Heatmap: Cluster_117 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_18301.1 (GALK2)	0.54	0.28	0.86	0.81	0.58	0.22	-0.6	-1.05	-0.06	0.04	0.09	-0.06	-0.11	-0.42	-0.41	-0.34	-0.41	-0.1	-0.53	-0.38	-0.19	-0.11	0.53	-0.55	-0.28	-0.41	-0.4	-0.49	0.24	0.15	0.4
Lsat_1_v5_gn_0_36880.1 (IAMT1)	-3.49	-1.33	0.5	1.45	-0.03	-0.29	-0.66	-0.12	0.01	0.15	0.61	-0.24	0.13	0.06	0.16	-0.18	-0.01	0.12	-0.85	-0.39	-0.32	-0.21	-5.44	-0.83	-0.77	0.1	-1.18	-1.51	0.82	1.05	1.3
Lsat_1_v5_gn_1_107820.1 (CR4)	0.4	0.38	0.42	0.62	0.08	-0.25	-0.22	0.27	-0.12	-0.2	0.19	-0.07	-0.46	-0.16	-0.14	-0.52	-0.64	-1.08	-0.39	-0.18	-0.36	-0.15	0.5	0.19	-0.09	-0.18	-0.33	-0.33	0.14	0.36	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_19240.1 (TPP)	0.54	0.45	0.01	0.36	1.05	0.52	0.04	-0.04	-0.09	-0.14	-0.06	-0.28	-0.3	-0.14	0.23	-0.11	-0.61	0.42	-0.35	-0.5	-0.35	-0.24	0.45	-0.57	-0.37	-0.29	-0.31	-0.31	0.1	-0.19	-0.68
Lsat_1_v5_gn_1_58821.1	0.14	-0.16	0.89	1.18	0.44	0.12	-0.72	-1.96	0.17	0.18	0.57	0.12	-0.7	-0.63	-0.6	-0.22	-0.5	0.39	-0.63	-0.39	-0.34	-0.28	0.91	-0.71	-0.35	0.22	0.07	-0.3	-0.04	-0.19	-0.31
Lsat_1_v5_gn_2_117121.1 (SIS)	-0.23	-0.26	1.13	1.92	1.28	0.57	-0.41	-0.85	-0.4	-0.48	-0.1	-0.6	-1.28	-1.75	-1.36	-0.44	-1.08	2.03	-1.08	-0.89	-0.25	0.01	-1.49	-1.11	-1.0	-0.29	-0.4	-1.03	0.05	-0.7	-0.43
Lsat_1_v5_gn_2_120001.1 (UGT76C2)	0.17	-1.22	0.51	1.15	0.59	0.46	-0.91	-1.57	0.04	0.6	0.27	-0.11	-0.3	-0.97	-0.76	-0.07	0.24	0.06	-0.7	-0.22	-0.28	-0.94	-0.9	-0.07	-0.2	0.48	-0.12	-0.79	0.42	0.24	0.76
Lsat_1_v5_gn_2_12241.1	-0.14	-0.64	-0.67	-0.04	1.5	0.63	-1.52	-1.62	-0.2	-0.3	0.12	-0.16	-0.54	0.36	0.59	0.3	-0.19	-0.17	-0.3	-0.72	-0.16	-0.29	0.56	-0.51	-0.21	-0.41	-0.42	-0.16	0.74	0.56	-0.06
Lsat_1_v5_gn_2_1280.1	0.22	0.1	1.62	1.95	-0.39	-0.39	-0.01	-0.01	-0.4	-0.53	-0.32	-0.49	-0.53	-0.18	0.31	-0.04	0.0	-0.56	-0.81	-1.15	-0.56	-0.71	-0.77	-1.14	-0.34	-0.27	-0.6	-0.81	-0.16	0.28	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_14581.1	-0.8	0.29	1.34	1.77	0.33	0.57	-0.12	-0.25	-0.35	-0.19	-0.7	-0.36	-1.56	0.24	-0.01	-0.29	-0.57	0.61	-0.27	-0.76	-0.57	-0.45	-0.47	-0.38	-0.7	0.07	-0.51	-1.16	0.26	-0.31	0.04
Lsat_1_v5_gn_2_15281.1 (OTU1)	-0.21	-0.35	-0.02	0.48	0.08	0.31	-0.07	0.07	0.02	-0.01	0.2	-0.02	-0.1	0.61	0.54	-0.19	-0.11	-1.57	-0.23	-0.41	-0.34	-0.26	0.19	-0.27	-0.17	-0.16	-0.11	-0.49	0.34	0.34	0.41
Lsat_1_v5_gn_2_21060.1	0.14	-0.78	0.49	0.56	0.45	-0.02	-0.24	-1.13	0.41	0.46	0.53	0.37	-0.35	-0.59	-0.17	0.23	-0.18	-2.31	-0.41	-0.35	-0.1	-0.0	0.02	-0.29	-0.09	-0.13	-0.19	-0.22	0.61	0.69	-0.47
Lsat_1_v5_gn_2_59820.1 (PCAP1)	-0.01	0.57	1.39	1.67	0.3	0.31	-0.84	0.2	-0.73	-0.39	-0.52	-0.17	0.14	0.56	-0.7	0.02	-0.27	-1.84	-0.37	-0.78	-0.29	-0.1	-2.87	-0.72	-0.2	0.1	0.02	0.21	0.07	-0.23	-1.27
Lsat_1_v5_gn_2_62940.1 (WAKL2)	0.88	0.4	1.02	0.93	1.5	0.45	-0.12	-0.18	-0.5	-0.42	-0.26	-0.04	-0.12	-0.07	-0.28	-0.44	-0.45	0.14	-0.48	-0.96	-0.6	-0.8	-0.18	-0.65	-0.66	-0.37	-0.63	-0.15	-0.52	-0.44	-0.0
Lsat_1_v5_gn_2_96940.1 (SPL7)	-0.29	0.2	0.81	1.17	0.02	-0.18	-0.21	-0.84	-0.18	0.29	0.02	0.43	0.11	-0.11	0.22	-0.7	-0.43	-0.18	-0.29	-0.5	-0.21	-0.82	0.6	-0.45	-0.35	-0.25	-0.38	-0.74	0.1	0.11	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_98320.1	0.04	-0.04	0.87	1.12	0.25	0.01	0.0	0.4	-0.16	0.04	-0.08	-0.05	-0.77	0.39	0.46	-0.24	-0.29	0.26	0.13	-0.41	-0.28	-0.35	-1.29	-0.68	-0.81	-0.76	-0.58	-0.82	0.56	0.14	0.08
Lsat_1_v5_gn_2_99620.1	0.97	0.11	1.09	2.35	0.81	-	0.76	-0.12	-	0.45	-	-0.01	1.07	-	-	0.41	-0.65	0.44	-1.54	-	-0.11	-	-1.41	-1.62	-	-1.53	-0.35	-1.86	0.83	0.87	0.68
Lsat_1_v5_gn_3_115221.1 (IQD5)	-0.03	0.02	0.5	0.63	0.04	0.06	-0.04	-0.27	0.1	0.12	0.21	0.06	-0.16	0.07	0.01	-0.0	-0.19	-0.3	-0.21	-0.33	-0.31	-0.15	-0.06	-0.23	-0.21	-0.02	-0.16	-0.14	-0.03	0.16	0.31
Lsat_1_v5_gn_3_12840.1	0.31	-0.2	-0.19	-0.23	-0.11	0.01	-0.46	-0.27	-0.38	-0.35	-0.39	-0.29	0.2	0.1	-0.22	-0.4	-0.33	0.54	0.02	0.02	0.28	0.31	-0.21	0.26	0.3	0.28	0.28	0.39	-0.01	-0.03	-0.03
Lsat_1_v5_gn_3_12861.1 (ABIL3)	0.34	-0.38	0.97	1.16	1.25	0.38	-0.37	-0.1	-0.2	-0.05	0.16	0.14	-1.07	0.66	0.15	-0.64	-0.75	0.13	-0.16	-0.63	-0.31	-0.16	-0.14	-0.85	-0.71	-0.51	-0.61	-0.3	-0.02	-0.55	-0.55
Lsat_1_v5_gn_3_1361.1 (AZI5)	0.15	0.29	1.16	1.49	-0.14	0.71	-0.06	0.24	-0.65	-0.4	-0.18	-0.41	-0.67	-1.2	-1.63	0.21	-0.23	-0.58	-0.64	-0.5	0.04	0.25	-0.12	-0.59	0.1	0.41	0.39	0.26	-0.34	-0.57	-1.71
Lsat_1_v5_gn_3_27720.1	0.22	0.09	1.09	1.49	0.34	-0.12	-0.84	-0.42	-0.19	-0.03	0.18	0.12	-0.56	0.17	-0.15	-0.35	-0.52	-0.09	-0.55	-0.6	-0.67	-0.6	0.0	-0.66	-0.52	-0.45	-0.37	-0.7	0.01	0.33	0.85
Lsat_1_v5_gn_3_28400.1 (HDH)	0.95	-2.58	2.14	2.33	-1.2	-0.67	-0.18	0.03	-0.46	0.39	-0.04	-2.04	0.88	-1.04	0.4	-1.46	-0.32	-1.75	-3.82	-	-2.25	-1.62	1.75	-0.96	-2.7	-1.2	-3.44	-0.91	-1.69	-1.75	0.87
Lsat_1_v5_gn_3_40341.1 (WIP1)	0.76	-0.49	1.48	1.68	0.45	0.18	-0.37	-0.67	-0.27	-0.26	0.15	-0.49	-1.01	-0.88	-0.65	-0.65	-1.09	-1.52	-0.1	-0.47	0.15	0.35	-2.38	-1.01	-0.3	-0.22	-0.11	-0.48	0.86	0.52	-0.36
Lsat_1_v5_gn_3_40361.1 (WIP1)	1.86	0.16	1.76	1.75	2.74	1.07	-	-	-1.34	-2.9	-1.26	-0.29	-1.04	0.49	-0.48	-0.85	-3.82	-5.17	-3.67	-1.37	-0.95	-0.47	-1.02	-1.54	-2.05	-1.12	0.27	-1.18	-2.09	-1.5	-2.35
Lsat_1_v5_gn_3_87981.1 (NCH1)	-0.05	-0.07	1.55	1.39	0.08	-0.06	-0.13	-0.79	-0.05	-0.01	-0.04	0.02	-0.34	-1.25	-0.56	0.14	0.16	-1.47	0.01	-0.25	-0.36	-0.13	-0.15	-0.69	-0.47	-0.34	-0.23	-0.22	0.21	0.17	0.06
Lsat_1_v5_gn_4_129640.1 (SD2-5)	0.35	-0.14	0.01	0.64	0.99	0.56	-0.36	-0.38	-1.06	-0.42	-0.53	-0.74	-0.11	1.15	0.74	-0.43	-0.58	1.29	0.03	-0.64	-0.48	0.12	-1.1	-1.06	-0.76	0.16	0.26	0.19	-0.19	-1.24	-1.7
Lsat_1_v5_gn_4_156481.1	0.78	0.76	1.08	1.24	1.79	0.92	-1.42	-0.0	-0.4	-0.44	-0.45	0.38	-0.44	-1.95	-1.88	-0.56	-0.69	-0.62	-0.1	-1.3	0.1	-0.61	-	-0.69	-0.26	0.52	-0.18	0.03	-1.52	-0.41	-0.55
Lsat_1_v5_gn_4_158221.1	0.89	0.05	0.51	0.49	0.96	0.56	-0.74	-0.9	-0.0	-0.13	0.0	-0.04	0.09	-0.06	0.25	-0.16	-0.29	0.32	-0.44	-0.49	-0.22	-0.16	-0.68	-0.39	-0.3	-0.11	-0.11	-0.19	-0.29	-0.18	-0.24
Lsat_1_v5_gn_4_160281.1 (AGL75)	0.68	0.97	1.54	1.98	-0.43	-0.61	-0.54	-0.94	-0.98	-0.31	-0.68	-0.12	0.32	-0.87	-0.19	0.24	-0.7	0.65	-1.25	-1.6	-0.96	-0.25	-1.94	-1.07	-0.63	-0.94	-0.96	-0.92	0.63	0.29	0.34
Lsat_1_v5_gn_4_168581.1 (P44)	0.19	0.27	0.78	0.67	1.2	0.43	0.48	0.64	-0.61	-0.32	-0.2	-0.01	-0.67	0.11	-0.34	-0.39	-0.74	-0.19	-0.81	-0.9	-0.91	-0.53	0.95	-0.71	-0.77	-0.66	-0.46	-0.97	0.23	0.07	0.22
Lsat_1_v5_gn_4_172021.1 (TRM2)	-1.21	-1.26	0.63	1.53	1.09	0.11	-0.82	-2.54	0.37	0.61	0.76	0.61	-0.53	-1.8	-0.87	-0.58	-0.34	-0.46	-0.94	-0.01	0.07	0.49	0.14	-1.23	-0.99	0.0	-0.67	-1.04	0.62	0.44	-0.02
Lsat_1_v5_gn_4_179440.1 (GPAT7)	0.3	-0.84	1.2	2.16	0.69	0.22	0.34	0.73	0.22	0.26	0.48	0.85	0.13	-2.4	-2.02	-1.0	-0.59	-0.94	-1.52	-0.76	0.36	0.32	-1.36	-1.47	-1.9	-1.57	-1.72	-0.6	0.42	-0.65	-2.4
Lsat_1_v5_gn_4_184761.1	0.2	0.56	0.73	0.99	0.25	0.39	0.23	0.3	-0.55	-0.48	-0.06	-0.1	0.13	0.72	0.26	-0.39	-0.48	0.15	-0.27	-0.74	-0.65	-0.51	0.03	-0.28	-0.57	-0.51	-0.4	-0.5	-0.27	-0.13	-0.27
Lsat_1_v5_gn_4_23340.1	0.12	0.51	0.98	1.48	1.1	1.15	-0.35	-0.09	-0.06	0.16	0.12	-0.36	-0.71	-1.04	-1.43	-0.4	-0.74	0.49	-0.68	-0.79	-0.56	-0.63	-1.36	-1.05	-0.58	-0.1	0.09	-1.26	-0.16	-0.08	0.21
Lsat_1_v5_gn_4_33420.1 (TRY)	0.36	0.68	0.34	1.58	1.05	1.4	-1.26	0.03	-0.01	0.06	-0.09	0.13	-1.45	-1.55	-0.95	0.15	-0.93	-3.36	-1.28	-0.79	-0.54	0.45	-0.19	-0.94	-0.09	-0.07	-0.14	-0.03	-0.01	-0.0	-1.08
Lsat_1_v5_gn_4_33860.1 (NDHH)	-1.23	1.23	1.78	2.33	-0.32	-2.93	0.99	-0.05	-0.76	0.26	0.66	0.14	-3.89	-	-0.38	-0.79	-0.12	1.72	-6.89	-7.93	-0.36	0.13	-	-2.22	-0.07	0.61	-26.01	-1.21	-0.84	-2.35	-
Lsat_1_v5_gn_4_3821.1	0.23	0.02	0.02	-0.0	0.34	0.52	-0.15	-0.1	-0.47	-0.3	-0.16	-0.21	0.12	0.12	-0.18	-0.24	-0.38	0.17	-0.02	-0.16	-0.04	0.01	-0.12	0.07	0.2	0.06	0.03	0.09	-0.05	0.06	0.08
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.