Heatmap: Cluster_126 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-3.51 -3.27 -3.65 -3.31 2.86 2.67 -5.27 -4.58 -3.62 -3.77 -2.68 -3.51 -1.48 2.88 0.52 -0.13 -3.7 -1.62 -0.56 -3.94 -1.56 -1.61 -2.04 -0.67 -1.21 -1.93 -1.41 -2.28 0.01 -0.61 -0.28
-0.57 -1.9 -1.76 -2.09 2.27 1.36 -2.17 -1.85 -1.61 -1.05 -0.84 -1.87 -1.34 1.92 0.82 -0.6 -2.04 0.85 -0.48 -1.18 -0.14 -0.97 1.03 -0.23 -0.56 -0.58 -0.45 -1.37 0.17 -0.04 0.42
-0.44 -0.55 -1.26 -0.93 0.25 0.49 0.28 0.44 -0.55 -0.53 -0.5 -0.03 0.35 0.63 0.26 0.02 -0.13 0.24 -0.23 -0.19 -0.06 -0.05 0.29 -0.33 -0.04 -0.05 -0.1 -0.05 0.28 0.18 0.51
-0.09 -0.29 -0.97 -0.83 0.56 0.93 0.21 0.16 -0.34 -0.41 -0.13 -0.43 -0.34 0.44 0.4 -0.06 -0.35 -0.13 -0.01 -0.33 -0.08 0.09 0.48 -0.27 -0.04 0.03 -0.02 -0.03 0.24 0.07 -0.02
-0.18 -0.57 -0.69 -0.58 0.81 0.69 -0.31 -0.27 -0.51 -0.38 -0.37 -0.55 0.31 0.69 0.5 -0.25 -0.39 0.25 0.05 -0.26 -0.28 0.03 0.33 0.06 -0.09 -0.11 -0.08 -0.05 0.03 0.04 0.42
-0.39 -0.36 -0.69 -0.42 0.47 0.72 -0.12 -0.1 -0.37 -0.34 -0.12 -0.15 0.22 0.52 0.35 0.09 -0.16 0.23 -0.09 -0.35 -0.09 -0.09 0.27 -0.11 -0.13 -0.1 -0.03 -0.16 0.18 0.15 0.17
-1.93 -1.17 -1.73 -1.36 1.89 1.67 -1.5 -1.08 -0.98 -0.95 -0.76 -1.34 -0.48 1.64 0.89 -0.2 -1.56 0.96 -0.2 -1.3 -1.02 -0.57 1.29 -0.69 -0.32 -0.94 -0.9 -1.27 0.17 -0.2 0.34
-0.5 -0.65 -1.35 -1.73 1.44 1.66 -1.53 -1.22 -1.1 -1.61 -0.7 -1.46 -0.17 0.72 0.35 -0.35 -1.06 0.62 0.37 -1.07 -0.24 -0.18 1.03 -0.07 -0.05 -0.47 0.01 -0.53 0.71 0.18 0.34
-0.64 -0.5 -0.24 -0.11 1.0 0.73 -0.73 -0.53 -0.47 -0.37 -0.18 -0.48 0.25 1.04 0.51 -0.26 -0.37 0.22 -0.16 -0.52 -0.37 -0.12 0.45 -0.3 -0.45 -0.34 -0.35 -0.33 0.48 0.13 0.42
-0.73 -0.37 -0.83 -0.27 0.51 0.34 -0.2 -0.02 -0.21 -0.13 -0.2 -0.38 0.15 0.78 0.59 0.03 -0.09 0.04 -0.0 -0.4 -0.29 -0.19 0.76 -0.23 -0.24 -0.16 -0.27 -0.39 0.24 0.18 0.39
-0.43 -0.65 -0.69 -0.8 0.51 0.57 -0.2 -0.16 -0.34 -0.33 -0.23 -0.2 0.32 0.56 0.3 0.03 -0.06 0.13 -0.12 -0.21 -0.05 -0.12 0.57 -0.02 -0.13 -0.0 -0.09 -0.02 0.03 0.02 0.48
-1.39 - -2.17 -3.7 2.74 1.62 - -3.85 - - - -1.56 -1.17 2.05 1.29 0.01 - 1.56 -1.15 -3.26 - -2.1 2.21 -1.86 -2.56 -2.22 -1.15 -1.38 -0.65 0.07 -0.85
-0.44 -0.43 -0.55 -0.28 0.28 0.47 0.01 0.23 -0.32 -0.2 -0.32 -0.29 0.49 0.54 0.27 -0.01 -0.08 0.19 -0.31 -0.18 -0.2 0.09 0.25 -0.22 -0.17 -0.13 -0.07 -0.09 0.18 0.09 0.29
0.02 -0.13 -0.35 -0.32 0.59 0.43 -0.6 -0.42 -0.64 -0.56 -0.51 -0.83 -0.17 0.69 0.67 0.01 -0.53 0.71 -0.08 -0.38 -0.26 -0.04 0.81 -0.26 -0.12 0.03 0.01 0.1 0.33 -0.14 -0.15
-0.06 -0.22 -0.41 -0.6 0.86 0.74 -0.3 -0.31 -0.5 -0.43 -0.37 -0.47 0.13 0.56 0.39 -0.21 -0.36 0.35 0.08 -0.28 -0.21 -0.04 0.31 -0.17 -0.05 -0.06 0.02 -0.0 0.18 -0.05 0.05
-0.89 -1.62 -1.95 -1.83 2.55 1.49 -1.99 -1.49 -1.62 -1.45 -0.68 -1.21 -0.42 2.28 1.04 -0.86 -1.48 0.63 -0.19 -1.65 -0.78 -0.7 -1.1 -0.54 -0.61 -1.52 -0.73 -1.29 -0.26 -0.99 0.62
0.32 -0.47 -2.11 -3.05 1.43 1.3 -1.31 -1.21 -0.75 -1.3 -0.88 -1.73 -0.21 0.8 0.77 0.07 -0.89 1.29 -0.09 -0.65 -0.1 -0.24 1.7 -0.23 -0.46 -0.19 -0.27 -0.19 -0.24 -0.66 -2.02
-0.19 -0.6 -0.52 -0.72 0.88 0.69 -1.59 -0.49 -0.66 -0.69 -0.19 -0.01 0.27 1.01 0.13 -0.19 -0.42 0.6 0.01 -0.66 -0.21 -0.12 0.48 0.15 -0.08 -0.47 -0.31 -0.01 0.23 0.07 0.56
0.16 -0.16 -0.45 -0.37 0.82 0.84 -0.21 -0.23 -0.74 -0.64 -0.5 -0.67 -0.47 0.69 0.65 0.05 -0.53 0.55 0.13 -0.34 -0.17 -0.04 0.79 -0.24 -0.33 -0.09 -0.12 -0.16 0.17 -0.23 -0.51
-0.48 -0.37 -0.68 -0.49 0.56 0.41 -0.21 0.03 -0.5 -0.2 -0.26 -0.3 0.23 0.63 0.46 0.02 -0.29 0.28 0.07 -0.28 -0.17 -0.22 0.56 -0.21 -0.21 -0.12 -0.1 -0.17 0.21 -0.04 0.51
-2.75 - -6.08 -4.51 2.49 2.4 - - -3.27 -3.4 -1.54 -4.04 -1.21 2.01 0.93 0.55 -1.58 0.6 -0.38 -2.85 -0.82 -0.83 1.12 -0.69 -0.68 -1.23 -0.66 -1.17 0.1 -0.21 -0.48
-0.03 -0.02 -0.25 -0.42 0.67 0.58 -0.2 -0.62 -0.24 -0.31 -0.17 -0.37 0.1 0.62 0.55 0.03 -0.16 0.06 0.01 -0.4 -0.2 -0.08 0.45 -0.27 -0.15 -0.06 0.03 -0.18 0.07 -0.04 -0.15
-0.75 -1.39 -1.75 -2.53 1.82 1.17 -0.81 -1.46 -0.08 -0.58 -0.04 -1.26 -1.32 1.28 1.0 0.13 -1.13 0.16 -0.97 -1.06 -0.06 -0.13 -0.25 0.46 -0.49 -0.37 -0.06 -0.26 0.17 0.25 0.74
-3.14 -2.38 -1.87 -0.89 1.44 0.99 -1.75 -1.2 -0.23 -0.46 0.48 -0.06 -0.55 1.3 0.68 0.45 -0.28 0.09 0.26 -0.53 -0.56 -0.22 -1.23 0.17 -0.2 -0.39 0.14 -0.28 0.71 0.57 -0.23
-0.33 -0.28 -0.59 -0.61 0.31 0.45 -0.07 -0.07 -0.21 -0.44 -0.2 -0.39 -0.06 0.59 0.48 0.03 -0.1 0.22 0.16 -0.12 -0.12 -0.0 0.45 -0.19 -0.09 0.01 0.06 -0.02 0.33 0.11 -0.25
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-0.99 -1.01 -1.2 -1.33 1.99 1.39 -1.29 -0.55 -0.32 -0.5 -0.62 -0.44 -0.71 1.18 0.2 -0.23 -0.67 0.64 -0.15 -0.46 -0.63 -0.65 -0.3 -0.52 -0.55 -0.1 -0.03 -0.73 0.26 0.16 0.64
-0.42 -0.66 -0.65 -0.52 1.09 0.39 -1.27 -0.92 -0.42 -0.33 -0.08 0.04 0.06 0.73 0.23 -0.16 -0.19 0.51 -0.1 -0.4 -0.24 -0.23 0.17 -0.05 -0.07 -0.18 -0.21 0.13 0.23 0.44 0.6
-0.07 -0.04 -0.32 -0.41 1.46 0.91 -1.56 -0.9 -0.5 -0.52 -0.38 -0.53 -0.62 1.08 0.1 -0.59 -1.19 1.0 0.43 -0.48 -0.54 -0.41 0.62 -0.48 -0.56 -0.45 -0.2 -0.95 0.08 -0.14 0.75
-2.66 -2.49 -3.91 -4.24 2.21 2.16 -1.4 -0.79 -1.65 -1.81 -1.48 -2.01 -0.76 2.36 0.8 0.02 -1.47 0.56 0.08 -1.82 -0.89 -0.49 -0.8 -0.43 -0.55 -0.67 -0.19 -0.68 -0.29 -0.56 -0.49
0.64 0.5 -0.5 -0.74 2.22 1.85 -2.29 -1.43 -2.58 -3.24 -2.07 -3.32 -1.39 -0.36 -0.34 -1.84 -4.12 1.89 0.09 -2.06 -0.8 -0.57 1.55 -0.32 -0.64 -0.81 -0.53 -0.54 0.16 -0.58 -0.75
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-0.46 -0.58 -0.61 -0.69 0.46 0.47 -0.13 0.07 -0.4 -0.39 -0.29 -0.54 0.47 0.76 0.46 -0.04 -0.22 0.43 -0.1 -0.3 -0.25 -0.17 0.42 -0.14 -0.1 -0.1 0.02 0.09 0.19 -0.0 0.21
-0.24 -0.3 -0.28 -0.47 1.22 0.46 -0.92 -1.06 -0.08 -0.16 0.08 0.12 0.09 1.04 0.74 -0.3 -0.6 -0.13 -0.07 -0.25 -0.4 -0.25 0.16 -0.23 -0.28 -0.31 -0.12 -0.4 -0.08 -0.19 0.53
-0.48 -0.48 -0.84 -0.67 0.26 0.38 -0.1 -0.01 -0.47 -0.41 -0.13 -0.05 0.31 0.63 0.33 0.01 -0.07 0.12 0.0 -0.28 -0.26 0.06 0.68 -0.19 -0.15 -0.23 -0.1 -0.28 0.15 0.23 0.61
-0.58 -0.39 -0.92 -0.4 0.56 0.32 -0.14 -0.06 -0.33 -0.22 -0.22 -0.44 0.33 0.69 0.65 -0.2 -0.16 0.26 -0.08 -0.38 -0.09 -0.24 0.69 -0.2 -0.0 -0.12 -0.26 -0.31 0.19 0.09 0.37
-0.31 -0.33 -0.42 -0.47 0.39 0.43 -0.18 -0.19 -0.25 -0.28 -0.2 -0.34 0.14 0.64 0.37 -0.14 -0.23 0.37 0.04 -0.18 -0.07 -0.01 0.3 -0.08 -0.02 0.06 0.08 -0.02 0.15 -0.02 -0.03
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0.03 -0.3 -0.46 -0.5 0.86 0.95 -0.19 -0.27 -0.48 -0.49 -0.27 -0.57 -0.25 0.69 0.44 -0.14 -0.34 0.26 0.07 -0.35 -0.07 -0.09 0.83 -0.24 -0.11 -0.02 -0.0 -0.01 -0.08 -0.35 -0.6
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-3.96 - -0.72 -0.34 1.82 1.02 -2.14 -2.45 -0.47 -0.2 -0.02 -0.16 -1.5 1.42 0.76 0.06 -0.25 -0.72 0.04 -0.67 0.02 0.23 -0.12 -0.11 -0.09 -1.24 -0.26 -0.54 0.9 0.55 -0.05
0.02 -0.15 -0.17 -0.11 0.49 0.61 -0.24 -0.25 -0.21 -0.25 -0.12 -0.22 0.01 0.2 -0.02 -0.22 -0.44 0.27 -0.06 -0.31 -0.23 -0.03 0.56 -0.02 -0.07 0.07 -0.0 -0.14 0.1 0.07 0.17
-0.4 -0.27 -0.65 -0.5 0.55 0.56 -0.22 -0.11 -0.38 -0.34 -0.26 -0.22 0.1 0.56 0.27 -0.06 -0.05 0.16 -0.0 -0.2 -0.19 -0.04 0.47 -0.11 -0.07 -0.12 -0.11 0.07 0.15 0.06 0.34
-0.57 -2.37 -3.1 -3.07 2.33 1.55 -1.74 -0.18 -1.39 -1.38 -0.74 -0.96 -0.7 2.03 0.18 -0.46 -2.09 1.21 -0.83 -1.88 -1.67 -0.94 1.68 -0.99 -0.88 -1.44 -1.09 -1.4 0.02 -0.42 -0.16
-0.82 -1.34 -1.33 -0.8 2.23 2.23 -2.09 -1.23 -2.7 -2.85 -2.04 -2.99 -0.09 1.65 0.74 -0.81 -3.19 1.43 -1.13 -2.61 -1.46 -1.63 2.07 -1.48 -1.46 -1.93 -1.39 -1.22 0.27 -1.08 -1.98
- -2.07 - - 2.1 2.41 -3.28 - -0.42 - -2.2 -3.54 -2.29 3.14 1.65 -3.24 -1.65 -1.57 -0.41 -0.99 -1.59 -0.09 - 0.65 -0.65 -1.91 -0.66 - -0.11 - -0.85
-1.64 -1.99 -1.2 -0.72 1.93 1.53 -1.77 -1.88 -0.62 -1.07 -0.37 -0.52 -0.32 1.48 0.7 -0.02 -0.91 -0.3 -0.13 -1.03 -0.52 -0.37 -1.0 -0.26 -0.28 -0.56 -0.15 -0.73 0.89 0.43 0.62
-1.0 -0.86 -1.72 -1.94 0.85 1.46 -0.25 -0.85 -0.3 -0.65 -0.23 -0.76 -0.21 1.0 0.64 -0.19 -0.58 0.58 0.29 -0.81 -0.26 -0.12 0.65 -0.27 -0.2 -0.09 -0.22 -0.65 0.56 0.26 0.23
-3.6 -3.66 -4.65 -3.66 2.47 2.37 -4.89 -5.9 -3.07 -3.5 -1.54 -3.07 -1.05 1.88 0.16 0.83 -1.13 -4.92 0.62 -1.86 -0.3 -0.23 -4.28 0.06 -0.22 -0.45 0.11 -0.26 0.63 0.25 -0.06
-0.28 -0.26 -0.21 -0.33 0.61 0.49 -0.12 -0.34 -0.43 -0.2 -0.15 -0.37 -0.13 0.7 0.5 0.11 -0.35 0.43 -0.16 -0.37 -0.15 -0.07 0.62 -0.37 -0.35 -0.06 -0.15 -0.05 0.09 -0.02 0.12
-0.94 -1.52 -1.6 -1.68 1.95 1.4 -1.13 -0.43 -0.25 -0.22 -0.26 -0.42 0.05 1.31 0.4 -0.07 -1.16 0.26 -0.06 -1.13 -0.64 -0.63 0.3 -0.14 -0.1 -0.97 -0.15 -0.42 0.02 -0.3 0.38
-0.48 -0.23 -0.52 -0.52 0.4 0.35 -0.11 -0.03 -0.31 -0.25 -0.13 -0.07 0.2 0.45 0.27 0.09 -0.05 0.05 0.0 -0.21 -0.19 -0.02 0.39 -0.21 -0.06 -0.05 -0.07 -0.15 0.16 0.1 0.44
-0.29 -0.24 -0.3 -0.19 0.58 0.58 -0.18 -0.19 -0.17 -0.33 -0.11 -0.38 -0.01 0.64 0.43 -0.05 -0.31 0.24 -0.0 -0.23 -0.08 -0.1 0.17 -0.22 -0.25 -0.12 -0.15 -0.22 0.19 0.04 0.34
-0.9 -0.66 -0.71 -0.43 1.44 0.86 -0.67 -1.0 -0.34 -0.51 -0.07 -0.41 -0.46 1.21 0.45 -0.21 -0.6 0.89 0.42 -0.8 -0.5 -0.79 0.09 -0.64 -0.54 -0.28 -0.18 -0.72 0.19 0.17 0.74
-0.21 0.04 -0.19 -0.11 0.86 0.39 -0.64 -0.69 -0.27 -0.32 -0.19 0.01 0.17 0.7 0.21 -0.3 -0.55 0.15 -0.19 -0.49 -0.3 -0.24 0.43 -0.28 -0.29 -0.21 -0.3 -0.17 0.59 0.32 0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.