Heatmap: Cluster_144 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.07 0.08 0.05 0.03 0.11 0.07 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.03 0.1 0.11 0.05 0.04 0.76 0.05 0.03 0.03 0.03 1.0 0.04 0.05 0.03 0.03 0.03 0.16 0.23 0.3
0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.78 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02
0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.07 0.0 0.0 0.95 0.02 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.02 0.05 0.01 0.0 0.12 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.73 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01
0.09 0.08 0.06 0.05 0.15 0.14 0.1 0.11 0.08 0.08 0.07 0.09 0.18 0.17 0.21 0.12 0.14 1.0 0.29 0.12 0.09 0.09 0.81 0.12 0.11 0.09 0.09 0.13 0.09 0.11 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.06 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.09 0.02 0.04 0.05 0.04 1.0 0.15 0.03 0.02 0.03 0.86 0.06 0.04 0.03 0.03 0.05 0.03 0.05 0.08
0.07 0.06 0.06 0.08 0.13 0.16 0.1 0.09 0.12 0.11 0.12 0.12 0.14 0.15 0.17 0.15 0.14 1.0 0.29 0.15 0.12 0.12 0.69 0.14 0.13 0.13 0.14 0.15 0.1 0.12 0.13
0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.06 0.05 0.02 0.02 0.84 0.04 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.08
0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.05 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.07 0.07 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.8 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03
0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.02 0.02 0.02 0.08 0.08 0.02 0.03 0.03 0.04 0.05 0.05 0.08 0.07 0.08 0.05 0.05 0.78 0.04 0.03 0.03 0.05 1.0 0.04 0.04 0.05 0.07 0.01 0.04 0.09 0.15
0.14 0.12 0.14 0.17 0.14 0.12 0.1 0.08 0.14 0.15 0.17 0.16 0.2 0.23 0.22 0.16 0.16 1.0 0.13 0.13 0.11 0.1 1.0 0.12 0.12 0.12 0.12 0.1 0.14 0.2 0.25
0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.14 0.06 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.6 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.06 0.05 0.02 0.02 0.88 0.02 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.08
0.04 0.02 0.01 0.01 0.14 0.09 0.08 0.07 0.1 0.09 0.08 0.08 0.09 0.15 0.15 0.06 0.08 0.75 0.21 0.1 0.09 0.09 1.0 0.1 0.12 0.13 0.11 0.09 0.22 0.2 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04
0.03 0.03 0.03 0.03 0.09 0.06 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.06 0.05 0.03 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.72 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02
0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.78 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02
0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.91 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02
0.02 0.01 0.01 0.05 0.05 0.06 0.02 0.01 0.03 0.05 0.03 0.05 0.07 0.18 0.11 0.02 0.03 0.97 0.02 0.01 0.01 0.02 1.0 0.04 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.07 0.06
0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.05 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.04 0.05 0.02 0.02 0.01 0.64 0.05 0.03 0.06 0.03 1.0 0.07 0.04 0.05 0.0 0.0 0.02 0.09 0.01
0.04 0.05 0.05 0.05 0.15 0.09 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.17 0.2 0.06 0.05 0.89 0.06 0.04 0.04 0.05 1.0 0.05 0.06 0.05 0.05 0.04 0.06 0.08 0.09
0.04 0.04 0.01 0.02 0.08 0.07 0.03 0.06 0.04 0.04 0.02 0.08 0.06 0.15 0.08 0.02 0.04 0.9 0.05 0.07 0.02 0.04 1.0 0.03 0.07 0.05 0.05 0.03 0.05 0.09 0.14
0.02 0.02 0.01 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.12 0.12 0.11 0.12 0.09 0.04 0.04 0.04 0.06 0.06 0.06 0.17 0.09 0.08 0.06 0.05 1.0 0.04 0.05 0.05 0.05 0.88 0.04 0.06 0.06 0.07 0.05 0.07 0.07 0.19
0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.04 0.05 0.07 0.06 0.03 0.02 0.88 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.07
0.15 0.17 0.13 0.15 0.23 0.21 0.14 0.14 0.16 0.16 0.17 0.16 0.28 0.25 0.22 0.17 0.16 1.0 0.14 0.15 0.15 0.18 0.88 0.15 0.15 0.14 0.15 0.17 0.21 0.23 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.08 0.09 0.14 0.12 0.12 0.1 0.1 0.11 0.09 0.13 0.14 0.21 0.21 0.17 0.13 0.13 1.0 0.11 0.12 0.12 0.11 0.99 0.12 0.13 0.13 0.1 0.11 0.12 0.14 0.2
0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.03 0.01 0.03 0.02 0.02 0.0 0.02 0.09 0.04 0.04 0.03 0.68 0.05 0.03 0.03 0.02 1.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.02 0.05 0.06 0.05
0.03 0.12 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.55 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03
0.03 0.07 0.03 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 1.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.79 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.07
0.03 0.04 0.03 0.05 0.14 0.1 0.07 0.05 0.06 0.07 0.08 0.05 0.1 0.21 0.2 0.06 0.04 1.0 0.08 0.04 0.05 0.05 0.93 0.06 0.08 0.04 0.06 0.03 0.11 0.09 0.11
0.02 0.06 0.04 0.05 0.08 0.05 0.07 0.07 0.05 0.08 0.1 0.1 0.13 0.1 0.11 0.06 0.1 0.81 0.08 0.07 0.06 0.05 1.0 0.1 0.09 0.08 0.06 0.06 0.11 0.16 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.06 0.05 0.05 0.12 0.12 0.06 0.08 0.07 0.06 0.08 0.07 0.12 0.19 0.15 0.08 0.08 1.0 0.09 0.06 0.07 0.08 0.73 0.08 0.09 0.08 0.08 0.05 0.12 0.12 0.21
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 1.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.63 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.05 0.03 0.03 0.15 0.1 0.07 0.06 0.07 0.05 0.1 0.06 0.07 0.16 0.14 0.09 0.08 1.0 0.06 0.06 0.05 0.06 0.79 0.09 0.11 0.09 0.11 0.05 0.09 0.12 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.73 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.04 0.04 0.1 0.08 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.04 0.06 0.13 0.11 0.06 0.04 1.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.62 0.04 0.04 0.03 0.06 0.02 0.05 0.06 0.08
0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.84 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.06 0.28
0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.07 0.06 0.03 0.01 0.05 0.06 0.03 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.09 0.17 0.07 0.02 0.03 1.0 0.04 0.02 0.02 0.02 0.83 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.04 0.05 0.21
0.07 0.09 0.09 0.14 0.15 0.12 0.1 0.08 0.07 0.06 0.09 0.07 0.07 0.15 0.14 0.09 0.07 1.0 0.09 0.07 0.1 0.1 0.99 0.08 0.09 0.1 0.09 0.06 0.08 0.1 0.13
0.02 0.03 0.09 0.21 0.08 0.08 0.06 0.04 0.05 0.07 0.06 0.06 0.14 0.14 0.11 0.11 0.1 1.0 0.06 0.07 0.07 0.07 0.57 0.06 0.07 0.1 0.09 0.06 0.06 0.08 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.08 0.03 0.01 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.63 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.08 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.67 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02
0.04 0.1 0.03 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.78 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.02 0.02 0.01 0.01 0.06 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.19 0.09 0.02 0.01 0.83 0.04 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.03 0.04
0.01 0.01 0.01 0.0 0.11 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.07 0.07 0.02 0.01 0.97 0.03 0.02 0.01 0.02 1.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.07 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.05 0.02 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.73 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02
0.01 0.01 0.01 0.01 0.1 0.06 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.05 0.09 0.08 0.04 0.03 0.83 0.03 0.01 0.02 0.02 1.0 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04
0.03 0.03 0.06 0.09 0.14 0.08 0.04 0.05 0.06 0.06 0.07 0.06 0.06 0.17 0.15 0.06 0.06 1.0 0.06 0.05 0.05 0.05 0.84 0.04 0.06 0.05 0.06 0.05 0.07 0.08 0.09
0.07 0.15 0.04 0.02 0.11 0.09 0.04 0.03 0.05 0.06 0.05 0.07 0.13 0.12 0.12 0.1 0.07 1.0 0.06 0.07 0.06 0.06 0.85 0.05 0.07 0.09 0.06 0.07 0.07 0.08 0.08
0.03 0.04 0.05 0.05 0.09 0.09 0.08 0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.08 0.17 0.12 0.08 0.07 0.82 0.14 0.09 0.07 0.05 1.0 0.08 0.06 0.07 0.07 0.07 0.13 0.13 0.1
0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.02 0.01 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.84 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.01 0.02 0.01 0.01 0.09 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.07 0.11 0.01 0.01 0.56 0.03 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.03 0.03 0.08 0.08 0.04 0.05 0.04 0.04 0.04 0.04 0.07 0.13 0.1 0.06 0.05 0.79 0.06 0.04 0.05 0.05 1.0 0.06 0.05 0.06 0.05 0.04 0.06 0.06 0.06
0.06 0.06 0.05 0.04 0.14 0.11 0.07 0.06 0.09 0.1 0.1 0.11 0.12 0.16 0.13 0.09 0.09 0.84 0.11 0.07 0.07 0.06 1.0 0.1 0.09 0.08 0.08 0.06 0.16 0.18 0.31
0.03 0.04 0.03 0.03 0.07 0.05 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.04 0.07 0.15 0.13 0.06 0.06 0.86 0.05 0.04 0.04 0.03 1.0 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.06 0.07 0.1
0.13 0.13 0.13 0.23 0.16 0.18 0.16 0.14 0.16 0.15 0.13 0.13 0.16 0.2 0.21 0.15 0.13 1.0 0.17 0.14 0.14 0.14 0.72 0.13 0.15 0.15 0.17 0.15 0.17 0.18 0.21
0.02 0.03 0.0 0.01 0.07 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.09 0.06 0.01 0.01 0.92 0.03 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)