Heatmap: Cluster_213 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.07 0.51 -0.11 -0.11 1.57 1.11 -0.77 -0.56 -0.91 -0.95 -0.86 -1.18 -1.96 0.69 0.31 -0.62 -1.21 -0.78 0.91 -0.64 -0.58 -0.31 -0.16 -0.06 -0.12 -0.66 -0.33 -0.77 0.88 0.33 0.66
-0.48 -0.11 -0.46 -0.4 1.33 1.19 0.05 0.11 -0.01 -0.09 -0.12 -0.19 -0.72 1.18 0.44 -0.41 -1.09 0.07 -0.31 -0.77 -0.13 -0.36 -2.41 -0.55 -0.13 -0.46 -0.06 -0.29 0.21 -0.16 0.4
0.02 0.03 0.16 0.06 0.36 0.35 0.01 -0.1 -0.21 -0.2 -0.11 -0.2 -0.23 0.17 0.03 0.06 -0.17 -0.64 0.12 -0.16 -0.07 0.01 0.3 -0.18 -0.09 -0.0 -0.05 -0.19 0.25 0.14 0.11
0.55 0.36 0.34 0.17 0.89 0.44 -0.24 -0.86 0.05 -0.01 -0.03 -0.28 -0.52 -0.11 0.1 -0.07 -0.34 -0.77 0.05 -0.32 -0.07 -0.12 0.2 -0.11 -0.1 0.01 -0.06 -0.06 0.1 -0.01 -0.53
0.27 -0.51 0.16 0.35 0.23 0.81 0.04 -0.69 -0.17 -0.22 -0.43 -0.68 -0.47 1.41 0.62 -0.05 -0.14 -0.8 0.38 0.22 -0.09 -0.06 -1.94 -0.6 -0.34 -0.03 0.11 -0.03 -0.13 -0.13 -0.51
-0.36 -0.22 -0.23 0.0 0.6 0.45 -0.39 -0.17 -0.4 -0.08 0.16 0.08 -0.01 0.84 0.44 0.1 -0.33 -1.24 -0.22 -0.42 -0.47 -0.67 -0.26 0.03 -0.11 -0.06 -0.0 -0.54 0.25 0.38 0.86
-0.25 -0.12 0.11 0.11 0.5 0.38 -0.26 -0.05 0.05 -0.01 0.1 -0.05 0.03 0.65 0.21 0.02 -0.21 -0.38 -0.05 -0.27 -0.12 -0.13 -0.78 -0.28 -0.33 -0.07 -0.11 -0.12 0.16 0.12 0.34
-0.09 -0.25 0.37 0.18 0.7 0.5 0.15 -0.07 -0.11 -0.09 0.12 -0.24 -0.47 0.45 0.18 0.17 -0.01 -0.46 -0.03 -0.23 -0.36 -0.31 -1.62 -0.29 -0.24 -0.1 -0.19 -0.57 0.36 0.29 0.5
-0.58 -0.23 -0.57 -0.24 0.64 0.25 -0.4 -0.39 0.03 0.03 0.18 0.13 0.03 0.46 0.28 0.04 -0.2 -0.73 -0.1 -0.19 -0.22 -0.24 0.13 -0.1 -0.13 -0.11 0.03 -0.29 0.41 0.46 0.47
-0.32 -0.46 0.16 0.35 0.47 0.57 -0.26 -0.22 -0.05 -0.17 0.06 -0.0 0.07 0.82 0.26 -0.07 -0.27 -0.59 -0.18 -0.48 -0.24 -0.16 -0.77 -0.26 -0.14 0.03 0.02 -0.41 0.21 0.35 0.36
-1.36 -0.39 -1.59 -1.44 1.65 1.69 -0.05 -1.14 -0.32 -0.04 -0.39 -0.49 -0.55 1.44 0.35 0.1 -0.58 -1.04 -0.91 -0.62 -0.25 -1.1 -0.47 -0.75 -0.05 -0.3 -0.18 -1.14 -0.02 0.39 1.01
0.03 0.4 0.5 0.28 0.78 0.47 0.26 -0.23 0.05 -0.17 -0.06 -0.28 -0.59 0.6 0.51 0.36 -0.17 -1.72 -0.27 -0.78 0.04 -0.26 -0.59 -0.49 0.04 -0.01 -0.06 -0.29 -0.25 -0.08 -0.24
-0.8 -0.52 -0.73 -0.54 0.87 0.55 0.11 0.19 0.08 0.14 0.08 0.16 -0.41 0.48 0.66 0.13 0.03 0.05 0.23 0.04 0.03 0.17 -3.98 -0.12 -0.1 0.07 0.07 0.08 -0.34 -0.42 -0.43
-0.7 -0.24 -0.1 -0.3 -0.04 0.39 0.66 0.12 -0.04 -0.14 -0.04 -0.83 -0.21 0.91 0.24 0.19 -0.15 -2.55 0.06 -0.42 -0.53 -0.26 -1.73 -0.21 -0.34 -0.16 -0.23 -1.17 0.82 0.92 1.12
-0.3 0.23 -0.26 -0.13 0.56 0.64 0.26 0.09 -0.13 -0.43 -0.25 -0.6 -0.77 0.37 0.2 0.02 -0.31 -0.24 0.1 -0.29 -0.11 -0.04 -3.11 -0.15 -0.2 0.07 0.12 -0.13 0.49 0.34 0.78
-0.88 -0.74 -0.28 0.2 0.39 0.57 0.16 0.22 -0.39 -0.27 -0.18 -0.73 -1.01 0.62 0.47 -0.27 -0.64 -0.02 0.23 0.01 -0.04 0.08 -1.3 -0.05 -0.1 -0.12 0.01 -0.5 0.71 0.63 0.61
0.4 0.42 1.08 1.0 1.08 0.16 -2.08 -2.33 -0.26 -0.21 0.18 -0.34 -1.69 0.65 0.96 -0.51 -0.86 -3.52 0.57 -0.0 -0.08 -0.08 -2.74 -0.35 -0.41 -0.13 -0.4 -0.36 0.34 -0.16 0.14
0.5 0.25 0.68 0.86 0.78 0.73 -0.09 -0.56 -0.35 -0.34 -0.09 -0.53 -1.02 0.17 0.02 0.19 -0.07 -2.06 0.51 -0.25 0.15 0.29 -4.21 -0.58 -0.12 0.14 0.13 0.3 0.04 -0.23 -1.84
-0.69 -0.22 -0.01 0.12 0.33 0.86 0.34 0.14 -0.27 -0.39 -0.22 -0.91 -1.39 0.29 0.4 -0.14 -0.57 -2.92 0.13 -0.24 -0.06 0.07 -2.18 0.1 -0.03 0.13 0.24 -0.54 0.92 0.83 0.61
-0.2 -0.08 -0.84 -0.5 0.92 0.54 -0.88 -1.49 -0.3 0.19 0.22 0.52 0.13 1.02 0.77 0.03 -0.4 -0.47 0.19 -0.08 -0.24 -0.26 -1.64 0.02 -0.43 -0.23 -0.2 -0.12 -0.54 -0.12 0.74
-0.35 -0.19 0.17 0.47 1.02 0.8 -0.29 -0.51 -0.27 -0.15 -0.22 -0.18 -0.78 0.53 0.28 0.03 -0.1 -1.11 0.09 -0.06 0.02 0.05 -2.37 -0.3 -0.13 0.01 0.16 -0.07 0.29 0.23 -0.09
0.25 0.08 -0.25 -0.45 1.01 0.68 -0.64 -0.66 -0.24 -0.41 -0.36 -0.34 0.11 0.3 0.09 -0.21 -0.38 0.42 0.38 -0.17 -0.08 -0.09 -0.43 0.12 -0.03 -0.19 -0.02 -0.15 0.0 -0.16 0.3
0.15 0.18 1.07 1.58 1.52 0.96 -0.89 -1.66 -0.38 -0.27 -0.02 -0.28 -0.83 0.43 0.1 -0.01 -0.38 -0.51 -0.19 -0.79 -0.36 -0.24 -1.72 -1.39 -0.87 -0.32 -0.33 -0.63 0.17 -0.25 -0.69
-0.05 -0.02 -0.06 -0.23 0.43 0.38 0.15 0.23 -0.21 -0.14 0.04 -0.09 -0.38 0.12 0.06 -0.12 -0.21 -0.8 0.31 -0.22 -0.05 0.07 -0.35 -0.06 -0.0 -0.1 -0.15 -0.22 0.32 0.28 0.37
-0.51 -0.55 -0.25 -0.1 0.66 0.5 -0.31 -0.18 0.04 0.12 0.27 0.11 0.02 0.23 0.21 -0.14 -0.25 -0.44 -0.1 -0.18 -0.27 -0.13 -0.08 -0.15 -0.15 -0.04 -0.01 -0.32 0.3 0.25 0.51
-0.2 -0.06 0.14 0.24 0.4 0.46 -0.17 0.12 -0.15 -0.11 -0.02 -0.17 -0.53 0.93 0.22 -0.05 -0.25 -0.44 -0.1 -0.29 -0.16 -0.06 -0.68 -0.15 -0.06 -0.09 0.01 -0.1 0.29 0.06 -0.05
0.09 0.15 0.03 0.27 0.96 0.6 -1.13 -0.09 -0.1 -0.22 0.1 0.14 -0.35 0.75 -0.06 -0.31 -0.6 -1.2 0.01 -0.65 -0.38 -0.34 -0.54 0.06 -0.18 -0.2 -0.32 -0.28 0.26 0.36 0.73
-0.2 -0.39 -0.6 -0.75 1.27 0.68 -1.86 -1.36 -0.12 -0.25 0.09 0.19 -0.33 1.12 0.6 -0.43 -0.49 -0.96 0.75 -0.37 -0.27 -0.16 -2.81 0.26 0.05 -0.24 -0.14 -0.09 -0.03 0.16 0.72
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0.3 0.26 0.29 0.36 0.99 0.64 -0.23 -0.72 0.1 0.06 0.18 -0.15 -0.86 0.04 0.02 -0.19 -0.55 -1.32 -0.2 -0.42 -0.22 -0.17 0.06 -0.21 -0.1 -0.13 -0.13 -0.33 0.17 0.31 0.23
-0.13 -0.15 0.46 0.75 0.94 0.75 -0.29 -0.7 -0.05 0.06 0.12 -0.01 -0.7 0.39 0.34 0.1 -0.26 -0.63 -0.01 -0.32 -0.14 -0.12 -1.48 -0.4 -0.44 -0.13 -0.14 -0.02 0.22 -0.15 -0.11
-0.34 -0.18 -0.14 0.07 0.47 0.65 -0.32 -0.35 -0.13 -0.11 0.07 -0.17 0.26 0.7 0.48 -0.18 -0.25 -0.81 -0.14 -0.22 -0.27 -0.11 -0.53 -0.15 -0.12 -0.23 0.06 -0.09 0.41 0.16 0.3
0.1 0.43 0.57 0.69 0.63 0.09 -0.26 -0.72 0.03 0.03 0.12 -0.01 -0.93 -0.14 0.27 -0.01 -0.2 -0.18 -0.01 -0.11 -0.14 -0.05 -2.21 -0.32 -0.26 0.16 -0.03 -0.12 0.11 0.01 0.25
0.22 0.11 0.18 0.0 0.56 0.45 -0.1 -0.21 -0.07 0.02 -0.04 -0.39 -0.6 0.29 0.2 0.06 -0.25 -0.39 0.48 -0.18 -0.08 0.03 0.34 -0.28 -0.25 -0.07 -0.05 0.02 -0.09 -0.23 -0.55
0.46 0.48 -1.24 -1.71 2.25 -0.4 -1.88 -2.5 0.59 0.12 0.4 -1.68 -2.69 0.82 -0.64 -1.69 -4.64 -1.52 -6.14 -3.79 -1.01 -1.36 2.31 0.5 -0.91 -1.57 -0.2 -0.18 -0.73 0.09 1.27
-0.44 -0.58 -0.53 -0.58 0.78 0.76 -0.16 -0.11 0.03 -0.51 -0.11 -0.2 -0.05 0.74 0.59 0.01 -0.65 -0.09 0.18 -0.49 -0.33 -0.3 -0.37 -0.28 -0.09 -0.07 -0.16 -0.33 0.19 0.46 0.68
-0.81 -0.59 -0.46 -0.26 1.55 1.14 -0.86 -0.76 -0.06 -0.04 0.15 -0.49 -1.45 0.78 0.18 -0.47 -1.35 0.42 0.03 -0.45 -0.32 -0.14 -0.77 -0.54 -0.32 -0.08 -0.04 -0.68 0.8 0.44 0.41
-0.83 -0.65 -0.89 -0.72 0.95 0.19 0.51 -0.18 0.46 0.39 0.52 0.39 -0.31 0.5 0.86 0.49 0.34 -3.83 0.02 -0.05 -0.03 0.17 -3.3 -0.48 -0.17 -0.29 0.03 -0.39 -0.01 -0.15 -0.37
0.12 0.2 0.36 0.52 1.1 0.85 -0.25 0.41 -0.05 -0.07 0.13 0.03 -0.61 0.38 0.19 -0.12 -0.63 -0.66 -0.45 -0.53 -0.28 -0.24 -0.45 -0.43 -0.32 -0.25 -0.15 -0.39 0.1 -0.08 -0.54
-0.16 -0.12 -0.28 -0.5 1.37 0.9 -1.36 -0.75 -0.27 -0.38 -0.07 -0.1 -0.37 0.97 0.03 -0.42 -0.9 -0.01 0.56 -0.54 -0.29 -0.23 -3.28 0.05 -0.04 -0.3 -0.19 -0.34 0.22 0.21 0.97
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0.76 -0.68 0.48 0.41 1.51 1.17 -1.39 -2.92 0.4 -0.49 -0.12 -0.13 0.08 0.07 0.45 -0.04 0.08 -2.68 -0.55 -0.19 -0.72 0.13 -3.5 -0.36 -0.28 -0.0 0.2 -0.09 -0.38 0.02 0.01
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0.15 0.59 0.05 0.14 1.27 0.78 -1.97 -1.64 0.09 -0.1 0.08 0.15 -0.12 0.49 -0.37 -0.02 -0.4 -0.81 -0.49 -0.47 -0.56 -0.17 -1.38 0.05 -0.37 -0.41 -0.01 -0.48 0.41 0.4 0.72
-0.94 -0.94 -0.65 -0.36 1.78 1.63 -1.84 -2.05 -0.41 -0.4 -0.37 -0.5 -0.01 0.99 -0.36 -0.04 -0.9 -0.45 -0.61 -0.74 -0.49 -0.21 -2.49 -0.31 -0.22 -0.26 0.05 -0.39 0.54 0.52 1.21
-0.13 0.13 0.09 -0.05 0.02 0.25 0.37 0.28 -0.06 -0.08 -0.03 -0.13 0.03 0.48 0.35 0.06 -0.12 -0.56 -0.37 -0.41 -0.12 -0.22 -0.42 -0.33 -0.16 0.13 0.17 -0.32 0.06 -0.02 0.42
-0.46 -0.15 -0.13 0.16 0.09 0.34 0.07 0.11 -0.07 -0.06 -0.04 -0.2 0.14 0.68 0.4 0.24 0.02 -0.71 -0.13 -0.24 -0.16 -0.18 -0.32 -0.24 -0.17 -0.06 -0.03 -0.45 0.22 0.16 0.33
-1.08 -1.46 -3.03 -1.61 1.72 1.42 -0.82 0.47 -1.18 -1.51 -0.76 -0.92 -1.55 1.7 0.81 0.14 -0.84 -4.48 0.27 -1.4 -0.61 -0.15 -4.81 0.15 -0.27 -0.24 0.17 -0.89 0.57 0.4 1.28
0.29 0.06 0.23 0.34 0.98 0.49 -0.65 -1.17 0.06 -0.12 0.14 -0.38 -0.3 0.12 -0.03 -0.2 -0.66 -0.48 -0.48 -0.65 -0.26 -0.21 0.61 -0.14 -0.5 -0.25 -0.12 -0.56 0.26 0.39 0.81
-0.13 -0.2 0.07 -0.03 0.36 0.41 0.3 0.32 -0.06 -0.12 -0.07 -0.18 -0.05 0.4 0.27 0.04 -0.18 -0.53 -0.25 -0.26 -0.22 -0.19 -0.56 -0.37 -0.38 -0.05 -0.04 -0.29 0.27 0.35 0.49
-0.27 -0.18 0.15 0.32 0.87 0.45 -0.84 -0.66 -0.09 -0.01 0.16 0.11 -0.11 0.56 0.22 -0.2 -0.39 -0.36 -0.07 -0.31 -0.48 -0.31 -0.5 -0.3 -0.27 -0.15 0.02 -0.46 0.28 0.33 0.75
-1.49 -1.28 -1.44 -1.11 1.76 1.55 -1.13 0.12 -0.61 -0.55 -0.13 -0.13 -0.05 1.26 0.79 -0.07 -0.51 -1.18 0.03 -0.55 -0.67 -0.76 -1.37 -0.21 -0.36 -0.59 -0.16 -1.0 -0.18 -0.18 1.28
-0.48 -0.2 -0.24 -0.1 0.34 0.39 -0.2 -0.23 -0.16 -0.17 0.07 -0.05 0.28 0.63 0.56 0.17 0.06 -0.64 -0.04 -0.33 -0.07 -0.06 -0.53 -0.22 -0.18 0.03 -0.07 -0.14 0.2 0.14 0.3
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-0.13 -0.05 0.29 0.59 0.35 0.45 0.07 -0.18 0.07 0.06 0.26 -0.17 -0.56 0.54 0.37 0.08 -0.19 -0.95 0.09 -0.16 -0.06 -0.02 -0.69 -0.38 -0.19 0.11 0.11 -0.27 -0.15 -0.2 -0.26
0.35 0.18 0.06 -0.14 0.43 0.21 0.19 -0.11 0.01 0.06 0.05 -0.2 -0.38 0.06 0.36 0.03 -0.14 -0.11 0.45 -0.17 -0.22 -0.23 0.53 -0.31 -0.25 -0.25 -0.22 0.02 -0.03 -0.21 -0.83
0.19 -0.23 -0.05 -0.03 0.42 0.31 0.04 -0.02 0.06 0.13 0.17 0.06 -0.47 0.23 0.39 0.11 -0.03 -0.71 0.0 -0.11 -0.12 -0.05 -0.5 -0.16 -0.08 0.04 0.19 -0.16 -0.15 -0.03 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.