Heatmap: Cluster_191 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_12940.1 (ALA8)	-1.28	-1.16	-0.91	-0.64	0.87	0.3	-0.77	-1.16	-0.22	-0.12	-0.16	-0.1	-0.19	1.38	0.79	-0.13	-0.37	0.24	-0.35	-0.53	-0.59	-0.45	1.26	-0.32	-0.38	-0.51	-0.33	-0.54	0.33	0.43	0.64
Lsat_1_v5_gn_0_4681.1 (ING1)	-0.76	-0.52	-0.86	-0.67	0.21	0.2	-0.1	0.18	-0.47	-0.68	-0.4	-0.42	0.14	1.06	0.7	-0.08	-0.3	0.49	0.08	-0.21	-0.63	-0.21	0.85	-0.21	-0.24	-0.17	-0.19	-0.56	0.24	0.31	0.59
Lsat_1_v5_gn_0_9321.1	-0.33	-0.32	-0.32	0.14	0.4	-0.01	-0.29	-0.23	-0.26	-0.22	0.01	-0.17	0.07	0.7	0.47	-0.05	-0.12	0.57	-0.24	-0.35	-0.4	-0.3	0.79	-0.32	-0.38	-0.28	-0.15	-0.37	0.12	0.08	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_107981.1	-0.15	-0.5	-0.68	-0.32	0.18	0.15	-0.26	-0.15	-0.22	-0.16	-0.16	-0.29	0.32	0.84	0.57	-0.2	-0.27	0.6	-0.23	-0.15	-0.15	-0.27	0.66	-0.16	-0.07	-0.01	-0.13	-0.22	0.03	0.01	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_11441.1 (DDR4)	-0.6	-0.62	-0.7	-0.37	0.42	0.14	-0.33	-0.32	-0.37	-0.39	-0.12	-0.32	0.03	0.84	0.71	-0.03	-0.4	0.86	-0.12	-0.42	-0.31	-0.36	1.03	-0.46	-0.42	-0.21	-0.18	-0.51	0.23	0.26	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_125380.1 (ROS4)	-0.45	-0.3	-0.23	-0.29	0.52	0.38	-0.34	-0.43	-0.68	-0.42	-0.44	-0.57	0.29	0.86	0.63	-0.12	-0.28	0.75	-0.04	-0.34	-0.34	-0.42	0.81	-0.49	-0.44	-0.3	-0.31	-0.38	0.16	0.17	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_27380.1 (SAC3C)	-0.64	-0.82	-0.53	-0.16	0.68	0.32	-0.47	-0.71	-0.29	-0.2	-0.16	-0.19	-0.09	0.88	0.53	-0.17	-0.43	0.79	-0.04	-0.43	-0.48	-0.29	0.88	-0.37	-0.41	-0.38	-0.26	-0.5	0.33	0.3	0.64
Lsat_1_v5_gn_1_54380.1	-0.78	-0.68	-0.73	-0.73	0.56	0.42	-0.45	-0.54	-0.2	-0.19	-0.2	-0.26	0.07	0.7	0.64	0.05	-0.24	0.42	-0.05	-0.33	-0.24	-0.19	1.23	-0.34	-0.33	-0.18	-0.12	-0.32	0.19	0.15	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_56360.1 (RBL15)	-0.66	-0.45	-0.55	-0.34	0.52	0.43	-0.58	-0.56	-0.31	-0.24	-0.06	-0.2	0.14	0.86	0.62	-0.03	-0.21	0.22	-0.09	-0.38	-0.35	-0.29	0.84	-0.38	-0.22	-0.29	-0.28	-0.33	0.17	0.25	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_64180.1 (CASPL5A2)	-1.14	-1.17	-0.63	-0.4	0.33	0.15	-0.6	-0.88	-0.06	-0.24	-0.1	-0.18	-0.07	0.99	0.66	-0.13	-0.27	0.59	-0.18	-0.26	-0.25	-0.29	1.07	-0.22	-0.2	-0.19	-0.07	-0.45	0.34	0.38	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_72381.1	-0.47	-0.43	-0.42	-0.15	0.5	0.43	-0.2	-0.13	-0.29	-0.23	-0.02	-0.35	-0.13	0.78	0.62	-0.02	-0.25	0.55	0.03	-0.37	-0.35	-0.25	0.97	-0.52	-0.37	-0.21	-0.21	-0.57	0.11	-0.06	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_74220.1 (LCBK1)	-0.57	-0.29	-0.57	-0.3	0.4	0.44	-0.21	-0.43	-0.14	-0.24	-0.15	-0.24	0.08	0.67	0.43	0.1	-0.18	0.21	-0.03	-0.35	-0.17	-0.17	0.64	-0.24	-0.1	-0.14	-0.11	-0.32	0.21	0.23	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_75501.1 (SEC20)	-0.29	-0.64	-0.53	-0.21	0.37	0.34	-0.31	-0.35	-0.38	-0.23	0.01	-0.34	0.08	0.67	0.51	-0.13	-0.29	0.6	0.03	-0.36	-0.35	-0.12	0.86	-0.35	-0.22	-0.02	-0.09	-0.36	0.05	0.06	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_78000.1 (FCLY)	-0.6	-0.37	-0.51	-0.44	0.49	0.25	-0.36	-0.56	-0.19	-0.33	-0.11	-0.18	-0.18	0.67	0.4	-0.13	-0.26	0.57	0.15	-0.32	-0.35	-0.32	0.97	-0.27	-0.29	-0.22	-0.15	-0.5	0.27	0.29	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_8340.1 (PSI1)	-0.38	-0.59	-0.45	-0.41	0.5	0.13	-0.69	-0.76	-0.38	-0.26	0.01	-0.31	0.1	0.82	0.75	0.12	-0.25	0.63	-0.13	-0.45	-0.37	-0.5	1.19	-0.5	-0.53	-0.39	-0.33	-0.46	0.16	0.37	0.54
Lsat_1_v5_gn_1_89600.1 (TFL2)	-0.14	-0.16	-0.5	-0.67	0.55	0.24	-0.42	-0.46	-0.67	-0.48	-0.54	-0.47	0.26	1.15	0.64	-0.16	-0.42	0.47	-0.04	-0.5	-0.5	-0.34	0.9	-0.27	-0.4	-0.33	-0.29	-0.66	0.18	0.2	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_89941.1 (PP2A-4)	-0.52	-0.49	-0.24	-0.11	0.3	0.26	-0.32	-0.2	-0.14	-0.14	-0.16	-0.28	0.04	0.62	0.34	-0.19	-0.24	0.31	-0.2	-0.26	-0.24	-0.19	0.74	-0.24	-0.16	-0.06	-0.06	-0.42	0.3	0.21	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_90081.1 (SNF7.1)	-0.57	-0.64	-0.48	-0.39	0.65	0.51	-0.76	-0.6	-0.38	-0.42	-0.07	-0.43	-0.14	0.85	0.65	-0.09	-0.37	0.69	0.01	-0.48	-0.25	-0.25	1.13	-0.4	-0.39	-0.16	-0.28	-0.3	0.26	0.16	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_102920.1	-0.67	-0.75	-1.24	-0.95	0.08	0.05	-0.66	-0.46	-0.67	-0.62	-0.68	-0.54	0.35	1.35	0.74	-0.15	-0.44	0.84	-0.08	-0.48	-0.52	-0.22	1.08	-0.42	-0.23	-0.36	-0.23	-0.87	0.43	0.54	0.97
Lsat_1_v5_gn_2_104801.1 (PDR11)	-1.28	-0.47	-1.02	-0.94	0.66	0.14	-0.69	-1.03	-0.47	-0.22	-0.57	-0.06	0.13	0.91	0.26	-0.14	-0.23	0.8	0.19	-0.75	-0.27	-0.41	1.48	-0.72	-0.24	-0.25	-0.33	-1.08	0.31	0.51	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_106321.1	-0.39	-0.24	-0.56	-0.49	-0.08	-0.05	-0.11	0.1	-0.5	-0.61	-0.43	-0.38	0.27	0.73	0.49	0.03	-0.08	0.9	0.21	-0.17	-0.3	-0.31	0.92	-0.3	-0.27	-0.14	-0.3	-0.22	0.0	-0.03	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_108480.1 (FRA3)	-0.9	-0.55	-0.84	-0.4	0.52	0.5	-0.24	-0.23	-0.26	-0.22	-0.06	-0.17	-0.02	0.66	0.41	-0.0	-0.3	0.35	-0.01	-0.42	-0.33	-0.05	1.08	-0.37	-0.34	-0.14	-0.14	-0.46	0.21	0.2	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_111101.1	-1.2	-0.98	-0.64	-0.08	0.57	0.43	-0.31	-0.34	-0.43	-0.49	-0.33	-0.43	-0.29	0.84	0.6	-0.34	-0.39	0.8	0.16	-0.32	-0.14	-0.21	0.68	-0.22	-0.24	-0.21	-0.13	-0.57	0.38	0.2	0.78
Lsat_1_v5_gn_2_118380.1	-0.99	-0.65	-1.19	-0.72	0.67	0.71	-0.19	-0.24	-0.36	-0.42	-0.18	-0.51	-0.32	0.85	0.61	-0.1	-0.42	0.66	0.35	-0.4	-0.4	-0.26	1.09	-0.32	-0.31	-0.24	-0.35	-0.64	0.33	0.23	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_119861.1	-2.75	-1.88	-1.33	-0.96	0.86	0.23	-1.24	-1.18	-0.39	-0.39	0.09	-0.17	-0.09	0.82	0.12	-0.25	-0.94	1.06	-0.14	-0.78	-0.55	-0.54	1.57	-0.58	-0.44	0.09	-0.56	-1.43	0.83	0.77	1.18
Lsat_1_v5_gn_2_121301.1 (AUX1)	-1.64	-0.94	-0.75	-0.39	0.24	0.29	-0.79	-0.8	-0.68	-0.66	-0.5	-0.59	-0.26	1.68	1.06	-0.03	-0.39	1.15	-0.06	-0.58	-0.47	-0.36	1.36	-0.68	-0.47	-0.21	-0.34	-1.09	0.03	-0.05	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_127360.1 (GLY2)	-0.36	-0.54	-0.63	-0.69	0.7	0.72	-0.39	-0.37	-0.51	-0.41	-0.42	-0.38	0.08	0.9	0.62	0.04	-0.3	0.41	0.12	-0.4	-0.21	-0.14	0.61	-0.35	-0.2	-0.29	-0.12	-0.33	0.16	0.15	0.36
Lsat_1_v5_gn_2_129741.1 (RAR1)	-0.46	-0.52	-0.66	-0.79	0.44	0.48	-0.46	-0.49	-0.46	-0.59	-0.36	-0.42	0.23	0.73	0.48	-0.04	-0.33	0.82	-0.05	-0.37	-0.22	-0.17	0.91	-0.32	-0.28	-0.39	-0.37	-0.26	0.26	0.23	0.83
Lsat_1_v5_gn_2_134160.1 (OSM1)	-0.63	-0.39	-0.57	-0.39	0.39	0.42	-0.34	-0.21	-0.33	-0.3	-0.37	-0.42	0.08	0.78	0.49	-0.09	-0.17	0.39	-0.05	-0.34	-0.24	-0.04	1.06	-0.38	-0.37	-0.15	-0.1	-0.39	0.2	0.11	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_1961.1 (AtEH1)	-0.57	-0.32	-0.46	-0.43	0.39	0.18	-0.31	-0.46	-0.22	-0.22	-0.02	-0.21	0.04	0.61	0.37	-0.0	-0.21	0.38	0.03	-0.34	-0.27	-0.13	0.72	-0.3	-0.25	-0.1	-0.14	-0.28	0.3	0.29	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_2361.1 (AtNCER1)	-0.32	-0.39	-0.58	-0.43	0.65	0.57	-0.32	-0.39	-0.3	-0.39	-0.15	-0.35	-0.03	0.83	0.66	0.13	-0.17	0.28	-0.02	-0.44	-0.34	-0.21	0.66	-0.41	-0.37	-0.22	-0.14	-0.35	0.33	0.18	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_28381.1	-0.67	-0.83	-0.81	-0.9	0.26	0.24	-0.18	-0.2	-0.47	-0.3	-0.37	-0.64	-0.05	0.86	0.57	-0.04	-0.26	0.61	0.04	-0.31	-0.05	-0.16	1.19	-0.11	-0.17	0.05	0.01	-0.25	0.13	0.07	0.25
Lsat_1_v5_gn_2_30041.1 (NADK1)	-0.57	-0.69	-0.85	-0.99	0.24	0.17	-0.48	-0.53	-0.18	-0.28	-0.01	-0.22	-0.17	1.01	0.79	-0.02	-0.33	0.5	0.27	-0.08	-0.03	-0.0	0.75	-0.05	-0.12	-0.08	-0.01	-0.15	0.01	-0.07	0.06
Lsat_1_v5_gn_2_33621.1	-0.61	-0.57	-0.68	-0.41	0.67	0.37	-0.49	-0.4	-0.35	-0.32	-0.16	-0.3	-0.12	0.73	0.56	-0.05	-0.24	0.5	0.01	-0.42	-0.41	-0.28	1.1	-0.3	-0.31	-0.23	-0.23	-0.4	0.27	0.27	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_34721.1 (APH-1)	-0.55	-0.92	-1.05	-0.71	0.31	0.42	-0.33	-0.29	-0.39	-0.17	-0.13	-0.19	0.17	0.85	0.76	0.17	-0.13	0.08	0.12	-0.12	-0.19	-0.01	0.61	-0.2	-0.16	-0.16	-0.02	-0.06	0.19	0.07	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_3480.1 (BRD1)	-0.99	-0.99	-0.63	-0.11	0.46	0.28	-0.42	-0.65	-0.38	-0.3	-0.04	-0.22	-0.22	0.87	0.46	-0.05	-0.27	1.06	-0.09	-0.25	-0.24	-0.33	0.87	-0.36	-0.35	-0.13	-0.14	-0.65	0.24	0.23	0.56
Lsat_1_v5_gn_2_38600.1 (FPA)	-0.68	-0.49	-0.45	-0.13	0.03	0.08	-0.48	-0.36	-0.15	-0.25	0.01	-0.2	-0.04	0.93	0.63	-0.05	-0.1	0.58	-0.06	-0.22	-0.2	-0.23	0.65	-0.29	-0.27	-0.15	-0.25	-0.33	0.21	0.09	0.59
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Lsat_1_v5_gn_9_79740.1 (RAG1)	-0.7	-0.92	-0.92	-0.24	0.52	0.17	-0.5	-0.6	0.01	-0.08	0.03	-0.18	-0.17	0.41	0.29	-0.37	-0.54	0.83	-0.17	-0.37	-0.3	-0.12	1.06	-0.26	-0.19	-0.21	-0.15	-0.4	0.44	0.41	0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.