Heatmap: Cluster_164 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_1041.1 (ELI3)	-2.11	-1.3	-1.97	-2.29	-0.47	-0.4	-0.36	-0.29	-0.27	-0.07	-0.11	0.14	0.84	0.94	0.78	0.36	0.39	1.13	0.13	0.33	-0.19	-0.14	-2.4	0.35	-0.01	-0.19	-0.16	-0.04	-0.1	0.12	0.55
Lsat_1_v5_gn_0_24140.1	-0.38	-0.39	-0.08	0.13	0.21	0.32	-0.41	-0.33	-0.41	-0.13	-0.01	-0.23	0.44	0.18	0.05	0.08	-0.13	0.72	-0.13	-0.36	-0.08	-0.25	0.32	-0.31	-0.13	-0.07	-0.16	-0.29	0.22	0.19	0.48
Lsat_1_v5_gn_0_2660.1	-1.57	-1.42	-1.76	-1.5	0.05	-0.1	-1.26	-1.69	-0.63	-0.67	-0.27	-0.26	1.06	1.05	0.72	-0.34	0.0	1.22	0.23	-0.27	-0.48	-0.31	-1.61	-0.0	-0.21	-0.04	-0.14	-0.85	0.41	0.41	1.71
Lsat_1_v5_gn_0_29540.1 (ZAC)	-2.52	-	-	-	1.47	-0.2	-2.02	-3.32	-0.96	0.11	-0.27	-0.58	0.5	-0.4	1.51	0.12	-0.49	3.02	-2.72	-1.88	-0.66	-3.32	2.07	-2.59	-	-1.63	0.21	-1.13	-4.52	-3.59	0.28
Lsat_1_v5_gn_0_4140.1 (PAB2)	-0.57	-0.41	-0.26	-0.1	0.1	0.14	-0.0	-0.15	-0.22	-0.09	-0.06	-0.2	-0.09	0.3	0.36	0.24	0.03	0.17	0.01	-0.2	-0.25	-0.24	0.63	-0.31	-0.22	-0.07	-0.1	-0.51	0.15	0.31	0.7
Lsat_1_v5_gn_0_45861.1	-3.35	-1.77	-1.25	-0.81	-0.07	-0.03	-0.27	-0.49	0.07	-0.05	-0.62	-0.33	0.52	0.69	1.16	0.08	-0.23	1.29	-0.22	0.14	-0.46	-0.17	-0.93	-0.14	0.13	-0.05	-0.36	-0.71	0.43	0.42	0.92
Lsat_1_v5_gn_1_109780.1 (RABA1d)	-0.59	-0.78	-0.78	-0.57	0.46	0.41	-0.38	-0.0	-0.44	-0.32	-0.28	0.08	0.48	0.24	0.32	-0.08	-0.15	0.86	-0.27	-0.31	-0.3	-0.15	0.58	-0.23	-0.12	-0.33	-0.08	-0.32	0.25	0.13	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_128681.1	-1.64	-1.34	-1.21	-0.64	-0.17	-0.15	-0.31	-0.03	0.17	0.18	0.31	0.18	0.28	0.67	0.36	0.16	-0.07	0.63	-0.16	-0.08	-0.45	-0.22	-0.32	-0.07	-0.44	0.02	-0.07	-0.26	0.16	0.53	1.0
Lsat_1_v5_gn_1_19180.1	-0.59	-0.51	-0.61	-0.45	0.21	0.23	-0.24	-0.16	-0.28	-0.07	-0.07	-0.09	0.7	0.38	0.01	0.06	-0.05	0.43	-0.26	-0.15	-0.19	-0.08	0.31	-0.26	0.02	-0.07	-0.1	-0.04	0.09	0.19	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_22980.1	-1.16	-1.54	-1.44	-1.76	-0.53	-0.99	-0.72	-2.23	-0.52	-0.2	0.39	0.42	1.07	-0.13	0.71	0.04	-0.37	1.68	0.48	0.45	-0.73	-0.32	-	0.65	0.86	-0.09	0.11	-0.93	-0.58	0.29	0.73
Lsat_1_v5_gn_1_26521.1 (RTL4)	-0.62	-0.67	-0.78	-0.53	0.37	0.54	-0.51	-0.52	-0.17	-0.05	-0.56	-0.57	0.13	0.64	0.2	-0.61	-0.66	0.97	-0.03	-0.13	-0.02	-0.14	0.11	-0.11	-0.19	-0.22	-0.07	-0.47	0.27	0.52	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_34861.1	-0.76	-0.57	-0.77	-0.79	0.22	0.25	-0.15	-0.17	-0.24	-0.14	-0.12	-0.03	0.65	0.18	0.04	0.02	0.14	0.2	-0.13	-0.16	-0.16	0.01	0.01	-0.06	0.01	-0.03	-0.06	0.08	0.32	0.36	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_50861.1	-0.57	-0.45	-0.73	-0.79	0.4	0.31	-0.18	-0.18	-0.43	-0.3	-0.32	-0.23	0.55	0.38	0.19	-0.08	-0.03	0.74	-0.1	-0.31	-0.38	-0.14	0.71	-0.22	-0.09	-0.26	-0.19	-0.05	0.26	0.23	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_58860.1 (COG1)	-0.99	-0.42	-0.69	-0.5	0.21	0.03	-0.38	-0.61	-0.28	-0.18	-0.01	-0.06	0.36	0.42	0.13	0.03	-0.04	0.65	0.12	-0.14	-0.19	-0.05	0.46	-0.25	-0.12	-0.01	-0.03	-0.18	0.32	0.31	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_63561.1	-1.28	-0.85	-1.01	-0.47	0.47	0.16	-0.72	-0.62	-0.13	-0.07	-0.06	-0.09	0.04	0.53	0.61	0.02	-0.24	1.56	-0.04	-0.2	-0.37	-0.32	0.36	-0.6	-0.37	-0.33	-0.33	-0.59	0.29	0.12	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_83000.1	-1.28	-1.46	-1.22	-0.79	-0.29	-0.53	-0.36	-0.2	0.01	0.16	0.03	0.36	0.41	0.35	0.34	0.26	0.12	0.17	-0.36	-0.16	-0.24	0.0	1.18	-0.01	-0.1	0.17	-0.04	-0.52	-0.01	0.06	0.85
Lsat_1_v5_gn_1_86700.1 (epsilon1-COP)	-0.54	-0.58	-0.75	-0.65	0.12	0.16	-0.38	-0.47	-0.36	-0.11	-0.13	-0.1	0.46	0.37	0.27	0.01	0.03	0.84	-0.06	-0.08	-0.08	-0.03	0.13	-0.04	-0.06	-0.09	-0.12	0.07	0.3	0.2	0.41
Lsat_1_v5_gn_2_101721.1	-1.14	-2.12	-0.72	-0.67	-0.08	0.02	-0.8	-0.89	-0.54	-0.29	-0.13	0.11	0.53	0.18	0.42	-0.23	0.04	1.32	0.09	-0.24	-0.08	-0.28	1.4	0.03	-0.28	-0.08	-0.41	-0.62	-0.02	-0.05	0.81
Lsat_1_v5_gn_2_115161.1 (NF-YB8)	-1.05	-1.48	-1.18	-0.68	0.24	0.28	-0.34	-0.54	-0.5	-0.42	-0.23	-0.15	0.72	0.55	0.41	-0.27	-0.3	1.08	0.16	-0.22	-0.18	0.09	0.65	-0.12	-0.08	-0.07	-0.09	-0.16	-0.01	0.08	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_119121.1	-1.19	-0.98	-0.97	-0.72	-0.4	-0.57	-0.55	-0.66	-0.16	-0.05	0.17	0.16	0.66	0.58	0.5	0.5	0.41	0.77	-0.15	0.15	-0.24	-0.29	0.06	0.15	0.11	0.12	-0.08	-0.42	-0.45	0.08	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_120401.1 (WLIM2a)	-0.65	-0.82	-0.57	-0.58	0.2	0.36	-0.57	-0.39	-0.21	-0.36	-0.3	-0.12	0.21	0.24	0.07	0.2	0.01	0.68	-0.02	-0.1	-0.16	-0.03	0.54	0.02	-0.01	-0.02	0.01	-0.13	0.27	0.29	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_134361.1	-2.59	-2.2	-2.17	-1.17	-0.78	-0.59	0.04	-0.26	0.08	0.12	0.11	0.11	0.34	0.12	0.39	0.12	0.21	0.51	0.13	0.25	0.06	-0.01	0.95	0.07	0.03	0.04	-0.1	-0.38	0.25	0.3	0.79
Lsat_1_v5_gn_2_1520.1	-1.44	-0.18	-0.18	-1.25	-0.97	-0.91	-0.36	-0.99	-0.64	0.14	-0.77	-0.31	-0.91	0.72	0.79	-0.65	-0.97	0.55	-0.45	-0.51	-0.76	-0.65	1.58	-0.6	-0.34	0.03	-1.12	-3.01	0.99	1.11	1.86
Lsat_1_v5_gn_2_61101.1 (GLCNA.UT2)	-0.61	-0.45	-0.43	-0.36	0.28	0.42	-0.27	-0.28	-0.22	-0.18	-0.02	0.11	0.61	0.04	0.13	0.07	-0.03	-0.01	-0.24	-0.17	-0.14	-0.12	0.2	-0.19	-0.02	-0.12	-0.04	-0.18	0.28	0.28	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_64140.1	-0.89	-0.6	-0.9	-0.81	0.33	0.4	-0.54	-0.27	-0.31	-0.42	-0.28	-0.28	0.66	0.51	0.41	-0.04	-0.28	1.03	-0.13	-0.42	-0.39	-0.12	0.7	-0.36	-0.28	-0.16	-0.07	-0.22	0.26	0.19	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_6741.1	-1.05	-0.82	-0.78	-0.44	0.19	0.02	-0.59	-0.83	-0.27	-0.25	-0.03	-0.08	0.53	0.24	0.13	0.11	-0.15	1.23	-0.18	-0.23	-0.23	-0.01	0.89	-0.36	-0.28	-0.05	-0.27	-0.27	0.12	0.25	0.73
Lsat_1_v5_gn_2_70580.1 (EXT13)	-1.05	-1.04	-1.23	-0.83	0.03	0.09	-0.31	-0.47	-0.07	-0.04	0.17	0.03	0.45	0.34	0.32	-0.02	0.02	0.35	0.09	-0.16	-0.23	-0.07	0.71	0.02	0.06	0.03	-0.05	-0.13	0.06	0.16	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_73701.1	-1.18	-0.65	-1.05	-1.0	0.16	0.13	-0.19	-0.41	0.17	-0.07	0.21	0.19	0.08	0.08	0.11	0.17	-0.13	0.39	0.06	-0.03	-0.05	-0.03	0.24	-0.27	0.05	0.07	-0.06	-0.29	0.17	0.44	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_7800.1	-0.91	-0.96	-0.84	-0.56	0.32	0.3	-0.44	0.12	-0.69	-0.61	-0.28	-0.13	0.77	0.49	0.1	-0.19	-0.11	0.89	-0.42	-0.45	-0.24	-0.08	0.77	0.01	-0.05	-0.23	-0.23	-0.15	0.03	0.09	0.94
Lsat_1_v5_gn_2_83920.1 (DDB1B)	-0.72	-1.04	-0.26	-0.49	-0.33	-0.32	-0.62	-0.65	0.21	0.14	0.38	0.36	-0.18	0.66	0.49	-0.05	-0.17	0.74	-0.51	-0.3	-0.52	-0.4	0.86	-0.37	-0.43	-0.4	-0.19	-1.26	0.22	0.53	1.19
Lsat_1_v5_gn_2_90981.1 (SEOb)	-1.68	-1.88	-0.49	-0.16	-0.02	-0.86	-0.72	-0.8	0.11	0.12	0.16	0.51	0.54	-0.67	0.45	-0.23	0.36	0.52	-0.85	-0.04	-0.25	-0.66	1.57	-0.04	0.13	-0.41	-0.45	-0.58	-0.08	0.73	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_93920.1 (TPLATE)	-0.71	-0.27	-0.65	-0.35	0.33	0.15	-0.38	-0.54	-0.21	-0.19	-0.14	-0.01	0.51	0.39	0.25	0.19	0.02	0.42	0.02	-0.17	-0.18	-0.03	-0.13	-0.26	-0.12	-0.02	-0.06	-0.15	0.19	0.25	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_96961.1	-0.63	-0.6	-0.65	-0.43	0.25	0.16	-0.1	-0.02	-0.33	-0.23	-0.24	-0.13	0.59	0.33	0.17	0.07	0.05	0.35	-0.08	-0.14	-0.18	-0.01	0.35	-0.11	-0.05	-0.03	-0.07	0.01	0.12	0.06	0.54
Lsat_1_v5_gn_3_103040.1	-2.17	-1.24	-1.21	-0.92	0.29	0.18	-1.03	-0.92	-0.2	-0.26	0.05	-0.17	-0.0	1.05	0.86	-0.07	-0.4	0.79	0.09	-0.13	0.01	0.06	0.43	-0.53	0.06	0.02	0.1	-0.46	0.76	0.28	0.31
Lsat_1_v5_gn_3_114940.1 (CPK4)	-1.79	-3.85	-2.24	-2.08	-1.14	-1.41	-1.19	-1.15	-0.35	0.5	0.09	0.79	1.37	0.72	0.97	-0.41	-0.18	2.13	-0.15	-0.18	-1.26	-0.36	-0.18	-0.1	-1.09	-1.14	-0.68	-0.18	-0.19	-0.08	1.17
Lsat_1_v5_gn_3_138461.1	-0.56	-0.26	-0.57	-0.31	0.3	0.06	-0.42	-0.64	0.02	0.02	0.16	0.16	0.18	0.38	0.32	-0.08	-0.05	0.35	-0.17	-0.25	-0.29	-0.15	0.28	-0.27	-0.16	-0.06	-0.15	-0.34	0.26	0.34	0.77
Lsat_1_v5_gn_3_140680.1	-1.22	-0.96	-1.94	-1.42	0.28	0.2	-0.96	-1.18	-0.28	-0.16	-0.13	-0.08	0.57	0.89	0.51	-0.08	0.1	1.07	0.2	-0.2	-0.34	-0.21	-0.21	0.04	0.04	-0.13	0.02	-0.62	0.14	0.3	1.11
Lsat_1_v5_gn_3_14761.1	-3.35	-1.77	-1.25	-0.81	-0.07	-0.03	-0.27	-0.49	0.07	-0.05	-0.62	-0.33	0.52	0.69	1.16	0.08	-0.23	1.29	-0.22	0.14	-0.46	-0.17	-0.93	-0.14	0.13	-0.05	-0.36	-0.71	0.43	0.42	0.92
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.