Heatmap: Cluster_31 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.33 -0.17 -0.27 -0.33 -0.5 -0.41 0.5 0.62 -0.05 -0.08 -0.09 -0.04 0.56 -0.36 -0.23 0.0 0.24 -1.0 0.01 0.17 0.04 0.03 0.12 0.27 0.13 0.03 0.02 0.33 -0.35 -0.34 -0.38
-0.16 -0.42 -0.6 -0.88 -0.4 -0.04 0.56 0.79 -0.09 -0.15 -0.03 0.12 0.39 0.45 0.36 0.2 0.39 -1.0 -0.21 0.1 0.09 -0.18 -1.14 0.26 0.14 -0.01 -0.06 0.18 -0.09 -0.23 -0.17
0.2 0.22 -0.17 -0.36 -0.37 0.02 0.59 0.9 -0.04 -0.09 -0.03 -0.03 0.0 -0.55 -0.39 0.13 0.19 -2.28 0.16 0.01 0.05 0.12 -0.26 0.07 0.16 0.03 -0.08 -0.1 -0.02 0.05 -0.08
-2.43 -1.18 -3.66 -4.07 -1.51 -0.15 1.22 2.46 -0.94 -0.89 -0.69 -0.28 0.42 0.27 -0.35 0.1 0.61 -0.91 -0.05 0.14 0.09 0.22 -1.33 0.38 0.16 0.08 -0.02 -0.07 -0.81 -0.53 -0.29
0.67 0.53 0.46 0.56 -1.76 -0.65 0.59 0.29 -0.09 0.03 -0.17 0.15 0.53 -1.36 -1.49 0.04 0.42 -3.83 -0.31 0.1 0.2 0.27 -3.45 0.05 0.36 0.5 0.21 0.45 -0.23 -0.11 -0.94
-0.58 -0.38 -0.96 -0.79 -0.66 -0.23 1.17 1.03 0.18 0.29 -0.02 -0.03 -0.07 -0.27 0.05 0.01 0.31 -1.52 -0.1 0.34 0.09 0.12 -0.37 0.08 0.04 0.17 0.05 0.21 -0.15 -0.19 -0.57
0.24 0.11 0.02 -0.25 -0.01 0.24 -0.14 -0.01 -0.19 -0.27 -0.19 -0.2 0.03 0.22 0.05 0.04 -0.02 -0.15 0.02 -0.11 0.14 0.07 -0.18 -0.11 0.04 0.1 0.12 0.13 0.2 0.05 -0.23
-0.28 -0.37 -0.97 -1.36 -0.23 0.14 0.96 1.41 -0.21 -0.28 -0.2 -0.24 0.01 0.0 0.05 0.11 0.11 -0.86 0.17 -0.11 -0.12 -0.08 -0.04 0.05 0.02 -0.1 0.0 -0.09 -0.01 0.03 -0.05
-0.73 -0.42 -1.04 -1.13 -0.78 0.16 1.0 1.16 0.12 0.07 0.13 -0.06 0.21 -0.52 -0.07 0.28 0.27 -2.8 -0.06 0.1 0.19 0.28 -2.63 0.07 0.18 0.37 0.32 0.07 -0.08 0.03 -0.11
-0.13 -0.79 -1.82 -2.33 -0.12 0.49 0.96 1.12 -0.05 -0.23 -0.04 -0.18 -0.26 -0.28 0.07 -0.07 0.08 -1.79 0.56 0.43 0.18 0.25 -1.95 0.51 0.35 0.08 0.19 0.35 -0.16 -0.37 -0.64
0.42 -0.07 -0.54 -0.63 -0.14 0.27 0.44 0.59 -0.11 -0.08 -0.18 -0.06 0.03 0.22 0.02 -0.04 0.13 -2.02 0.24 0.06 0.06 0.16 -1.29 0.15 0.12 0.09 0.14 0.46 -0.05 -0.08 -0.47
0.78 0.02 -0.56 -1.4 -0.67 -0.07 0.69 0.76 -0.17 -0.21 -0.14 0.05 0.2 0.09 0.03 -0.02 0.32 -2.75 0.21 0.35 0.26 0.33 -3.68 0.39 0.27 0.16 0.2 0.73 -0.7 -0.89 -1.11
0.75 0.02 -0.22 -0.3 -0.75 -0.61 0.52 1.06 0.06 0.01 0.09 0.43 0.38 -0.41 -0.29 -0.23 0.11 -1.4 -0.1 0.2 0.16 0.13 -0.73 0.21 0.03 -0.01 -0.09 0.48 -0.63 -0.67 -0.85
-0.05 -0.52 -1.14 -1.2 -0.29 0.37 0.48 0.88 -0.26 -0.25 -0.04 -0.08 0.14 0.34 0.18 -0.01 0.13 -1.79 0.3 0.18 0.1 0.27 -1.08 0.36 0.22 0.23 0.22 0.19 -0.17 -0.22 -0.25
0.59 0.21 -0.31 -0.87 0.01 0.09 0.78 0.95 -0.38 -0.54 -0.16 -0.18 -0.76 0.32 0.45 -0.04 -0.1 -2.49 0.29 0.03 0.0 0.04 -0.13 -0.11 -0.08 -0.0 0.13 0.06 -0.13 -0.17 -0.43
0.43 0.25 -0.28 -0.54 -0.22 0.13 0.73 0.75 0.01 -0.02 -0.07 -0.2 -0.32 -0.32 -0.03 -0.15 -0.01 -3.12 0.19 0.2 0.16 0.19 -2.3 0.24 0.16 0.1 0.12 0.38 0.09 -0.06 -0.55
0.15 -0.12 -0.06 0.04 -0.3 0.09 0.16 0.35 0.04 0.04 -0.01 0.06 0.2 -0.22 -0.3 0.12 0.14 -1.2 -0.13 0.03 0.0 0.21 -0.15 0.11 0.12 0.03 0.04 0.35 -0.12 -0.03 -0.32
0.33 -0.17 -0.27 -0.33 -0.5 -0.41 0.5 0.62 -0.05 -0.08 -0.09 -0.04 0.56 -0.36 -0.23 0.0 0.24 -1.0 0.01 0.17 0.04 0.03 0.12 0.27 0.13 0.03 0.02 0.33 -0.35 -0.34 -0.38
0.2 0.24 0.03 -0.25 -0.12 0.55 0.67 0.62 -0.23 -0.32 -0.2 -0.34 -0.44 -0.12 -0.23 -0.04 -0.08 -2.2 0.17 0.06 0.05 0.31 -2.73 0.16 0.2 0.36 0.31 0.02 -0.0 -0.0 -0.11
-0.35 -0.06 -0.93 -1.93 -2.79 -0.31 1.41 1.69 -0.27 -0.29 -0.3 -0.22 -0.15 -1.58 -0.98 0.26 0.35 -0.85 -0.46 -0.06 0.14 0.13 -0.8 0.01 0.31 0.12 -0.13 -0.1 0.21 0.39 0.52
-0.59 -0.55 -1.38 -2.4 -2.59 -0.3 1.53 1.61 -0.09 -0.36 -0.17 -0.36 -0.35 -1.8 -0.96 0.31 0.37 -0.92 -0.59 0.03 0.22 0.13 -0.59 0.02 0.33 0.19 -0.14 -0.26 0.38 0.55 0.68
-0.01 -0.04 -0.49 -0.8 -0.76 -0.16 0.62 0.38 -0.05 -0.09 -0.07 -0.3 0.15 -0.28 0.26 0.43 0.53 -2.05 0.16 0.37 0.31 0.33 -1.6 -0.01 0.14 0.41 0.37 0.46 -0.12 -0.32 -0.9
1.04 1.18 0.69 -0.29 -0.83 -0.31 0.4 0.13 -0.5 -0.6 -0.47 -0.34 0.25 -0.09 -0.13 0.33 0.4 -1.75 0.0 0.03 -0.1 0.07 -1.83 -0.19 0.08 0.17 0.02 0.18 -0.62 -0.43 -0.37
-0.74 -0.86 -1.23 -1.19 -1.17 -0.64 1.45 1.62 -0.17 0.07 -0.09 -0.21 0.35 -0.46 -0.12 -0.01 0.33 0.23 -0.0 0.3 -0.01 -0.03 -0.29 0.0 0.0 -0.14 -0.17 -0.03 -0.3 -0.2 -0.9
0.55 0.32 -0.76 -2.43 -0.94 0.26 0.91 1.31 -0.31 -0.6 -0.53 -0.59 -0.07 0.27 -0.17 -0.01 -0.05 -9.06 0.45 0.2 0.27 0.22 -6.58 0.25 0.23 0.35 -0.09 0.29 -0.01 -0.18 0.05
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0.17 -0.25 -0.95 -1.35 0.1 0.47 0.78 1.06 -0.17 -0.35 -0.29 -0.54 -0.06 0.08 0.14 0.11 -0.12 -1.14 -0.07 -0.11 0.3 0.17 -0.32 0.02 0.06 0.06 0.18 0.2 0.15 -0.11 -0.6
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1.13 0.19 -0.56 -1.01 -1.14 -1.48 0.49 1.03 0.2 0.39 0.37 0.61 -0.01 -1.25 -0.1 -0.23 0.28 -2.84 0.13 0.58 0.32 0.23 -4.24 0.26 0.04 -0.13 -0.0 0.86 -0.87 -0.78 -1.86
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0.76 0.0 -0.89 -1.78 -0.49 0.06 0.89 1.15 -0.38 -0.56 -0.52 -0.56 0.33 0.36 0.46 -0.0 0.04 -2.26 0.35 0.11 0.1 0.19 -0.2 0.12 0.08 -0.02 -0.04 0.46 -0.47 -0.72 -1.19
0.1 -0.12 -0.29 -0.31 0.23 0.45 0.23 0.31 -0.24 -0.13 -0.14 -0.05 0.15 0.01 -0.23 -0.0 -0.07 -0.22 -0.09 -0.09 0.06 0.14 -0.04 -0.09 0.03 0.14 0.14 0.3 -0.12 -0.2 -0.26
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0.45 0.38 0.14 -0.04 -0.25 -0.06 0.38 0.47 0.04 -0.04 0.01 0.07 -0.15 -0.15 -0.13 -0.1 0.01 -1.85 0.04 0.01 0.04 0.09 -0.54 0.01 0.01 0.09 0.08 -0.05 -0.03 -0.03 -0.14
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-0.34 -0.44 -1.12 -1.56 0.47 1.28 0.89 0.42 -0.08 -0.9 -0.91 -0.28 0.92 -0.48 -0.0 0.12 -0.54 -0.41 -0.29 -1.2 -0.52 0.29 -0.29 0.01 -0.06 0.04 1.0 1.38 -0.99 -1.56 -1.84
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0.36 0.07 -0.62 -1.22 0.14 0.26 0.54 0.74 -0.22 -0.39 -0.25 -0.54 -0.58 0.46 0.44 -0.13 -0.12 -1.48 0.38 -0.02 0.06 0.2 -0.55 0.01 -0.02 0.11 0.14 -0.1 0.2 0.01 -0.01
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-0.5 -0.46 -1.0 -0.42 -0.53 0.02 0.97 1.05 0.26 0.4 0.36 0.15 0.36 -0.4 -0.15 0.37 0.39 -1.32 0.09 0.1 0.28 0.1 -3.06 0.31 0.06 -0.32 -0.05 0.29 -0.66 -0.47 -0.8
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0.46 0.18 -0.25 -0.41 -0.2 0.07 0.33 0.22 0.01 -0.08 -0.01 -0.02 0.07 0.01 -0.08 0.02 0.11 -1.63 -0.01 0.05 0.07 0.17 -0.72 0.11 0.09 0.08 0.07 0.27 0.09 0.05 -0.26
0.34 -0.08 -0.46 -0.65 -0.43 0.32 0.35 0.01 0.31 0.09 0.25 -0.1 -0.34 -1.27 -1.25 0.29 0.27 -6.3 0.17 0.18 0.49 0.49 -2.93 0.31 0.42 0.6 0.47 0.49 -0.09 -0.01 -0.63
-0.31 -0.36 -1.25 -1.52 -1.12 0.05 0.88 1.22 -0.04 -0.02 0.01 0.08 0.48 -0.73 -0.45 0.42 0.5 -3.28 -0.11 0.13 0.17 0.21 -2.28 0.34 0.34 0.22 0.2 0.44 -0.32 -0.06 -0.16
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-0.59 -1.02 -2.51 -3.32 -0.52 0.74 1.46 2.02 -0.75 -0.99 -0.75 -1.08 0.05 0.65 0.52 0.05 -0.14 -2.01 0.37 -0.09 0.11 0.21 -1.39 0.01 0.04 -0.0 0.09 0.11 -0.28 -0.64 -0.95
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0.19 -0.41 -0.91 -1.6 -0.47 0.48 0.65 1.02 -0.35 -0.54 -0.34 -0.42 0.36 0.44 0.31 0.26 0.21 -1.71 0.4 0.06 0.12 0.21 -1.42 0.32 0.16 0.01 0.09 0.09 -0.19 -0.25 -0.31
0.4 -0.06 0.1 0.24 -0.01 0.17 0.22 0.18 0.02 -0.02 0.01 -0.03 0.28 -0.94 -0.75 0.06 0.19 -2.33 -0.31 0.03 0.18 0.18 -0.44 0.27 0.27 0.25 0.2 0.46 -0.25 -0.17 -0.61
0.72 0.48 -0.61 -0.98 0.3 0.53 1.11 0.65 -0.36 -0.55 -0.55 -0.19 0.16 0.14 0.15 0.2 0.21 -4.59 -0.55 -0.45 -0.12 0.16 -3.04 -0.02 0.23 0.06 0.27 0.28 -0.24 -0.38 -0.19
0.25 -0.21 -0.04 -0.21 -1.5 -0.83 1.78 1.66 -0.14 -0.1 -0.09 -0.13 1.35 -3.11 -2.16 0.42 0.54 -2.22 -0.92 -0.12 -0.09 -0.14 -3.13 -0.2 -0.06 0.18 -0.11 -0.06 -0.81 -0.79 -0.77
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0.07 0.09 0.28 0.16 -0.79 -0.68 0.34 -0.17 -0.21 -0.13 -0.11 -0.09 0.53 -1.11 -1.05 -0.02 0.13 -0.37 -0.47 -0.33 -0.07 0.11 0.48 -0.26 0.21 0.46 0.24 0.42 0.15 0.24 0.25
-0.42 -0.3 -1.06 -1.15 -0.63 0.33 1.15 1.0 0.02 -0.12 -0.15 -0.29 0.25 -1.09 -0.38 0.28 0.27 -2.04 -0.18 0.28 0.21 0.28 -0.61 -0.01 0.24 0.39 0.26 0.64 -0.09 -0.32 -0.89
0.64 0.52 0.25 -1.18 -0.59 -0.15 0.64 1.07 -0.77 -0.9 -0.56 -0.46 0.66 0.51 -0.2 0.29 0.47 -1.38 -0.6 -0.35 -0.05 0.05 -1.95 -0.48 0.02 0.02 0.1 0.63 0.08 -0.28 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.