Heatmap: Cluster_172 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_12340.1 (KUP8)	-0.17	-0.05	-0.78	-1.17	0.29	0.44	-0.13	0.27	-0.78	-0.69	-0.66	-0.88	-0.58	1.39	0.87	-0.36	-0.61	0.33	0.1	-0.73	-0.66	-0.6	1.88	-0.45	-0.56	-0.66	-0.58	-0.88	0.2	0.0	0.2
Lsat_1_v5_gn_0_7601.1 (MDD2)	-0.54	-0.21	-0.55	-0.71	1.07	0.91	-0.3	-0.1	-0.74	-0.65	-0.63	-0.54	-0.27	1.04	0.86	0.14	-0.46	0.16	0.11	-0.63	-0.44	-0.45	1.29	-0.73	-0.46	-0.55	-0.65	-0.6	0.31	0.1	-0.07
Lsat_1_v5_gn_1_117041.1 (BUG22)	-0.25	-0.21	-0.12	0.26	0.31	0.24	-0.28	-0.14	-0.36	-0.33	-0.23	-0.26	0.3	0.39	0.31	-0.05	-0.21	0.22	-0.32	-0.31	-0.15	-0.33	1.27	-0.41	-0.15	-0.02	-0.22	-0.08	-0.07	-0.03	-0.15
Lsat_1_v5_gn_1_12401.1 (PDI8)	-0.42	-0.33	-0.72	-0.85	0.8	0.69	-0.41	-0.14	-0.55	-0.43	-0.37	-0.43	0.21	0.81	0.6	-0.01	-0.26	0.29	-0.05	-0.4	-0.24	-0.08	1.26	-0.51	-0.38	-0.25	-0.11	-0.06	0.03	-0.18	-0.19
Lsat_1_v5_gn_1_124421.1 (DEG15)	-0.04	-0.07	-0.25	-0.18	0.81	0.54	-0.51	-0.43	-0.32	-0.4	-0.23	-0.43	-0.42	0.52	0.54	-0.02	-0.52	0.08	-0.13	-0.47	-0.27	-0.32	1.38	-0.4	-0.39	-0.43	-0.36	-0.31	0.23	0.19	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_125001.1 (SC3)	-0.17	-0.07	-0.07	-0.21	0.52	0.36	-0.31	-0.33	-0.49	-0.28	-0.24	-0.37	0.17	0.43	0.46	0.09	-0.23	0.51	-0.1	-0.39	-0.37	-0.29	1.3	-0.35	-0.34	-0.36	-0.29	-0.26	-0.07	-0.11	0.08
Lsat_1_v5_gn_1_129581.1	-0.4	-0.33	-0.37	-0.39	0.45	0.48	-0.33	-0.27	-0.28	-0.21	-0.2	-0.2	-0.06	0.82	0.53	-0.0	-0.2	-0.2	-0.03	-0.4	-0.27	-0.14	1.01	-0.26	-0.31	-0.22	-0.27	-0.47	0.15	0.17	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_130060.1 (OPT3)	-0.6	-0.26	-0.89	-0.77	1.26	0.81	-1.48	-0.74	-0.95	-1.01	-0.71	-0.78	-0.63	1.46	0.66	-0.22	-1.28	-0.02	-0.38	-1.19	-0.77	-0.68	2.51	-0.6	-0.59	-0.94	-0.5	-1.2	0.12	-0.28	-0.26
Lsat_1_v5_gn_1_13760.1	-0.37	-0.38	-0.47	-0.46	0.31	0.22	-0.08	-0.02	-0.45	-0.43	-0.25	-0.44	0.07	0.67	0.53	0.09	-0.25	-0.11	-0.1	-0.6	-0.4	-0.35	1.58	-0.42	-0.4	-0.23	-0.27	-0.44	0.13	0.16	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_15001.1 (SKIP6)	-0.57	-0.76	-0.41	-0.14	0.9	0.78	-0.62	-0.75	-0.51	-0.42	-0.13	-0.43	-0.6	0.95	0.68	-0.2	-0.52	0.26	-0.12	-0.65	-0.53	-0.5	1.88	-0.51	-0.23	-0.42	-0.38	-0.8	-0.04	-0.08	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_15601.1 (AAE17)	-0.25	-0.29	-0.51	-0.48	0.63	0.73	-0.3	-0.38	-0.19	-0.3	-0.15	-0.44	-0.0	0.78	0.42	0.0	-0.3	-0.29	-0.09	-0.35	-0.32	-0.24	1.2	-0.21	-0.28	-0.19	-0.1	-0.38	0.09	0.01	0.17
Lsat_1_v5_gn_1_30761.1	-0.22	-0.2	-0.25	-0.24	0.49	0.38	-0.39	-0.49	-0.33	-0.38	-0.32	-0.43	-0.08	0.86	0.53	0.01	-0.21	0.12	-0.03	-0.39	-0.2	-0.22	1.34	-0.42	-0.28	-0.2	-0.18	-0.34	0.12	-0.06	-0.03
Lsat_1_v5_gn_1_39720.1 (CAX2)	-0.48	-0.19	-0.3	-0.32	0.68	0.51	-0.45	-0.76	-0.28	-0.13	-0.05	-0.16	0.1	0.52	0.29	0.07	-0.14	-0.08	-0.22	-0.41	-0.19	-0.13	1.08	-0.43	-0.25	-0.27	-0.19	-0.27	0.16	0.27	0.31
Lsat_1_v5_gn_1_53840.1 (UPL4)	-1.0	-1.12	-1.13	-0.76	0.99	0.65	-0.59	-0.87	-0.28	-0.45	-0.18	-0.55	-0.66	1.39	0.96	-0.14	-0.74	0.35	-0.08	-0.78	-0.63	-0.6	1.7	-0.6	-0.59	-0.5	-0.37	-0.77	0.33	0.13	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_55421.1	-0.3	-0.25	-0.43	-0.52	0.41	0.46	0.05	0.12	-0.44	-0.43	-0.14	-0.4	0.14	0.64	0.58	0.02	-0.1	0.17	0.03	-0.37	-0.33	-0.13	0.94	-0.35	-0.29	-0.26	-0.18	-0.36	0.09	0.01	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_61921.1 (DDP2)	-0.2	-0.23	-0.31	-0.21	0.31	0.18	-0.14	-0.01	-0.35	-0.22	-0.28	-0.25	0.11	0.62	0.35	-0.01	-0.18	-0.02	-0.06	-0.42	-0.37	-0.25	1.14	-0.41	-0.22	-0.23	-0.21	-0.49	0.08	0.23	0.56
Lsat_1_v5_gn_1_64901.1 (PAO)	-0.47	-0.34	-0.68	-0.97	0.16	0.26	-0.28	-0.38	-0.66	-0.61	-0.53	-0.63	-0.32	1.04	0.67	0.1	-0.16	-0.24	0.23	-0.44	-0.2	-0.28	1.84	-0.37	-0.23	-0.36	-0.3	-0.31	0.47	0.13	-0.21
Lsat_1_v5_gn_1_74260.1 (MPK6)	-0.35	-0.21	-0.38	-0.27	0.47	0.32	-0.1	-0.12	-0.38	-0.37	-0.17	-0.44	-0.22	0.73	0.62	-0.05	-0.39	0.35	0.04	-0.28	-0.23	-0.15	1.12	-0.43	-0.34	-0.16	-0.28	-0.35	0.22	-0.03	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_77721.1 (GNK)	-0.26	-0.19	-0.78	-0.43	0.59	0.55	-0.37	-0.28	-0.32	-0.27	-0.17	-0.3	-0.01	0.76	0.58	-0.09	-0.31	-0.06	-0.0	-0.52	-0.36	-0.25	1.29	-0.19	-0.32	-0.28	-0.24	-0.38	0.12	0.02	0.26
Lsat_1_v5_gn_1_87300.1 (CALS3)	-0.6	-0.36	-0.22	-0.12	1.09	0.72	-0.88	-1.19	-0.32	-0.38	-0.11	-0.44	-0.52	0.98	0.51	0.01	-0.54	-0.67	-0.11	-0.74	-0.47	-0.35	1.63	-0.56	-0.44	-0.26	-0.2	-0.52	0.09	0.17	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_101461.1 (PPK1)	-0.31	-0.13	-0.15	0.03	0.83	0.55	-0.33	-0.21	-0.36	-0.31	-0.23	-0.44	-0.1	0.67	0.42	-0.1	-0.49	0.34	-0.33	-0.67	-0.41	-0.34	1.42	-0.49	-0.57	-0.39	-0.35	-0.32	0.14	-0.01	0.05
Lsat_1_v5_gn_2_12080.1 (ALMT9)	-0.33	-0.03	-0.7	-0.99	0.34	0.3	-0.13	-0.36	-0.57	-0.78	-0.66	-0.69	0.34	1.02	0.54	-0.12	-0.11	0.25	0.13	-0.32	-0.18	-0.17	1.54	-0.26	-0.21	-0.04	-0.37	-0.27	-0.21	-0.25	0.09
Lsat_1_v5_gn_2_133400.1 (UGT88A1)	-0.43	-0.64	-1.01	-1.42	-0.24	0.65	-0.01	0.45	-1.03	-1.01	-0.94	-1.03	0.42	1.49	0.72	-0.26	-0.5	0.17	0.3	-0.83	-0.57	-0.46	2.11	-0.43	-0.52	-0.54	-0.48	-0.54	-0.22	-0.41	-0.25
Lsat_1_v5_gn_2_136101.1 (CLPX)	-0.06	-0.21	-0.42	-0.53	0.51	0.18	-0.24	-0.33	-0.14	-0.1	-0.07	-0.22	-0.23	0.77	0.62	-0.13	-0.27	-0.7	-0.29	-0.31	-0.35	-0.28	1.54	-0.24	-0.29	-0.32	-0.19	-0.32	0.1	0.07	0.06
Lsat_1_v5_gn_2_19801.1 (NANMT)	-1.03	-1.25	-1.3	-1.85	-0.23	0.01	-0.37	-0.16	-1.21	-1.2	-1.12	-0.91	0.07	1.68	1.26	-0.39	-0.11	0.58	0.49	-0.48	-0.6	-0.58	2.35	-0.31	-0.47	-0.56	-0.52	-0.8	-0.35	-0.9	-0.23
Lsat_1_v5_gn_2_52280.1 (PDC1)	-1.49	-1.67	-2.1	-2.08	0.37	0.36	-0.58	-0.46	-0.83	-0.85	-0.74	-0.98	-0.13	1.5	1.2	0.22	0.07	0.36	0.15	-0.36	-0.58	-0.46	2.16	-0.65	-0.52	-0.64	-0.53	-0.66	-0.19	-0.28	0.42
Lsat_1_v5_gn_2_65401.1 (RKP)	-0.52	-0.28	-0.82	-0.77	0.47	0.39	-0.03	-0.04	-0.56	-0.48	-0.44	-0.6	-0.05	1.03	0.76	-0.06	-0.34	0.59	0.08	-0.48	-0.41	-0.39	1.43	-0.45	-0.45	-0.38	-0.34	-0.39	0.15	-0.1	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_6701.1 (LRS1)	-0.23	-0.16	-0.75	-0.61	0.65	0.39	-0.07	-0.05	-0.31	-0.28	-0.11	-0.3	0.07	0.73	0.48	-0.04	-0.26	0.01	-0.16	-0.38	-0.3	-0.24	1.19	-0.42	-0.35	-0.23	-0.16	-0.06	0.09	-0.0	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_67680.1	-0.37	-0.38	-0.21	-0.26	0.38	0.48	-0.06	-0.19	-0.29	-0.27	-0.29	-0.37	0.01	0.54	0.39	-0.06	-0.08	0.39	-0.24	-0.32	-0.19	-0.18	1.04	-0.37	-0.19	-0.16	-0.06	-0.3	0.05	0.04	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_68621.1 (GSR2)	-0.77	-0.92	-1.23	-1.27	0.64	0.9	-0.81	-0.88	-0.71	-0.72	-0.51	-0.63	-0.07	1.18	0.55	-0.18	-0.57	0.36	0.18	-0.53	-0.22	-0.05	1.54	-0.19	-0.14	-0.15	-0.13	-0.33	0.37	0.11	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_69340.1 (RAD4)	-0.84	-0.53	-0.72	-0.72	-0.07	-0.05	-0.24	-0.05	-0.56	-0.74	-0.49	-0.74	0.07	0.72	0.19	-0.24	-0.43	0.49	-0.26	-0.44	-0.25	-0.17	1.86	-0.33	-0.19	-0.15	-0.28	-0.22	0.25	0.47	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_72300.1 (AAE5)	-0.6	-0.47	-0.62	-0.28	0.77	0.79	-0.97	-1.5	-0.39	-0.46	-0.26	-0.7	-0.59	1.27	0.65	-0.05	-0.63	0.27	0.03	-0.77	-0.32	-0.43	1.94	-0.63	-0.5	-0.38	-0.47	-0.76	0.11	-0.04	-0.06
Lsat_1_v5_gn_2_78240.1 (NERD1)	-0.38	-0.38	-0.54	-0.51	0.44	0.42	-0.39	-0.42	-0.31	-0.35	-0.24	-0.4	0.03	0.94	0.56	0.02	-0.28	0.22	-0.07	-0.41	-0.21	-0.16	1.27	-0.31	-0.29	-0.21	-0.14	-0.35	0.1	-0.0	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_86320.1	-0.58	-0.41	-0.51	-0.44	0.35	0.4	-0.2	-0.21	-0.32	-0.28	-0.17	-0.38	0.04	0.84	0.6	0.07	-0.2	-0.28	-0.01	-0.2	-0.27	-0.17	1.14	-0.21	-0.28	-0.15	-0.16	-0.27	0.25	0.05	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_90520.1 (CW7)	-0.5	-0.29	-0.45	-0.68	0.36	0.37	-0.12	0.07	-0.33	-0.22	-0.24	-0.09	0.2	0.77	0.57	0.11	-0.1	-0.03	-0.1	-0.25	-0.33	-0.35	1.05	-0.35	-0.33	-0.19	-0.13	-0.31	0.03	0.07	0.15
Lsat_1_v5_gn_2_97481.1 (XDH1)	0.1	-0.06	-0.44	-0.58	0.9	0.54	-0.28	-0.17	-0.37	-0.46	-0.32	-0.58	-0.41	0.99	0.52	-0.11	-0.59	-0.12	-0.44	-0.74	-0.47	-0.37	1.8	-0.47	-0.44	-0.43	-0.37	-0.42	0.13	-0.15	-0.25
Lsat_1_v5_gn_3_10081.1 (SPA2)	-0.6	-0.32	-0.73	-0.86	0.12	0.31	0.05	0.25	-0.49	-0.5	-0.48	-0.47	0.17	0.99	0.71	0.08	-0.06	0.44	-0.13	-0.34	-0.39	-0.29	1.27	-0.36	-0.35	-0.26	-0.19	-0.23	-0.06	-0.01	0.11
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.