Heatmap: Cluster_18 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10760.1	-0.94	-0.48	-0.55	0.32	0.72	0.08	-0.92	-0.95	-0.09	-0.34	0.21	-0.2	-0.24	0.36	0.37	-0.34	-0.57	0.77	-0.26	-0.66	-0.68	-0.52	1.56	-0.58	-0.35	-0.73	-0.54	-0.61	0.33	0.35	1.04
Lsat_1_v5_gn_0_14601.1 (ARI8)	-0.33	-0.43	-0.32	-0.01	0.61	0.35	-0.48	-0.61	-0.27	-0.31	-0.19	-0.35	-0.18	0.91	0.57	-0.13	-0.47	1.08	-0.19	-0.48	-0.43	-0.38	1.14	-0.52	-0.45	-0.31	-0.32	-0.57	0.08	-0.03	0.2
Lsat_1_v5_gn_0_14761.1	-1.21	-1.03	-1.11	-0.86	-0.01	-0.24	-0.46	-0.39	-0.35	-0.35	-0.32	-0.44	-0.2	0.91	0.59	-0.17	-0.37	1.61	-0.0	-0.34	-0.4	-0.42	1.31	-0.34	-0.55	-0.23	-0.26	-0.59	0.16	0.3	0.75
Lsat_1_v5_gn_0_16501.1	-0.23	-0.27	-0.43	-0.62	0.53	0.04	-0.85	-1.04	-0.68	-0.41	-0.3	-0.48	-0.26	0.52	0.12	-0.36	-0.39	1.97	-0.21	-0.63	-0.54	-0.29	1.67	-0.72	-0.57	-0.47	-0.3	-0.58	-0.05	-0.09	0.14
Lsat_1_v5_gn_0_22900.1 (sks18)	-0.42	-0.78	0.14	0.04	0.73	-0.18	-1.12	-1.73	-0.48	-0.6	-0.42	-0.9	-0.07	1.08	0.14	-0.44	-0.49	1.61	-0.92	-0.83	-1.15	-1.06	1.89	-0.65	-0.68	-1.02	-0.43	-0.87	0.03	0.19	0.98
Lsat_1_v5_gn_0_23481.1 (BET9)	-0.43	-0.46	-0.3	-0.02	0.3	0.17	-0.11	0.06	-0.46	-0.45	-0.16	-0.46	0.04	0.58	0.42	-0.12	-0.18	0.76	-0.22	-0.42	-0.37	-0.39	1.31	-0.44	-0.32	-0.33	-0.23	-0.38	0.09	0.09	0.31
Lsat_1_v5_gn_0_26921.1	-0.57	-0.88	-0.61	-0.22	0.14	0.18	-0.3	-0.3	-0.48	-0.29	-0.25	-0.31	0.3	0.67	0.52	0.04	-0.23	0.73	-0.11	-0.28	-0.38	-0.35	1.26	-0.31	-0.38	-0.18	-0.15	-0.54	0.18	0.16	0.52
Lsat_1_v5_gn_0_29760.1	-0.96	-0.38	-1.18	-0.88	0.18	-0.11	-0.88	-0.73	-0.55	-0.39	-0.26	-0.43	-0.23	0.85	0.61	-0.34	-0.55	1.61	-0.07	-0.4	-0.53	-0.63	1.73	-0.61	-0.37	-0.36	-0.33	-0.65	0.22	0.19	0.55
Lsat_1_v5_gn_0_31381.1 (SNL2)	-0.51	-0.31	-0.49	-0.2	0.48	0.39	-0.25	-0.34	-0.3	-0.36	-0.08	-0.38	-0.13	0.71	0.36	-0.19	-0.52	0.88	-0.37	-0.61	-0.53	-0.42	1.42	-0.51	-0.4	-0.3	-0.3	-0.47	0.25	0.15	0.49
Lsat_1_v5_gn_0_34021.1 (EBS5)	-0.2	-0.18	-0.23	-0.28	0.59	0.29	-0.27	-0.15	-0.33	-0.39	-0.25	-0.27	0.17	0.41	0.38	-0.03	-0.1	0.95	-0.28	-0.45	-0.34	-0.34	1.07	-0.54	-0.3	-0.3	-0.18	-0.26	0.01	-0.02	0.04
Lsat_1_v5_gn_1_102200.1	-1.0	-1.44	-0.69	-0.39	0.42	0.25	-0.02	-0.04	-0.79	-0.69	-0.28	-0.63	-0.11	0.31	0.35	-0.67	-0.7	2.09	-1.12	-0.63	-0.65	-0.68	2.0	-0.59	-0.86	-0.23	-0.73	-1.02	-0.1	-0.29	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_106881.1 (DEG9)	-1.31	-1.74	-1.15	-0.57	0.59	0.3	-0.38	-0.67	0.03	-0.01	0.01	-0.19	-0.21	-0.11	0.14	-0.06	-0.37	0.61	-0.15	-0.25	-0.26	-0.37	1.65	-0.28	-0.25	-0.24	-0.23	-0.73	0.43	0.44	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_108541.1 (SPT42)	-0.63	-0.54	-0.63	-0.49	0.27	0.19	-0.47	-0.36	-0.49	-0.44	-0.35	-0.58	0.23	0.89	0.51	-0.11	-0.31	1.1	-0.15	-0.38	-0.43	-0.25	1.11	-0.36	-0.27	-0.01	-0.27	-0.47	0.14	0.09	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_113361.1 (SNF7.1)	-1.09	-0.27	-0.93	-1.01	0.09	-1.07	-2.01	-1.34	-1.5	-0.2	-0.59	0.08	-0.21	0.5	0.34	-1.05	-0.7	1.33	-1.27	-1.75	-1.44	-0.79	2.63	-2.25	-1.03	-1.63	-0.79	-2.1	0.46	0.71	1.88
Lsat_1_v5_gn_1_12301.1	-0.56	-0.74	-0.89	-0.97	0.39	0.29	-0.57	-0.38	-0.6	-0.47	-0.28	-0.21	0.41	0.46	0.37	-0.11	-0.21	1.04	-0.03	-0.3	-0.22	-0.17	1.35	-0.32	-0.03	-0.13	-0.18	-0.27	0.12	0.06	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_126820.1	-1.04	-0.5	-0.85	-0.83	0.53	0.43	-0.95	-1.09	-0.5	-0.76	-0.6	-0.45	0.03	1.02	0.65	-0.28	-0.67	1.51	-0.2	-0.64	-0.64	-0.56	1.48	-0.63	-0.48	-0.3	-0.41	-1.05	0.3	0.27	0.89
Lsat_1_v5_gn_1_127601.1 (UBQ10)	-1.07	-1.2	-1.07	-0.59	0.29	0.33	-0.2	0.23	-0.4	-0.62	-0.41	-0.6	-0.94	0.59	0.48	-0.33	-0.64	1.8	-0.26	-0.68	-0.45	-0.46	2.04	-0.63	-0.55	-0.59	-0.6	-0.92	0.08	-0.09	0.06
Lsat_1_v5_gn_1_1441.1 (SCYL2B)	-0.41	-0.25	-0.49	-0.3	0.42	0.26	-0.45	-0.35	-0.33	-0.32	-0.22	-0.31	0.1	0.75	0.53	0.06	-0.28	0.9	-0.11	-0.41	-0.37	-0.29	1.05	-0.47	-0.43	-0.27	-0.33	-0.4	0.23	0.11	0.25
Lsat_1_v5_gn_1_1740.1 (UBP16)	-0.54	-0.67	-0.63	-0.6	-0.02	0.11	-0.3	-0.33	-0.33	-0.36	-0.21	-0.44	0.16	0.67	0.49	-0.12	-0.33	1.17	-0.1	-0.33	-0.49	-0.34	1.35	-0.33	-0.27	-0.45	-0.46	-0.65	0.21	0.2	0.72
Lsat_1_v5_gn_1_17900.1	-0.29	-0.3	-0.58	-0.31	0.13	0.2	-0.2	-0.3	-0.22	-0.29	-0.22	-0.31	0.11	0.54	0.38	-0.06	-0.12	0.51	-0.19	-0.22	-0.22	-0.15	0.96	-0.25	-0.24	-0.13	-0.08	-0.3	0.16	0.19	0.51
Lsat_1_v5_gn_1_1961.1	-0.6	-0.38	-0.71	-0.7	0.21	0.06	-0.28	-0.34	-0.43	-0.28	-0.26	-0.24	0.25	0.73	0.4	0.07	-0.14	0.83	-0.12	-0.43	-0.44	-0.36	1.34	-0.43	-0.34	-0.25	-0.24	-0.26	0.21	0.15	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_21140.1 (ABF2)	-0.76	-0.88	-1.18	-1.35	0.05	0.19	-0.72	-0.69	-0.55	-0.66	-0.41	-0.57	-0.33	1.29	0.84	-0.4	-0.77	1.62	0.02	-0.73	-0.61	-0.49	1.72	-0.42	-0.51	-0.56	-0.58	-1.12	0.47	0.27	0.4
Lsat_1_v5_gn_1_22260.1 (RD21B)	-0.86	-0.72	-1.52	-1.69	-0.17	-0.53	-1.68	-2.18	-0.94	-0.92	-0.62	-0.52	1.53	0.16	0.62	-1.2	-1.02	2.2	-1.43	-0.66	-1.13	-0.94	2.54	-1.18	-0.96	-1.01	-1.28	-1.56	-1.3	-0.85	1.39
Lsat_1_v5_gn_1_26880.1 (SIS3)	-1.04	-1.44	-1.6	-0.85	0.12	0.13	-0.76	-0.95	-0.37	-0.21	-0.41	-0.46	0.01	0.43	0.3	0.0	-0.33	1.94	0.08	-0.49	-0.54	-0.2	1.84	-0.38	-0.5	-0.59	-0.19	-0.35	-0.14	-0.08	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_32281.1 (SCD2)	-0.39	-0.3	-0.53	-0.47	0.52	0.36	-0.33	-0.43	-0.4	-0.22	-0.25	-0.31	-0.09	0.61	0.42	-0.11	-0.2	1.27	-0.09	-0.33	-0.25	-0.17	0.97	-0.57	-0.38	-0.15	-0.23	-0.46	0.05	-0.07	0.17
Lsat_1_v5_gn_1_34301.1	-0.42	-0.56	-0.54	-0.49	0.3	0.26	-0.14	-0.12	-0.58	-0.66	-0.55	-0.53	0.29	0.77	0.53	-0.15	-0.22	1.1	-0.18	-0.58	-0.4	-0.29	1.42	-0.35	-0.34	-0.24	-0.32	-0.21	0.03	-0.15	0.2
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Lsat_1_v5_gn_1_4261.1	-0.28	-0.27	-0.18	-0.15	0.51	0.24	-0.39	-0.34	-0.36	-0.34	-0.32	-0.46	0.02	0.72	0.58	-0.24	-0.42	1.01	-0.28	-0.59	-0.32	-0.42	1.37	-0.53	-0.43	-0.58	-0.39	-0.38	-0.0	-0.0	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_48100.1	-1.16	-0.91	-0.75	-0.76	0.75	0.24	-0.86	-0.87	-0.31	-0.57	-0.4	-0.34	0.43	0.17	0.12	-0.19	-0.47	2.06	-0.39	-0.95	-0.43	-0.6	1.7	-0.8	-0.58	-0.2	-0.53	-0.4	-0.09	-0.03	0.13
Lsat_1_v5_gn_1_50100.1	-2.01	-1.64	-2.03	-2.13	0.42	0.78	-0.71	-0.68	-0.85	-1.22	-0.63	-1.63	-1.22	1.03	0.72	-0.76	-1.26	2.32	-0.15	-1.04	-0.97	-0.78	2.41	-0.53	-0.79	-0.54	-0.75	-0.52	0.03	-0.31	-0.54
Lsat_1_v5_gn_1_54740.1	-2.07	-1.72	-1.62	-1.01	0.21	-0.32	-0.8	-1.02	-0.59	-0.25	-0.42	-0.3	-0.21	0.78	0.48	-0.56	-0.63	2.0	-0.44	-0.77	-0.75	-0.67	1.95	-0.64	-0.86	-0.64	-0.69	-1.16	0.41	0.4	1.2
Lsat_1_v5_gn_1_60260.1 (MVQ4)	-1.56	-1.66	-2.77	-0.97	0.15	0.07	-0.74	-0.71	-0.66	-0.56	-0.26	-0.7	-0.31	0.94	0.83	-0.05	-0.43	1.75	0.18	-0.56	-0.33	-0.47	1.85	-0.69	-0.39	-0.34	-0.24	-1.05	0.22	-0.03	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_68521.1 (CALS9)	-0.39	-0.03	-0.54	-0.52	0.83	0.3	-0.46	-0.38	-0.6	-0.49	-0.36	-0.44	-0.04	0.64	0.48	-0.16	-0.42	1.27	-0.25	-0.64	-0.56	-0.41	1.32	-0.64	-0.48	-0.46	-0.39	-0.53	0.1	0.11	0.47
Lsat_1_v5_gn_1_76041.1	-1.19	-1.14	-1.24	-1.65	-0.97	-0.68	-0.07	-0.21	-0.85	-0.44	-0.21	-0.76	1.11	1.0	0.36	-0.11	-0.2	1.36	-0.74	-0.96	-0.63	-0.56	1.99	-0.5	-0.85	-1.01	-1.18	-0.07	0.0	-0.18	1.27
Lsat_1_v5_gn_1_84160.1	-0.35	-0.23	-0.07	0.32	0.55	-0.07	-0.59	-0.56	-0.35	-0.25	-0.23	-0.21	0.17	0.5	0.31	-0.21	-0.38	0.86	-0.14	-0.42	-0.36	-0.3	1.06	-0.39	-0.37	-0.27	-0.28	-0.44	0.13	0.06	0.51
Lsat_1_v5_gn_1_8600.1	-0.57	-0.38	-0.72	-0.49	0.67	0.19	-0.62	-0.56	-0.68	-0.63	-0.47	-0.78	0.03	0.9	0.7	-0.2	-0.56	1.45	-0.36	-0.7	-0.57	-0.5	1.61	-0.49	-0.57	-0.47	-0.45	-0.67	0.13	0.02	0.48
Lsat_1_v5_gn_1_89541.1 (CYP71B36)	-	-	-	-	-1.18	-2.68	-	-	-	-2.72	-3.57	-2.67	2.07	1.1	-0.93	-	-3.66	2.91	-2.72	-2.26	-	-	3.58	-2.09	-	-	-3.51	-3.57	-2.1	-1.77	1.23
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.