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Heatmap: Cluster_183 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.29 0.24 0.46 -0.06 0.44 0.37 -0.19 -0.11 -0.53 -0.5 -0.32 -0.52 -0.08 0.42 0.3 0.03 -0.19 0.45 -0.21 -0.44 -0.29 -0.23 0.9 -0.48 -0.35 -0.31 -0.27 -0.26 0.05 -0.02 -0.01
0.36 0.37 0.21 0.36 0.89 0.2 -0.39 -0.34 -0.42 -0.47 -0.29 -0.46 0.06 0.57 0.44 -0.12 -0.38 0.78 -0.25 -0.65 -0.57 -0.49 0.93 -0.72 -0.55 -0.33 -0.46 -0.56 -0.1 -0.14 0.01
0.51 0.38 0.25 0.15 1.09 0.59 -0.51 -0.59 -0.45 -0.44 -0.37 -0.65 -0.53 1.03 0.73 -0.1 -0.53 0.66 -0.17 -0.77 -0.61 -0.63 0.94 -0.78 -0.61 -0.65 -0.47 -0.68 -0.1 -0.29 -0.29
0.2 0.08 0.3 0.21 0.52 0.25 -0.25 -0.46 -0.34 -0.29 -0.25 -0.41 -0.32 0.76 0.41 -0.15 -0.25 0.57 0.04 -0.52 -0.37 -0.35 0.86 -0.52 -0.49 -0.4 -0.34 -0.52 -0.01 0.03 0.25
0.43 0.29 0.63 0.75 0.6 0.27 -0.79 -1.22 -0.35 -0.32 -0.23 -0.3 -0.28 0.73 0.31 -0.15 -0.25 0.38 -0.34 -0.42 -0.23 -0.21 0.94 -0.66 -0.44 -0.23 -0.39 -0.18 -0.23 -0.46 -0.25
0.34 -0.15 0.04 -0.01 0.9 0.43 -0.3 -0.28 -0.45 -0.46 -0.47 -0.31 -0.17 0.46 0.59 -0.32 -0.38 0.55 -0.19 -0.36 -0.13 0.02 0.93 -0.36 -0.36 -0.23 -0.41 -0.12 0.02 -0.16 -0.57
0.32 0.4 -0.17 -0.86 0.78 0.49 -0.58 -0.43 -0.57 -0.49 -0.54 -0.55 0.07 0.78 0.62 0.16 -0.35 0.96 -0.21 -0.59 -0.28 -0.35 0.96 -0.74 -0.48 -0.17 -0.34 -0.39 -0.05 -0.14 -0.25
0.59 0.38 0.39 0.48 0.73 0.19 -0.75 -0.93 -0.29 -0.4 -0.3 -0.59 -0.84 1.45 0.96 -0.38 -0.79 0.72 -0.21 -0.77 -0.6 -0.59 0.41 -0.71 -0.72 -0.57 -0.59 -0.54 0.13 -0.07 -0.18
0.04 -0.58 0.82 0.88 1.1 0.78 -1.21 -1.1 -0.66 -0.77 -0.34 -0.89 -0.8 1.07 0.72 -0.54 -0.77 0.91 0.14 -0.74 -0.51 -0.27 0.64 -0.74 -0.5 -0.41 -0.33 -0.5 -0.14 -0.33 -0.19
0.58 0.65 0.36 0.26 1.38 0.43 -1.6 -2.23 -0.37 -0.5 -0.17 -0.5 -0.88 0.75 0.71 0.11 -0.36 1.12 -0.5 -0.97 -0.75 -0.83 0.74 -1.24 -1.04 -0.69 -0.61 -0.98 0.12 0.15 0.11
0.71 0.67 0.55 0.14 0.5 0.05 -0.78 -1.0 -0.46 -0.54 -0.47 -0.86 -0.49 1.02 0.46 -0.49 -0.69 1.63 -0.37 -0.68 -0.55 -0.74 0.59 -0.62 -0.63 -0.58 -0.57 -0.67 0.06 -0.12 0.06
0.45 0.48 0.23 0.04 0.91 0.59 -0.54 -0.22 -0.48 -0.59 -0.42 -0.59 -0.29 0.78 0.42 -0.43 -0.7 0.78 -0.44 -1.02 -0.67 -0.41 1.31 -1.03 -0.68 -0.56 -0.26 -0.87 -0.05 -0.08 0.26
0.1 0.19 0.38 0.45 0.38 0.16 -0.25 -0.14 -0.28 -0.25 -0.18 -0.19 -0.24 0.63 0.32 -0.23 -0.33 0.3 -0.12 -0.34 -0.2 -0.16 0.48 -0.31 -0.38 -0.19 -0.2 -0.41 -0.03 0.04 0.09
0.28 0.19 0.22 -0.23 0.4 0.12 -0.14 -0.28 -0.31 -0.25 -0.22 -0.29 0.09 0.27 0.27 0.04 -0.08 0.56 -0.07 -0.25 -0.32 -0.24 0.57 -0.48 -0.25 -0.18 -0.22 -0.23 0.01 0.04 0.17
0.22 0.2 0.02 0.12 0.96 0.33 -0.83 -1.46 -0.37 -0.46 -0.4 -0.59 -0.37 0.85 0.58 -0.09 -0.28 0.25 0.08 -0.33 -0.23 -0.25 1.31 -0.58 -0.41 -0.27 -0.32 -0.2 -0.09 -0.21 -0.43
0.1 -0.16 0.41 0.78 0.24 -0.09 -0.37 -0.7 -0.01 -0.11 0.08 -0.18 -0.81 0.01 0.22 -0.07 -0.29 1.03 -0.29 -0.5 -0.29 -0.31 0.58 -0.54 -0.45 -0.15 -0.18 -0.44 0.43 0.3 -0.2
0.47 0.01 -0.0 0.02 0.59 0.24 -0.49 -0.44 -0.42 -0.28 -0.23 -0.24 0.01 0.42 0.39 -0.04 -0.17 0.64 0.11 -0.18 -0.23 -0.16 0.04 -0.23 -0.23 -0.3 -0.13 -0.03 0.09 0.02 -0.18
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0.41 -0.49 0.34 0.65 1.51 0.37 -1.56 -1.88 -0.17 -0.29 -0.34 -0.29 -1.22 0.52 0.18 -0.87 -1.28 1.62 -0.37 -1.48 -0.87 -0.78 1.65 -1.21 -0.92 -1.1 -0.85 -1.1 0.26 0.11 -0.15
1.12 1.17 1.26 0.62 1.98 0.36 -1.43 -1.15 -0.59 -0.58 -0.35 -0.65 -2.04 1.09 0.39 -1.45 -2.03 0.07 -1.19 -1.79 -1.45 -1.36 1.32 -1.53 -1.72 -1.65 -1.22 -1.8 0.33 -0.08 -0.68
0.5 0.59 0.8 0.72 0.75 0.46 -0.65 -0.85 -0.71 -0.64 -0.57 -0.64 -0.4 0.82 0.37 -0.37 -0.7 0.68 -0.28 -0.54 -0.58 -0.39 0.69 -0.44 -0.38 -0.46 -0.03 -0.5 -0.13 -0.33 -0.19
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Lsat_1_v5_gn_4_117700.1 (AUXILIN-LIKE4)
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-0.11 -0.24 -0.08 0.14 0.32 0.15 -0.13 -0.14 -0.43 -0.38 -0.22 -0.48 0.26 0.78 0.46 -0.28 -0.33 0.66 -0.43 -0.53 -0.31 -0.34 0.97 -0.3 -0.31 -0.16 -0.43 -0.2 0.05 0.03 0.31
1.04 0.71 0.55 0.25 0.45 0.14 -0.14 -0.5 -0.39 -0.35 -0.34 -0.01 -0.35 0.1 -0.3 -0.44 -0.29 1.32 -0.28 -0.37 -0.43 -0.38 0.87 -0.68 -0.47 -0.27 -0.26 -0.49 -0.55 -0.47 -1.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.