Heatmap: Cluster_117 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.54 0.28 0.86 0.81 0.58 0.22 -0.6 -1.05 -0.06 0.04 0.09 -0.06 -0.11 -0.42 -0.41 -0.34 -0.41 -0.1 -0.53 -0.38 -0.19 -0.11 0.53 -0.55 -0.28 -0.41 -0.4 -0.49 0.24 0.15 0.4
-3.49 -1.33 0.5 1.45 -0.03 -0.29 -0.66 -0.12 0.01 0.15 0.61 -0.24 0.13 0.06 0.16 -0.18 -0.01 0.12 -0.85 -0.39 -0.32 -0.21 -5.44 -0.83 -0.77 0.1 -1.18 -1.51 0.82 1.05 1.3
0.4 0.38 0.42 0.62 0.08 -0.25 -0.22 0.27 -0.12 -0.2 0.19 -0.07 -0.46 -0.16 -0.14 -0.52 -0.64 -1.08 -0.39 -0.18 -0.36 -0.15 0.5 0.19 -0.09 -0.18 -0.33 -0.33 0.14 0.36 0.7
0.54 0.45 0.01 0.36 1.05 0.52 0.04 -0.04 -0.09 -0.14 -0.06 -0.28 -0.3 -0.14 0.23 -0.11 -0.61 0.42 -0.35 -0.5 -0.35 -0.24 0.45 -0.57 -0.37 -0.29 -0.31 -0.31 0.1 -0.19 -0.68
0.14 -0.16 0.89 1.18 0.44 0.12 -0.72 -1.96 0.17 0.18 0.57 0.12 -0.7 -0.63 -0.6 -0.22 -0.5 0.39 -0.63 -0.39 -0.34 -0.28 0.91 -0.71 -0.35 0.22 0.07 -0.3 -0.04 -0.19 -0.31
-0.23 -0.26 1.13 1.92 1.28 0.57 -0.41 -0.85 -0.4 -0.48 -0.1 -0.6 -1.28 -1.75 -1.36 -0.44 -1.08 2.03 -1.08 -0.89 -0.25 0.01 -1.49 -1.11 -1.0 -0.29 -0.4 -1.03 0.05 -0.7 -0.43
0.17 -1.22 0.51 1.15 0.59 0.46 -0.91 -1.57 0.04 0.6 0.27 -0.11 -0.3 -0.97 -0.76 -0.07 0.24 0.06 -0.7 -0.22 -0.28 -0.94 -0.9 -0.07 -0.2 0.48 -0.12 -0.79 0.42 0.24 0.76
-0.14 -0.64 -0.67 -0.04 1.5 0.63 -1.52 -1.62 -0.2 -0.3 0.12 -0.16 -0.54 0.36 0.59 0.3 -0.19 -0.17 -0.3 -0.72 -0.16 -0.29 0.56 -0.51 -0.21 -0.41 -0.42 -0.16 0.74 0.56 -0.06
0.22 0.1 1.62 1.95 -0.39 -0.39 -0.01 -0.01 -0.4 -0.53 -0.32 -0.49 -0.53 -0.18 0.31 -0.04 0.0 -0.56 -0.81 -1.15 -0.56 -0.71 -0.77 -1.14 -0.34 -0.27 -0.6 -0.81 -0.16 0.28 0.65
-0.8 0.29 1.34 1.77 0.33 0.57 -0.12 -0.25 -0.35 -0.19 -0.7 -0.36 -1.56 0.24 -0.01 -0.29 -0.57 0.61 -0.27 -0.76 -0.57 -0.45 -0.47 -0.38 -0.7 0.07 -0.51 -1.16 0.26 -0.31 0.04
-0.21 -0.35 -0.02 0.48 0.08 0.31 -0.07 0.07 0.02 -0.01 0.2 -0.02 -0.1 0.61 0.54 -0.19 -0.11 -1.57 -0.23 -0.41 -0.34 -0.26 0.19 -0.27 -0.17 -0.16 -0.11 -0.49 0.34 0.34 0.41
0.14 -0.78 0.49 0.56 0.45 -0.02 -0.24 -1.13 0.41 0.46 0.53 0.37 -0.35 -0.59 -0.17 0.23 -0.18 -2.31 -0.41 -0.35 -0.1 -0.0 0.02 -0.29 -0.09 -0.13 -0.19 -0.22 0.61 0.69 -0.47
-0.01 0.57 1.39 1.67 0.3 0.31 -0.84 0.2 -0.73 -0.39 -0.52 -0.17 0.14 0.56 -0.7 0.02 -0.27 -1.84 -0.37 -0.78 -0.29 -0.1 -2.87 -0.72 -0.2 0.1 0.02 0.21 0.07 -0.23 -1.27
0.88 0.4 1.02 0.93 1.5 0.45 -0.12 -0.18 -0.5 -0.42 -0.26 -0.04 -0.12 -0.07 -0.28 -0.44 -0.45 0.14 -0.48 -0.96 -0.6 -0.8 -0.18 -0.65 -0.66 -0.37 -0.63 -0.15 -0.52 -0.44 -0.0
-0.29 0.2 0.81 1.17 0.02 -0.18 -0.21 -0.84 -0.18 0.29 0.02 0.43 0.11 -0.11 0.22 -0.7 -0.43 -0.18 -0.29 -0.5 -0.21 -0.82 0.6 -0.45 -0.35 -0.25 -0.38 -0.74 0.1 0.11 0.57
0.04 -0.04 0.87 1.12 0.25 0.01 0.0 0.4 -0.16 0.04 -0.08 -0.05 -0.77 0.39 0.46 -0.24 -0.29 0.26 0.13 -0.41 -0.28 -0.35 -1.29 -0.68 -0.81 -0.76 -0.58 -0.82 0.56 0.14 0.08
0.97 0.11 1.09 2.35 0.81 - 0.76 -0.12 - 0.45 - -0.01 1.07 - - 0.41 -0.65 0.44 -1.54 - -0.11 - -1.41 -1.62 - -1.53 -0.35 -1.86 0.83 0.87 0.68
-0.03 0.02 0.5 0.63 0.04 0.06 -0.04 -0.27 0.1 0.12 0.21 0.06 -0.16 0.07 0.01 -0.0 -0.19 -0.3 -0.21 -0.33 -0.31 -0.15 -0.06 -0.23 -0.21 -0.02 -0.16 -0.14 -0.03 0.16 0.31
0.31 -0.2 -0.19 -0.23 -0.11 0.01 -0.46 -0.27 -0.38 -0.35 -0.39 -0.29 0.2 0.1 -0.22 -0.4 -0.33 0.54 0.02 0.02 0.28 0.31 -0.21 0.26 0.3 0.28 0.28 0.39 -0.01 -0.03 -0.03
0.34 -0.38 0.97 1.16 1.25 0.38 -0.37 -0.1 -0.2 -0.05 0.16 0.14 -1.07 0.66 0.15 -0.64 -0.75 0.13 -0.16 -0.63 -0.31 -0.16 -0.14 -0.85 -0.71 -0.51 -0.61 -0.3 -0.02 -0.55 -0.55
0.15 0.29 1.16 1.49 -0.14 0.71 -0.06 0.24 -0.65 -0.4 -0.18 -0.41 -0.67 -1.2 -1.63 0.21 -0.23 -0.58 -0.64 -0.5 0.04 0.25 -0.12 -0.59 0.1 0.41 0.39 0.26 -0.34 -0.57 -1.71
0.22 0.09 1.09 1.49 0.34 -0.12 -0.84 -0.42 -0.19 -0.03 0.18 0.12 -0.56 0.17 -0.15 -0.35 -0.52 -0.09 -0.55 -0.6 -0.67 -0.6 0.0 -0.66 -0.52 -0.45 -0.37 -0.7 0.01 0.33 0.85
0.95 -2.58 2.14 2.33 -1.2 -0.67 -0.18 0.03 -0.46 0.39 -0.04 -2.04 0.88 -1.04 0.4 -1.46 -0.32 -1.75 -3.82 - -2.25 -1.62 1.75 -0.96 -2.7 -1.2 -3.44 -0.91 -1.69 -1.75 0.87
0.76 -0.49 1.48 1.68 0.45 0.18 -0.37 -0.67 -0.27 -0.26 0.15 -0.49 -1.01 -0.88 -0.65 -0.65 -1.09 -1.52 -0.1 -0.47 0.15 0.35 -2.38 -1.01 -0.3 -0.22 -0.11 -0.48 0.86 0.52 -0.36
1.86 0.16 1.76 1.75 2.74 1.07 - - -1.34 -2.9 -1.26 -0.29 -1.04 0.49 -0.48 -0.85 -3.82 -5.17 -3.67 -1.37 -0.95 -0.47 -1.02 -1.54 -2.05 -1.12 0.27 -1.18 -2.09 -1.5 -2.35
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0.35 -0.14 0.01 0.64 0.99 0.56 -0.36 -0.38 -1.06 -0.42 -0.53 -0.74 -0.11 1.15 0.74 -0.43 -0.58 1.29 0.03 -0.64 -0.48 0.12 -1.1 -1.06 -0.76 0.16 0.26 0.19 -0.19 -1.24 -1.7
0.78 0.76 1.08 1.24 1.79 0.92 -1.42 -0.0 -0.4 -0.44 -0.45 0.38 -0.44 -1.95 -1.88 -0.56 -0.69 -0.62 -0.1 -1.3 0.1 -0.61 - -0.69 -0.26 0.52 -0.18 0.03 -1.52 -0.41 -0.55
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0.68 0.97 1.54 1.98 -0.43 -0.61 -0.54 -0.94 -0.98 -0.31 -0.68 -0.12 0.32 -0.87 -0.19 0.24 -0.7 0.65 -1.25 -1.6 -0.96 -0.25 -1.94 -1.07 -0.63 -0.94 -0.96 -0.92 0.63 0.29 0.34
0.19 0.27 0.78 0.67 1.2 0.43 0.48 0.64 -0.61 -0.32 -0.2 -0.01 -0.67 0.11 -0.34 -0.39 -0.74 -0.19 -0.81 -0.9 -0.91 -0.53 0.95 -0.71 -0.77 -0.66 -0.46 -0.97 0.23 0.07 0.22
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0.2 0.56 0.73 0.99 0.25 0.39 0.23 0.3 -0.55 -0.48 -0.06 -0.1 0.13 0.72 0.26 -0.39 -0.48 0.15 -0.27 -0.74 -0.65 -0.51 0.03 -0.28 -0.57 -0.51 -0.4 -0.5 -0.27 -0.13 -0.27
0.12 0.51 0.98 1.48 1.1 1.15 -0.35 -0.09 -0.06 0.16 0.12 -0.36 -0.71 -1.04 -1.43 -0.4 -0.74 0.49 -0.68 -0.79 -0.56 -0.63 -1.36 -1.05 -0.58 -0.1 0.09 -1.26 -0.16 -0.08 0.21
0.36 0.68 0.34 1.58 1.05 1.4 -1.26 0.03 -0.01 0.06 -0.09 0.13 -1.45 -1.55 -0.95 0.15 -0.93 -3.36 -1.28 -0.79 -0.54 0.45 -0.19 -0.94 -0.09 -0.07 -0.14 -0.03 -0.01 -0.0 -1.08
-1.23 1.23 1.78 2.33 -0.32 -2.93 0.99 -0.05 -0.76 0.26 0.66 0.14 -3.89 - -0.38 -0.79 -0.12 1.72 -6.89 -7.93 -0.36 0.13 - -2.22 -0.07 0.61 -26.01 -1.21 -0.84 -2.35 -
0.23 0.02 0.02 -0.0 0.34 0.52 -0.15 -0.1 -0.47 -0.3 -0.16 -0.21 0.12 0.12 -0.18 -0.24 -0.38 0.17 -0.02 -0.16 -0.04 0.01 -0.12 0.07 0.2 0.06 0.03 0.09 -0.05 0.06 0.08
-0.01 0.76 1.35 1.8 0.98 1.0 -0.04 0.63 -0.88 0.06 -0.07 -0.45 -1.67 -2.87 -1.53 -0.2 -0.49 -1.14 -1.17 -0.57 -0.11 -0.05 0.63 -1.98 -0.72 -0.42 -0.19 -0.06 -0.14 -0.66 -3.21
-0.8 -1.03 0.13 0.73 0.5 -0.33 -0.66 -1.52 0.2 0.48 0.5 0.25 -0.23 0.24 0.32 -0.22 -0.36 0.24 -0.05 -0.36 -0.32 -0.1 0.24 -0.68 -0.33 -0.18 -0.43 -0.29 0.11 0.34 0.9
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0.17 -0.05 0.47 0.9 0.45 0.27 0.03 -0.04 -0.09 -0.05 -0.05 -0.02 -0.42 0.19 -0.11 -0.31 -0.29 -0.01 -0.39 -0.31 -0.15 -0.02 0.32 -0.54 -0.49 -0.11 -0.3 -0.42 0.35 0.0 -0.15
-1.16 -0.13 1.44 1.86 -1.23 -0.53 -0.05 -1.37 0.15 0.22 0.11 -0.02 -0.28 -2.59 -1.6 0.13 0.11 -0.2 -1.04 -0.46 -0.46 -0.51 1.33 -0.56 -0.02 0.05 -0.46 -0.59 -0.25 0.22 -0.24
-0.24 -0.39 0.5 0.72 1.07 0.21 -0.49 0.14 -0.15 -0.04 0.12 0.3 -0.27 -0.94 -0.81 -0.16 -0.12 0.8 -0.16 -0.27 -0.09 0.05 -0.98 -0.14 -0.09 0.02 0.06 -0.17 -0.13 -0.29 -0.19
-0.85 -0.7 1.69 1.55 1.02 0.74 -0.29 -0.52 -0.05 0.37 -0.12 -0.08 -1.58 -1.21 -0.32 -0.09 0.23 -2.16 -0.68 -0.31 0.37 0.0 -2.41 -1.6 -1.09 -0.96 -0.92 -1.58 1.24 0.3 -0.42
0.37 0.09 -0.1 0.26 0.89 1.05 -0.18 -0.59 -0.97 -0.11 -0.57 -1.34 -0.31 1.27 0.13 -0.6 -0.75 0.84 -1.08 -1.32 -0.84 0.35 -2.13 -0.33 0.63 0.24 -0.06 0.1 0.35 -0.15 -1.02
-0.17 0.12 0.61 1.27 0.21 0.43 -0.14 -0.29 -0.42 -0.02 0.15 -0.23 -0.76 -0.26 0.27 -0.05 -0.36 -1.2 -0.12 -0.25 -0.32 -0.55 0.92 -0.7 -0.35 -0.18 -0.45 -1.09 0.17 0.47 0.31
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-0.34 -0.04 -0.13 -0.18 0.72 0.88 -0.53 0.17 -0.44 -0.4 -0.29 -0.17 -0.53 -0.15 -0.53 -0.24 -0.57 0.98 0.63 -0.57 -0.21 0.03 -1.77 -0.03 -0.04 -0.04 0.1 -0.1 0.74 0.38 -0.2
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-0.17 -0.23 2.52 2.79 -0.01 -0.17 -2.69 -1.79 -0.02 -0.3 -0.21 -0.68 -4.13 -1.21 -1.5 0.03 -0.29 - -0.5 -0.91 -0.13 -1.07 -4.08 -1.46 -0.22 -0.97 0.51 -1.16 -0.92 -0.13 -0.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.