Heatmap: Cluster_86 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_19981.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	1.0
Lsat_1_v5_gn_1_107960.1 (RPN2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_107821.1 (CAP-G)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_109520.1	0.04	0.0	0.15	0.18	0.26	0.12	0.6	0.63	0.65	0.37	0.27	0.36	0.73	0.23	0.79	0.52	0.67	0.35	1.0	0.62	0.43	0.28	0.14	0.37	0.12	0.4	0.44	0.46	0.44	0.41	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_73780.1 (CHX15)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_122221.1 (CTPS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_4521.1 (EXP7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_74940.1 (GLT1)	0.0	0.0	0.0	0.24	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32
Lsat_1_v5_gn_3_79340.1 (LEW3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.95
Lsat_1_v5_gn_3_82280.1 (AtSEC23B)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_102100.1 (PSBD)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_104681.1 (BOR4)	0.03	0.49	0.0	0.39	0.33	0.26	0.12	0.07	0.34	0.45	1.0	0.36	0.2	0.16	0.25	0.36	0.18	0.07	0.28	0.23	0.34	0.41	0.05	0.21	0.28	0.19	0.15	0.14	0.31	0.38	0.64
Lsat_1_v5_gn_4_11880.1 (TOPII)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.93	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_148300.1 (FAC1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.0	0.45	0.54	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_167101.1 (MDS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	1.0	0.48	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_167940.1	0.0	0.0	0.45	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_177421.1 (AFB2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_182881.1 (ALAAT2)	0.0	0.0	0.53	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	1.0
Lsat_1_v5_gn_4_74080.1 (DOF4.7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_74160.1 (SULTR4;1)	0.0	0.0	0.0	0.13	0.1	0.1	0.24	0.1	0.0	0.18	0.0	0.0	0.65	0.06	0.12	0.18	0.16	0.42	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.05	0.21	0.23	0.2	0.21	1.0	0.2	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_75340.1 (KJK)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_133480.1 (SNAP29)	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.52	0.55	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_135141.1 (PKS2)	0.19	0.37	0.0	0.41	0.4	0.32	0.16	0.26	0.34	0.6	0.63	0.52	0.53	0.42	0.5	0.28	0.52	0.24	0.49	0.42	0.11	0.61	0.18	0.45	0.27	0.64	0.57	0.18	0.6	0.52	1.0
Lsat_1_v5_gn_5_149360.1 (OTU1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_158740.1 (NFD3)	0.0	0.15	0.0	0.56	0.11	0.87	0.27	1.0	0.54	0.1	0.0	0.0	0.46	0.49	0.74	0.29	0.22	0.28	0.56	0.28	0.0	0.25	0.7	0.0	0.73	0.0	0.34	0.22	0.77	0.0	0.68
Lsat_1_v5_gn_5_173240.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_181560.1 (BTL08)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_45120.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_64620.1 (NOC4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_84421.1 (G18F)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_86001.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_88040.1 (MTV8)	0.28	0.62	0.37	0.26	0.14	0.33	0.17	0.26	0.35	1.0	0.65	0.96	0.14	0.14	0.1	0.22	0.35	0.0	0.0	0.24	0.33	0.04	0.0	0.54	0.23	0.46	0.2	0.19	0.46	0.98	0.42
Lsat_1_v5_gn_6_116101.1	0.07	0.41	0.14	0.07	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.06	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.28	0.05	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_4541.1	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.23	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.96	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.24	0.0	0.22	0.94	0.0	0.0	0.0	0.73	0.8	1.0
Lsat_1_v5_gn_6_82200.1 (RIC10)	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.42	0.0	0.17	0.76	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.71	0.0	0.16	0.3	0.0	0.0	0.38	0.33	0.5	0.48	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_95021.1	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.04	0.0	0.34	0.19	0.33	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.94	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.34	0.0	0.29	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_16661.1 (PKp3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.31	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.63	0.57	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_2081.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	1.0	0.48	0.97
Lsat_1_v5_gn_7_21001.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_28560.1 (BRP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.67
Lsat_1_v5_gn_7_29041.1 (PAB8)	0.71	0.0	0.0	0.0	0.2	0.2	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_341.1 (RPS12)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_37981.1	0.27	0.0	0.0	0.0	0.61	0.61	0.0	0.69	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.22	0.91	0.47	0.0	0.54	0.0	0.17	0.0	0.58	0.92	0.0	0.38	0.61	0.0	0.0	0.82	0.19	1.0
Lsat_1_v5_gn_7_38001.1	0.27	0.0	0.0	0.0	0.61	0.61	0.0	0.69	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.22	0.91	0.47	0.0	0.54	0.0	0.17	0.0	0.58	0.92	0.0	0.38	0.61	0.0	0.0	0.82	0.19	1.0
Lsat_1_v5_gn_7_55340.1 (ROC7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.54	0.0	0.53
Lsat_1_v5_gn_7_80281.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_96520.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_101460.1 (OPL3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	1.0	0.0	0.3	0.29	0.0	0.0	0.79	0.0	0.72
Lsat_1_v5_gn_8_10660.1	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.52
Lsat_1_v5_gn_8_112340.1 (WOX1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_121760.1 (SAUR75)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_131700.1 (HSC70-7)	0.36	0.42	0.75	0.59	0.6	0.48	0.53	0.92	0.61	0.59	0.75	0.76	0.65	0.74	0.71	0.46	0.63	0.53	0.53	0.44	0.62	0.66	0.51	0.58	0.78	0.64	0.7	0.7	1.0	0.57	0.9
Lsat_1_v5_gn_8_1360.1 (alpha-DOX2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.44	0.38	0.25	0.0	0.0	0.0	0.41	0.14	0.7	0.5	0.23	0.47	1.0	0.78	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.38	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_137021.1 (SEC)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_143660.1 (CYP79A2)	0.33	1.0	0.0	0.32	0.25	0.26	0.0	0.0	0.0	0.47	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.25	0.98	0.94	0.24
Lsat_1_v5_gn_8_19080.1 (CHR)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_46640.1 (UPS1)	0.07	0.73	0.07	0.0	0.2	0.06	0.74	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.14	0.41	0.22	0.0	0.0	0.1	0.29	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_52181.1 (CPK9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_72520.1	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_19160.1 (PRISE)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_24241.1 (COPT1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.87	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23
Lsat_1_v5_gn_9_55180.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_60941.1 (UBP25)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)