Heatmap: Cluster_168 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_18421.1	-1.0	-0.88	-1.4	-0.96	-0.19	0.06	0.05	0.17	-0.43	-0.38	-0.17	-0.23	0.36	0.54	0.52	0.02	-0.25	0.41	-0.1	-0.15	-0.19	-0.24	1.28	-0.21	-0.26	-0.12	-0.13	-0.37	0.12	0.12	0.93
Lsat_1_v5_gn_1_2220.1 (ASG2)	-0.4	-0.38	-0.79	-1.22	0.07	0.25	0.13	-0.03	-0.17	-0.35	-0.33	-0.19	0.34	0.77	0.61	0.1	-0.02	0.42	-0.07	-0.24	-0.15	-0.24	0.76	-0.25	-0.22	-0.08	-0.13	-0.09	-0.04	-0.27	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_39541.1 (SK19)	-4.21	-3.31	-6.27	-5.4	-1.39	0.01	0.64	1.23	-1.17	-1.29	-1.36	-1.67	-1.34	1.94	1.33	-0.06	-0.27	0.95	0.51	-0.37	-0.42	-0.54	1.43	-0.16	-0.3	-0.79	-0.52	-1.24	0.3	0.41	0.26
Lsat_1_v5_gn_1_45401.1 (CAP-D3)	-0.49	-0.33	-1.03	-1.02	-0.24	0.01	0.28	0.75	-0.48	-0.27	-0.18	-0.22	0.44	0.31	0.2	-0.13	-0.0	0.75	0.02	-0.11	-0.23	-0.21	1.07	0.22	-0.2	-0.07	-0.3	-0.04	-0.32	-0.31	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_5160.1	-0.36	-0.86	-1.53	-2.13	-1.0	-0.25	0.74	1.16	-0.81	-0.88	-0.69	-0.64	0.73	0.84	0.51	0.03	0.21	0.46	-0.02	-0.09	-0.21	-0.21	1.54	-0.09	-0.14	-0.21	-0.19	-0.05	-0.53	-0.61	-0.77
Lsat_1_v5_gn_1_75801.1 (TAF2)	-0.9	-0.66	-1.86	-2.65	-0.61	0.18	0.44	0.4	-0.46	-0.61	-0.5	-0.6	0.22	0.55	0.6	0.2	-0.06	0.22	0.04	-0.01	0.1	0.16	1.35	0.06	0.11	-0.02	0.32	-0.03	-0.02	-0.2	-0.27
Lsat_1_v5_gn_1_81541.1 (FOL2)	-2.05	-1.25	-1.15	-0.79	-0.05	0.09	-0.3	-0.04	-0.51	-0.17	-0.35	-0.31	0.38	0.85	0.71	-0.15	-0.35	0.77	-0.24	-0.28	-0.29	-0.42	1.56	-0.2	-0.25	-0.23	-0.66	-1.27	0.17	0.3	1.03
Lsat_1_v5_gn_1_83080.1	-1.32	-1.06	-1.68	-1.71	-0.77	-0.49	0.78	1.37	-1.02	-0.98	-0.96	-0.88	0.2	0.72	0.77	0.28	0.46	0.94	0.31	-0.05	-0.37	-0.26	1.26	-0.07	-0.2	-0.31	-0.35	-0.23	-0.45	-0.49	-0.17
Lsat_1_v5_gn_1_96620.1	-0.2	-0.95	-1.41	-2.16	-0.76	-0.29	-0.35	0.02	-1.02	-1.43	-1.45	-1.41	0.26	1.87	1.82	0.49	0.49	0.84	-0.4	-1.26	-0.59	-1.4	1.88	-0.49	-0.69	-2.0	-1.32	-1.62	-0.81	0.27	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_114381.1 (EMB1144)	-0.44	-0.64	-1.06	-1.59	-0.49	-0.12	0.52	0.82	-0.7	-0.7	-0.5	-0.46	0.29	0.35	0.49	0.07	0.22	0.35	0.51	-0.08	-0.18	-0.07	0.96	-0.01	-0.08	-0.2	-0.15	-0.01	0.03	0.01	0.07
Lsat_1_v5_gn_2_114601.1 (ABF4)	-0.58	-1.1	-1.19	-1.57	-0.2	-0.04	0.16	0.61	-0.15	-0.29	-0.11	-0.28	-0.06	1.02	0.9	0.1	-0.04	0.74	-0.18	-0.23	-0.44	-0.16	0.83	-0.27	-0.42	-0.22	-0.18	-0.51	0.04	-0.11	0.54
Lsat_1_v5_gn_2_52260.1 (PDC1)	-1.09	-0.57	-1.14	-2.22	-0.39	-0.28	-0.06	0.13	-0.88	-1.26	-0.74	-0.92	0.34	1.41	0.73	0.18	-0.22	0.56	0.57	-0.04	-0.18	-0.08	1.48	-0.01	-0.28	-0.51	-0.28	-0.33	0.21	-0.24	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_69281.1	-0.71	-1.02	-1.39	-1.02	0.21	0.27	0.46	0.58	-0.56	-0.51	-0.47	-0.44	0.42	0.59	0.48	-0.07	0.1	-0.33	-0.07	-0.26	-0.21	-0.18	1.51	-0.33	0.08	-0.16	-0.18	-0.03	-0.02	-0.13	-0.01
Lsat_1_v5_gn_2_85480.1 (MRG1)	-1.86	-2.25	-2.63	-3.98	-0.4	0.28	0.47	1.23	-0.76	-0.31	-0.6	-0.09	0.6	0.68	0.55	-0.36	-0.61	1.08	-0.54	-0.18	-0.98	-0.04	1.6	-0.01	-0.25	-0.25	-0.54	-0.44	0.2	-0.34	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_86220.1 (FtsHi3)	-1.16	-1.03	-1.07	-0.9	-0.23	0.14	0.01	0.72	-0.82	-0.79	-0.75	-0.31	0.59	0.52	0.24	-0.05	-0.12	0.5	-0.66	-0.32	-0.27	-0.09	1.91	-0.16	-0.07	-0.17	-0.41	-0.27	-0.15	-0.22	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_88180.1 (CM1)	-0.22	-0.46	-0.12	-0.53	-0.85	-0.97	0.43	0.81	-0.89	-0.8	-0.76	-0.93	-0.37	0.7	0.76	-0.07	0.16	0.6	0.6	-0.27	-0.48	-0.36	1.9	-0.3	-0.44	-0.45	-0.4	-0.33	-0.15	-0.3	-0.72
Lsat_1_v5_gn_3_119900.1	0.13	-0.16	-1.07	-1.24	-0.26	0.07	-0.09	0.93	-1.05	-0.76	-0.79	-0.29	0.43	1.32	0.35	-1.01	-1.01	0.77	-0.53	-0.96	-0.55	-0.78	2.46	-0.21	-0.71	-0.9	-0.89	-0.61	-0.53	-0.74	-0.65
Lsat_1_v5_gn_3_121781.1	-0.36	-0.46	-0.58	-0.45	0.26	0.3	0.09	0.47	-0.47	-0.35	-0.22	-0.39	0.49	0.54	0.3	0.11	-0.07	0.23	-0.27	-0.22	-0.18	-0.08	0.41	-0.21	0.05	0.04	-0.09	-0.02	-0.02	-0.11	0.22
Lsat_1_v5_gn_3_13660.1 (MTA)	-0.42	-0.6	-0.65	-0.28	-0.03	0.0	-0.04	0.17	-0.39	-0.37	-0.28	-0.18	0.59	0.42	0.16	-0.09	-0.12	0.21	-0.41	-0.19	-0.14	-0.17	1.34	-0.09	-0.19	-0.15	-0.3	-0.3	-0.06	0.01	0.66
Lsat_1_v5_gn_3_35740.1 (RH2)	-0.35	-0.38	-0.57	-0.49	0.11	0.2	0.19	0.43	-0.42	-0.42	-0.38	-0.3	0.28	0.34	0.19	0.03	-0.05	0.37	0.01	-0.11	-0.04	-0.02	0.68	-0.11	-0.12	-0.06	-0.12	-0.02	0.01	-0.03	0.23
Lsat_1_v5_gn_3_53161.1	-0.96	-1.01	-2.05	-2.58	-0.72	0.25	0.74	1.07	-0.66	-0.73	-0.73	-0.75	0.53	0.95	0.53	0.02	0.15	0.62	0.16	-0.06	-0.13	-0.07	1.01	-0.1	-0.05	-0.15	-0.03	-0.09	-0.31	-0.36	-0.28
Lsat_1_v5_gn_4_104740.1 (NTT1)	0.24	-0.33	-0.8	-1.14	-0.95	-0.33	0.75	1.51	-0.63	-0.76	-0.55	-0.59	0.05	0.64	0.36	-0.22	-0.09	0.22	-0.3	-0.27	-0.3	-0.31	1.69	-0.21	-0.27	-0.35	-0.31	-0.19	-0.46	-0.44	-0.7
Lsat_1_v5_gn_4_114681.1 (H3.3)	-1.51	-0.97	-1.22	-1.26	-0.46	0.54	0.1	0.25	-0.44	-0.43	-0.37	-0.46	0.81	1.39	1.17	0.45	0.13	0.63	-0.35	-0.5	-0.46	-0.46	1.04	-0.57	-0.53	-0.58	-0.52	-0.81	-0.09	-0.15	0.14
Lsat_1_v5_gn_4_120601.1 (CYP82G1)	-1.4	-0.78	-1.07	-1.78	-2.45	-0.36	0.6	1.42	-1.92	-2.34	-1.59	-2.17	0.2	0.92	0.36	-0.59	-0.67	1.58	0.24	-0.51	-0.93	-0.64	2.43	-0.01	-0.25	-0.93	-0.5	-0.61	0.33	-0.77	-0.99
Lsat_1_v5_gn_4_151281.1 (SBA3)	-1.12	-0.65	-1.21	-1.12	-0.12	-0.02	0.18	0.68	-0.61	-0.37	-0.62	-0.26	0.58	0.48	0.17	0.06	0.02	0.44	-0.23	-0.22	-0.22	-0.28	1.36	-0.22	-0.22	-0.06	-0.32	-0.27	0.1	0.12	0.67
Lsat_1_v5_gn_4_161761.1 (NUDX26)	-0.47	-0.48	-0.59	-0.59	-0.25	0.4	0.17	0.13	-0.04	-0.24	-0.15	-0.36	-0.54	0.43	0.47	0.25	-0.02	-0.9	-0.04	-0.3	-0.21	0.03	1.6	-0.19	-0.22	-0.12	0.15	-0.28	0.02	0.04	-0.16
Lsat_1_v5_gn_4_172421.1 (AtPEP2)	-0.75	-0.51	-0.99	-0.52	0.12	0.43	0.29	0.62	-0.53	-0.43	-0.44	-0.46	0.38	0.67	0.32	-0.09	-0.0	0.24	-0.32	-0.33	0.05	-0.05	0.83	-0.08	-0.13	-0.05	-0.08	-0.02	-0.07	-0.24	0.27
Lsat_1_v5_gn_4_183501.1	-0.56	-1.35	-1.47	-1.61	0.21	0.39	-0.22	0.19	-0.53	-0.72	-0.29	-0.43	-0.22	1.13	1.13	0.32	0.02	0.77	-0.08	-0.41	-0.47	-0.32	0.59	0.04	-0.4	-0.25	-0.25	-0.66	0.25	-0.02	0.77
Lsat_1_v5_gn_4_25961.1	-0.64	-0.8	-1.23	-1.03	-0.04	0.12	0.07	0.36	-0.53	-0.53	-0.4	-0.26	0.55	1.04	0.75	-0.14	-0.29	0.43	0.04	-0.23	-0.22	-0.18	1.18	-0.1	-0.15	-0.23	-0.34	-0.37	-0.13	-0.05	0.26
Lsat_1_v5_gn_4_34900.1	-0.23	-0.44	-0.6	-0.53	0.15	0.17	0.2	0.56	-0.32	-0.05	0.01	-0.24	0.24	0.4	0.12	0.08	-0.07	-0.33	-0.41	-0.31	-0.38	0.01	1.09	-0.25	0.06	-0.14	-0.16	-0.08	-0.14	-0.05	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_41860.1 (CDC48C)	-0.77	-0.64	-0.98	-0.58	0.15	-0.08	-0.02	0.71	-0.71	-0.39	-0.51	-0.25	0.56	0.72	0.36	-0.22	-0.14	0.56	-0.43	-0.3	-0.09	-0.22	1.35	-0.23	-0.24	-0.07	-0.45	-0.17	-0.13	-0.31	0.53
Lsat_1_v5_gn_4_43461.1 (EPSPS)	-1.31	-1.28	-1.44	-1.36	-0.42	-0.25	-0.19	0.16	-0.81	-0.61	-0.51	-0.3	0.48	0.79	0.53	0.02	0.12	0.54	0.12	-0.14	-0.31	-0.18	1.46	0.01	0.01	-0.23	-0.27	-0.08	0.23	0.12	0.71
Lsat_1_v5_gn_4_50380.1 (COSY)	-0.62	-1.5	-1.85	-1.93	-0.97	-0.49	0.75	1.15	-0.71	-0.71	-0.56	-0.76	0.31	1.45	0.93	-0.13	-0.13	0.76	0.15	-0.04	-0.27	-0.18	1.4	0.08	-0.14	-0.36	-0.49	-0.28	-0.55	-0.75	-1.16
Lsat_1_v5_gn_4_59561.1 (TOP1)	-0.57	-0.34	-0.94	-0.83	0.1	0.09	-0.04	0.4	-0.46	-0.35	-0.25	-0.08	0.42	0.51	0.23	-0.05	-0.08	0.33	-0.15	-0.22	-0.29	-0.14	1.15	-0.13	-0.19	-0.21	-0.17	-0.26	-0.01	0.03	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_68920.1 (ULT2)	-1.04	-2.07	-1.04	-0.7	-0.99	-0.57	-0.08	0.1	-0.7	-0.94	-0.82	-0.98	1.05	0.88	0.27	-0.67	-0.52	1.62	-0.79	-0.28	-0.88	-0.78	2.51	-0.47	-0.83	-0.61	-0.43	-0.16	-0.95	-1.03	0.53
Lsat_1_v5_gn_4_85240.1 (4CL1)	-0.43	-0.45	-0.04	-0.01	-0.94	-0.33	0.32	0.27	-0.59	-0.49	-0.51	-0.49	0.09	0.35	0.56	0.21	0.2	0.82	0.11	-0.16	-0.27	-0.29	1.53	-0.21	-0.18	-0.17	-0.24	-0.2	-0.46	-0.45	-0.33
Lsat_1_v5_gn_4_89020.1 (ATS3A)	-0.61	-0.73	-0.9	-1.18	-0.17	0.01	0.1	0.36	-0.3	-0.28	-0.07	-0.18	0.31	0.44	0.5	-0.03	0.09	0.55	0.04	-0.07	-0.25	-0.25	1.26	-0.01	-0.15	-0.28	-0.06	-0.22	-0.3	-0.14	0.28
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.