Heatmap: Cluster_146 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11900.1 (GAPC)	1.01	0.31	-0.69	-1.17	-0.25	0.35	-0.32	-0.35	0.0	-0.24	0.22	0.16	-0.68	0.22	-0.45	-0.54	-0.24	0.31	0.24	-0.08	0.12	0.39	0.02	0.25	0.11	0.08	0.11	0.73	-0.62	-0.45	-0.81
Lsat_1_v5_gn_0_23500.1	0.18	0.05	-0.18	-0.11	-0.16	0.07	0.11	0.13	-0.04	-0.02	-0.03	0.14	0.32	0.03	-0.24	-0.28	-0.07	-1.62	-0.37	0.02	0.09	0.22	-0.35	0.41	0.22	0.15	0.15	0.47	-0.06	-0.15	-0.17
Lsat_1_v5_gn_0_2440.1 (NTF2A)	-0.18	-0.53	-0.38	-0.4	0.09	0.16	-0.49	-0.45	-0.12	-0.16	-0.11	0.1	0.64	0.57	0.26	0.16	0.07	-0.02	-0.12	-0.06	-0.02	0.01	0.11	-0.01	0.01	0.01	0.04	0.3	-0.02	-0.15	-0.07
Lsat_1_v5_gn_0_31521.1	1.85	-0.62	-0.97	-1.67	0.4	1.19	-0.93	-1.14	-0.57	-0.13	-0.77	-0.08	0.16	-0.75	-0.1	-0.71	-0.6	-1.51	0.51	0.03	0.14	0.48	-1.17	0.01	-0.15	0.0	0.69	1.69	-1.7	-2.57	-1.56
Lsat_1_v5_gn_1_33641.1 (BOR4)	1.72	-0.73	-0.5	-0.83	1.35	1.19	-0.08	-0.13	-0.44	-0.46	-0.16	-0.48	-0.8	-0.11	-0.11	-0.2	-0.19	-4.65	-0.73	-0.1	0.59	0.5	-4.18	-0.42	-0.17	0.54	0.52	1.43	-3.21	-4.77	-7.25
Lsat_1_v5_gn_1_39801.1 (PPR2)	-0.09	-0.47	-0.53	-0.26	-0.05	0.16	-0.55	-0.66	-0.25	-0.28	-0.11	0.04	0.97	0.15	0.08	0.14	0.18	-0.91	-0.2	-0.01	0.14	0.08	-1.08	0.23	0.2	-0.09	-0.06	0.47	0.28	0.01	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_40281.1 (mtLPD2)	0.38	-0.06	-0.57	-1.18	-0.41	-0.11	0.15	0.35	-0.01	-0.12	-0.02	0.07	0.21	-0.38	-0.26	0.02	0.19	-0.51	0.24	0.24	0.21	0.25	-0.32	0.41	0.27	0.1	0.14	0.3	-0.34	-0.17	-0.2
Lsat_1_v5_gn_2_105921.1 (ARF4)	0.89	-0.12	0.56	0.02	0.27	0.17	-0.16	-0.28	-0.2	-0.62	-0.4	-0.25	0.54	0.55	0.21	-0.12	-0.12	-0.71	-0.23	-0.23	-0.27	-0.17	-0.42	-0.43	-0.41	-0.07	0.03	-0.06	-0.08	0.0	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_22961.1	-0.64	-0.85	-1.56	-1.33	-0.44	-1.3	-0.22	-0.82	0.34	0.22	0.13	0.07	0.39	-1.19	0.65	0.47	0.68	-1.33	0.47	0.67	0.5	-0.03	-2.73	0.25	-0.25	0.39	0.15	0.58	0.16	0.51	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_31480.1 (HISN5B)	0.16	-0.24	-0.18	-0.37	-0.11	0.01	0.05	0.15	0.03	-0.0	0.06	0.28	0.46	-0.05	-0.13	-0.1	0.09	-1.05	-0.07	-0.07	-0.06	0.09	-0.37	0.26	0.13	0.1	0.1	0.34	-0.15	-0.07	0.04
Lsat_1_v5_gn_2_35940.1	0.59	0.07	-0.13	-0.19	0.08	0.17	-0.27	-0.23	-0.02	-0.05	0.07	0.15	0.25	0.23	0.05	-0.15	0.01	-1.88	0.22	0.0	0.02	0.01	-0.45	0.22	0.13	-0.0	0.07	0.22	-0.06	-0.15	-0.21
Lsat_1_v5_gn_2_52961.1 (CYP76C3)	1.33	0.93	-1.55	-1.67	0.79	1.05	0.42	0.99	-0.31	-2.72	0.43	-2.17	-0.58	-2.5	-0.29	-0.96	-1.35	-	0.65	0.75	-0.31	0.92	-	-1.14	-0.16	0.56	0.57	1.34	-1.05	-1.21	-
Lsat_1_v5_gn_2_69461.1 (DHAR3)	0.11	-0.22	-0.27	-0.19	-0.31	-0.31	-0.12	0.06	0.07	0.07	0.16	0.38	0.58	-0.24	-0.25	-0.09	0.27	-0.67	-0.1	0.03	-0.02	0.05	0.2	0.33	0.14	-0.16	-0.1	0.3	-0.3	-0.11	0.04
Lsat_1_v5_gn_2_76660.1	-0.7	-1.2	-1.01	-0.56	-0.26	0.24	-0.37	-0.45	-0.14	-0.16	-0.02	0.2	0.54	0.42	0.21	0.29	0.3	-0.27	0.33	0.26	0.09	0.12	-0.18	-0.12	0.24	0.48	0.15	0.22	-0.36	-0.08	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_81581.1	-0.06	-0.23	-0.23	-0.32	0.07	0.09	-0.11	-0.06	-0.06	-0.03	0.04	0.04	0.52	0.09	0.21	0.08	0.06	0.17	0.06	-0.07	0.03	0.0	-0.73	-0.02	-0.01	0.05	-0.01	0.03	-0.04	-0.06	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_84360.1	-1.63	-3.2	-2.79	-2.28	-1.23	-0.07	-0.78	-1.11	-0.78	-0.71	-0.17	-0.5	1.5	0.03	0.42	0.81	0.88	0.63	-0.07	0.55	0.4	0.66	-2.05	0.11	0.39	0.59	0.43	0.76	-1.99	-1.27	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_88561.1 (VDAC1)	0.41	-0.19	-0.56	-0.84	-0.05	0.09	-0.06	-0.1	-0.01	-0.11	-0.03	0.1	0.31	-0.17	0.0	0.04	0.2	-0.39	0.01	0.14	0.18	0.23	-0.33	0.34	0.18	0.06	0.11	0.4	-0.35	-0.25	-0.14
Lsat_1_v5_gn_2_89521.1	0.72	0.17	0.73	-0.02	0.42	0.18	-0.42	-0.61	-0.58	-0.3	-0.44	-0.36	0.51	-0.19	-0.24	0.37	0.23	-0.45	-0.99	-0.48	-0.28	-0.02	-0.51	-0.13	-0.16	0.11	0.01	0.13	0.21	0.17	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_91041.1 (CP31B)	-0.35	-1.5	-1.74	-1.68	0.27	0.54	-1.5	-1.28	-0.3	-0.32	0.1	0.11	1.23	0.68	-0.43	-0.04	0.01	-1.97	0.03	-0.19	0.02	0.31	-1.28	0.65	0.48	0.24	0.35	1.04	-0.39	-0.27	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_108980.1 (HDC1)	0.11	-0.08	-0.24	-0.27	0.25	0.22	-0.14	-0.43	-0.04	-0.04	0.07	0.27	0.3	0.27	-0.03	0.06	-0.02	-1.23	-0.09	0.12	-0.02	-0.02	0.04	0.19	0.12	0.07	-0.01	0.28	-0.08	-0.23	-0.11
Lsat_1_v5_gn_3_3401.1 (CLP2)	0.1	-0.12	-0.12	-0.11	0.21	0.18	0.02	-0.13	-0.09	0.0	-0.01	-0.04	0.5	0.44	0.03	-0.12	-0.04	-0.88	-0.15	-0.02	-0.08	0.0	-0.15	0.16	0.07	-0.09	-0.14	0.3	-0.19	-0.22	0.1
Lsat_1_v5_gn_3_46200.1 (Tic20-II)	-0.16	-0.26	-0.59	-0.53	-0.56	-0.37	-0.36	-0.38	0.06	0.1	0.09	0.32	0.75	0.2	-0.1	-0.02	0.2	-0.79	-0.1	-0.05	0.17	0.08	0.01	0.4	0.21	0.09	0.02	0.17	0.01	0.08	0.22
Lsat_1_v5_gn_3_50900.1 (KDR)	-0.05	0.07	-0.75	-1.55	0.09	-0.18	0.17	-0.39	0.06	0.16	0.13	0.09	-0.18	-0.96	0.31	0.32	0.54	-2.63	0.4	0.78	0.39	0.12	-2.49	0.13	0.16	0.38	0.34	0.72	-0.23	-0.16	-0.71
Lsat_1_v5_gn_3_69860.1 (CTI1)	-0.25	-0.47	-0.39	-0.51	0.31	0.33	-0.12	-0.24	-0.06	-0.04	0.03	-0.04	0.22	0.41	0.21	0.05	-0.03	-0.94	0.16	0.07	-0.01	0.07	-0.33	0.21	0.19	0.04	0.12	-0.02	0.01	0.05	0.22
Lsat_1_v5_gn_3_74081.1 (PIN1AT)	-0.04	-0.24	-0.36	-0.48	0.22	0.27	-0.09	-0.09	-0.18	-0.16	-0.12	0.03	0.43	0.09	0.11	0.14	0.1	-0.26	0.07	0.05	0.1	0.06	-0.45	0.05	0.15	0.1	0.09	0.19	-0.14	-0.1	0.01
Lsat_1_v5_gn_3_75020.1 (FOLT1)	-0.32	-0.5	-0.33	-0.42	0.22	-0.01	-0.22	-0.36	-0.16	0.02	-0.12	-0.03	0.31	0.52	0.47	0.05	0.11	-0.58	0.06	0.01	-0.01	0.04	-0.49	0.04	0.15	0.07	0.02	0.02	0.16	0.16	0.34
Lsat_1_v5_gn_3_76061.1	1.0	0.26	0.2	0.15	0.31	-0.15	-0.26	0.19	0.02	-0.05	0.11	0.33	0.19	-0.93	-0.95	-0.43	-0.05	-0.67	0.87	0.22	-0.15	-0.19	-1.49	0.25	0.01	-0.3	-0.17	0.82	-0.6	-0.66	-0.96
Lsat_1_v5_gn_4_109761.1 (EIF5A)	0.18	-0.02	0.06	0.15	0.15	0.29	-0.26	-0.21	-0.19	-0.18	-0.12	-0.06	0.45	0.01	-0.19	0.09	-0.02	-0.17	-0.31	-0.17	-0.03	-0.0	-0.22	-0.04	0.04	0.07	0.08	0.24	0.01	-0.02	0.07
Lsat_1_v5_gn_4_11141.1 (LOF2)	-	-	-3.64	-2.94	-0.03	0.53	-0.6	-1.4	-0.38	-0.14	-0.55	-0.18	0.83	-0.62	0.22	0.61	0.64	-0.07	-0.03	0.14	0.51	0.74	-1.78	-0.24	0.71	0.62	0.91	0.33	0.35	-0.11	0.7
Lsat_1_v5_gn_4_117260.1 (H1.1)	-1.21	-0.71	-1.21	-1.22	0.01	0.28	-0.24	-0.49	0.1	0.22	0.19	0.18	1.26	0.26	0.49	0.39	0.2	-0.64	-0.19	-0.12	0.01	0.0	-0.23	-0.02	0.04	-0.05	0.01	-0.18	0.08	0.05	0.14
Lsat_1_v5_gn_4_124421.1 (CYP77B1)	-2.56	-2.77	-2.25	-2.41	-0.66	-0.42	-1.14	-1.08	-0.68	-0.32	-0.44	0.11	0.84	1.23	0.81	0.61	0.75	-0.55	0.68	0.24	0.01	0.36	-4.33	0.39	0.32	0.54	0.36	0.37	-0.29	0.0	0.51
Lsat_1_v5_gn_4_12981.1	1.0	0.01	-0.17	-0.81	1.38	1.1	-0.24	-0.81	-0.26	-0.66	-0.23	-1.2	-0.67	0.5	0.77	-0.23	-0.62	-1.5	-0.04	-0.61	0.5	0.38	-0.63	-0.33	-0.2	0.51	0.44	0.49	-0.74	-1.13	-3.16
Lsat_1_v5_gn_4_137741.1 (ALX8)	0.13	-0.36	-0.5	-0.53	-0.01	0.11	-0.1	-0.62	-0.2	-0.07	-0.03	-0.01	0.69	0.43	0.26	0.15	0.21	-0.67	0.18	0.03	-0.0	0.09	-0.44	0.21	0.12	0.0	-0.04	0.44	-0.22	-0.39	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_138241.1 (FBN5)	-1.03	-1.75	-2.2	-1.6	0.1	0.67	-0.83	-1.09	-0.29	-0.12	-0.1	0.08	0.86	0.9	0.09	0.36	0.39	-1.52	0.48	0.04	0.05	0.27	-1.49	0.44	0.26	0.29	0.21	0.53	-0.31	-0.19	0.56
Lsat_1_v5_gn_4_164600.1 (LEJ2)	0.34	0.11	-0.03	0.12	0.08	0.06	-0.25	-0.06	0.01	-0.03	0.16	0.31	0.23	0.08	-0.17	-0.3	-0.03	-1.16	-0.09	-0.05	0.05	0.03	-0.53	0.32	0.16	0.1	0.12	0.37	-0.3	-0.21	-0.24
Lsat_1_v5_gn_4_178361.1 (DEG8)	0.33	-1.11	-1.11	-1.38	0.82	0.49	-0.7	-1.04	-0.09	-0.14	-0.03	-0.1	0.98	0.46	-0.06	0.08	0.22	-2.27	-0.24	-0.12	0.07	0.34	-1.02	0.15	0.31	-0.04	0.11	1.04	-0.48	-0.69	0.38
Lsat_1_v5_gn_4_39741.1 (NRG2)	-0.63	-0.69	-0.34	-0.53	-0.08	0.18	-0.54	-1.06	-0.15	-0.19	0.01	-0.0	-0.01	0.74	0.34	0.4	0.31	-0.55	0.26	0.07	0.17	0.22	-0.66	0.05	0.07	0.37	0.31	0.04	-0.12	-0.04	0.42
Lsat_1_v5_gn_4_43000.1 (MSL1)	0.27	-0.19	-0.22	-0.16	0.51	0.36	-0.2	-0.27	-0.02	0.03	0.03	0.1	0.36	-0.08	-0.14	-0.01	0.07	-1.67	-0.16	-0.13	-0.03	0.09	-0.19	0.14	0.07	0.02	0.03	0.44	-0.02	-0.08	-0.06
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.