Heatmap: Cluster_230 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_30940.1	-0.08	0.05	0.07	0.35	0.34	0.34	-0.1	-0.68	-0.1	-0.11	0.02	-0.05	0.15	-0.12	-0.21	-0.02	-0.11	-0.01	-0.36	-0.34	-0.17	-0.06	0.35	-0.39	-0.1	0.17	0.04	-0.0	0.3	0.25	-0.0
Lsat_1_v5_gn_0_31780.1 (RABA5a)	-0.66	-0.7	-0.06	0.32	0.07	0.13	0.16	-0.45	0.12	0.09	0.26	-0.08	-0.15	-0.24	-0.15	-0.06	-0.14	-0.32	-0.36	-0.24	-0.04	0.1	-0.1	-0.05	0.04	0.35	0.12	-0.08	0.31	0.53	0.47
Lsat_1_v5_gn_1_20080.1	-0.69	-1.54	-0.12	0.52	0.46	0.49	-0.71	-1.26	0.21	0.04	0.18	0.06	-0.36	-0.49	-0.09	0.09	0.15	-1.3	-0.33	0.15	0.37	0.23	0.2	-0.05	0.26	0.61	0.37	0.21	-0.11	0.02	-0.12
Lsat_1_v5_gn_1_4360.1 (ATPC2)	-0.06	-0.44	-0.15	-0.01	0.33	0.47	-0.18	-0.08	-0.26	-0.16	-0.13	-0.11	0.26	0.26	0.2	0.15	0.0	-0.66	-0.05	-0.18	0.0	0.02	0.23	-0.07	0.03	0.06	-0.13	0.01	-0.0	-0.05	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_103340.1	0.08	-0.1	-0.07	0.15	0.63	0.44	-0.15	-0.26	-0.2	-0.11	-0.02	-0.12	0.06	0.41	0.24	0.07	-0.01	-0.15	-0.25	-0.16	-0.07	0.03	-0.35	-0.29	-0.17	-0.13	-0.05	0.31	0.02	-0.09	-0.28
Lsat_1_v5_gn_2_126200.1 (PMIR1)	-0.39	-1.25	-1.21	-2.31	1.8	2.53	-2.28	-4.23	-1.65	-1.82	-0.61	-2.6	0.32	0.05	-0.83	-0.24	-1.19	-1.11	-0.57	-1.8	-0.5	-0.54	1.84	0.34	-0.24	-0.32	0.0	-1.46	-0.14	-0.41	0.81
Lsat_1_v5_gn_2_57920.1	-0.17	-0.12	-0.32	0.09	1.0	1.38	-0.43	-0.76	-0.27	-0.25	0.07	0.09	0.25	0.18	-0.11	-0.07	-0.5	-0.95	-0.19	-0.8	-0.26	-0.14	-0.27	-0.18	-0.05	-0.01	0.01	-0.37	-0.02	0.13	0.56
Lsat_1_v5_gn_2_58440.1	0.28	1.01	-1.13	-1.16	1.44	0.35	-0.01	-0.06	-0.31	-0.4	-0.2	-0.38	0.39	-0.04	0.37	-0.11	-0.28	-0.76	0.22	-0.2	-0.16	-0.16	-0.02	-0.43	-0.32	-0.19	-0.4	-0.03	0.11	0.08	-0.52
Lsat_1_v5_gn_2_80180.1	-0.1	-0.87	0.28	0.38	0.43	0.55	-0.17	-0.39	0.23	-0.1	0.08	-0.06	-0.78	-0.34	0.05	0.03	-0.36	-0.82	-0.34	-0.14	-0.19	-0.23	0.87	-0.12	-0.01	-0.09	-0.04	-0.26	0.21	0.33	0.4
Lsat_1_v5_gn_2_84140.1 (ACD2)	0.18	0.07	0.2	0.19	0.41	0.59	-0.4	-0.63	-0.0	0.01	0.09	-0.11	-0.05	0.03	-0.09	0.0	-0.3	-0.49	-0.03	-0.32	-0.01	0.04	-0.42	-0.13	-0.01	0.15	0.08	-0.21	0.28	0.25	-0.06
Lsat_1_v5_gn_2_87400.1	-0.05	-0.28	-0.21	0.5	0.53	0.51	-0.46	-0.9	0.06	0.15	0.4	0.2	0.2	-0.01	0.13	-0.19	-0.22	-0.44	-0.11	-0.45	-0.04	-0.12	-0.17	-0.18	0.08	-0.04	-0.17	-0.0	-0.07	0.03	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_90560.1	0.05	-0.21	0.03	0.42	0.96	0.47	-0.41	-1.16	0.17	-0.02	0.11	0.3	-0.64	-0.25	0.08	-0.17	-0.13	0.48	-0.22	-0.38	-0.59	-0.19	0.61	-0.72	-0.48	-0.31	-0.2	-0.06	0.19	0.33	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_115961.1 (FRS3)	-1.09	-0.47	-0.05	0.15	0.22	0.25	0.09	-0.09	0.2	0.19	0.3	0.06	-0.14	0.3	0.12	0.09	-0.01	-0.66	-0.38	-0.08	-0.24	-0.26	0.54	-0.44	-0.34	0.11	-0.08	-0.42	0.17	0.4	0.39
Lsat_1_v5_gn_3_26920.1 (LLR2)	-0.98	-1.04	-0.59	0.18	0.05	-0.11	0.75	-0.13	0.33	0.41	0.17	-0.17	-0.02	0.01	-0.57	0.12	0.47	-1.02	-0.92	-0.28	-0.29	-0.37	-0.5	-0.03	-0.09	0.3	-0.1	-0.17	0.37	0.81	0.82
Lsat_1_v5_gn_3_40141.1 (WIP1)	0.58	0.5	0.98	0.74	0.54	0.94	-0.61	-1.31	-0.37	-0.47	-0.13	-0.82	-0.73	-0.8	-0.86	0.21	-0.42	-1.28	-0.5	-0.6	0.06	-0.04	-3.69	-0.09	0.11	0.28	0.19	-0.37	0.73	0.68	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_50160.1 (PP2A)	0.08	-0.01	-0.04	0.16	0.23	0.15	-0.09	-0.14	-0.16	0.01	-0.12	-0.02	0.3	-0.07	-0.01	0.12	0.03	-0.12	-0.34	-0.14	-0.08	-0.03	0.41	-0.26	-0.13	-0.01	0.04	0.11	0.03	0.03	-0.19
Lsat_1_v5_gn_3_56361.1	-0.41	-0.4	-0.1	0.27	0.03	0.25	0.17	-0.07	0.07	0.08	0.1	0.04	-0.01	-0.13	0.08	0.09	-0.02	-0.5	-0.2	-0.22	0.04	-0.14	0.23	-0.15	-0.08	0.08	-0.05	-0.18	0.11	0.28	0.35
Lsat_1_v5_gn_3_62600.1 (LRK10L4)	0.95	0.23	0.3	0.18	1.15	0.95	-0.29	-1.06	-0.33	-0.45	-0.15	-0.63	-0.24	-0.67	0.07	0.03	-0.6	-0.29	-0.23	-0.75	-0.0	-0.01	0.52	-0.56	-0.23	0.08	-0.05	0.05	0.27	-0.1	-1.35
Lsat_1_v5_gn_3_70620.1 (STY8)	0.52	0.52	0.79	0.89	0.05	0.33	-0.31	-0.49	-0.0	-0.08	0.04	-0.02	-0.42	-0.39	-0.44	-0.28	-0.5	-0.34	-0.42	-0.48	-0.34	-0.41	1.22	-0.55	-0.43	-0.43	-0.14	-0.14	-0.01	-0.04	-0.11
Lsat_1_v5_gn_3_80541.1	-0.37	-0.44	-0.18	0.14	0.17	0.25	-0.1	-0.05	0.01	0.09	0.17	0.17	0.53	0.4	0.14	-0.02	-0.02	-1.1	-0.26	-0.07	-0.11	-0.18	-1.29	0.2	-0.08	0.07	0.19	0.22	0.21	0.15	-0.09
Lsat_1_v5_gn_4_142660.1 (GRF2)	-0.3	-0.32	-0.09	0.18	0.47	0.48	-0.25	-0.18	-0.2	-0.15	-0.14	-0.16	0.38	0.18	0.09	0.18	0.03	-0.31	-0.56	-0.32	-0.1	-0.07	0.46	-0.25	-0.09	-0.02	-0.05	0.08	0.11	0.08	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_164560.1 (SCE1)	-0.14	-0.29	-0.23	-0.02	0.17	0.27	0.05	0.14	-0.28	-0.19	-0.03	-0.05	0.29	0.2	0.14	0.16	-0.05	-0.02	-0.26	-0.12	-0.08	-0.09	0.31	-0.09	-0.1	-0.02	-0.12	0.01	-0.03	0.02	0.18
Lsat_1_v5_gn_4_19700.1 (LLR1)	0.18	0.19	0.27	0.27	0.37	0.17	-0.24	-0.41	-0.06	0.02	0.08	0.07	-0.11	0.17	0.27	0.18	0.02	-0.77	-0.25	-0.17	-0.02	-0.12	0.26	-0.32	-0.18	-0.1	-0.15	-0.16	0.08	0.01	-0.13
Lsat_1_v5_gn_4_2081.1 (SAUR55)	-2.41	-4.29	-	-2.16	1.41	1.87	0.22	0.56	-0.34	-0.61	-0.04	-0.37	-0.5	0.32	0.8	0.42	-0.03	0.26	0.08	-0.65	-0.24	-0.37	0.14	-0.38	-0.96	-0.18	0.03	-1.21	0.29	-0.61	0.33
Lsat_1_v5_gn_4_34080.1	-0.12	-0.13	0.31	0.46	0.74	0.29	-0.45	-0.33	-0.2	-0.13	-0.01	-0.0	0.05	0.24	0.13	-0.04	-0.12	-0.67	-0.18	-0.38	-0.33	-0.14	-0.23	-0.31	-0.22	-0.18	-0.16	-0.11	0.53	0.37	0.26
Lsat_1_v5_gn_4_37541.1 (CLB1)	-0.04	-0.08	0.17	0.35	0.61	0.49	-0.02	-0.07	-0.05	0.01	0.05	0.03	-0.1	0.14	0.11	0.13	-0.03	-1.04	-0.15	-0.22	-0.14	-0.07	0.05	-0.29	-0.15	-0.12	-0.11	-0.06	-0.04	-0.04	-0.05
Lsat_1_v5_gn_4_56181.1 (ZIP11)	-0.27	-0.09	0.33	-0.01	0.95	0.72	-1.06	-0.86	0.31	0.33	0.16	-0.05	-1.14	0.81	0.27	0.28	-0.49	-1.14	-0.24	-0.75	-0.36	-0.51	0.84	-0.4	-0.78	-0.66	-0.27	-0.24	0.44	-0.03	0.37
Lsat_1_v5_gn_4_58141.1 (TPS14)	-0.06	-0.03	-1.29	-1.07	1.39	0.95	-0.07	-1.88	-0.26	-0.45	-0.43	-1.16	-2.06	0.1	0.41	-0.16	-1.27	-3.48	-0.04	-0.36	0.03	0.38	-0.0	-0.27	-0.09	-0.29	-0.36	-1.79	1.03	1.33	1.23
Lsat_1_v5_gn_4_69060.1	1.25	0.79	1.19	1.19	-0.18	-0.19	-1.53	-2.27	-0.52	-0.34	-0.52	-0.01	0.11	-0.17	-0.15	-0.39	-0.73	0.66	-0.78	-1.0	-1.15	-0.84	1.51	-1.22	-0.71	-0.95	-0.61	-1.68	0.02	0.4	0.3
Lsat_1_v5_gn_4_71901.1 (PP2C.D6)	0.17	-0.32	0.3	0.14	0.41	0.8	-0.37	-0.62	-0.26	-0.36	-0.05	-0.31	-0.27	0.48	0.34	0.27	-0.11	0.02	-0.19	-0.48	-0.17	-0.01	-0.22	-0.33	-0.23	-0.07	0.07	-0.22	0.35	0.22	-0.09
Lsat_1_v5_gn_4_75941.1 (CYP71B3)	-0.12	0.18	0.04	0.19	0.73	1.05	-0.07	-0.32	-0.38	-0.34	-0.2	-0.4	-0.15	0.18	0.03	0.24	-0.2	-2.15	-0.04	-0.65	-0.17	-0.06	-0.7	-0.3	-0.02	-0.2	-0.15	-0.45	0.74	0.55	0.37
Lsat_1_v5_gn_5_13080.1 (MRF3)	0.43	0.3	0.6	0.52	0.37	0.3	-0.37	-0.52	-0.27	-0.28	-0.24	-0.2	0.26	0.29	-0.02	-0.19	-0.42	-0.11	-0.49	-0.42	-0.3	-0.32	0.88	-0.46	-0.3	-0.25	-0.36	-0.54	0.19	0.08	0.26
Lsat_1_v5_gn_5_135721.1 (PDAT)	0.2	0.07	0.11	0.23	0.45	0.4	-0.12	-0.24	-0.06	-0.11	0.03	-0.11	0.05	-0.05	-0.17	0.07	-0.11	-0.54	-0.18	-0.21	-0.13	-0.05	0.27	-0.14	-0.05	0.08	0.09	-0.08	-0.05	-0.02	-0.02
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Lsat_1_v5_gn_5_2860.1	0.82	0.43	1.22	0.88	0.15	0.32	-1.11	-1.67	-0.37	-0.3	0.04	-0.94	-0.3	0.01	-0.17	0.02	-0.23	-0.02	-0.3	-0.61	-0.28	-0.27	1.45	-0.74	-0.58	-0.64	-0.28	-0.62	-0.3	-0.24	-0.01
Lsat_1_v5_gn_5_57121.1	-0.93	-0.29	-0.04	0.03	0.38	0.65	-0.39	-0.07	0.14	0.3	0.28	-0.1	-0.17	0.41	0.11	0.09	-0.25	-0.45	-0.05	-0.65	-0.4	-0.2	0.08	0.01	-0.34	-0.45	-0.07	-0.01	0.25	0.3	0.57
Lsat_1_v5_gn_5_65220.1 (NEK6)	-0.39	-0.26	-0.19	0.18	0.71	0.2	-0.75	-1.05	0.04	0.03	0.11	0.09	0.04	0.04	0.11	0.11	-0.16	-0.1	0.01	-0.26	-0.12	-0.19	0.24	-0.23	-0.18	-0.0	-0.14	-0.12	0.35	0.36	0.44
Lsat_1_v5_gn_5_8321.1	-0.31	-0.47	-0.08	0.23	1.26	0.18	-0.56	-0.69	-0.19	-0.16	0.05	0.1	0.16	0.37	0.09	-0.19	-0.23	-0.25	-0.08	-0.24	-0.42	-0.27	0.14	-0.21	-0.06	-0.23	-0.28	-0.11	0.2	0.34	0.36
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.