Heatmap: Cluster_88 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.76 - - - - - - 1.59 4.62
- - - - - - - - - - - - 2.49 - - 2.05 - - - - - - 1.88 - - - - - - - 4.13
- - - - - - - - - - - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.29
- - - - - - - - - - - - 2.79 - 2.96 - - - - - - - - - - - - - 3.02 - 3.04
- - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - 2.67 - 3.73
- - - - - - - - - - - 2.89 - - - - 2.93 - - - - - - - - - - - - - 4.0
- - - - - - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.87 - - - 4.03
- - - - - - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - 2.22 - - 4.06
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - 1.71 - - 4.59
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.79 - 3.02 - - - - - - - 4.28
- - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - 0.9 - - - - - - - - - - - - 4.41
- - - - 1.93 - 1.32 2.39 1.72 - - - - - - 1.14 - - - 0.74 - - - - - - 2.3 - - - 2.88
- - - - 2.03 - - - - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.53 - - - 4.28
- - - - - - - - - - - - 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89
- - - - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - - 4.18
- - 2.19 - 0.02 - - - - 0.18 - 1.27 2.71 0.45 - - - - - 0.1 - - - - - - - 0.3 0.19 1.17 3.05
- - - - - - - - - - - - - 2.52 - - - 2.23 - - - - - - - - - - - - 4.36
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - 1.91 1.82 - - 1.86 - - - - - - - - - 1.39 - - - 4.13
- - - - - 2.37 - - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - - - - - - - - 4.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.86 - - - - - - - 3.83
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.65
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.