Heatmap: Cluster_44 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_15960.1	-0.45	0.4	0.28	0.39	-0.54	-0.72	-0.09	0.05	-0.08	0.01	-0.13	0.28	-0.08	0.13	0.35	0.14	0.11	0.35	0.07	-0.21	-0.15	-0.36	-3.09	-0.22	0.02	-0.1	0.06	-0.75	-0.42	0.61	0.9
Lsat_1_v5_gn_0_18240.1	-1.3	-0.17	0.27	0.19	-0.68	-0.89	-0.41	-0.3	0.0	0.37	0.09	0.61	0.42	-0.39	0.61	0.04	0.29	-1.56	-0.04	-0.09	-0.18	-0.53	-5.7	0.15	0.14	-0.13	-0.56	-0.91	0.02	0.88	1.5
Lsat_1_v5_gn_0_6661.1 (BBX13)	-1.24	-1.91	-1.08	-0.2	-0.68	-0.95	-0.61	-1.06	0.2	0.44	0.24	0.65	0.81	-0.79	0.59	0.13	0.63	-0.36	-0.15	0.39	-0.08	-0.38	-1.03	0.51	0.41	-0.03	-0.11	-0.24	-0.09	0.72	0.74
Lsat_1_v5_gn_0_7361.1	-0.41	-0.45	0.05	0.25	-0.22	-0.59	0.03	-0.29	0.04	0.12	0.28	0.42	0.52	-0.32	0.19	0.14	0.39	-0.65	-0.05	0.1	-0.14	-0.42	-2.23	0.17	0.2	0.01	-0.23	-0.08	-0.24	0.45	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_107281.1	-0.9	-0.98	-0.26	0.41	-0.2	-0.47	0.01	-0.52	0.17	0.16	0.29	0.27	0.43	-0.59	0.44	0.45	0.23	-0.86	-0.11	0.19	-0.07	0.06	-	-0.54	0.07	0.14	-0.05	-0.43	0.08	0.4	1.25
Lsat_1_v5_gn_1_112160.1 (NLM2)	-1.12	-1.08	-0.03	0.69	-0.38	-0.59	-0.41	-0.57	0.38	0.64	0.49	0.78	0.22	-0.04	0.72	0.52	0.21	-0.58	0.08	0.29	-0.07	-0.2	-1.17	-0.04	-0.36	-0.47	-0.27	0.06	-0.37	0.06	-0.15
Lsat_1_v5_gn_1_117460.1 (DSEL)	-1.13	-0.8	0.13	0.2	-0.9	-1.03	-0.28	-0.69	0.1	-0.2	-0.05	0.76	0.66	-0.08	0.78	0.58	0.7	-0.35	-0.33	0.51	-0.48	-0.27	-	-0.01	0.1	0.09	-0.45	-0.42	-0.04	0.43	0.86
Lsat_1_v5_gn_1_124100.1	-1.32	-1.4	-0.73	-0.11	-0.42	-1.25	-0.44	-0.55	0.12	0.53	0.15	0.55	0.81	-0.27	0.77	0.18	0.7	-0.58	-0.14	0.19	-0.23	-0.74	-2.36	-0.04	-0.21	-0.16	-0.39	-0.56	0.27	0.94	1.2
Lsat_1_v5_gn_1_124180.1	-0.92	-1.61	-0.31	0.19	-0.46	-0.79	-0.41	-0.87	0.12	0.19	0.62	0.81	0.52	-0.35	0.56	0.14	0.51	-1.16	-0.25	0.17	-0.07	-0.12	-2.16	0.41	0.28	-0.13	-0.21	0.02	-0.07	0.51	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_124601.1	-1.06	-2.01	-0.52	-0.38	-0.86	-1.09	-0.29	-0.95	0.11	0.61	0.49	0.92	1.0	-1.08	0.43	-0.18	0.63	-1.55	-0.4	0.39	-0.32	-0.54	-2.75	0.59	0.34	-0.09	-0.5	-0.08	-0.24	0.92	1.1
Lsat_1_v5_gn_1_13620.1 (UGD3)	-1.45	0.16	0.3	0.45	-1.18	-1.36	-0.89	-0.79	0.0	-0.27	0.11	0.54	0.28	-1.12	-0.36	-0.2	0.17	-1.0	0.13	0.14	-0.51	-0.48	-7.84	0.13	-0.03	0.03	-0.14	-0.41	0.46	1.35	1.75
Lsat_1_v5_gn_1_25160.1 (IDN1)	-2.19	-2.18	-0.1	-0.36	-0.98	-0.87	-0.52	-1.69	0.14	0.08	0.03	0.5	0.74	-2.54	-1.42	0.15	0.49	0.23	-0.45	0.17	-0.16	-0.12	-4.3	0.17	0.11	0.47	0.3	-0.43	0.18	0.8	2.04
Lsat_1_v5_gn_1_25320.1 (GXM2)	-2.36	-1.19	-0.96	-0.32	-1.0	-1.45	-0.43	-0.7	-0.17	0.3	-0.08	0.04	1.19	-0.95	-0.12	-0.41	0.27	0.29	-0.76	0.71	-0.24	-0.11	-1.88	0.43	0.19	-0.03	-0.07	-0.48	0.0	0.96	1.8
Lsat_1_v5_gn_1_35161.1 (ISTL9)	-2.14	-2.26	-1.73	0.1	-0.59	-0.97	-0.4	-0.58	0.27	0.29	0.81	0.78	0.25	-0.33	0.59	0.37	0.62	-0.06	-0.02	0.38	-0.28	-0.48	-0.12	0.36	0.2	-0.19	-0.06	-0.46	-0.04	0.29	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_44721.1 (PLDALPHA2)	-1.71	-1.2	-1.17	-0.06	-0.27	-1.4	-0.54	-0.84	0.4	0.4	0.5	0.66	0.92	-0.78	0.43	-0.11	0.68	-1.04	-0.07	-0.12	-0.19	-0.56	0.5	0.28	0.27	-0.22	-0.02	-0.07	-0.24	0.32	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_53961.1 (IRX9)	-0.87	-0.53	0.08	-0.01	-0.57	-1.0	-0.02	-0.28	-0.05	0.09	0.27	0.29	0.4	-0.2	0.3	0.14	0.31	-0.52	0.11	0.12	0.09	-0.29	-4.95	0.1	-0.11	0.2	-0.06	-0.2	-0.4	0.75	1.2
Lsat_1_v5_gn_1_56241.1	-1.2	-2.01	-0.1	-0.26	-0.04	-1.0	-0.61	-0.72	-0.19	0.45	0.23	0.36	0.46	-0.88	0.54	0.4	0.49	-0.19	0.2	0.3	-0.25	-0.64	-0.1	-0.01	0.08	0.25	-0.29	0.04	-0.24	0.59	0.92
Lsat_1_v5_gn_1_87140.1	-1.6	-1.93	-0.48	-0.21	-0.51	-0.81	-0.6	-0.71	0.05	0.28	0.45	0.61	0.5	-0.47	0.72	0.22	0.48	0.05	0.07	0.2	-0.06	-0.19	0.03	0.34	0.13	-0.19	-0.21	-0.29	-0.17	0.47	0.6
Lsat_1_v5_gn_1_88201.1 (VH1)	-0.85	-0.55	0.02	0.3	-0.43	-0.65	0.06	-0.04	-0.22	-0.15	-0.04	0.19	0.62	-0.58	0.2	0.4	0.28	0.12	0.1	0.28	-0.54	-1.03	-5.95	0.24	-0.23	-0.0	-0.5	-0.55	-0.23	0.48	1.64
Lsat_1_v5_gn_1_920.1	-0.35	-0.34	0.35	0.33	-0.36	-0.93	-0.11	-0.19	0.33	0.33	0.21	0.33	0.06	0.03	0.62	0.14	0.21	-0.47	0.17	-0.0	-0.24	-0.22	-	-0.06	-0.22	0.12	-0.03	-0.56	-0.38	0.45	0.82
Lsat_1_v5_gn_1_96600.1 (VRLK1)	-1.19	-0.34	0.03	0.13	-0.61	-0.8	0.09	-0.23	0.17	0.08	-0.04	0.31	0.32	-0.3	0.4	0.34	0.4	-0.77	-0.28	0.03	-0.24	-0.33	-	-0.29	0.14	0.15	-0.09	-0.14	0.1	0.97	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_97880.1	-1.29	-0.93	-0.18	0.45	-0.76	-1.15	-0.15	-0.87	0.25	0.23	0.29	0.37	0.66	-0.71	-0.11	0.03	0.08	0.05	-0.26	0.18	-0.21	-0.53	-3.09	0.03	0.02	-0.1	-0.31	-0.6	0.17	1.09	1.52
Lsat_1_v5_gn_2_100441.1 (UXT1)	-0.71	-0.48	-0.13	-0.01	-0.24	-0.98	-0.51	-0.37	0.02	0.14	0.22	0.58	0.84	-0.71	0.38	0.1	0.45	-0.67	-0.3	0.0	0.04	-0.27	-2.49	-0.01	0.04	-0.22	-0.17	-0.32	-0.13	0.73	1.26
Lsat_1_v5_gn_2_124521.1 (ESK1)	-1.04	-0.77	-0.22	0.11	-0.53	-0.76	-0.07	-0.43	0.23	0.18	0.12	0.26	0.72	-0.4	0.21	0.31	0.53	-0.35	-0.28	-0.03	-0.09	-0.47	-5.61	0.18	0.19	0.02	-0.17	-0.2	-0.24	0.88	1.13
Lsat_1_v5_gn_2_128940.1 (VND5)	-1.07	-0.93	-0.11	-0.11	-0.5	-1.17	-0.12	-0.05	0.25	0.19	0.25	0.28	1.04	-0.79	0.42	0.69	0.66	-0.98	0.34	0.18	-0.21	-0.89	-	0.26	0.23	-0.31	-0.5	0.09	-0.08	0.57	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_3121.1 (XCP2)	-0.49	-0.67	0.08	-0.01	-0.96	-1.36	-0.16	-0.67	-0.04	0.1	-0.09	0.66	1.0	-1.74	0.13	0.08	0.54	-0.61	0.4	0.16	0.3	-0.22	-7.33	0.02	0.36	0.06	0.1	-0.09	-0.37	0.63	0.91
Lsat_1_v5_gn_2_37681.1 (ASPR1)	-1.1	-0.17	-0.22	0.17	-0.73	-0.63	0.23	-0.13	0.03	-0.12	-0.05	0.45	0.5	-0.26	0.33	0.15	0.16	0.43	-0.39	0.1	0.12	-0.47	-4.73	0.11	-0.16	-0.17	-0.44	-0.35	-0.36	0.7	1.32
Lsat_1_v5_gn_2_71740.1 (NAC028)	-1.18	-4.21	-0.48	0.06	-0.3	-1.2	-0.35	-0.57	0.04	0.37	0.05	0.65	1.11	-0.65	0.62	0.12	0.28	0.32	-0.21	0.33	-0.24	-0.34	-0.85	0.19	-0.2	-0.84	-0.22	-0.21	0.14	0.39	1.15
Lsat_1_v5_gn_2_71841.1 (SUS6)	-1.14	-1.59	-0.73	-0.11	-0.42	-0.8	-0.62	-0.77	0.17	0.37	0.43	0.59	0.8	-0.53	0.47	0.23	0.53	-0.54	-0.13	0.19	-0.05	-0.55	0.11	0.3	0.04	-0.08	-0.11	-0.14	-0.16	0.46	0.71
Lsat_1_v5_gn_2_75361.1 (PLDDELTA)	-1.59	-0.93	-0.54	-0.14	-0.14	-0.31	-0.68	-0.79	0.23	0.1	0.27	0.59	0.62	0.32	0.68	-0.03	0.48	-0.15	-0.28	0.19	-0.43	-0.59	0.37	0.34	0.15	-0.13	-0.13	-0.1	-0.32	0.14	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_76580.1 (LAC11)	-0.82	-0.6	-0.24	-0.0	-0.82	-1.08	-0.0	-0.27	0.14	0.3	0.27	0.86	1.1	-0.8	0.48	0.37	0.61	-1.38	-0.41	0.12	0.02	-0.35	-	0.28	0.3	-0.0	-0.28	-0.14	-0.71	0.38	0.73
Lsat_1_v5_gn_2_91021.1 (SEOb)	-1.16	-1.4	-0.46	-0.15	-0.33	-1.11	-0.48	-0.77	0.03	0.37	0.22	0.83	1.05	-1.09	0.4	0.16	0.61	-0.77	-0.33	0.16	-0.24	-0.63	-2.05	0.41	0.3	-0.15	-0.29	-0.25	-0.12	0.8	1.15
Lsat_1_v5_gn_2_99800.1	-0.4	-0.2	-0.26	0.77	-0.33	-1.08	0.19	0.03	0.03	0.13	0.13	0.36	0.49	0.13	0.27	0.15	0.07	-0.44	-0.39	0.13	-0.54	-0.2	-3.72	-0.12	-0.39	-0.12	0.0	-0.53	-0.12	0.76	0.93
Lsat_1_v5_gn_3_135061.1 (XSP1)	-0.86	-0.51	0.11	0.37	-0.38	-0.89	0.08	-0.14	0.09	0.44	0.24	0.36	0.47	-0.21	0.36	0.11	0.52	-0.68	0.08	-0.07	-0.02	-0.46	-4.85	0.02	-0.07	-0.1	0.09	-0.32	-0.68	0.38	1.06
Lsat_1_v5_gn_3_25141.1 (RPPR3a)	-3.29	-3.32	-3.34	-1.05	-1.84	-1.71	-0.79	-0.22	0.56	-0.16	0.2	0.25	0.3	0.83	0.49	0.13	-0.13	0.25	-0.33	-0.7	-0.16	-0.1	-0.31	-0.18	0.49	0.07	-0.12	-1.9	0.26	0.94	2.06
Lsat_1_v5_gn_3_34861.1 (GSL7)	-1.6	-1.12	-0.58	-0.23	-0.58	-1.6	-0.69	-0.97	0.26	0.32	-0.04	0.81	1.25	-0.35	0.38	-0.03	0.23	-0.17	-0.47	0.04	-0.6	-0.92	-2.07	0.51	-0.05	-0.39	-0.65	-0.54	0.14	1.2	1.51
Lsat_1_v5_gn_3_35021.1 (GSL7)	-1.39	-0.68	-0.04	0.01	-0.34	-0.9	-0.48	-0.45	0.05	0.18	0.1	0.56	0.89	-0.07	0.33	0.01	0.32	-0.37	-0.4	-0.08	-0.59	-0.68	-1.52	0.1	0.02	-0.22	-0.34	-0.63	0.06	0.88	1.5
Lsat_1_v5_gn_3_56140.1	-1.78	-2.17	-0.56	0.36	-0.14	-0.83	-0.65	-0.71	0.3	0.35	0.29	0.51	0.6	-0.58	0.94	0.36	0.45	-0.12	0.06	0.16	-0.27	-0.4	-0.87	0.35	-0.11	-0.04	-0.12	-0.21	0.24	0.33	0.38
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.