Heatmap: Cluster_91 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_28381.1 (ILP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_7020.1 (CAS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17
Lsat_1_v5_gn_0_9440.1 (BTI1)	0.06	0.0	0.06	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.03	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.08	0.0	0.15	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.09
Lsat_1_v5_gn_1_116560.1 (CPK27)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_29461.1 (AZG2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.0	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	1.0	0.0	0.05	0.0	0.02	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.05	0.07
Lsat_1_v5_gn_1_32801.1 (HSD2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_58041.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_60521.1 (RLP37)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.16	0.09	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.06	0.12	0.06	0.01	0.0	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_62660.1 (MYB36)	0.21	0.0	0.0	0.0	0.09	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.12	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_88661.1 (HERK1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_90541.1 (PEX6)	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_114000.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_17020.1 (scpl18)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_24941.1 (CYP706A7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_49621.1 (ATB2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_66400.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23
Lsat_1_v5_gn_2_67041.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.04	0.07	0.0	1.0	0.02	0.06	0.02	0.0	0.22	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Lsat_1_v5_gn_2_68380.1 (OPT9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_88541.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_100380.1 (MIF2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_35841.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_36880.1 (MYB14)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_69481.1 (VETH2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_75181.1 (TRX1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_98401.1 (LTI6b)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_155040.1 (CYP76C1)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_174101.1 (PERK6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_56281.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_106361.1 (VTL5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26
Lsat_1_v5_gn_5_11101.1 (HAC1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_138801.1 (PP7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_152421.1 (ACBP5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_158220.1 (BHLH100)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Lsat_1_v5_gn_5_168280.1 (COPT3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_174001.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_182001.1 (LBD29)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_183501.1 (bZIP69)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Lsat_1_v5_gn_6_54961.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.08	0.04	0.0	0.0	1.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.15
Lsat_1_v5_gn_6_88820.1 (SMR9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_90220.1 (AEP2)	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.03	0.02	1.0	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.1	0.05	0.0	0.04	0.11
Lsat_1_v5_gn_7_37460.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_113341.1	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_130280.1	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_155761.1 (ET2)	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Lsat_1_v5_gn_8_54860.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_81460.1	0.03	0.02	0.03	0.04	0.12	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.17	0.12	0.03	0.03	1.0	0.04	0.02	0.03	0.03	0.17	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.04	0.17
Lsat_1_v5_gn_8_97660.1 (GLR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_110700.1 (SCL21)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_22041.1 (MYB48)	0.2	0.17	0.23	0.2	0.23	0.29	0.15	0.14	0.09	0.09	0.12	0.07	0.17	0.29	0.21	0.11	0.05	1.0	0.12	0.06	0.1	0.1	0.12	0.08	0.09	0.09	0.11	0.07	0.18	0.12	0.12
Lsat_1_v5_gn_9_40000.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_87721.1 (PIS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)