1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_66 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
4.99 6.56 5.31 7.22 9.94 10.8 13.08 9.86 11.89 11.07 12.29 12.69 53.69 9.59 11.73 13.39 14.66 25.99 12.46 14.28 12.56 12.89 4.2 15.8 16.31 14.95 13.5 12.97 12.08 25.65 64.77
0.0 0.12 0.11 0.43 0.87 0.4 0.06 0.21 0.15 0.94 0.33 1.94 10.77 0.12 0.27 0.26 0.46 4.62 0.24 0.83 0.65 0.29 0.07 0.85 1.26 0.4 0.73 1.0 0.14 0.97 15.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.03 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9
0.07 0.06 0.09 0.12 0.22 0.19 0.07 0.1 0.16 0.16 0.12 0.15 1.37 0.16 0.15 0.15 0.15 0.54 0.1 0.13 0.1 0.13 0.41 0.11 0.2 0.14 0.06 0.17 0.09 0.21 1.38
0.3 0.56 0.63 1.12 0.83 1.08 0.89 0.76 1.26 0.98 1.3 1.53 8.95 0.42 1.01 1.67 2.13 6.72 0.79 1.43 1.22 1.36 0.9 1.25 1.76 1.49 1.98 0.9 0.68 1.99 11.23
0.2 0.13 0.43 0.65 0.89 0.71 1.04 0.71 0.73 1.07 1.05 1.58 8.15 0.3 0.99 1.22 1.62 3.49 0.8 1.24 1.0 1.15 0.3 1.39 1.43 0.93 0.98 1.08 0.68 1.41 9.42
0.03 0.03 0.09 0.06 0.12 0.15 0.23 0.06 0.19 0.5 0.35 0.59 5.63 0.95 0.73 0.8 0.64 3.05 0.47 0.71 0.52 0.19 0.63 0.58 0.49 0.19 0.23 0.19 0.31 0.78 6.62
0.24 0.3 0.37 0.38 0.63 0.19 0.46 0.29 0.71 0.48 0.6 0.85 4.03 0.68 0.93 0.61 0.65 3.18 0.43 0.84 0.64 0.46 0.14 0.7 0.7 0.55 0.65 0.33 0.83 1.45 6.2
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.1 0.25 0.27 0.45 0.56 3.41 0.05 0.05 0.32 0.32 1.79 0.12 0.51 0.13 0.2 0.2 0.37 0.15 0.23 0.07 0.1 0.16 0.58 4.32
0.31 0.39 0.52 0.68 0.88 0.71 0.81 0.95 0.86 0.92 0.92 0.91 6.09 1.08 1.48 1.01 1.14 3.35 0.85 1.09 0.79 0.84 0.11 1.04 1.24 0.82 0.86 0.69 1.27 1.6 7.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.21 0.39 0.15 0.2 0.29 0.19 4.06 0.06 0.08 0.3 0.4 3.48 0.0 0.09 0.25 0.0 0.15 0.59 0.52 0.12 0.02 0.09 0.23 0.38 6.86
0.02 0.06 0.15 0.08 0.09 0.05 0.08 0.1 0.16 0.22 0.17 0.32 2.2 0.07 0.24 0.08 0.21 1.41 0.21 0.16 0.18 0.18 0.0 0.29 0.27 0.2 0.19 0.07 0.19 0.33 3.75
0.01 0.02 0.06 0.05 0.07 0.04 0.06 0.15 0.12 0.05 0.13 0.22 1.03 0.21 0.13 0.12 0.12 0.89 0.09 0.15 0.08 0.11 0.5 0.24 0.09 0.09 0.13 0.04 0.08 0.24 1.72
1.05 0.32 0.49 0.32 6.12 4.39 2.33 1.84 8.14 8.59 7.79 14.28 74.7 2.66 5.92 4.4 9.54 51.1 5.74 9.26 4.38 5.78 12.01 7.52 8.14 4.59 8.04 1.95 6.89 12.22 89.13
1.39 2.04 1.43 1.46 4.25 3.34 2.1 1.83 2.62 4.26 3.45 3.13 45.25 6.99 8.05 3.96 3.8 23.41 1.42 4.03 3.93 3.42 5.92 5.06 4.22 2.8 2.4 3.45 3.61 3.92 45.03
0.34 0.32 0.48 0.64 1.09 0.9 0.59 0.48 1.05 0.73 0.95 1.28 6.0 1.05 0.99 1.01 1.11 3.19 0.91 1.08 0.85 0.92 0.46 1.19 1.35 0.83 0.56 0.77 1.18 1.62 8.23
5.01 4.33 5.21 2.67 9.81 4.73 2.49 3.58 3.14 3.28 3.48 6.74 70.15 3.9 5.18 4.22 5.26 25.2 2.97 4.22 3.53 4.0 26.94 7.81 7.63 4.27 3.09 4.87 2.02 5.51 68.5
0.32 0.56 0.58 0.66 0.63 0.81 0.32 0.52 0.49 0.62 0.85 1.07 6.51 0.64 1.03 0.77 0.88 3.41 0.54 0.92 0.79 0.66 0.88 1.45 1.13 0.69 0.97 0.97 0.55 1.09 8.71
0.05 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.13 0.0 0.26 0.25 0.23 0.17 3.57 0.07 0.27 0.14 0.3 1.4 0.24 0.46 0.28 0.17 0.01 0.27 0.46 0.11 0.21 0.18 0.11 0.28 4.95
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.36 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.53
0.97 1.3 1.66 1.46 1.75 2.14 1.73 1.82 1.93 1.38 1.5 2.35 7.16 2.22 2.69 1.95 2.49 6.19 1.71 1.71 1.63 1.57 1.81 2.7 1.59 1.77 1.8 1.54 2.23 3.41 12.23
0.22 0.37 0.16 0.56 0.86 0.55 0.56 0.47 1.16 1.68 1.35 2.24 11.95 0.99 2.16 1.46 2.38 6.71 0.95 1.99 1.42 1.14 0.91 2.08 1.85 1.16 1.17 1.0 1.14 2.11 11.84
0.01 0.0 0.0 0.07 0.06 0.04 0.04 0.05 0.05 0.06 0.05 0.09 0.82 0.02 0.06 0.05 0.06 0.43 0.02 0.03 0.04 0.1 0.15 0.09 0.06 0.03 0.05 0.12 0.05 0.09 1.24
0.02 0.0 0.03 0.0 0.1 0.14 0.03 0.11 0.06 0.05 0.13 0.09 1.99 0.17 0.14 0.07 0.05 0.84 0.08 0.08 0.08 0.12 0.01 0.04 0.27 0.11 0.19 0.08 0.13 0.09 2.5
4.84 4.58 5.03 4.73 8.09 7.3 4.94 4.75 4.51 5.49 5.03 7.53 43.91 5.33 6.23 5.98 7.61 20.42 3.84 5.39 4.88 5.79 3.03 10.6 9.05 6.82 5.05 8.32 5.9 15.81 62.1
0.13 0.0 0.03 0.01 0.13 0.13 0.06 0.21 0.28 0.5 0.34 0.59 5.46 0.16 0.3 0.34 0.46 2.11 0.15 0.3 0.29 0.16 1.0 0.52 0.59 0.24 0.11 0.18 0.06 0.57 7.79
0.11 0.33 0.02 0.28 0.83 0.41 0.94 0.76 0.61 0.64 0.42 1.03 8.53 1.03 0.92 0.97 0.94 10.88 1.14 1.08 0.64 0.69 2.01 0.81 0.96 0.89 0.95 0.51 0.92 1.34 15.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.06 0.0 0.81 0.52 0.97 2.49 27.7 0.81 2.01 0.57 1.52 19.63 0.46 2.04 0.66 0.73 0.05 1.54 1.8 0.58 0.2 0.47 0.43 1.14 46.58
0.28 0.1 0.12 0.33 0.58 0.4 0.48 0.62 0.82 0.75 0.77 0.75 6.15 0.88 1.17 1.01 0.7 3.4 0.94 0.77 0.57 0.59 0.18 0.77 0.77 0.71 0.44 0.47 1.01 1.58 7.6
0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.09 0.09 0.72 1.14 1.03 2.28 22.2 0.56 1.09 0.93 1.63 13.11 0.46 2.38 0.68 0.75 0.84 1.76 2.41 0.84 0.23 0.6 0.53 2.53 27.77
0.05 0.05 0.06 0.11 0.06 0.05 0.05 0.1 0.05 0.05 0.13 0.19 1.57 0.03 0.01 0.06 0.06 0.91 0.01 0.11 0.06 0.03 0.55 0.12 0.04 0.11 0.05 0.05 0.04 0.11 2.17
1.26 0.87 1.63 1.8 6.27 3.72 2.32 1.54 5.29 6.77 5.93 8.5 26.49 3.52 3.33 4.54 4.89 14.1 3.78 5.94 4.34 4.6 7.74 6.97 7.15 4.97 4.93 4.26 4.97 7.83 33.25
0.06 0.09 0.14 0.3 0.31 0.11 0.22 0.14 0.5 0.41 0.45 0.7 6.53 0.01 0.17 0.57 0.74 5.14 0.15 0.63 0.4 0.47 0.47 0.62 0.54 0.62 0.47 0.28 0.43 1.06 11.05
1.2 2.05 1.16 1.0 3.0 2.24 2.16 1.48 3.09 2.84 3.63 4.48 19.46 1.4 1.94 2.63 3.24 6.33 3.02 3.01 1.91 2.07 0.38 4.02 3.35 2.94 2.45 2.9 2.75 4.76 24.8
0.2 0.2 0.53 0.33 0.71 0.79 0.39 0.28 0.43 0.61 0.63 0.56 4.84 1.62 1.38 0.9 0.88 4.03 0.83 0.77 0.76 0.62 0.91 0.72 0.96 0.64 0.56 0.45 0.8 1.54 6.79
0.09 0.06 0.0 0.0 0.1 0.2 0.05 0.08 0.08 0.13 0.34 0.22 2.15 0.2 0.22 0.28 0.28 2.03 0.18 0.21 0.02 0.02 0.31 0.29 0.15 0.16 0.16 0.07 0.19 0.15 3.61
0.15 0.09 0.08 0.15 0.3 0.27 0.35 0.23 0.4 0.61 0.38 0.72 4.68 0.68 0.49 0.57 0.68 2.99 0.26 0.78 0.39 0.44 1.14 0.72 0.55 0.5 0.42 0.46 0.58 0.62 6.8
1.34 0.49 0.84 1.19 3.72 2.29 1.53 1.89 1.79 1.91 2.72 3.66 50.62 2.08 1.66 2.24 2.66 21.97 1.72 2.36 1.89 2.64 16.98 5.67 4.33 2.69 1.97 3.18 1.72 9.09 53.61
0.03 0.0 0.11 0.1 0.24 0.15 0.11 0.13 0.11 0.22 0.09 0.56 2.93 0.03 0.08 0.16 0.13 1.19 0.06 0.11 0.06 0.16 0.13 0.48 0.38 0.15 0.12 0.22 0.08 0.55 4.62
0.14 0.31 0.31 0.38 0.39 0.51 0.39 0.57 0.48 0.65 0.74 0.65 3.1 0.27 0.31 0.61 0.72 2.18 0.45 0.66 0.54 0.57 0.1 0.66 0.78 0.47 0.39 0.35 0.68 1.09 3.93
0.06 0.0 0.02 0.04 0.16 0.09 0.25 0.28 1.07 1.23 1.62 2.47 23.95 0.63 1.25 1.44 2.35 11.69 0.66 2.99 1.06 0.81 1.22 2.4 2.31 0.78 0.48 0.63 0.63 2.59 30.83
0.0 0.4 2.86 1.84 1.87 2.73 2.4 0.0 4.53 2.28 2.78 4.65 56.03 0.37 3.06 3.04 5.17 24.03 3.64 3.7 3.23 2.37 0.0 6.02 8.37 2.77 2.12 1.62 1.46 4.47 93.57
0.03 0.0 0.01 0.03 0.0 0.04 0.02 0.06 0.02 0.01 0.05 0.03 1.69 0.06 0.12 0.06 0.1 1.28 0.03 0.01 0.07 0.02 0.33 0.02 0.11 0.01 0.09 0.08 0.03 0.08 2.39
0.51 0.4 0.7 0.23 0.95 0.65 0.52 0.32 0.41 0.58 0.51 0.7 3.76 0.72 0.67 0.73 0.43 1.97 0.51 0.5 0.61 0.51 0.41 0.76 0.82 0.79 0.6 0.73 0.55 0.9 4.68
0.23 0.33 0.5 0.33 0.46 0.27 0.25 0.16 0.63 0.88 0.9 1.34 7.31 0.41 0.89 0.53 0.92 2.44 0.22 0.82 0.48 0.36 0.15 0.94 0.92 0.61 0.26 0.49 0.51 1.19 7.67
0.08 0.01 0.02 0.09 0.6 0.49 0.57 0.19 0.98 1.38 1.44 1.83 12.81 1.48 1.69 1.45 1.75 5.26 0.99 1.77 1.23 1.01 0.44 2.19 1.52 1.01 1.39 1.04 1.43 2.34 19.47
0.46 0.19 0.33 0.77 0.7 0.96 0.63 0.4 1.02 0.86 0.83 0.9 3.47 0.36 0.89 0.76 0.84 2.55 0.62 0.87 0.74 1.03 0.41 1.11 1.17 0.96 0.6 0.61 0.86 0.98 4.42
0.4 0.26 0.74 0.89 0.2 0.01 0.79 1.23 0.65 1.0 0.79 1.33 15.89 0.47 0.93 0.96 0.83 11.96 0.89 0.94 0.54 0.27 1.11 1.22 0.62 0.59 0.38 1.13 0.5 0.94 19.32
0.09 0.08 0.03 0.07 0.25 0.14 0.12 0.09 0.1 0.19 0.09 0.34 3.7 0.11 0.13 0.11 0.22 3.0 0.06 0.17 0.13 0.08 0.44 0.32 0.32 0.07 0.07 0.17 0.1 0.75 4.99
0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.08 0.13 0.3 0.25 0.34 3.06 0.0 0.08 0.24 0.23 1.21 0.03 0.24 0.12 0.03 0.02 0.21 0.34 0.03 0.06 0.04 0.17 0.26 3.87
3.27 4.16 3.55 4.24 11.47 10.99 4.74 4.73 5.08 5.67 6.4 7.95 27.32 4.72 5.91 7.42 6.41 19.89 4.64 4.45 4.02 4.81 4.31 10.59 8.15 6.04 5.69 8.51 4.97 14.08 39.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.13 0.16 0.03 0.43 0.56 0.53 1.16 5.87 0.21 0.49 0.55 1.11 1.66 0.25 1.1 0.73 0.65 0.64 0.72 0.64 0.42 0.58 0.56 0.16 0.67 7.66
1.06 1.36 2.03 1.6 1.29 1.51 3.01 2.4 2.54 3.33 4.25 5.81 16.12 3.81 3.53 3.85 3.56 12.78 2.29 3.41 2.88 3.09 0.12 3.67 3.77 2.29 2.94 1.62 3.65 5.38 22.69
0.0 0.0 0.0 0.05 0.43 0.33 0.21 0.27 0.23 0.4 0.47 0.88 4.19 0.88 0.37 0.2 0.22 2.03 0.18 0.75 0.12 0.25 0.04 1.14 0.82 0.19 0.49 0.5 0.3 0.51 6.51
0.06 0.0 0.0 0.03 0.32 0.11 0.18 0.08 0.19 0.33 0.2 0.56 4.53 0.05 0.26 0.19 0.37 1.42 0.03 0.24 0.23 0.1 0.38 0.71 0.74 0.84 0.12 0.35 0.14 0.62 6.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.02 0.0 0.11 0.0 0.98 0.0 0.03 0.05 0.07 0.27 0.07 0.08 0.0 0.01 0.19 0.09 0.05 0.04 0.0 0.01 0.0 0.12 1.3
0.3 0.26 0.23 0.24 0.67 0.63 0.32 0.29 0.39 0.5 0.46 0.49 3.3 0.51 0.55 0.42 0.44 0.87 0.32 0.39 0.34 0.34 0.4 0.56 0.59 0.45 0.4 0.45 0.54 0.8 3.69
3.48 4.46 4.76 6.0 15.49 13.86 9.12 7.21 14.2 15.57 15.2 18.55 75.22 11.49 13.85 15.25 16.48 41.5 12.34 15.86 12.52 13.59 4.08 17.5 17.2 14.31 13.73 10.89 18.28 26.85 93.58
0.1 0.03 0.1 0.17 0.21 0.18 0.2 0.18 0.41 0.5 0.49 0.85 5.58 0.87 0.99 0.53 0.74 2.46 0.36 0.64 0.44 0.44 0.32 0.72 0.69 0.34 0.32 0.42 0.4 0.73 5.02
0.06 0.36 0.39 0.38 0.36 0.36 0.37 0.26 0.43 0.67 0.58 0.46 3.29 0.7 0.61 0.45 0.52 2.57 0.46 0.37 0.19 0.23 0.63 0.36 0.41 0.49 0.27 0.25 0.62 0.82 5.1
0.76 1.14 0.38 0.55 1.21 0.85 1.32 1.73 1.31 1.62 1.07 1.82 7.16 0.59 0.86 1.07 1.45 1.41 1.13 1.32 1.23 0.98 0.46 1.74 1.53 1.44 1.42 1.28 1.86 2.29 8.3

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)