Heatmap: Cluster_78 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_7441.1 (PDR11)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_115321.1 (REC2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_118421.1 (PEN3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_120721.1 (TCP10)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86
Lsat_1_v5_gn_1_13840.1 (ESL3.03)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_14620.1 (IRX6)	0.13	0.0	0.36	0.0	0.19	0.28	0.2	0.0	0.17	0.0	0.0	0.09	0.5	1.0	0.86	0.53	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.36	0.13
Lsat_1_v5_gn_1_19301.1	0.02	0.16	0.0	0.0	0.1	0.03	0.04	0.06	0.09	0.01	0.06	0.04	0.08	1.0	0.38	0.04	0.01	0.79	0.11	0.0	0.06	0.0	0.41	0.01	0.12	0.04	0.06	0.06	0.06	0.08	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_20761.1 (PLP2)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.35	0.18	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.81	1.0	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_29981.1 (CNX1)	0.02	0.0	0.0	0.03	0.33	0.23	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.01	0.23	1.0	0.82	0.02	0.01	0.16	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.01	0.09	0.02	0.05	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_31441.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.29	0.0	0.11	0.09	0.09	0.21	0.0	0.12	0.68	1.0	0.11	0.0	0.28	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_78900.1 (SRK2B)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_80760.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.62	1.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_81681.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.42
Lsat_1_v5_gn_1_85880.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_96360.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_57520.1	0.03	0.01	0.0	0.0	0.16	0.09	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	1.0	0.75	0.04	0.02	0.06	0.07	0.02	0.03	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01
Lsat_1_v5_gn_2_82300.1 (LecRK-IX.2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_21180.1 (ATL67)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_5860.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_8821.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_115641.1 (UNH)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_118940.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_129001.1 (EFR)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	1.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_130641.1 (SAC3B)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_162021.1 (INO80)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_164120.1 (FAB1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_167001.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_22560.1	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44
Lsat_1_v5_gn_4_25441.1 (CYP89A7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_74820.1 (ARO1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_147380.1 (RH37)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_184340.1 (NSUN5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_186261.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_37800.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_41081.1 (LMK1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_46240.1 (CYP71A21)	0.03	0.07	0.04	0.01	0.41	0.21	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.15	1.0	0.06	0.02	0.44	0.07	0.04	0.04	0.04	0.0	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.23	0.08	0.01
Lsat_1_v5_gn_5_52601.1 (FLP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_22401.1 (CYP82G1)	0.1	0.03	0.02	0.0	0.4	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.05	0.58	1.0	0.02	0.02	0.3	0.08	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.03	0.04	0.06	0.08	0.01	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_28481.1 (PLP)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_68300.1 (AtPMEI10)	0.0	0.0	0.0	0.29	0.4	0.2	0.08	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0	0.09	0.35	0.65	0.0	0.0	0.0	0.1	0.17	0.0	0.0	0.16	0.09	0.0	0.0	0.13
Lsat_1_v5_gn_6_96981.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_106621.1 (DND2)	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.06	0.13	0.06	0.0	1.0	0.21	0.15	0.05	0.0	0.53	0.05	0.1	0.0	0.0	0.23	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12
Lsat_1_v5_gn_7_106861.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.6	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_18600.1 (PS3)	0.09	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.11	0.0	0.0	0.0	1.0	0.29	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_110641.1 (WOL)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_22660.1 (GAS2)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.17	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.54	1.0	0.0	0.0	0.17	0.12	0.04	0.01	0.0	0.0	0.05	0.17	0.03	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_25540.1 (MAH1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_4201.1 (SAUR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_68800.1 (IAN13)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_78801.1	0.04	0.15	0.07	0.0	0.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.09	1.0	0.51	0.02	0.04	0.27	0.03	0.02	0.0	0.03	0.6	0.04	0.07	0.04	0.01	0.1	0.05	0.07	0.14
Lsat_1_v5_gn_8_82740.1	0.18	0.21	0.1	0.13	0.36	0.32	0.2	0.08	0.19	0.07	0.33	0.26	0.09	0.86	0.46	0.16	0.13	0.19	0.32	0.22	0.33	0.22	1.0	0.13	0.22	0.15	0.26	0.08	0.18	0.16	0.14
Lsat_1_v5_gn_9_100781.1 (GLP9)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.5	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_100801.1 (GLP9)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.5	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_100901.1 (GLP9)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.5	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_112160.1	0.13	0.08	0.1	0.06	0.34	0.24	0.05	0.05	0.11	0.12	0.14	0.11	0.13	1.0	0.36	0.1	0.11	0.3	0.18	0.1	0.14	0.11	0.26	0.11	0.19	0.1	0.13	0.14	0.16	0.1	0.06
Lsat_1_v5_gn_9_50500.1 (GGT2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_85080.1 (FD)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.1	0.19	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)