Heatmap: Cluster_228 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_21100.1	-0.7	-0.81	-0.35	-0.24	0.61	0.46	-0.46	-1.16	0.03	-0.24	-0.29	-0.39	0.01	1.13	0.76	-0.07	-0.21	0.22	-0.15	-0.68	-0.38	-0.39	0.63	-0.4	-0.34	-0.3	-0.38	-1.36	0.39	0.49	0.97
Lsat_1_v5_gn_0_37380.1 (BBX12)	-0.45	-0.06	-0.35	0.15	1.04	0.58	-0.86	-0.64	-0.41	-0.36	-0.14	-0.41	-0.5	1.34	0.92	-0.2	-0.72	0.96	-0.03	-0.93	-0.77	-0.66	0.45	-0.61	-0.78	-0.63	-0.52	-0.84	0.09	0.0	0.68
Lsat_1_v5_gn_0_9101.1	-0.49	-0.09	0.0	0.36	0.88	0.4	-0.58	-0.66	-0.16	-0.25	0.17	-0.22	-0.7	1.23	0.83	-0.24	-0.72	0.86	-0.2	-0.53	-0.68	-0.49	0.57	-0.68	-0.75	-0.73	-0.31	-0.68	0.07	-0.01	0.29
Lsat_1_v5_gn_1_105241.1 (BURNOUT1)	-0.22	-0.25	-0.06	0.18	0.74	0.5	-0.44	-0.59	-0.53	-0.51	-0.3	-0.53	-0.14	1.0	0.97	0.08	-0.17	0.51	-0.26	-0.72	-0.58	-0.63	0.72	-0.84	-0.86	-0.65	-0.54	-0.58	0.36	0.37	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_124381.1 (RING1B)	-0.23	-0.3	-0.64	-0.17	0.34	0.41	-0.35	-0.49	-0.09	-0.12	0.1	-0.35	0.25	0.86	0.69	0.11	-0.07	0.49	-0.5	-0.29	-0.32	-0.25	0.47	-0.33	-0.4	-0.16	-0.19	-0.42	0.08	0.05	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_15700.1 (NF-YB12)	-0.64	-0.83	-0.29	0.2	0.55	0.31	-0.37	-0.61	-0.34	-0.27	-0.01	-0.52	-0.26	1.01	0.74	-0.07	-0.31	0.65	-0.1	-0.44	-0.44	-0.25	0.86	-0.29	-0.53	-0.43	-0.34	-0.63	0.36	0.23	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_30260.1 (BON2)	-0.33	-0.33	-0.21	-0.0	0.75	0.52	-0.34	-0.73	-0.26	-0.18	-0.3	-0.28	0.06	0.98	0.86	-0.01	-0.18	-0.11	-0.2	-0.39	-0.35	-0.27	-0.11	-0.47	-0.56	-0.26	-0.34	-0.38	0.39	0.3	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_33701.1	-1.32	-0.73	-0.69	-0.24	0.23	-0.02	-0.64	-0.6	-0.29	-0.09	-0.4	-0.52	0.21	1.29	0.99	-0.22	-0.24	0.99	-0.06	-0.66	-0.7	-1.26	1.04	-0.19	-0.8	-0.59	-0.34	-0.94	0.2	0.36	1.02
Lsat_1_v5_gn_1_33920.1	-0.86	-0.5	-0.63	-0.41	0.77	0.33	-0.26	-0.29	-0.3	-0.15	-0.27	-0.06	-0.13	0.51	0.48	0.15	-0.11	0.34	0.01	-0.36	-0.35	-0.32	0.64	-0.37	-0.24	-0.12	0.04	-0.28	0.43	0.27	0.4
Lsat_1_v5_gn_1_3680.1	-0.94	-0.7	-0.43	0.04	0.59	0.23	-0.93	-0.65	-0.24	-0.28	-0.01	-0.23	-0.58	1.13	1.03	-0.14	-0.26	0.4	-0.02	-0.33	-0.53	-0.53	0.96	-0.57	-0.4	-0.4	-0.12	-1.01	0.42	0.41	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_40161.1 (MLK3)	-1.01	-0.54	-0.65	-1.17	-0.47	-0.05	0.3	0.2	-0.13	-0.23	-0.08	-0.32	-0.03	0.74	0.49	-0.11	-0.21	0.94	-0.23	-0.33	-0.35	-0.38	0.94	-0.17	-0.23	-0.26	-0.03	-0.84	0.23	0.43	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_42601.1	-0.87	-0.84	-0.7	-1.13	0.51	0.47	-0.58	-0.58	-0.17	-0.28	-0.14	-0.28	-0.43	0.94	0.53	-0.09	-0.22	0.24	0.13	-0.34	-0.17	-0.05	0.68	-0.41	-0.22	-0.08	0.07	-0.94	0.38	0.63	0.86
Lsat_1_v5_gn_1_52540.1 (UGT73C7)	-0.97	-1.09	-1.26	-0.64	-0.33	-1.0	-0.36	-0.66	-0.65	-1.0	-0.41	-0.68	-0.09	1.17	0.49	-1.12	-0.87	1.68	-0.41	-0.76	-1.44	-0.7	1.61	-0.2	-0.3	-0.58	-1.01	-1.46	0.76	1.05	1.36
Lsat_1_v5_gn_1_53780.1 (SIMP1)	-1.42	-1.13	-0.96	-0.9	0.31	0.36	-0.66	-0.81	-0.46	-0.43	-0.18	-0.27	0.46	0.94	0.8	0.23	0.02	0.65	0.37	-0.18	-0.46	-0.36	-0.49	-0.17	-0.16	-0.14	-0.18	-0.99	0.07	0.33	1.4
Lsat_1_v5_gn_1_66180.1 (HRA1)	-1.05	-0.78	-0.4	-0.49	0.74	0.4	-0.57	-0.75	-0.5	-0.39	-0.29	-0.22	-0.05	1.0	0.68	-0.08	-0.41	0.83	0.34	-0.29	-0.35	-0.26	0.28	-0.42	-0.36	-0.14	-0.45	-0.58	0.36	0.38	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_681.1 (CIB4)	-1.36	-1.46	-0.94	-0.75	0.13	-0.23	-0.66	-0.7	-0.17	0.03	0.05	-0.14	0.48	0.74	0.64	0.14	-0.05	0.65	0.22	-0.2	-0.54	-0.23	0.01	-0.31	0.03	-0.29	-0.28	-0.62	0.14	0.44	1.42
Lsat_1_v5_gn_1_68741.1 (LCB2)	-2.93	-1.77	-0.91	-1.93	0.44	0.53	-0.3	-0.57	-0.5	-0.75	-0.87	-0.28	0.12	1.57	1.36	-0.02	-0.56	1.27	-0.22	-0.68	-0.96	-1.47	1.13	-1.06	-0.87	-0.84	-0.75	-1.52	0.24	0.33	1.38
Lsat_1_v5_gn_1_75121.1	-0.35	-0.25	-0.18	0.13	0.41	0.21	-0.3	0.0	-0.31	-0.07	-0.14	-0.09	0.13	0.71	0.61	-0.12	-0.31	0.44	-0.22	-0.41	-0.37	-0.41	0.62	-0.57	-0.34	-0.29	-0.31	-0.38	0.11	0.09	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_91840.1 (RLM3)	-0.78	-0.32	-1.52	-1.13	1.09	0.39	-1.13	-0.89	-0.51	-0.64	-0.25	-0.53	-0.16	1.6	0.98	-0.26	-0.63	0.81	-0.18	-0.86	-0.65	-0.86	0.57	-0.89	-0.95	-0.97	-0.84	-1.63	0.51	0.7	1.46
Lsat_1_v5_gn_1_94741.1 (ENT6)	-1.11	-0.53	-0.88	-0.69	0.38	0.09	-0.37	0.03	-0.08	-0.03	-0.16	-0.29	-0.04	1.23	0.78	-0.24	-0.6	0.85	-0.48	-0.76	-0.58	-0.7	0.5	-0.59	-0.49	-0.56	-0.44	-1.06	0.33	0.62	1.3
Lsat_1_v5_gn_2_106121.1 (J3)	-0.91	-0.43	-0.32	-0.29	0.73	0.46	-0.17	-0.11	-0.44	-0.35	-0.17	-0.65	-0.33	1.09	0.61	0.07	-0.4	0.78	-0.41	-0.65	-0.47	-0.32	0.04	-0.54	-0.53	-0.25	-0.3	-0.94	0.42	0.44	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_11200.1 (NAC014)	-0.55	-0.68	-0.52	-0.23	0.82	0.5	-0.69	-0.68	-0.57	-0.18	-0.34	-0.21	0.23	0.93	0.81	0.05	-0.14	0.24	-0.14	-0.31	-0.52	-0.33	0.24	-0.59	-0.65	-0.36	-0.37	-0.52	0.43	0.44	0.93
Lsat_1_v5_gn_2_21361.1	-0.52	-0.34	-0.46	-0.08	0.16	0.03	-0.19	-0.02	-0.34	-0.17	-0.04	-0.21	0.1	0.77	0.51	0.07	-0.16	0.56	-0.34	-0.5	-0.27	-0.34	0.32	-0.25	-0.22	-0.14	-0.11	-0.52	0.28	0.32	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_38101.1 (GNAT6)	-0.84	-0.66	-0.33	-0.36	0.89	0.59	-0.8	-1.22	-0.08	-0.1	-0.01	-0.25	-0.51	0.99	0.86	-0.02	-0.63	0.68	0.01	-0.35	-0.43	-0.52	1.09	-0.37	-0.55	-0.38	-0.35	-0.48	0.31	0.03	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_47941.1 (URGT5)	-0.72	-1.42	-0.51	-0.28	0.47	0.39	-0.02	-0.02	-0.24	-0.19	-0.15	-0.22	0.0	0.72	0.63	0.09	-0.09	0.23	-0.11	-0.25	-0.31	-0.15	0.36	-0.23	-0.23	-0.15	-0.08	-0.4	0.11	0.19	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_84101.1	-0.43	-0.15	-0.08	0.05	0.51	0.27	-0.32	-0.47	-0.19	-0.14	0.04	-0.2	-0.19	0.84	0.57	0.0	-0.26	0.55	-0.06	-0.4	-0.4	-0.33	0.55	-0.53	-0.45	-0.2	-0.2	-0.55	0.15	0.07	0.4
Lsat_1_v5_gn_3_109100.1 (PAPS2)	-0.54	-0.52	-0.37	-0.09	0.37	0.33	-0.18	-0.08	-0.34	-0.14	-0.11	-0.16	0.06	0.55	0.5	0.17	-0.01	0.26	-0.14	-0.3	-0.21	-0.15	0.11	-0.28	-0.17	-0.12	-0.01	-0.14	0.26	0.16	0.44
Lsat_1_v5_gn_3_110460.1	-1.11	-1.18	-0.57	-0.32	0.62	0.39	-0.84	-1.15	-0.25	-0.08	-0.05	-0.03	0.46	0.76	0.48	0.03	-0.24	0.49	0.03	-0.32	-0.49	-0.26	0.06	-0.33	-0.13	-0.05	-0.22	-0.56	0.33	0.49	1.01
Lsat_1_v5_gn_3_118060.1 (LRRAC1)	-0.62	-0.14	-1.17	-1.01	0.35	0.16	-0.6	-0.46	-0.45	-0.54	-0.67	-0.9	0.09	1.23	0.67	-0.15	-0.17	0.99	-0.3	-0.96	-0.71	-0.72	0.49	-0.86	-0.57	-0.65	-0.41	-1.54	0.45	0.89	1.69
Lsat_1_v5_gn_3_135660.1 (GEN1)	-0.6	-0.61	-0.55	-0.22	0.15	0.17	-0.19	-0.11	-0.34	-0.34	0.03	-0.02	0.3	0.68	0.53	-0.28	-0.34	0.08	-0.16	-0.14	-0.23	-0.11	0.07	-0.13	-0.23	-0.1	-0.17	-0.19	0.32	0.37	0.94
Lsat_1_v5_gn_3_140420.1 (WNK7)	-0.71	-0.44	-0.27	-0.56	0.47	0.21	-0.51	-0.41	-0.38	-0.44	-0.02	-0.34	-0.16	0.94	0.01	-0.53	-0.73	0.87	-0.33	-0.61	-0.82	-0.17	0.93	-0.56	-0.23	-0.13	-0.26	-0.69	0.71	0.63	1.03
Lsat_1_v5_gn_3_15901.1	-0.38	-0.25	-0.31	-0.17	0.37	0.01	-0.41	-0.56	-0.19	-0.1	0.0	-0.1	0.08	0.86	0.47	0.04	-0.13	0.38	0.12	-0.5	-0.43	-0.47	0.35	-0.41	-0.42	-0.22	-0.29	-0.37	0.25	0.41	0.78
Lsat_1_v5_gn_3_21081.1 (AE7)	-0.66	-0.47	-0.35	-0.1	0.54	0.28	-0.28	-0.23	-0.22	-0.12	0.04	-0.54	-0.63	0.88	0.85	0.19	-0.49	0.63	-0.24	-0.54	-0.45	-0.52	0.78	-0.57	-0.5	-0.24	-0.16	-0.87	0.34	0.37	0.58
Lsat_1_v5_gn_3_42641.1 (CNX2)	-1.56	-0.9	-0.64	-0.72	0.03	0.06	-1.19	-0.11	-0.34	-0.04	-0.55	-0.33	-0.07	1.65	0.7	-0.27	-0.47	0.49	-0.29	-0.87	-0.28	-0.27	0.45	-0.49	-0.43	-0.05	-0.57	-0.94	0.76	0.45	1.31
Lsat_1_v5_gn_3_46220.1	-1.49	-0.96	-0.66	-0.14	0.04	0.08	-0.43	-0.38	0.04	-0.06	-0.01	-0.13	0.18	0.78	0.5	-0.07	0.02	0.15	-0.04	-0.06	-0.21	-0.38	-0.24	-0.37	-0.11	-0.25	0.13	-0.45	0.11	0.53	1.29
Lsat_1_v5_gn_3_69940.1 (PILS7)	-0.62	-0.84	-0.66	-0.48	0.4	0.3	-0.31	-0.4	-0.03	-0.06	0.09	-0.11	-0.04	0.94	0.63	-0.3	-0.16	0.57	0.08	-0.32	-0.08	-0.23	0.15	-0.35	-0.34	-0.2	0.05	-0.17	0.07	0.04	0.65
Lsat_1_v5_gn_3_93260.1	-0.14	-0.25	-0.02	-0.21	0.49	0.27	-0.44	-0.57	-0.19	-0.28	-0.14	-0.37	-0.2	0.84	0.8	-0.11	-0.35	0.79	0.02	-0.31	-0.37	-0.42	0.92	-0.53	-0.54	-0.36	-0.35	-0.75	0.11	0.13	0.27
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.