Heatmap: Cluster_129 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.34 0.16 0.02 -0.08 0.08 0.57 0.57 0.58 0.01 -0.03 0.04 -0.23 -0.3 0.21 0.2 -0.01 -0.23 -2.52 -0.35 -0.36 -0.0 -0.02 -0.12 -0.14 -0.07 -0.11 -0.17 0.14 0.13 -0.02 -0.34
1.3 0.52 0.86 0.63 0.94 0.0 -0.74 -0.53 -0.25 0.05 -0.25 -0.53 -0.92 0.75 0.82 0.05 -0.45 0.61 -0.4 -1.05 -1.08 -0.68 -1.34 -0.6 -0.72 -1.08 -0.68 -0.76 0.23 0.22 -0.27
0.34 0.07 0.04 0.08 0.4 0.53 -0.13 -0.05 -0.04 -0.03 0.0 -0.16 -0.03 0.21 0.08 0.02 -0.15 -0.58 0.03 -0.17 -0.03 0.04 -0.65 -0.06 -0.05 0.03 0.01 0.19 0.05 -0.19 -0.41
0.85 0.4 -0.05 -0.37 0.38 -0.03 0.36 0.58 -0.09 -0.19 -0.15 -0.16 -0.36 0.54 0.43 0.04 -0.19 -2.19 0.2 -0.15 -0.07 -0.01 -0.43 -0.06 -0.02 -0.18 -0.12 0.09 -0.19 -0.34 -0.84
0.52 0.07 -0.29 -0.59 0.2 0.13 0.26 0.27 -0.2 -0.39 -0.29 -0.23 -0.24 0.64 0.71 -0.08 -0.01 -2.13 0.69 0.17 0.08 0.12 -2.51 -0.03 -0.08 -0.11 -0.18 0.42 0.3 -0.07 -0.8
0.57 0.52 -0.02 0.07 0.8 0.75 -0.21 0.23 -0.66 -0.72 -0.45 -0.67 -0.6 0.78 0.11 -0.24 -0.52 -1.46 0.07 -0.67 0.04 0.02 -0.29 -0.45 -0.12 -0.16 -0.06 0.17 0.69 0.38 -0.88
0.89 0.78 0.5 0.02 0.58 -0.17 -0.28 -0.92 0.09 0.02 0.11 0.34 -0.12 -0.07 0.48 0.02 0.06 -1.53 -0.54 -0.08 -0.03 -0.22 -1.6 -0.12 0.0 -0.36 0.1 0.06 -0.62 -0.34 0.13
0.57 0.44 0.12 -1.68 0.29 -0.3 -0.28 -0.42 -0.07 -0.68 -0.44 0.22 0.98 -0.03 1.02 0.59 0.78 -1.94 0.19 -0.34 -0.09 0.18 -2.93 -0.42 0.0 -0.17 -0.18 0.1 -1.79 -0.31 0.49
0.42 0.21 0.45 0.38 -0.11 0.24 0.53 0.85 -0.39 -0.36 -0.39 -0.34 0.09 0.7 -0.03 -0.19 -0.01 -0.81 -0.38 -0.4 -0.21 -0.18 -0.38 -0.31 -0.13 -0.11 -0.11 0.05 -0.01 -0.11 -0.49
0.44 0.19 0.17 0.24 0.36 0.43 0.01 -0.42 -0.17 -0.36 -0.22 -0.32 -0.64 0.65 0.55 0.24 -0.02 -0.41 0.27 -0.06 -0.02 0.08 -1.18 0.02 0.06 -0.01 0.02 -0.09 -0.24 -0.37 -0.71
0.68 0.78 0.38 -0.14 0.87 0.6 0.1 -0.06 -0.26 -0.52 -0.39 -0.6 -0.36 0.86 0.6 -0.26 -0.48 -0.78 -0.05 -0.42 -0.27 -0.23 -2.17 -0.21 -0.2 -0.21 -0.12 -0.43 -0.04 -0.15 0.22
0.24 -0.08 0.23 0.12 0.4 0.36 0.04 0.08 -0.13 -0.04 -0.1 -0.19 -0.15 0.67 0.62 0.17 0.1 -1.08 -0.19 -0.15 -0.2 -0.15 -0.67 -0.22 -0.19 -0.08 -0.04 -0.27 -0.1 -0.09 -0.01
0.57 0.85 -0.06 -0.37 0.32 0.87 0.91 0.82 -0.55 -0.51 -0.47 -0.52 -0.26 0.56 0.26 0.3 -0.09 -1.4 0.04 -0.2 0.01 -0.07 -2.06 -0.04 0.02 -0.12 -0.09 0.28 -1.01 -1.46 -1.43
0.59 0.51 0.11 -0.21 0.67 0.61 -0.14 -0.12 -0.19 -0.09 -0.06 -0.02 0.31 0.4 0.21 -0.15 -0.14 -0.87 0.11 -0.22 -0.19 -0.14 -1.34 -0.14 -0.05 -0.15 -0.2 0.15 -0.24 -0.28 -0.34
1.02 0.25 0.03 -0.55 1.54 1.6 -0.46 -0.24 -0.55 -1.6 -0.3 -1.49 -0.47 1.48 0.66 -0.49 -0.75 -1.31 0.15 -0.52 -0.71 -0.36 -2.17 -0.1 -0.92 -0.34 -0.55 0.66 -0.39 -0.74 -1.79
-0.06 -0.01 0.16 -0.13 0.22 0.37 0.12 0.05 -0.02 0.01 0.04 -0.1 -0.39 0.8 0.5 0.21 -0.02 -0.94 -0.2 -0.27 -0.13 -0.09 -0.28 -0.36 -0.27 -0.04 -0.05 -0.27 0.11 -0.07 0.2
-0.06 1.0 -0.13 0.23 0.7 0.93 0.46 0.25 -0.53 -1.1 -1.13 -0.84 -1.27 0.91 0.41 -0.41 -0.54 -0.68 0.0 -0.68 -0.47 -0.29 0.54 -0.53 -0.11 -0.32 0.24 -0.39 0.22 -0.26 0.01
1.06 0.64 1.08 0.18 0.82 0.71 -0.31 -0.65 -0.56 -0.64 -0.65 -0.95 -0.46 0.54 0.59 0.18 -0.23 0.07 -0.25 -0.5 -0.45 0.06 -1.31 -0.34 -0.63 -0.4 0.07 -0.11 -0.28 -0.48 -0.63
0.63 0.55 0.39 0.21 0.36 0.33 0.01 -0.15 -0.28 -0.41 -0.14 -0.35 -0.33 0.33 0.21 -0.13 -0.31 -1.2 0.11 -0.25 -0.02 0.01 0.08 -0.14 -0.2 -0.07 0.0 -0.18 -0.04 -0.12 -0.09
0.38 0.33 0.15 0.08 0.4 0.21 0.15 0.18 -0.25 -0.23 -0.14 -0.26 -0.53 0.61 0.37 -0.29 -0.22 -1.19 0.31 -0.07 -0.04 -0.18 -0.04 -0.15 -0.12 -0.17 -0.21 -0.22 0.24 0.09 -0.34
-0.09 0.08 0.49 0.69 -0.17 0.07 0.3 0.49 -0.38 -0.11 -0.2 -0.25 0.25 0.06 0.13 -0.09 0.0 0.08 -0.61 -0.5 -0.18 -0.22 0.24 -0.69 -0.36 -0.21 0.02 -0.2 0.2 0.04 0.11
0.36 0.39 0.16 -0.01 0.37 0.18 0.19 0.18 -0.17 -0.2 -0.12 -0.26 -0.59 0.86 0.85 0.08 -0.07 -1.86 -0.13 -0.28 -0.31 -0.34 -0.26 -0.33 -0.38 -0.22 -0.22 -0.26 0.13 0.17 0.0
0.57 0.3 0.04 -0.27 0.0 0.15 0.38 0.4 -0.04 -0.29 -0.25 -0.17 -0.37 1.07 0.72 0.12 0.29 -3.21 0.23 -0.06 -0.13 -0.03 -6.42 -0.1 -0.26 -0.08 -0.03 0.08 -0.19 -0.28 -0.45
0.46 0.95 0.54 -0.56 0.2 0.04 0.02 -0.12 -0.2 -0.26 -0.17 -0.36 -2.96 1.39 0.95 -0.05 -0.35 -4.54 0.25 -0.19 -0.2 -0.09 - -0.44 -0.32 -0.15 0.13 -0.79 0.56 0.05 0.17
0.65 1.01 0.39 -0.14 0.33 0.38 0.48 0.26 -0.31 -0.35 -0.16 -0.67 -0.69 0.45 0.55 0.02 -0.21 - -0.01 -0.28 -0.21 0.09 -3.64 -0.41 -0.52 0.36 -0.17 -0.02 0.38 0.12 -0.36
0.51 0.22 0.01 -0.13 0.15 0.62 0.3 0.33 -0.02 -0.19 0.01 -0.16 -0.04 0.21 -0.09 0.08 -0.0 -2.64 -0.31 -0.24 0.05 0.13 -1.04 0.06 0.12 0.2 0.15 0.07 -0.11 -0.17 -0.37
0.5 0.24 0.07 -0.17 0.6 0.43 -0.11 -0.16 -0.1 -0.18 -0.16 -0.2 -0.19 0.17 0.17 -0.12 -0.2 -1.24 0.21 -0.13 0.06 0.08 -0.11 -0.09 -0.01 -0.04 0.07 0.26 0.09 -0.08 -0.76
0.4 0.43 0.21 0.02 0.42 0.21 0.1 0.03 -0.07 -0.11 0.01 -0.14 -0.38 0.32 0.16 -0.06 -0.18 -1.7 0.21 -0.25 -0.14 -0.05 -0.67 -0.21 -0.16 -0.12 -0.17 -0.28 0.26 0.27 0.28
0.56 0.46 0.05 -0.65 -0.03 -0.41 -0.21 -0.66 0.07 -0.16 -0.09 -0.09 0.21 0.63 0.66 0.0 0.24 -1.85 -0.26 -0.12 0.03 0.03 -2.91 -0.11 -0.08 0.1 0.23 0.23 0.39 0.15 0.04
0.68 0.57 -0.09 -0.49 -0.1 -0.06 0.49 0.55 -0.07 -0.22 -0.22 -0.4 -0.15 0.08 0.24 0.07 -0.04 -1.47 0.05 -0.07 -0.01 -0.06 -0.2 0.04 0.02 -0.09 0.01 0.1 0.07 -0.04 -0.66
0.38 1.1 0.82 0.51 1.31 1.31 0.14 0.03 -0.56 -0.74 -0.4 -1.15 -1.92 0.32 0.78 -0.01 -0.78 -0.63 -0.73 -0.88 -0.45 -0.19 -2.89 -0.19 -0.13 -0.42 -0.08 -0.99 -0.11 -0.57 -0.2
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0.74 1.08 0.71 0.31 1.42 1.27 -0.05 -0.26 -0.61 -0.91 -0.49 -1.11 -2.07 0.86 0.72 -0.26 -0.99 -2.99 0.04 -0.79 -0.42 -0.38 -5.48 -0.35 -0.4 -0.52 -0.27 -1.18 0.21 -0.23 0.34
0.1 0.43 0.6 0.91 1.23 0.5 0.13 0.14 -0.13 -0.05 0.15 -0.23 -1.41 0.66 1.12 -0.46 -0.89 0.22 -0.61 -0.69 -0.77 -0.68 -1.87 -0.91 -0.75 -0.4 -0.61 -0.85 0.17 0.02 -0.21
0.73 0.74 0.45 0.61 0.41 0.36 -0.18 -0.39 -0.31 -0.5 -0.03 -0.37 -0.93 0.83 0.56 -0.17 -0.65 -1.05 -0.14 -0.19 -0.27 -0.31 0.88 -0.36 -0.45 -0.54 -0.36 -1.0 -0.06 0.13 -0.57
0.54 0.43 0.16 -0.14 0.2 0.18 0.3 0.38 -0.01 -0.13 -0.11 -0.23 -0.56 0.27 0.08 -0.16 -0.21 -1.93 0.08 -0.07 0.01 0.07 -0.32 -0.01 -0.02 0.05 0.1 -0.05 0.16 -0.05 -0.49
0.28 0.31 0.3 0.21 0.56 0.53 0.17 0.31 -0.24 -0.21 -0.07 -0.28 -0.4 0.53 0.13 -0.3 -0.47 -0.82 -0.08 -0.5 -0.31 -0.14 -0.25 -0.27 -0.21 -0.15 -0.09 -0.31 0.28 0.14 0.19
0.9 0.53 0.11 0.06 0.64 0.23 0.58 0.96 0.01 -0.02 0.03 -0.05 -0.3 -0.1 -0.22 -0.43 -0.44 -2.55 -0.07 -0.23 -0.15 -0.13 -1.25 -0.04 -0.12 -0.28 -0.25 0.2 -0.11 -0.23 -0.68
0.77 0.94 0.69 0.15 0.64 0.69 0.03 0.07 -0.92 -0.34 -0.27 -1.24 -0.49 0.23 0.14 -0.36 -0.55 -1.76 0.24 -0.35 -0.12 0.24 -2.09 -0.05 0.01 0.15 0.01 0.27 0.07 -0.58 -0.39
0.81 0.7 0.4 0.41 0.69 0.55 0.41 0.1 -0.29 -0.44 -0.27 -0.55 -0.42 0.38 0.29 -0.36 -0.4 -1.08 -0.24 -0.5 -0.21 0.04 -0.49 -0.26 -0.29 -0.13 -0.07 -0.01 -0.17 -0.35 -0.34
0.57 0.25 -0.03 -0.46 0.16 0.45 0.14 0.09 0.01 0.12 0.24 -0.2 -0.66 0.32 -0.18 -0.43 -0.53 -2.53 0.1 0.02 0.1 0.22 -0.16 0.14 -0.15 0.09 0.16 0.16 -0.06 -0.08 0.04
0.47 -0.68 1.11 1.36 -0.97 0.15 0.96 1.72 -1.1 -0.71 -0.94 -0.74 0.7 0.22 -0.62 -0.21 -0.37 0.26 -1.17 -1.11 -0.24 -0.15 0.8 -1.3 -0.74 -0.04 -0.65 0.56 -2.72 -3.87 -2.18
0.05 -0.07 -0.36 -0.36 0.27 0.53 -0.08 0.01 0.04 0.02 0.0 0.05 -0.06 0.34 0.23 0.14 0.05 -0.13 0.44 0.06 -0.11 -0.06 -0.62 -0.04 -0.07 -0.14 0.02 0.19 -0.2 -0.18 -0.61
0.23 0.07 -0.27 -0.3 0.6 0.57 0.23 0.28 0.05 0.23 0.34 0.08 -0.28 0.41 0.32 -0.17 -0.26 -1.52 0.07 -0.21 -0.11 -0.11 -0.38 -0.08 -0.27 -0.25 -0.16 0.27 -0.0 -0.25 -0.58
0.34 0.15 0.1 0.04 0.33 0.46 0.13 0.2 -0.32 -0.28 0.02 -0.03 -0.34 0.48 0.08 -0.33 -0.41 -1.23 -0.02 -0.31 -0.2 0.04 0.06 -0.04 -0.12 -0.02 -0.11 0.14 0.08 -0.12 0.24
0.7 0.53 0.19 -0.1 0.35 0.44 0.22 0.02 -0.34 -0.44 -0.22 -0.44 -0.63 0.27 0.27 -0.0 -0.17 -1.13 0.15 -0.05 0.16 0.23 -0.61 -0.18 -0.04 0.05 0.13 0.13 -0.15 -0.36 -0.39
0.17 0.23 -0.0 -0.15 -0.09 -0.08 -0.01 0.03 0.07 -0.11 -0.01 -0.13 -0.39 0.32 0.18 0.03 -0.0 -1.11 0.18 -0.02 0.08 -0.01 -0.29 -0.07 -0.04 -0.01 0.01 -0.15 0.25 0.26 0.26
0.53 0.1 -0.1 -0.29 0.32 0.26 0.32 0.42 0.0 0.02 0.04 -0.12 -0.42 -0.01 -0.04 -0.13 -0.2 -1.44 0.07 -0.06 0.02 0.08 0.13 -0.14 -0.01 0.09 0.11 0.2 -0.06 -0.22 -0.55
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0.39 0.32 0.25 0.21 0.69 0.55 0.1 0.3 -0.12 -0.12 -0.08 -0.15 -0.41 0.35 0.2 -0.04 -0.25 -1.63 0.16 -0.26 -0.18 -0.11 -0.55 -0.2 -0.2 -0.09 -0.1 -0.22 0.14 -0.08 -0.42
0.38 0.5 0.17 -0.1 0.2 -0.2 0.06 0.17 -0.08 -0.09 0.01 -0.11 -0.38 0.45 0.35 -0.12 -0.13 -1.71 0.18 -0.25 -0.25 -0.12 -0.63 -0.13 -0.16 -0.18 -0.15 -0.27 0.4 0.46 0.22
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1.27 1.04 0.13 -0.54 0.74 1.06 0.42 0.38 -0.52 -0.88 -0.41 -0.88 -0.25 0.59 -0.35 -0.26 -0.7 -2.22 -0.14 -0.5 0.13 0.29 -2.32 -0.28 -0.3 -0.08 0.11 0.31 -0.15 -0.66 -1.11
0.67 0.54 0.24 -0.44 0.12 -0.17 -0.22 -0.51 0.07 -0.19 -0.2 0.0 0.35 0.48 0.71 0.02 0.32 -1.74 -0.27 -0.27 0.09 -0.03 -3.07 -0.22 -0.01 -0.03 0.12 0.2 -0.15 -0.12 0.18
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1.42 0.6 -0.22 -0.65 0.1 0.34 0.72 1.43 0.03 -0.18 -0.31 0.01 -0.38 1.05 0.73 -0.08 -0.37 -2.59 -0.47 -0.62 -0.72 -0.11 -1.93 -0.89 -0.77 -0.18 -0.66 -0.36 -0.72 -0.48 -0.73
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0.73 0.37 -0.32 -0.47 0.38 0.38 0.25 0.21 -0.07 -0.3 -0.08 -0.28 -0.19 0.17 0.05 -0.2 -0.25 -2.46 0.08 -0.13 0.03 0.14 0.05 0.02 -0.08 -0.06 0.03 0.03 0.22 -0.09 -0.1
0.53 0.8 0.51 0.18 0.32 -0.12 0.11 -0.24 0.1 -0.18 0.15 -0.18 -0.13 0.62 0.45 -0.2 -0.18 -1.01 -0.49 -0.37 -0.24 -0.37 -1.93 0.05 -0.2 -0.51 -0.27 -0.29 0.24 0.16 0.3
0.33 0.09 0.41 0.2 0.02 0.21 0.23 0.3 -0.24 -0.22 -0.13 -0.22 0.12 0.38 0.08 -0.04 -0.04 -1.42 -0.14 -0.27 -0.2 -0.05 -0.05 -0.25 -0.14 -0.04 -0.08 0.05 0.02 0.02 0.13
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1.48 1.36 0.22 -0.74 0.66 0.45 0.1 -0.2 -0.21 -0.52 -0.24 -0.77 -1.64 -0.05 -0.24 -0.94 -0.89 -2.72 0.22 -0.28 0.29 0.32 -2.68 -0.05 -0.05 0.04 0.09 -0.52 0.19 0.01 0.24
0.4 0.18 0.04 -0.15 0.55 0.46 0.26 -0.14 0.06 -0.01 0.05 -0.3 -0.74 0.24 0.37 -0.1 -0.38 -2.05 0.28 -0.17 -0.03 0.01 -0.05 -0.06 -0.08 -0.02 -0.03 -0.0 0.25 -0.03 -0.54
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1.5 1.28 0.71 0.17 0.82 0.09 -0.22 -0.63 0.25 -0.34 -0.02 -0.35 0.28 -3.65 -4.0 -0.92 -1.48 -3.8 -2.07 -1.27 0.17 0.23 -0.66 0.26 0.21 0.22 0.41 0.57 -1.09 -0.75 0.68
0.83 0.44 0.01 -0.37 0.46 0.09 0.51 0.77 -0.02 -0.14 -0.05 -0.26 -0.42 0.55 0.35 -0.2 -0.2 -1.9 0.13 -0.08 -0.01 -0.08 -0.41 -0.28 -0.23 -0.08 0.01 -0.03 -0.3 -0.51 -1.1
0.82 0.38 0.04 0.08 0.09 0.02 0.21 0.5 -0.25 -0.23 -0.17 -0.12 0.02 0.21 0.16 -0.04 0.06 -1.05 -0.22 -0.12 -0.03 0.0 -0.64 -0.26 -0.16 -0.09 -0.07 0.49 0.02 -0.2 -0.74
0.89 0.63 0.17 -0.05 0.27 0.12 0.68 0.59 -0.11 -0.17 -0.14 -0.46 0.11 0.66 0.68 0.0 -0.23 -2.65 -0.43 -0.46 -0.18 -0.19 -1.12 -0.37 -0.33 -0.19 -0.26 0.02 -0.07 -0.33 -0.59
1.96 1.51 0.59 -0.23 0.49 0.04 -0.3 -4.61 -0.63 -2.19 0.17 -1.0 -1.64 0.37 -1.82 -1.55 -1.46 -3.86 -1.26 -0.83 -0.08 0.37 -0.29 0.19 0.21 1.09 1.04 0.27 -0.49 -1.7 -0.54
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0.77 0.42 0.63 -0.03 -0.35 0.44 0.48 0.62 -0.32 -0.49 -0.28 -0.56 -0.09 0.81 0.41 0.06 -0.06 -2.26 -0.12 -0.51 -0.25 -0.15 -0.93 -0.29 -0.32 -0.12 -0.14 -0.32 0.04 -0.02 -0.08
0.4 0.24 0.05 -0.21 -0.22 -0.05 0.18 0.38 -0.1 -0.24 -0.11 -0.18 -0.24 0.74 0.55 -0.03 0.03 -1.78 0.18 -0.04 0.05 0.03 -1.95 0.0 -0.04 0.14 0.04 -0.1 0.27 0.0 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.