Heatmap: Cluster_123 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_17700.1	-0.69	-0.52	-0.55	-0.39	0.41	0.53	-0.07	-0.12	-0.15	-0.22	0.06	0.04	-0.15	0.63	0.44	0.12	-0.14	-0.13	-0.15	-0.29	-0.22	-0.18	0.05	-0.48	-0.28	-0.17	-0.01	-0.49	0.37	0.44	0.82
Lsat_1_v5_gn_0_23641.1	0.0	0.23	0.19	0.2	0.51	0.16	-0.71	-0.74	-0.17	-0.16	0.07	-0.27	-0.09	0.79	0.17	-0.34	-0.09	-0.15	-0.25	-1.0	-0.77	-0.7	0.73	-0.33	-0.51	-0.48	-0.37	-0.74	0.44	0.39	1.15
Lsat_1_v5_gn_0_23961.1	-0.58	-0.97	-0.35	-0.33	1.15	0.17	-0.88	-0.76	-0.51	-0.4	0.02	-0.12	0.03	1.27	0.87	-0.24	-0.41	0.56	0.12	-0.43	-0.42	-0.63	-0.03	-0.21	-0.38	-0.52	-0.43	-0.84	0.43	0.21	0.76
Lsat_1_v5_gn_0_37320.1 (PRX34)	-0.29	-0.47	-0.08	-0.24	0.26	0.16	-0.23	-0.33	-0.13	-0.38	-0.14	-0.26	-0.07	0.78	0.69	-0.09	-0.01	0.56	0.16	-0.4	-0.45	-0.37	-1.04	-0.39	-0.3	-0.28	0.04	-0.89	0.17	0.36	1.23
Lsat_1_v5_gn_1_100380.1 (ABI8)	-1.0	-0.75	-0.83	-0.77	0.38	0.41	-0.31	-0.59	-0.09	-0.09	-0.17	-0.03	0.21	0.83	0.59	0.02	-0.15	0.26	0.04	-0.17	-0.11	-0.18	-0.05	-0.22	-0.32	-0.14	-0.09	-0.39	0.45	0.49	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_101561.1	-1.03	-0.54	-0.1	-0.06	0.62	0.23	-0.42	-0.07	-0.0	-0.32	0.12	-0.21	-0.28	0.69	0.49	0.07	-0.24	0.25	-0.27	-0.5	-0.46	-0.32	0.3	-0.48	-0.42	-0.09	-0.31	-0.54	0.36	0.57	0.92
Lsat_1_v5_gn_1_101600.1 (TAO1)	-0.68	-0.44	-0.69	-0.1	0.77	0.36	-0.39	-0.66	-0.13	0.06	0.02	-0.14	-0.34	0.71	0.57	0.22	-0.1	-0.36	-0.11	-0.3	-0.29	-0.27	-0.17	-0.48	-0.38	-0.07	-0.12	-0.6	0.51	0.55	0.88
Lsat_1_v5_gn_1_12001.1	-1.01	-0.29	-0.5	-0.37	0.85	0.45	-0.54	-0.62	0.05	0.01	0.17	0.02	-0.64	0.78	0.72	0.05	-0.3	0.29	0.1	-0.37	-0.52	-0.13	-0.16	-0.3	-0.54	-0.18	0.02	-0.75	0.37	0.32	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_126900.1 (TIR1)	-0.89	-0.52	-0.5	0.0	0.72	0.34	-0.4	-0.29	0.09	0.11	0.14	-0.03	-0.56	0.7	0.48	-0.05	-0.33	-0.09	0.01	-0.27	-0.23	-0.2	-0.01	-0.12	-0.17	-0.11	-0.05	-0.53	0.38	0.35	0.52
Lsat_1_v5_gn_1_16080.1 (PPRT3)	-0.86	-0.84	-0.33	0.26	0.07	0.26	-0.24	0.03	-0.09	-0.01	-0.05	-0.21	0.08	0.73	0.49	0.09	-0.03	-0.39	-0.02	-0.33	-0.27	-0.22	0.13	-0.13	-0.31	-0.12	-0.16	-0.49	0.27	0.36	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_23861.1 (CYP81D4)	-0.88	-0.54	-0.48	-0.27	1.12	0.52	-0.58	-0.56	-0.22	-0.29	-0.12	-0.46	-0.81	1.37	0.89	-0.15	-0.4	0.46	0.14	-0.34	-0.39	-0.48	-0.77	-0.34	-0.37	-0.4	-0.24	-0.88	0.27	0.37	0.81
Lsat_1_v5_gn_1_28281.1 (MORC6)	-0.54	-0.52	-0.82	-0.85	0.1	0.09	-0.15	-0.18	-0.11	-0.08	0.09	-0.14	0.08	0.66	0.56	0.2	-0.06	-0.48	0.11	-0.13	-0.05	-0.07	-0.03	-0.01	-0.06	0.01	0.06	-0.27	0.27	0.37	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_30601.1	-0.44	-0.49	-0.39	-0.28	-0.02	0.1	-0.2	-0.3	-0.89	-0.52	-0.57	-0.48	0.04	0.35	0.33	-0.28	-0.37	0.98	-0.48	0.13	-0.07	-0.0	0.71	0.01	0.2	0.11	0.21	-0.07	0.23	0.05	0.61
Lsat_1_v5_gn_1_33720.1 (HTA8)	-0.77	-0.46	0.07	-0.33	1.07	0.71	-0.68	-0.35	-0.11	-0.42	-0.21	-0.05	0.33	0.72	0.39	-0.03	-0.48	0.25	-0.21	-0.44	-0.35	-0.23	-0.6	-0.58	-0.25	-0.3	-0.34	-0.14	0.33	0.23	0.78
Lsat_1_v5_gn_1_39821.1 (SPL12)	-0.82	-1.08	-0.51	-0.58	0.53	0.49	-0.36	-0.68	-0.33	-0.28	-0.11	-0.33	-0.34	1.08	0.89	0.15	-0.15	-0.33	0.29	-0.14	-0.18	-0.05	-0.21	-0.17	-0.19	-0.15	-0.2	-0.57	0.5	0.47	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_4060.1	-1.02	-0.89	-0.6	-0.11	0.56	0.5	-0.14	-0.42	-0.22	-0.15	-0.07	-0.09	-0.11	0.9	0.78	0.14	-0.02	-0.61	0.3	-0.16	-0.13	-0.09	-0.65	-0.23	-0.28	-0.17	-0.17	-0.22	0.31	0.32	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_52340.1	-0.98	-0.54	-0.49	-0.3	0.59	0.56	-0.14	-0.24	-0.15	-0.19	-0.09	-0.36	-0.26	0.85	0.59	0.25	-0.25	0.45	-0.13	-0.23	-0.15	-0.02	-0.51	-0.31	-0.41	0.04	0.11	-0.64	0.41	0.24	0.42
Lsat_1_v5_gn_1_52361.1 (PGP1)	-2.48	-1.53	-1.87	-1.42	0.71	0.65	-0.94	-1.18	-0.11	-0.05	0.07	0.05	0.11	-0.14	0.18	0.57	0.24	-1.07	0.12	-0.03	-0.15	0.21	-2.0	0.25	0.36	0.42	0.47	-0.41	0.35	0.77	1.09
Lsat_1_v5_gn_1_55680.1 (RbohI)	-0.65	-0.46	-0.7	-0.46	0.72	0.58	-0.46	-0.64	0.02	-0.06	0.12	-0.17	-0.59	0.95	0.9	0.33	-0.3	-0.35	0.1	-0.45	-0.18	-0.19	-0.82	-0.33	-0.29	-0.05	-0.05	-0.55	0.45	0.5	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_58361.1 (CLV2)	-0.96	-0.71	-0.29	-0.21	0.18	0.28	-0.92	-0.96	-0.41	-0.31	-0.11	-0.2	0.02	1.11	0.95	-0.13	-0.09	-0.06	0.2	-0.27	-0.39	-0.37	-0.14	-0.3	-0.4	-0.24	-0.08	-0.61	0.44	0.4	1.28
Lsat_1_v5_gn_1_63041.1 (ABCG3)	-0.25	-0.1	0.08	0.29	0.26	-0.01	-0.54	-0.38	-0.33	-0.03	-0.11	-0.25	0.52	0.15	0.03	-0.12	-0.14	0.0	0.02	-0.3	-0.41	-0.19	-0.36	-0.35	-0.2	-0.08	-0.2	-0.39	0.47	0.47	1.08
Lsat_1_v5_gn_1_68181.1 (RLK1)	-0.98	-0.0	-0.84	-1.29	0.66	0.83	-0.07	-0.6	-0.02	-0.27	-0.41	-1.24	-1.91	1.07	0.98	0.18	-0.39	-0.34	0.28	-0.63	-0.49	-0.45	-0.64	-0.32	-0.18	-0.19	-0.31	-2.05	0.9	1.13	0.94
Lsat_1_v5_gn_1_69940.1 (OK1)	-0.56	-0.63	-0.66	-0.66	0.64	0.45	-1.03	-0.91	-0.42	-0.42	-0.16	-0.27	0.14	1.16	0.48	-0.15	-0.3	-0.42	0.36	-0.49	-0.45	-0.21	0.13	-0.02	-0.23	-0.3	-0.26	-0.32	0.42	0.61	1.15
Lsat_1_v5_gn_1_72761.1 (PHL3)	-1.11	-1.1	-1.72	-1.66	0.81	0.96	-0.1	-0.41	-0.41	-0.55	-0.44	-0.58	0.03	0.91	0.66	0.31	-0.08	-0.05	0.39	-0.16	-0.06	0.11	-2.49	-0.22	-0.23	-0.2	-0.21	-0.17	0.97	0.45	0.6
Lsat_1_v5_gn_1_86321.1	-0.73	-0.52	-0.34	-0.1	0.56	0.55	0.01	-0.24	-0.15	-0.18	0.11	-0.04	-0.34	0.49	0.57	0.1	-0.36	-0.19	-0.14	-0.36	-0.29	-0.12	0.1	-0.37	-0.16	-0.18	-0.13	-0.34	0.36	0.4	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_104120.1	-2.64	-1.26	-2.06	-1.78	1.72	1.14	-1.6	-1.11	0.1	-0.99	0.31	0.34	-1.97	0.84	1.84	0.26	0.27	-1.33	-0.36	-0.83	-0.59	-0.45	-2.39	-0.51	-0.44	-0.21	0.01	-0.34	0.65	0.88	-0.62
Lsat_1_v5_gn_2_105441.1	0.14	-0.58	-0.95	-2.36	1.67	0.49	-1.49	-1.59	0.11	-0.76	0.53	-0.2	-2.49	0.44	1.52	0.6	0.39	-1.99	0.17	-0.37	0.1	0.09	-1.76	-0.18	-0.01	0.29	0.62	0.07	-0.37	-0.28	-2.56
Lsat_1_v5_gn_2_1140.1	-1.12	-0.59	-0.1	-0.26	0.31	0.3	-0.22	-0.21	-0.06	-0.06	-0.2	-0.35	-0.01	0.61	0.41	0.1	-0.31	0.41	-0.26	-0.63	-0.51	-0.17	-0.52	-0.76	-0.22	-0.23	0.09	-0.59	0.79	0.47	1.25
Lsat_1_v5_gn_2_118160.1	-0.75	-0.33	-0.88	-0.51	0.71	0.54	-0.71	-0.9	-0.09	-0.02	0.14	0.07	0.31	0.44	0.39	0.22	-0.08	-0.26	0.03	-0.16	-0.11	0.08	-1.01	-0.43	-0.2	-0.04	0.07	-0.37	0.58	0.58	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_122720.1	-2.06	-2.32	-1.81	-0.89	-0.34	-0.19	0.26	-0.31	-0.46	0.02	0.06	0.02	0.34	-0.46	-0.02	0.39	0.22	-0.13	0.39	0.03	-0.6	-0.41	0.65	-0.1	0.04	0.04	-0.04	-1.06	0.24	0.7	1.74
Lsat_1_v5_gn_2_12620.1 (FAS3)	-1.53	-1.51	-2.44	-1.02	0.48	0.45	-1.14	-1.17	-0.15	-0.05	0.12	-0.13	0.17	0.75	1.14	0.34	-0.27	0.42	0.26	-0.35	-0.28	-0.37	-0.94	-0.17	-0.53	-0.3	-0.24	-0.45	0.67	0.76	1.19
Lsat_1_v5_gn_2_130220.1	-0.35	-0.48	-0.46	-0.24	0.63	0.46	-0.23	-0.2	-0.12	-0.09	0.01	-0.14	0.06	0.5	0.45	0.06	-0.06	-0.23	-0.04	-0.13	-0.32	-0.15	0.47	-0.24	-0.1	-0.19	-0.12	-0.24	0.27	0.17	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_131220.1 (NAGS1)	-0.97	-0.82	-0.06	0.37	0.24	-0.16	-0.47	-0.13	0.23	0.43	0.26	0.12	-0.33	1.01	0.84	-0.09	-0.5	0.7	-0.44	-0.37	-0.43	-0.34	-0.15	-0.65	-0.57	-0.37	-0.14	-1.24	0.2	0.37	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_134680.1 (PYL8)	-0.56	-0.92	-0.77	-0.3	0.57	0.51	-0.31	-0.24	0.05	0.06	0.13	0.2	-0.1	1.02	0.67	-0.09	-0.34	-0.15	-0.15	-0.44	-0.25	-0.19	-0.88	-0.01	-0.21	-0.18	-0.1	-0.45	0.27	0.27	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_17201.1 (PERK7)	-1.68	-0.87	-1.37	-0.91	0.28	0.62	0.05	-0.17	-0.24	-0.18	-0.22	-0.37	-0.33	0.74	0.96	0.3	-0.11	-0.49	0.67	-0.12	-0.29	-0.16	0.35	-0.12	-0.18	-0.19	-0.02	-0.32	0.62	0.29	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_27301.1 (PUB15)	-0.98	-0.71	-0.54	-0.2	0.67	0.57	-0.21	-0.49	-0.22	-0.38	-0.19	-0.53	-0.59	1.12	1.0	0.13	0.08	0.1	0.0	-0.42	-0.46	-0.45	-0.83	-0.42	-0.58	-0.46	-0.07	-1.23	0.36	0.35	1.36
Lsat_1_v5_gn_2_28220.1 (PDM3)	-1.15	-1.09	-0.82	-0.61	0.31	0.5	-0.23	-0.57	-0.14	-0.14	-0.29	-0.4	-0.32	1.08	0.76	0.2	-0.12	0.29	0.09	-0.38	-0.37	-0.18	-1.08	-0.18	-0.27	-0.26	-0.08	-0.78	0.51	0.61	1.26
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.