Heatmap: Cluster_194 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_16841.1 (CYP77A4)	-1.47	-1.95	-0.41	0.19	0.16	0.26	-0.89	-0.59	-0.6	-0.12	-0.02	0.46	0.83	0.7	0.63	0.44	0.61	-0.27	-0.14	0.26	0.1	0.17	-1.34	-0.22	-0.08	-0.15	-0.18	0.08	-0.44	-0.27	0.54
Lsat_1_v5_gn_0_9600.1	-2.46	-1.57	-3.53	-2.31	-0.84	-0.1	-0.56	-1.01	-1.41	-0.63	-1.69	-0.97	1.42	1.14	1.24	0.24	0.68	1.41	-0.01	-0.26	-0.41	-0.69	-3.84	-0.39	-0.59	-1.32	-0.54	-1.94	0.14	0.39	2.18
Lsat_1_v5_gn_1_102541.1	-1.73	-0.67	-0.53	-0.17	0.18	0.16	-0.12	-0.45	-0.07	-0.35	0.16	-0.12	-0.54	0.72	0.84	0.31	-0.12	0.41	0.26	0.02	-0.52	-0.27	-3.07	-0.01	0.17	-0.18	-0.29	-0.65	0.59	0.53	0.96
Lsat_1_v5_gn_1_121861.1 (PDF2)	-0.76	-0.96	-0.41	-0.01	-0.27	-0.24	-0.21	-0.39	-0.19	-0.06	-0.05	-0.13	0.65	0.56	0.53	0.17	0.17	-0.41	0.22	-0.0	0.03	0.1	-0.47	-0.14	-0.14	0.03	-0.0	-0.14	0.22	0.32	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_15720.1	-2.72	-1.97	-2.17	-1.61	-1.28	-0.97	0.03	0.23	-0.53	-0.45	-0.49	-0.54	1.07	0.91	0.89	0.4	0.46	0.09	0.34	0.17	0.05	-0.33	-1.63	0.18	0.23	0.15	-0.25	-0.7	0.16	0.33	1.45
Lsat_1_v5_gn_1_22441.1 (ATRER1C1)	-1.25	-1.15	-1.13	-0.95	0.2	0.2	-0.34	-0.46	-0.23	0.05	-0.1	-0.02	0.21	-0.11	0.28	0.36	0.33	0.64	0.26	-0.01	0.02	0.1	0.48	-0.25	-0.02	0.27	0.41	-0.33	0.06	0.04	0.31
Lsat_1_v5_gn_1_40420.1 (PGX3)	-3.15	-3.99	-4.82	-5.68	-1.99	-0.57	0.26	0.1	-0.74	-1.07	-0.82	-1.21	0.88	1.48	1.15	0.05	0.44	1.03	0.13	-0.14	-0.37	-0.11	-2.06	0.28	0.36	-0.41	0.12	-0.59	-0.47	0.01	1.82
Lsat_1_v5_gn_1_59041.1	-2.38	-3.59	-3.04	-1.57	-1.4	-1.57	-0.63	-0.92	-0.1	0.35	0.22	0.45	1.42	0.5	0.9	0.02	0.29	0.93	0.13	0.38	-0.33	-0.38	-4.22	0.39	0.11	-0.53	-0.72	-0.32	-0.27	0.4	1.53
Lsat_1_v5_gn_1_59720.1 (MED26C)	-0.59	-0.91	-0.54	-0.41	-0.05	0.17	-0.56	-0.71	-0.11	-0.24	0.08	0.02	-0.01	0.41	0.43	0.19	0.04	0.24	0.23	0.04	0.1	0.18	0.13	-0.16	0.05	0.23	0.32	0.02	0.01	0.08	0.28
Lsat_1_v5_gn_1_61641.1 (PATL5)	-1.39	-1.4	-1.66	-1.92	-0.33	-0.12	0.13	-0.8	0.01	-0.16	-0.26	-0.31	1.06	-0.03	0.76	0.44	0.51	0.32	0.77	0.31	0.07	-0.0	-2.97	-0.11	-0.05	-0.12	-0.15	-0.58	-0.13	0.14	1.27
Lsat_1_v5_gn_1_66240.1 (BB)	-1.11	-1.29	-1.14	-1.27	-0.51	-0.41	-0.36	-0.3	0.19	0.17	0.19	0.33	0.94	0.3	0.6	-0.06	0.14	0.68	0.0	-0.16	-0.43	-0.11	-2.45	-0.01	-0.13	-0.66	-0.26	-0.25	0.09	0.65	1.39
Lsat_1_v5_gn_1_75020.1 (IQD13)	-0.7	-0.37	-0.54	-0.54	0.02	-0.13	-0.56	-0.59	-0.15	-0.15	-0.15	0.04	0.68	0.36	0.52	0.15	0.06	0.64	0.02	-0.1	-0.39	-0.43	-0.92	-0.18	-0.02	-0.09	0.01	-0.49	0.11	0.49	1.14
Lsat_1_v5_gn_1_82081.1 (ABCG5)	-3.11	-1.81	-2.61	-1.46	-0.44	-0.08	-0.22	-0.74	0.08	0.22	0.31	0.07	0.32	0.8	0.98	0.38	0.24	-0.37	0.11	-0.03	-0.16	-0.34	-1.43	-0.06	-0.23	-0.37	-0.19	-0.36	0.48	0.82	1.43
Lsat_1_v5_gn_1_860.1	-0.55	-0.3	0.3	0.29	-0.46	-1.28	-0.39	-0.16	0.05	0.05	0.06	0.22	0.33	-0.12	0.46	0.03	0.13	-0.32	0.16	0.07	-0.39	-0.07	-	-0.24	0.18	-0.21	-0.24	-0.74	-0.09	0.61	1.53
Lsat_1_v5_gn_2_10080.1 (NILR2)	-1.8	-1.48	-1.72	-0.82	-0.18	-1.33	-1.11	-1.01	-0.63	-0.48	0.08	-1.08	0.01	1.24	0.97	-0.04	-0.05	0.42	-0.12	-0.6	-0.11	-0.6	0.17	-0.19	-0.21	-0.44	-0.58	-2.95	0.94	1.34	1.9
Lsat_1_v5_gn_2_10121.1 (LMK1)	-2.09	-1.27	-1.34	-0.57	0.2	-0.37	-0.89	-1.03	-0.5	-0.23	0.01	-0.49	-0.15	0.86	1.07	0.14	-0.2	0.14	0.19	-0.71	-0.3	-1.13	-0.43	-0.6	-0.42	0.09	-0.35	-2.21	1.02	1.17	1.87
Lsat_1_v5_gn_2_102681.1 (DME)	-0.52	-0.49	-0.96	-0.45	-0.1	-0.23	-0.02	-0.21	0.12	0.21	0.28	0.27	0.1	0.29	0.57	0.35	0.15	-0.97	-0.1	0.08	-0.26	-0.21	-0.47	-0.04	-0.12	-0.08	-0.11	-0.12	0.24	0.47	0.78
Lsat_1_v5_gn_2_107300.1 (LTL1)	-2.42	-	-4.07	-1.81	-0.86	-2.4	-1.13	-1.31	-0.45	0.13	-0.1	0.43	2.26	-0.85	0.58	-0.11	0.2	1.46	-1.13	0.2	-0.16	-0.81	-6.62	0.68	0.05	-0.35	-1.17	-0.47	-0.27	0.64	1.61
Lsat_1_v5_gn_2_119741.1	-3.04	-2.98	-1.8	-1.34	-0.32	0.07	-0.46	-0.53	0.12	0.17	0.43	0.16	0.27	0.83	0.56	0.28	-0.01	-0.31	-0.2	-0.05	-0.12	0.06	-1.48	0.36	0.16	-0.01	0.03	-0.57	0.16	0.65	1.43
Lsat_1_v5_gn_2_129920.1 (SBT1.3)	-2.8	-2.8	-3.29	-2.82	-0.95	-1.21	-0.52	-0.84	-0.26	0.15	0.09	0.35	1.49	0.27	0.98	0.32	0.53	0.34	0.03	0.43	-0.16	-0.42	-2.83	0.43	0.02	-0.31	-0.46	-0.54	-0.19	0.43	1.62
Lsat_1_v5_gn_2_47761.1 (Tic22-III)	-0.39	-0.87	-0.77	-0.73	0.03	-0.36	-0.42	-0.19	-0.53	-0.14	-0.23	0.07	0.76	0.55	0.29	0.15	0.26	0.03	-0.48	-0.04	0.01	-0.08	-0.29	0.12	0.26	-0.02	-0.16	0.18	0.08	0.2	0.94
Lsat_1_v5_gn_2_51761.1 (ELP)	-1.57	-1.29	-0.92	-0.77	-0.89	-0.77	-0.06	-0.12	-0.19	-0.04	-0.12	0.0	-0.46	0.89	1.04	-0.08	0.11	0.25	0.25	-0.08	-0.37	-0.38	-1.33	-0.38	-0.28	-0.18	-0.33	-0.93	0.44	1.0	1.72
Lsat_1_v5_gn_2_52200.1 (PDC1)	-1.38	-0.73	-0.74	-0.62	0.22	-0.17	-0.48	-0.3	0.08	-0.09	-0.02	-0.04	-0.04	0.87	0.6	0.08	-0.02	-0.23	0.01	-0.22	-0.5	-0.65	-4.63	-0.03	-0.03	-0.12	-0.15	-0.84	0.59	1.01	1.55
Lsat_1_v5_gn_2_65940.1	-	-	-4.99	-	-4.3	-4.25	-0.14	-0.03	-1.73	-0.66	-1.68	-0.76	1.81	0.75	0.75	0.12	0.05	-0.05	0.44	-0.47	-0.85	-1.21	-	0.25	0.63	-0.09	0.04	-2.69	-0.24	0.82	2.73
Lsat_1_v5_gn_2_65981.1 (GRF2)	-0.5	-0.34	-0.23	0.05	0.37	0.32	-0.11	-0.18	-0.13	-0.07	-0.04	-0.08	0.56	0.24	0.35	0.32	0.22	-0.18	-0.45	-0.18	-0.09	-0.12	-0.36	-0.22	-0.05	-0.08	0.03	0.04	0.07	0.02	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_66741.1 (NEK1)	-0.54	-0.48	-0.79	-0.31	0.14	-0.09	-0.7	-0.45	0.15	0.14	0.31	0.49	0.67	0.04	0.2	-0.01	-0.12	-0.1	-0.09	0.07	-0.11	-0.06	-0.67	0.01	-0.02	-0.15	-0.04	-0.02	0.11	0.3	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_67640.1 (SIRK1)	-0.71	-0.39	-0.44	-0.14	-0.12	-0.17	-0.35	-0.33	-0.11	-0.07	0.05	0.19	0.58	0.08	0.19	0.21	0.18	-0.35	-0.01	0.01	-0.16	0.0	-0.41	-0.12	0.05	0.13	0.04	0.03	0.12	0.37	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_68360.1 (SKOR)	-1.1	-0.98	-0.53	-0.5	0.07	-0.39	-0.2	-0.11	0.24	0.24	0.15	0.24	-0.29	0.91	0.77	0.16	0.19	-0.54	-0.05	-0.12	-0.25	-0.3	-3.2	0.2	-0.05	-0.15	0.01	-0.57	0.23	0.55	1.02
Lsat_1_v5_gn_2_7020.1 (MPPBETA)	-0.85	-0.31	-0.58	-0.21	-0.27	-0.72	-0.46	-0.44	-0.18	-0.1	-0.03	-0.42	-0.61	0.97	0.93	-0.17	-0.66	0.36	0.5	-0.44	-0.41	-0.26	-0.5	-0.12	-0.26	0.02	-0.11	-0.78	0.56	0.7	1.34
Lsat_1_v5_gn_2_74061.1	-0.92	-0.84	-1.36	-0.96	-0.43	-0.26	-0.29	0.27	-0.53	-0.37	-0.21	-0.19	1.0	0.62	0.4	-0.09	0.03	0.14	0.03	-0.09	-0.01	0.08	-0.47	0.14	0.07	0.08	0.02	-0.49	0.19	0.36	1.13
Lsat_1_v5_gn_2_76320.1 (HANL2)	-2.06	-3.32	-0.59	-0.79	-1.16	-1.73	-0.74	-1.07	-0.55	0.3	-0.18	0.9	1.6	-1.91	-0.27	0.28	0.4	0.5	-0.8	0.48	-0.6	-0.93	-2.73	0.4	0.16	-0.55	-0.76	-0.6	-0.22	0.7	2.23
Lsat_1_v5_gn_2_80100.1 (SQE2)	-2.1	-1.53	-0.94	-0.84	-0.25	-0.34	-0.28	-0.45	0.01	0.04	0.23	0.24	0.35	-0.08	0.51	0.25	0.21	0.46	-0.0	0.16	-0.28	-0.29	-1.66	0.08	0.01	-0.09	-0.03	-0.59	0.57	0.92	1.2
Lsat_1_v5_gn_2_83561.1 (AGP18)	-1.26	-1.42	0.03	0.39	-1.1	-0.75	-0.63	-1.29	-0.03	0.14	-0.0	0.48	0.86	-1.26	-0.04	0.5	0.59	0.92	-0.2	0.38	0.2	0.01	-2.76	-0.08	0.3	0.51	0.51	0.13	-0.17	-0.15	-0.16
Lsat_1_v5_gn_2_84641.1	-1.47	-0.57	-1.7	-0.89	0.02	-0.68	-0.32	-0.75	0.06	0.23	0.4	0.31	0.07	1.09	0.96	0.24	0.38	0.11	0.17	-0.17	-0.46	-1.01	-1.61	0.06	-0.23	-0.12	-0.09	-1.19	-0.04	0.73	1.16
Lsat_1_v5_gn_2_86141.1 (SNI1)	-1.78	-1.51	-2.66	-2.72	-1.52	-0.18	-0.34	-0.87	-0.4	-0.35	-0.64	-0.59	0.26	0.5	0.5	0.25	0.08	0.91	0.56	0.28	0.16	0.19	0.71	0.07	0.2	0.45	0.17	-0.06	0.52	0.62	0.35
Lsat_1_v5_gn_2_91441.1 (D6PK)	-1.84	-1.73	-1.61	-0.72	-0.59	-0.39	-0.41	-1.08	-0.18	-0.08	-0.15	0.18	1.04	0.59	0.83	0.15	0.18	0.76	-0.11	0.1	-0.27	-0.3	-2.37	0.15	-0.32	-0.42	-0.38	-0.47	0.53	0.46	1.53
Lsat_1_v5_gn_2_96600.1 (CSLA2)	-1.3	-1.19	-0.38	-0.06	-0.07	-0.29	-0.56	-0.59	-0.03	0.17	0.12	0.32	0.78	0.37	0.33	0.16	0.44	0.29	0.1	0.08	-0.17	-0.07	-2.19	-0.02	-0.0	0.04	0.13	-0.12	-0.06	0.21	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_99240.1 (OTU1)	-1.8	-1.0	-1.4	-0.93	-0.24	-0.37	-0.7	-0.67	-0.12	-0.18	-0.09	0.07	-0.36	1.03	1.22	0.15	0.32	-0.56	0.31	-0.27	-0.42	-0.42	-2.03	-0.25	-0.28	-0.06	0.11	-1.25	0.92	1.08	1.34
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.