1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_116 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
2.57 2.17 3.27 3.73 6.08 5.29 3.54 3.47 4.09 4.07 4.1 4.32 6.58 8.85 6.65 4.88 4.59 8.47 4.39 4.16 3.44 3.91 11.54 4.05 4.13 4.21 4.4 3.56 5.35 6.18 9.55
29.35 33.42 33.72 35.29 65.46 69.02 45.45 46.82 44.83 44.19 45.67 45.37 111.6 106.01 83.19 52.88 50.35 109.06 55.05 47.32 47.25 48.43 124.01 53.57 56.46 51.56 55.18 44.1 69.39 64.12 107.9
2.06 1.85 1.79 2.13 4.46 3.98 2.73 2.59 2.85 2.88 2.85 3.44 4.16 5.42 4.95 3.49 3.28 5.46 2.87 3.12 2.76 3.18 5.73 2.91 3.72 2.87 3.49 3.58 3.44 3.74 5.59
9.2 11.0 8.99 9.25 15.93 15.46 10.83 11.51 11.13 12.11 12.64 13.75 18.6 17.77 15.52 14.85 13.67 17.97 12.62 11.9 11.65 12.16 20.47 11.8 12.42 12.77 12.21 12.46 15.64 15.92 20.65
4.8 6.07 5.1 4.97 10.3 11.08 8.35 8.88 7.86 7.46 8.21 7.06 15.27 15.92 12.32 7.94 8.27 16.06 8.95 8.79 8.6 8.41 17.43 8.38 9.59 8.56 9.44 8.25 10.64 10.46 19.48
10.13 11.45 12.17 12.65 20.2 18.51 11.76 10.76 12.35 13.1 14.07 14.08 18.14 21.12 19.37 15.14 13.16 19.52 12.03 11.03 12.04 12.11 26.2 11.44 12.09 12.62 12.18 13.41 18.38 17.89 22.35
4.0 4.02 3.35 4.57 6.84 6.02 4.33 4.39 4.16 4.24 4.78 4.67 7.55 8.73 7.44 5.25 4.6 6.4 4.41 4.16 4.32 4.39 7.73 4.36 4.31 4.24 4.28 4.74 5.38 5.29 7.09
10.4 10.29 10.16 10.84 14.4 13.8 10.35 10.78 9.82 9.54 10.55 9.29 14.05 17.89 15.2 11.56 11.16 14.1 10.1 9.01 9.75 10.55 14.23 9.92 10.02 10.86 10.98 10.74 13.29 12.47 13.87
4.81 4.31 4.48 6.3 8.75 9.45 5.46 6.71 5.53 5.12 5.5 5.77 8.53 10.83 9.54 6.35 6.26 11.23 6.36 5.74 5.78 6.08 11.04 5.25 5.48 5.81 5.71 6.02 8.72 8.89 10.84
5.36 5.44 5.14 5.4 8.56 7.76 7.34 9.68 6.67 6.24 7.15 6.65 10.25 13.27 10.99 8.32 7.53 8.67 7.48 6.68 7.87 7.44 13.51 7.68 7.42 7.31 7.6 6.27 9.74 9.43 11.93
2.61 3.38 3.72 4.19 7.47 7.37 5.33 5.3 4.53 4.72 5.07 4.36 9.09 11.85 8.13 6.27 5.52 10.51 4.9 4.11 4.63 4.79 15.02 4.7 4.97 5.02 5.14 3.9 7.66 8.48 14.75
7.73 7.39 8.38 8.8 10.65 10.48 8.37 8.61 7.44 7.72 7.88 8.74 14.02 16.49 14.3 9.13 9.61 17.98 8.97 7.87 8.39 10.55 18.36 9.17 9.26 9.92 8.96 8.83 11.27 11.02 15.96
7.57 9.42 8.66 11.31 18.27 19.45 12.63 12.96 12.92 12.21 14.16 12.7 17.64 22.33 20.98 15.66 14.88 22.46 14.52 11.72 12.24 14.36 24.6 12.69 13.52 12.91 12.4 12.5 18.6 17.99 22.84
10.35 11.12 9.34 11.78 16.35 16.82 15.09 17.47 14.61 14.61 14.52 14.0 24.89 26.59 25.94 19.44 17.72 17.35 15.67 15.94 14.93 13.23 31.19 15.16 13.04 13.8 14.61 13.68 19.47 18.24 25.6
6.67 6.6 7.38 8.31 11.62 11.72 8.98 8.58 8.53 9.04 9.83 9.42 13.44 14.84 13.33 10.63 9.46 14.28 9.38 9.63 8.63 9.87 19.69 9.07 9.58 10.02 9.72 8.89 12.19 11.9 14.79
1.54 1.9 1.49 2.15 3.0 3.5 2.79 3.04 2.34 2.55 2.45 2.89 3.27 3.75 3.82 3.17 2.32 3.1 2.72 2.71 2.53 2.81 4.41 2.53 2.53 2.68 2.66 2.39 3.43 3.66 4.24
0.79 0.78 0.43 0.77 1.4 1.22 1.13 0.96 0.84 0.66 1.08 0.77 2.69 3.43 2.25 1.33 1.03 3.16 1.08 0.92 0.96 1.08 2.45 1.04 0.96 1.38 1.24 0.99 2.01 1.69 3.96
5.68 6.46 5.83 6.55 13.21 12.62 8.87 10.45 8.63 8.87 9.51 9.83 19.53 31.27 23.49 11.76 11.1 24.98 11.49 9.65 9.65 9.92 39.55 10.9 10.75 9.05 8.65 6.42 19.0 20.87 39.93
9.34 9.58 10.33 12.83 16.14 15.78 10.11 10.19 11.79 12.6 12.81 11.71 19.89 21.27 18.67 14.09 12.12 16.67 10.68 9.69 10.31 10.84 22.09 10.54 10.64 11.33 11.3 11.63 13.98 15.12 19.52
6.39 6.75 5.62 7.55 12.56 11.72 9.75 9.82 7.17 8.03 9.0 7.82 14.04 15.52 12.7 9.44 8.56 12.03 9.63 8.04 7.47 7.84 15.51 7.69 8.93 8.55 8.72 6.83 9.74 11.24 16.64
12.19 13.53 13.54 15.58 27.39 25.99 17.68 17.31 17.58 20.14 20.59 19.3 31.5 39.22 35.06 19.89 18.35 48.04 31.61 20.15 16.69 17.34 43.28 17.48 18.34 18.75 18.9 14.72 26.8 26.81 38.29
1.46 1.71 1.28 1.67 4.8 4.39 2.46 2.9 2.18 2.31 2.73 2.82 8.41 9.15 5.75 3.43 3.0 8.92 3.42 3.28 2.48 3.35 7.38 3.72 3.7 3.22 2.89 2.88 3.98 4.17 9.91
5.89 6.61 5.98 6.99 10.06 9.87 8.87 10.88 7.19 7.74 8.28 8.58 13.39 14.71 11.64 9.0 9.06 12.85 8.09 7.88 7.93 8.07 20.07 8.91 8.6 8.68 8.13 8.29 10.59 11.28 19.09
12.59 16.0 12.08 12.12 20.11 21.43 21.84 21.12 18.29 20.1 19.99 20.36 25.74 25.68 27.13 23.5 21.76 20.63 19.05 17.72 17.6 17.47 32.24 17.06 18.28 18.89 19.17 17.19 22.83 25.65 32.62
2.5 3.55 2.31 2.55 5.09 5.21 3.62 2.96 3.78 3.85 3.74 3.85 5.7 6.15 5.43 4.35 4.37 4.95 3.56 3.16 3.35 3.37 6.97 3.34 3.29 3.63 3.45 4.05 4.72 4.89 6.85
18.67 17.28 18.03 17.61 41.42 42.15 25.85 23.96 25.81 27.08 29.11 28.42 45.7 50.31 41.95 33.0 30.15 40.79 33.53 29.89 29.23 32.08 57.38 29.1 32.76 32.41 33.54 29.18 43.41 41.32 63.72
8.98 8.25 7.42 9.55 12.5 12.34 11.69 11.94 7.93 7.71 7.8 7.63 18.64 19.13 13.94 10.78 10.32 17.38 9.88 8.84 10.02 9.33 26.78 10.04 10.98 9.69 10.05 9.7 12.96 11.13 22.51
7.01 8.35 7.58 8.25 13.42 13.47 10.66 11.53 8.23 9.06 9.36 9.1 17.3 18.46 15.89 11.47 10.45 13.86 11.47 8.8 9.91 10.18 23.66 9.38 9.74 9.98 9.62 8.74 13.9 14.02 22.51
3.45 4.57 3.27 4.49 8.2 8.37 6.54 6.36 6.3 7.58 7.23 7.24 10.55 11.28 9.73 8.08 7.63 12.24 7.55 6.72 7.04 7.3 12.27 7.05 6.9 7.5 7.63 6.86 8.67 9.14 11.7
0.7 0.94 0.5 0.73 1.49 1.7 1.05 0.99 1.08 1.02 0.81 1.06 2.14 2.0 1.69 1.08 0.88 2.49 1.16 0.8 0.86 0.93 2.41 1.02 0.97 1.18 0.95 0.89 1.63 1.4 2.52
6.9 8.79 8.56 8.86 14.17 12.78 7.76 7.46 9.87 10.32 11.0 10.69 15.65 15.49 13.19 11.55 11.03 13.49 9.32 9.1 8.75 9.1 20.76 8.81 9.95 9.73 9.59 9.34 13.86 13.67 19.14
22.02 18.44 19.0 23.09 31.63 31.49 24.29 28.65 28.92 29.61 29.07 32.93 45.68 55.45 46.14 32.81 33.73 55.49 28.44 32.79 29.54 29.96 49.88 31.76 32.85 30.48 32.71 28.44 34.03 37.93 46.81
0.91 0.55 0.96 0.88 2.84 3.11 1.45 1.35 1.54 1.91 1.7 2.0 2.74 4.41 3.87 1.65 1.36 3.09 1.98 1.74 1.46 1.47 3.34 1.9 1.51 1.8 1.95 0.94 2.4 3.05 4.51
0.26 0.36 0.33 0.32 0.89 0.6 0.5 0.45 0.55 0.41 0.64 0.54 1.4 1.61 1.03 0.52 0.5 1.88 0.56 0.5 0.54 0.52 1.6 0.51 0.73 0.6 0.61 0.52 0.9 0.87 1.95
10.12 9.88 9.23 10.72 13.8 13.64 9.42 9.58 10.16 10.06 10.89 10.77 18.89 20.66 16.8 12.6 11.72 22.69 13.06 11.33 10.07 10.45 21.34 10.91 10.86 10.61 10.25 10.82 14.1 13.15 19.83
4.13 4.26 3.28 3.35 8.4 7.62 4.15 4.7 3.83 3.83 4.43 4.14 9.53 9.43 8.18 4.34 4.14 11.39 5.11 3.72 4.22 4.74 13.56 4.59 4.97 4.51 4.8 4.28 6.26 6.49 11.64
3.62 3.4 4.68 4.97 12.03 12.32 5.72 6.23 7.86 7.81 7.9 7.82 10.71 18.77 13.41 6.86 7.77 13.69 7.84 5.27 6.42 8.31 15.32 8.27 7.19 7.95 7.75 5.24 10.12 8.52 12.9
2.04 1.68 2.5 3.01 7.0 5.05 2.21 1.98 3.16 3.24 3.08 3.61 5.94 9.12 8.61 3.43 3.61 10.57 5.1 3.0 2.53 3.35 9.01 3.1 3.29 2.69 2.81 3.16 4.4 4.54 7.73
9.17 8.77 9.74 10.68 13.65 13.21 9.3 9.03 8.7 9.48 10.46 9.17 16.53 18.85 15.56 10.45 9.84 11.94 10.85 8.72 9.32 10.06 15.22 9.18 9.29 9.5 9.46 10.68 12.59 10.78 15.26
2.69 2.84 2.64 2.55 8.11 7.06 3.06 3.1 3.78 3.73 4.53 4.38 11.18 9.54 8.27 5.0 4.43 9.91 3.71 3.39 3.9 4.33 11.6 4.03 4.41 4.89 4.14 3.16 6.46 7.72 12.64
7.17 7.16 6.84 6.33 10.62 13.01 12.45 12.83 9.38 10.29 9.95 10.03 15.09 16.52 14.97 13.29 11.64 10.77 11.37 9.86 10.38 9.78 19.24 9.78 10.45 10.24 10.39 10.76 11.33 12.26 15.12
8.43 8.31 4.84 4.56 20.3 14.23 6.74 7.93 8.63 6.92 6.97 6.84 17.53 25.16 21.54 9.04 7.22 22.65 10.43 8.21 8.0 6.75 32.49 9.34 8.19 8.35 8.65 7.18 12.01 12.86 28.42
14.1 12.64 13.93 14.63 31.13 28.58 18.01 20.02 19.1 19.52 21.46 21.94 35.97 38.89 31.3 21.52 20.66 38.14 24.91 19.87 18.22 21.65 44.11 20.54 21.73 22.51 21.46 19.49 24.72 26.03 48.57
0.65 0.56 0.58 0.68 2.13 2.35 0.97 0.63 1.26 1.52 1.66 1.65 2.29 3.71 2.89 1.74 1.49 2.94 1.62 1.39 1.15 1.55 3.07 1.49 1.8 1.67 1.85 1.12 1.98 1.93 2.83
25.75 24.74 30.04 32.01 35.02 36.8 38.82 39.65 29.6 31.19 32.84 32.41 55.92 61.47 61.03 42.04 41.67 39.54 38.52 36.05 33.25 33.15 67.51 34.92 35.18 33.79 34.16 28.8 42.92 43.34 70.5
4.31 4.69 4.06 5.2 14.83 17.31 8.17 8.03 10.02 10.76 11.03 10.87 16.4 25.24 20.06 13.29 12.03 25.02 14.59 10.66 9.95 11.96 22.58 11.41 11.95 11.19 13.5 9.3 15.97 16.9 22.9
1.39 1.84 1.38 1.54 3.12 2.89 1.32 1.27 1.87 2.35 2.76 2.55 4.31 5.77 3.9 2.08 2.22 4.04 2.3 1.55 1.38 2.21 5.33 1.96 2.27 1.67 2.2 1.95 2.8 2.94 5.7
1.5 2.19 1.56 2.19 3.19 2.93 1.98 1.64 1.91 2.28 2.32 2.27 3.94 3.67 2.78 2.36 2.11 3.46 2.31 2.24 2.09 2.16 4.39 2.15 2.22 2.53 2.32 2.49 3.09 3.21 4.52
1.79 2.21 2.09 2.45 5.01 4.58 2.9 2.7 2.74 3.09 3.51 3.0 5.76 6.57 5.24 3.74 3.39 5.63 3.48 3.13 2.85 2.91 7.09 3.19 3.02 3.6 3.59 2.57 4.41 4.7 8.69
9.51 11.39 10.55 11.45 19.0 19.71 16.34 14.92 15.56 17.04 19.31 17.81 31.96 34.94 27.54 18.49 17.04 35.3 22.52 17.71 16.5 17.07 34.19 20.31 17.24 17.54 17.0 16.04 23.01 23.94 43.38
22.24 19.0 16.24 20.69 48.81 61.27 40.6 45.64 40.13 42.54 40.33 46.39 90.34 121.06 94.49 63.67 52.79 112.03 58.79 47.2 47.6 50.54 108.65 55.36 53.28 50.53 52.26 36.76 53.95 59.29 96.44
3.07 3.55 2.93 4.07 9.96 7.61 5.25 4.96 6.02 5.85 6.05 6.23 11.49 13.33 11.34 6.7 6.12 13.95 7.88 5.98 5.79 5.99 14.15 6.1 6.26 6.31 6.39 5.68 9.76 9.25 15.22
8.14 9.13 7.49 6.8 16.57 17.17 12.81 12.61 10.54 11.18 12.34 12.99 18.3 16.24 13.7 13.61 12.83 17.58 12.73 12.09 11.46 13.28 22.96 12.19 13.42 12.7 13.16 11.46 15.72 16.43 25.21
10.08 9.61 8.25 10.37 17.04 18.74 15.05 17.82 12.84 12.2 13.73 13.61 24.87 28.32 26.22 17.74 16.99 20.65 15.64 14.33 14.61 14.94 35.28 15.68 14.58 14.48 13.92 14.04 20.17 19.22 33.69
6.39 7.19 7.54 9.42 12.19 11.85 9.15 9.43 8.59 8.62 8.56 8.7 13.43 14.29 12.56 9.38 9.79 14.54 9.23 8.41 8.18 8.48 19.54 8.51 9.49 9.27 9.52 8.79 10.22 10.59 15.42
9.13 10.28 7.53 7.93 17.14 18.58 13.47 13.44 12.21 11.99 13.25 13.34 20.32 20.65 18.81 15.92 14.82 17.61 12.96 12.66 13.01 13.06 24.69 13.14 13.25 13.82 13.59 12.72 18.1 18.21 24.93
2.9 3.18 2.46 3.23 6.13 6.91 4.43 3.92 4.76 4.82 5.62 5.52 7.98 9.23 7.7 5.01 5.23 7.51 5.98 4.62 5.41 4.66 8.33 4.79 4.43 5.47 5.01 4.04 6.19 7.27 10.84
4.38 5.02 3.99 4.9 7.97 7.69 6.13 6.54 6.29 6.59 7.03 6.84 9.79 11.15 9.19 8.05 7.76 8.6 7.27 6.18 6.78 6.78 12.65 6.44 6.26 6.82 6.9 6.24 7.63 7.92 11.04
1.06 1.12 0.55 0.82 3.18 2.92 1.54 1.77 1.47 1.72 1.46 1.57 4.87 5.0 4.0 2.85 1.69 3.75 2.02 1.53 1.84 1.79 7.73 1.91 1.99 1.92 1.74 1.73 2.92 3.39 8.24
8.88 8.78 7.53 7.79 13.5 14.0 10.78 9.8 10.65 10.86 10.4 10.55 15.67 16.36 15.37 13.11 12.54 15.31 11.97 10.3 10.35 11.94 19.63 11.15 11.23 11.46 11.47 10.22 13.95 14.54 17.76
6.86 7.6 5.8 5.96 12.1 11.88 9.4 10.34 7.93 8.65 8.94 9.14 15.86 18.21 15.72 10.37 9.81 13.37 10.35 8.55 8.71 8.83 24.74 9.36 9.04 9.36 9.24 8.76 13.77 13.43 21.88
3.08 3.54 2.49 2.44 7.8 6.59 2.91 3.31 3.24 3.16 3.43 3.51 8.05 9.97 6.89 3.99 3.47 9.34 3.74 3.02 3.29 3.49 14.03 3.74 3.65 3.59 3.58 3.08 5.38 5.49 11.74
3.78 4.32 4.16 5.36 8.76 7.66 4.1 3.78 5.08 5.54 5.83 5.59 6.39 9.06 7.94 6.41 5.26 7.14 5.3 4.97 5.16 5.19 11.59 4.11 5.19 5.23 5.26 5.12 7.35 7.02 8.62
5.86 6.69 6.81 8.01 11.28 12.05 9.33 9.32 8.35 10.26 9.5 8.94 15.69 15.94 13.02 10.89 11.08 11.78 9.15 9.87 9.83 10.79 18.89 10.16 11.03 10.53 10.02 8.69 12.07 11.41 17.77

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)