Heatmap: Cluster_101 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_45000.1 (FPT1)	-	-	-	-	1.22	1.18	-	2.4	1.44	-	-	-	1.44	-	2.56	-	-	-	-	2.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.36
Lsat_1_v5_gn_0_8880.1 (IGMT5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_101281.1 (LOG5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_126141.1 (GTD1)	-	-	-	2.3	-	-	-	-	-	-	-	-	1.1	-	3.75	-	-	0.96	-	0.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.76
Lsat_1_v5_gn_1_127100.1 (CKA1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_57420.1	-0.19	-	-1.9	-	-	-0.15	-	-0.97	1.06	0.42	1.57	-1.03	-0.82	1.58	2.1	0.22	-1.93	-	-0.15	1.08	0.79	-1.01	-	-2.19	-	0.1	0.13	0.1	-	1.36	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_6780.1 (PLAI)	-	-	-	-	3.65	-	-	-	4.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_77181.1 (ACA1)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_23780.1 (CID1)	-	-	-	3.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_26880.1 (FPF1)	0.7	-	-1.08	-1.12	1.03	0.81	-1.35	-	-	-1.58	-	0.4	-0.46	1.35	1.61	0.81	0.08	-0.12	0.69	-0.69	-0.71	-	-1.4	-1.65	-	-1.67	-0.32	1.35	1.29	0.09	0.86
Lsat_1_v5_gn_2_26920.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.13	1.85	-	-	-	-	-	-	-	-	1.97	2.3	-	-	-	1.87	-	-	-	2.27	2.51
Lsat_1_v5_gn_2_66300.1 (ATJ6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.0	-	3.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_100060.1 (CTS)	0.24	-1.49	-0.83	-2.44	-1.29	0.04	-1.02	-0.66	1.02	-2.57	0.61	0.22	1.08	0.44	0.18	-1.58	1.15	-0.28	-3.0	0.35	-0.29	0.42	-0.14	-2.86	-0.84	-0.3	-1.16	-0.31	0.42	1.27	1.23
Lsat_1_v5_gn_3_106420.1 (FIP37)	0.96	-1.28	-0.5	-0.67	-0.17	-0.41	0.5	0.29	-0.35	0.46	-0.66	0.0	-0.15	0.11	0.81	-0.58	-0.2	-0.13	-0.33	-0.38	-0.34	-0.11	-0.05	-1.44	-1.58	0.87	-0.25	0.19	0.85	0.18	0.43
Lsat_1_v5_gn_3_128760.1 (NUA)	-0.04	-0.48	-2.06	-2.11	1.33	1.41	0.7	1.77	1.48	-2.18	-	0.09	-0.81	-	-	1.25	0.02	-	-	-1.23	1.65	0.14	-	-1.21	-	-1.13	-1.15	1.11	0.09	0.47	-
Lsat_1_v5_gn_3_132500.1	-	-	1.11	-	0.55	0.83	-	0.72	-	-	1.03	-	0.94	-	2.79	1.11	-	-	0.2	-	-	0.97	-	-	-0.22	-	-	-0.41	0.84	2.15	-
Lsat_1_v5_gn_3_135781.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_138340.1 (GTE8)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_50400.1 (ABCI16)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_52840.1 (BW62B)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_82201.1 (SHOC1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.62	-	-	-	-	3.7	-	-	-	-	-	-	-	2.58	-	-	-	-	2.54	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_82401.1	-	-	-	-	3.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_84861.1	-	-	-	0.25	-	1.44	1.6	1.15	2.6	0.16	-	-	-	0.33	2.17	0.42	0.17	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-	0.1	1.28	-0.04	-0.15	-
Lsat_1_v5_gn_4_129921.1 (IWS2)	-	-	-	-	-	2.7	-	-	2.82	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	-	-	-	-	3.21	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_148580.1	-	-	-	-	-	-	-	-	3.51	-	-	-	-	-	-	-	2.28	-	-	-	-	2.33	-	-	-	-	-	-	-	3.29	-
Lsat_1_v5_gn_4_154500.1	0.45	-	-	-1.21	-0.8	-	-1.55	-1.35	1.76	-1.22	1.84	1.08	0.91	-1.32	0.93	0.66	0.87	1.43	-	-0.18	-	-	-1.56	-0.07	-0.59	-0.86	-0.75	0.01	-	-0.64	1.3
Lsat_1_v5_gn_4_173780.1 (EMB2247)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_182701.1 (DGK1)	-	1.13	-	-	1.84	-	-	-	3.27	-	-	-	-	-	2.0	-	0.64	0.73	-	-	2.22	-	-	-	-	-	-	-	0.74	1.06	-
Lsat_1_v5_gn_4_30781.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_40420.1 (ATPE)	-	-	-	-	-	-	-	2.65	3.78	2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_89841.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_101220.1 (ATG8C)	-	-	-	-	-	-	-	-	2.95	-	3.09	-	-	-	1.75	-	-	-	-	1.28	-	1.49	-	-	-	-	-	1.51	-	1.73	-
Lsat_1_v5_gn_5_112021.1 (DRS1)	-	-	-	-	3.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_112581.1 (AtPMEI10)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.83	-
Lsat_1_v5_gn_5_127161.1 (Sec. 61-alpha1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_138701.1	-	-	-	-	-	1.95	-	0.85	-	-	-	-0.36	-	-0.17	2.78	-0.12	-0.53	-	-	-	-0.41	-	1.47	-0.43	-	1.15	-	-	-	0.59	2.85
Lsat_1_v5_gn_5_160220.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_46681.1	0.06	-1.91	0.04	0.58	0.83	1.19	-0.56	-	-0.59	-	-0.2	-	-0.96	1.61	1.81	0.33	0.56	1.01	-1.44	-2.34	-2.31	-	-0.17	-1.35	0.7	-0.4	-	-2.16	0.9	-0.41	0.84
Lsat_1_v5_gn_5_47881.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_71541.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	-	-	-	-	-	-	3.74	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_85080.1 (RBCS1A)	-	-0.11	-1.79	-	-2.07	-0.04	-1.87	-1.83	-	0.44	0.29	-0.45	0.22	1.21	2.95	-0.05	-0.24	0.15	-1.56	0.28	-1.15	-0.85	1.26	0.28	-1.95	-0.36	-0.23	-0.42	-0.34	-0.41	-2.0
Lsat_1_v5_gn_5_88960.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_109481.1	-	-	-	-	1.35	-0.16	-	0.54	2.09	0.3	-	1.16	1.52	0.57	-0.67	-	-0.88	1.92	0.24	-	1.18	-	-	0.16	-	-	-	-0.74	-	-	1.97
Lsat_1_v5_gn_6_20961.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_39460.1	-	-	-	-	-	2.43	-	-	1.65	-	-	-	-	1.86	3.2	-	-	-	-	-	-	-	2.55	-	-	-	-	-	-	-	1.95
Lsat_1_v5_gn_6_63780.1 (PE11)	-	-	-	3.19	-	-	-	-	3.8	-	2.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_88100.1 (UPL2)	2.46	-	-	2.38	-	3.04	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.54
Lsat_1_v5_gn_7_10900.1 (TAF15b)	-	-	-	-	-	-	1.2	-	-	-	-	-	-	1.22	3.1	-	1.14	2.2	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	2.08	-
Lsat_1_v5_gn_7_14040.1	-	-2.84	0.36	0.96	-2.26	-1.59	-	-1.0	0.57	0.86	1.56	1.31	0.36	-0.95	0.21	0.7	-0.2	-1.21	-2.76	0.46	-0.92	1.12	-	-0.82	0.17	1.89	-0.25	-1.05	-1.02	-0.9	-
Lsat_1_v5_gn_7_27941.1 (OST3/6)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_37840.1	-	-	-	-	-	-	-	-	2.98	-	-	-	-	2.46	3.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.05
Lsat_1_v5_gn_7_81620.1 (ROPGEF5)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.51	2.38	-	-	-	-	2.07	-	-	-	-	0.7	1.78	-	-	-	-	-	0.66	1.84	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_8460.1	-	-	-	2.59	-	-	1.1	-	2.38	-0.12	-	-	-	-	2.09	-	0.16	0.89	0.33	-	-	-	2.65	-	-0.13	-	-	-	0.07	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_101740.1 (GGL17)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_114140.1 (SAC9)	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	4.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_117380.1 (NAC020)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_122241.1 (SAUR68)	-	-	-	-	-0.1	-	-0.35	-	2.36	0.86	-1.26	0.55	0.76	-	-1.33	1.79	0.07	-	-	-0.56	-0.68	-1.34	-	1.06	-	-	1.6	0.92	0.92	0.92	0.44
Lsat_1_v5_gn_8_129341.1 (GT18)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_129840.1 (TED7)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.99	-	4.0	-	-	-	-	1.74	-	1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_140321.1 (CHX3)	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.79	-	-	-	-	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_17641.1	1.19	-	-	2.01	-	0.67	1.84	-	2.84	-	-	0.69	-	0.84	-	-	-	-	-	0.52	0.51	-	-	-	1.63	-	-	1.59	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_2480.1	-	-	-	-	-	-	-	-	3.52	-	-	-	-	-	3.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.57
Lsat_1_v5_gn_8_31541.1 (PRMA)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_37740.1	2.59	-	-	-	3.66	-	-	-	3.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.0	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_21841.1 (E2- OGDH1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.47	-	-	-	-	-	-	-	2.06	1.84	-	-	-	-	-	3.07	1.9
Lsat_1_v5_gn_9_33980.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_60000.1 (EIF5A)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_66700.1	-	-	-	-	3.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_69340.1 (RPT5B)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_90221.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.