Heatmap: Cluster_138 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_17361.1	-0.14	-0.46	-0.22	0.23	0.2	0.2	-0.23	-0.79	-0.21	-0.16	-0.17	-0.38	-0.1	0.71	0.47	-0.04	-0.11	0.69	-0.16	-0.41	-0.46	-0.42	1.4	-0.58	-0.64	-0.19	-0.22	-0.34	-0.01	0.09	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_112021.1	-0.23	-0.41	0.03	0.08	0.59	0.27	-0.64	-0.96	-0.44	-0.47	-0.32	-0.54	-0.6	0.91	0.56	-0.18	-0.52	0.91	-0.33	-0.59	-0.59	-0.58	1.73	-0.47	-0.56	-0.42	-0.3	-0.54	0.16	0.02	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_126440.1 (SPHK1)	-0.36	-0.45	-0.14	-0.14	0.5	0.42	-0.59	-0.41	-0.49	-0.31	-0.23	-0.44	0.32	0.8	0.41	-0.35	-0.62	0.59	-0.54	-0.43	-0.51	-0.29	1.45	-0.32	-0.49	-0.25	-0.5	-0.22	0.01	0.07	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_127701.1 (MSH6)	0.16	-0.23	-0.02	0.06	0.64	0.54	-0.08	-0.06	-0.38	-0.33	-0.38	-0.44	-0.45	0.53	0.49	-0.01	-0.27	0.28	-0.18	-0.57	-0.59	-0.47	1.01	-0.51	-0.47	-0.48	-0.32	-0.53	0.22	0.24	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_24741.1 (MO1)	-0.33	-0.17	0.0	0.38	0.37	0.6	-0.42	-0.48	-0.38	-0.42	-0.22	-0.69	-0.1	0.61	0.07	-0.4	-0.57	0.46	-0.21	-0.64	-0.34	-0.33	1.55	-0.52	-0.34	-0.1	-0.09	-0.7	0.25	0.09	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_29301.1 (DAP1)	-0.34	-0.46	-0.32	-0.34	0.71	0.6	-0.34	-0.24	-0.46	-0.44	-0.38	-0.44	0.19	1.1	0.78	0.0	-0.26	0.16	-0.11	-0.59	-0.42	-0.33	1.01	-0.49	-0.49	-0.29	-0.38	-0.35	0.16	-0.02	0.2
Lsat_1_v5_gn_1_36001.1 (FLL3)	-1.31	-1.18	-1.59	-1.38	1.3	0.92	-1.51	-1.27	-0.88	-0.58	-0.48	-0.77	-0.26	1.38	0.83	-0.06	-0.91	0.75	-0.19	-1.07	-0.74	-0.75	1.73	-0.42	-0.74	-1.03	-0.29	-0.93	0.2	0.28	1.0
Lsat_1_v5_gn_1_64141.1	-0.18	-0.07	-0.27	-0.04	0.4	0.32	-0.31	-0.18	-0.29	-0.24	-0.1	-0.28	0.08	0.94	0.54	-0.1	-0.29	0.29	-0.3	-0.43	-0.34	-0.33	0.97	-0.4	-0.42	-0.24	-0.29	-0.48	0.07	-0.01	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_68240.1 (PPK1)	-0.3	-0.32	-0.24	-0.09	0.77	0.26	-0.48	-0.26	-0.41	-0.37	-0.23	-0.26	0.16	0.84	0.45	-0.3	-0.57	0.52	-0.18	-0.6	-0.42	-0.44	1.1	-0.48	-0.47	-0.39	-0.34	-0.36	0.14	0.2	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_94401.1 (RLM3)	-0.07	-0.23	-0.24	-0.31	0.78	0.44	-0.33	-0.41	-0.63	-0.63	-0.37	-0.65	-0.26	0.63	0.45	-0.36	-0.2	0.33	-0.11	-0.78	-0.43	-0.13	1.35	-0.43	-0.35	-0.37	-0.1	-0.86	0.25	0.39	0.64
Lsat_1_v5_gn_1_98941.1	-0.88	-0.29	-0.54	-0.26	1.2	0.66	-1.55	-1.07	-0.8	-0.97	-0.7	-0.63	-0.45	1.11	0.96	-0.49	-1.32	1.16	-0.63	-1.3	-0.92	-0.47	1.66	-1.25	-1.01	-0.82	-0.55	-1.33	0.24	0.52	1.17
Lsat_1_v5_gn_1_99060.1	-0.23	-0.2	-0.36	-0.06	1.23	0.37	-0.92	-0.9	-0.68	-0.84	-0.33	-0.57	-0.56	1.04	0.73	-0.36	-0.65	0.99	-0.59	-1.16	-0.85	-0.8	1.56	-0.98	-0.82	-0.65	-0.6	-1.28	0.41	0.48	0.78
Lsat_1_v5_gn_2_102020.1 (MyoB7)	-0.31	-0.22	-0.09	0.05	0.42	0.26	-0.27	-0.31	-0.47	-0.3	-0.17	-0.42	-0.37	0.59	0.43	-0.01	-0.29	0.87	0.04	-0.34	-0.43	-0.28	1.06	-0.58	-0.41	-0.31	-0.3	-0.62	0.32	0.17	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_106500.1	-0.09	-0.08	-0.06	0.1	0.69	0.75	-1.36	-1.92	-0.98	-1.3	-0.87	-1.38	-0.23	1.3	0.32	-0.71	-1.45	1.11	-0.25	-1.19	-0.52	-0.63	2.02	-0.46	-0.49	-0.28	-0.19	-1.34	0.29	-0.03	0.23
Lsat_1_v5_gn_2_108360.1	-0.13	-0.11	-0.18	0.01	0.7	0.26	-0.44	-0.04	-0.22	-0.12	-0.09	-0.11	0.03	0.53	0.2	-0.26	-0.44	0.3	-0.21	-0.42	-0.35	-0.26	0.81	-0.28	-0.29	-0.31	-0.27	-0.23	0.23	0.13	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_113780.1 (PWR)	-0.14	-0.03	0.02	0.06	0.54	0.24	-0.08	-0.04	-0.24	-0.25	-0.15	-0.17	-0.31	0.49	0.28	-0.11	-0.26	0.46	-0.09	-0.37	-0.38	-0.31	0.73	-0.36	-0.44	-0.24	-0.2	-0.36	0.19	0.2	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_118280.1 (SDIR1)	-0.45	-0.56	-0.63	-0.33	0.54	0.41	-0.31	-0.46	-0.37	-0.43	-0.2	-0.47	-0.23	0.95	0.74	-0.17	-0.44	0.54	0.02	-0.47	-0.3	-0.27	1.11	-0.43	-0.46	-0.28	-0.04	-0.47	0.21	0.14	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_122780.1 (DLS1)	-0.23	-0.28	0.09	0.14	0.5	0.23	-0.63	-0.63	-0.38	-0.32	-0.17	-0.38	0.16	0.65	0.39	-0.11	-0.35	0.58	-0.39	-0.44	-0.43	-0.3	1.3	-0.41	-0.36	-0.25	-0.17	-0.41	0.03	0.02	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_125620.1 (SNX2a)	-0.23	-0.13	-0.04	0.18	0.55	0.23	-0.6	-1.03	-0.26	-0.2	-0.08	-0.29	-0.15	0.48	0.28	-0.11	-0.33	0.71	-0.41	-0.53	-0.43	-0.33	1.47	-0.49	-0.4	-0.23	-0.19	-0.45	0.01	-0.01	0.39
Lsat_1_v5_gn_2_33981.1	-1.73	-1.04	-1.31	-0.53	0.87	0.78	-0.99	-0.05	-0.63	-0.62	-0.27	-0.07	0.24	1.24	0.62	-0.34	-0.76	0.1	-0.44	-0.73	-0.39	-0.66	1.42	-0.5	-0.52	-0.32	-0.74	-0.5	0.46	0.12	1.08
Lsat_1_v5_gn_2_35961.1 (E2FB)	-0.79	-0.24	-0.6	-0.04	0.37	0.18	-0.51	-0.61	-0.3	-0.53	-0.06	-0.59	-0.25	0.88	0.68	-0.09	-0.4	0.67	0.08	-0.4	-0.34	-0.32	1.34	-0.25	-0.44	-0.26	-0.36	-0.44	0.34	0.24	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_38240.1 (CHR5)	-0.3	-0.06	-0.4	-0.26	0.51	0.29	-0.22	-0.26	-0.27	-0.19	-0.08	-0.19	0.05	0.67	0.43	0.05	-0.22	0.22	-0.11	-0.44	-0.35	-0.26	0.85	-0.45	-0.35	-0.17	-0.14	-0.33	0.25	0.13	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_41661.1 (SDG22)	-0.53	-0.88	-0.21	0.04	0.33	0.24	-0.19	-0.32	-0.17	-0.19	-0.2	-0.4	-0.18	0.88	0.43	-0.02	-0.2	0.43	-0.1	-0.33	-0.34	-0.14	0.8	-0.39	-0.24	-0.2	-0.11	-0.21	0.28	0.16	0.39
Lsat_1_v5_gn_2_5520.1	-0.52	-0.82	-0.17	0.05	0.53	0.47	-0.3	-0.62	-0.25	-0.3	-0.05	-0.51	-0.55	1.01	0.62	-0.07	-0.37	0.55	-0.03	-0.54	-0.38	-0.36	1.01	-0.39	-0.39	-0.22	-0.26	-0.47	0.24	0.21	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_56141.1	-0.05	-0.07	-0.19	-0.2	0.5	0.21	-0.08	-0.27	-0.11	-0.13	-0.04	-0.27	0.14	0.18	0.12	-0.03	-0.11	0.24	-0.32	-0.25	-0.28	-0.22	0.57	-0.1	-0.31	-0.11	-0.05	-0.13	0.04	0.21	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_76741.1 (IDD2)	-0.18	-0.54	-0.17	-0.09	0.82	0.48	-1.29	-1.4	-0.68	-0.76	-0.52	-0.59	-0.3	1.22	0.8	-0.21	-0.79	0.84	-0.18	-0.81	-0.83	-0.47	1.82	-0.52	-0.63	-0.67	-0.42	-0.83	0.22	0.15	0.18
Lsat_1_v5_gn_2_91901.1 (TOT3)	-0.88	-0.86	-0.55	-0.11	0.51	0.38	-0.41	-0.48	-0.37	-0.31	-0.14	-0.38	-0.69	1.07	0.78	-0.14	-0.62	0.76	0.2	-0.48	-0.42	-0.49	1.39	-0.46	-0.52	-0.63	-0.37	-0.8	0.4	0.38	0.23
Lsat_1_v5_gn_3_109960.1 (RTN20)	-0.42	-0.25	-0.29	-0.25	0.49	0.47	-0.28	-0.36	-0.12	-0.19	-0.16	-0.14	0.2	0.71	0.46	-0.02	-0.26	0.23	-0.42	-0.35	-0.3	-0.2	0.83	-0.4	-0.28	-0.22	-0.17	-0.27	0.21	0.0	0.37
Lsat_1_v5_gn_3_139541.1 (TAP46)	-0.49	-0.33	-0.59	-0.45	0.5	0.61	-0.36	-0.08	-0.34	-0.38	-0.23	-0.36	0.22	0.85	0.56	0.02	-0.26	0.3	-0.27	-0.62	-0.43	-0.37	1.23	-0.43	-0.44	-0.37	-0.31	-0.57	0.12	-0.01	0.63
Lsat_1_v5_gn_3_139961.1 (ATG6)	-0.36	-0.43	-0.21	-0.02	0.39	0.26	-0.54	-0.74	-0.24	-0.29	-0.05	-0.31	-0.22	0.84	0.6	-0.06	-0.36	0.46	-0.06	-0.31	-0.24	-0.25	0.92	-0.31	-0.36	-0.25	-0.13	-0.34	0.25	0.2	0.39
Lsat_1_v5_gn_3_25641.1	0.07	0.15	0.01	-0.01	0.64	0.53	-0.45	-0.2	-0.29	-0.41	-0.09	-0.29	-0.4	0.59	0.35	-0.15	-0.68	0.37	-0.0	-0.64	-0.49	-0.31	1.14	-0.47	-0.42	-0.35	-0.39	-0.44	0.22	0.21	0.16
Lsat_1_v5_gn_3_36081.1 (WDS1)	-0.44	-0.4	-0.2	-0.07	0.61	0.49	-0.2	-0.33	-0.38	-0.18	-0.1	-0.33	-0.17	0.71	0.51	-0.02	-0.4	-0.03	-0.09	-0.4	-0.31	-0.18	0.93	-0.39	-0.37	-0.14	-0.24	-0.46	0.28	0.22	0.44
Lsat_1_v5_gn_3_381.1 (PTPMT1)	-0.21	-0.45	-0.02	0.07	0.79	0.48	-0.5	-0.55	-0.35	-0.45	-0.26	-0.67	-0.45	0.92	0.59	-0.23	-0.71	0.66	-0.33	-0.55	-0.5	-0.46	1.37	-0.61	-0.39	-0.3	-0.3	-0.64	0.32	0.04	0.31
Lsat_1_v5_gn_3_46701.1 (SYT2)	-0.39	-0.41	-0.27	-0.1	0.58	0.36	-0.24	-0.4	-0.24	-0.13	-0.13	-0.11	0.19	0.53	0.5	-0.05	-0.24	0.48	-0.22	-0.4	-0.43	-0.39	0.98	-0.42	-0.34	-0.38	-0.34	-0.18	0.09	0.12	0.39
Lsat_1_v5_gn_3_56320.1	-0.46	-0.52	-0.51	-0.43	0.71	0.59	-0.3	-0.31	-0.48	-0.44	-0.34	-0.43	0.01	1.11	0.64	-0.15	-0.47	0.36	-0.09	-0.45	-0.41	-0.26	1.18	-0.64	-0.73	-0.32	-0.23	-0.34	0.24	-0.03	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_6160.1 (ETR)	-0.45	-0.36	-0.14	0.08	0.44	0.29	-0.4	-0.65	-0.12	-0.15	-0.09	-0.37	-0.23	0.68	0.51	-0.04	-0.29	0.41	-0.1	-0.4	-0.31	-0.32	1.15	-0.47	-0.4	-0.25	-0.24	-0.46	0.26	0.21	0.33
Lsat_1_v5_gn_3_95340.1	-0.12	-0.51	0.01	0.04	0.84	0.49	-0.63	-1.05	-0.39	-0.41	-0.21	-0.69	-0.63	0.99	0.59	-0.3	-0.76	1.02	-0.21	-0.57	-0.57	-0.56	1.72	-0.59	-0.77	-0.56	-0.62	-0.68	0.1	-0.03	0.05
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.