -0.18 0.25 0.02 -0.17 -0.03 -2.08 -0.45 -0.39 -0.31 -0.12 -0.24 -0.43 -0.55 -0.4
-0.52 -0.53 0.41 0.48 -0.32 -0.29 -0.43 -0.56 -0.86 -0.73 -0.14 -0.74 -0.71 1.27 0.97 0.03 -0.19 -0.35 0.84 0.05 0.03 0.06 -1.67 -0.25 -0.2 -0.04 0.11 -0.33 0.38 0.35 0.24
-0.19 -0.11 0.07 0.12 0.39 0.3 -0.43 -0.73 -0.45 -0.34 -0.37 -0.29 -0.01 0.99 0.97 0.56 0.37 -0.87 0.21 -0.01 0.17 0.05 -1.15 -0.21 -0.19 -0.16 0.09 0.01 -0.51 -0.64 -0.02
-0.2 -0.22 -0.37 -0.45 0.45 0.39 -0.67 -0.87 -0.03 -0.05 -0.01 -0.22 0.12 1.11 0.63 -0.11 -0.4 0.4 -0.08 -0.11 -0.19 -0.1 -0.31 -0.41 -0.3 -0.09 -0.13 0.11 0.34 0.12 -0.01
0.12 -0.77 0.05 -0.15 -0.17 0.19 -0.31 -0.74 -0.45 -0.56 -0.52 -0.26 -0.09 1.12 1.38 0.35 0.27 -2.23 0.1 0.08 0.08 0.05 -1.2 -0.06 -0.1 0.4 0.11 0.13 -0.2 -0.11 -0.41
-0.45 -0.31 -0.65 -1.28 -0.24 0.14 -0.42 -0.88 0.15 -0.07 -0.07 -0.37 -0.14 1.67 1.27 0.39 0.27 -1.38 0.19 -0.06 -0.21 0.07 -3.08 -0.14 0.1 -0.14 0.11 -0.53 -0.05 0.08 0.22
-0.23 -0.06 -0.37 -0.41 0.5 0.38 -0.13 -0.3 -0.26 -0.4 -0.21 -0.35 0.04 1.05 0.9 0.23 -0.01 0.36 0.1 -0.29 -0.19 -0.15 -1.47 -0.19 -0.17 -0.14 -0.12 -0.36 0.04 0.01 0.19
0.4 0.63 0.23 -0.43 0.23 0.13 -0.19 -0.47 -0.46 -0.27 -0.3 -0.51 0.3 1.1 0.79 -0.06 -0.02 0.5 0.16 -0.32 -0.35 -0.3 -0.5 -0.55 -0.58 -0.42 -0.29 -0.3 0.04 -0.28 0.02
-0.85 -0.98 -1.4 -0.91 1.15 0.67 0.08 0.31 -1.65 -0.96 -1.09 -0.8 -0.62 1.49 1.77 0.28 0.24 0.75 0.45 -0.15 0.04 0.12 -2.69 -1.3 -0.96 -0.14 -0.26 0.59 -0.02 -1.92 -2.6
-0.06 0.82 -0.49 -0.94 0.23 0.53 -0.61 -0.17 -0.92 -1.54 -0.81 -1.84 0.35 1.68 1.1 -0.04 -0.83 0.72 0.74 -0.36 -0.79 -0.4 -0.71 -0.03 -0.62 -0.36 -0.92 -1.18 0.44 -0.17 0.4
-0.44 0.12 -2.17 -1.76 0.63 1.13 -0.39 -0.21 -1.24 -0.86 -1.03 -1.35 0.09 2.03 0.97 -0.71 -1.51 0.58 0.03 -0.57 -1.0 -0.13 -0.13 -0.39 -0.31 -0.23 0.22 -0.52 0.0 -0.12 0.72
-0.55 -0.54 -0.37 -0.37 0.31 0.33 -0.31 -0.39 -0.34 -0.28 -0.13 -0.24 0.24 1.0 0.85 0.27 0.24 -0.59 0.19 -0.17 -0.08 -0.08 -1.11 -0.29 -0.14 0.06 -0.02 -0.13 0.28 0.29 0.16
-0.5 0.98 -0.13 -1.12 0.78 1.04 -1.9 -1.25 -1.47 -1.56 -1.06 -2.03 0.42 2.33 1.2 -0.47 -0.76 0.69 0.06 -0.77 -0.42 -0.96 -0.16 -0.67 -0.71 -0.66 -0.84 -1.45 -0.04 -0.3 0.18
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-2.62 -4.91 -3.81 -1.85 -0.23 -0.06 0.25 0.3 0.1 0.15 0.15 -0.1 -0.53 1.32 1.54 0.63 0.04 0.32 0.76 0.58 0.08 -0.06 -2.89 -1.08 -0.47 0.22 -0.28 -0.75 0.39 0.15 -0.92
-0.5 -0.13 -0.4 -0.15 0.94 0.74 -0.54 -1.15 -0.38 -0.52 -0.52 -0.35 -0.75 1.44 1.36 0.66 0.28 0.39 0.06 -0.01 -0.2 0.07 -1.4 -0.54 -0.59 -0.04 0.1 0.04 -1.2 -0.99 -1.55
-1.78 -1.71 -1.87 -1.14 -0.0 0.23 -0.23 -0.7 0.23 0.0 -0.08 0.23 -0.64 0.6 1.09 0.1 0.35 -1.13 0.25 0.33 0.34 0.17 -3.42 0.34 0.31 0.54 0.34 0.04 0.57 0.21 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.