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Heatmap: Cluster_209 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.85 1.03 0.8 0.45 0.48 0.12 -0.77 -0.71 -0.24 -0.03 -0.02 0.35 0.2 -0.03 -0.62 -0.17 -0.05 0.06 -0.54 -0.81 -0.55 -0.38 0.42 -0.57 -0.38 -0.21 -0.24 0.21 -0.47 -0.41 -0.37
0.85 0.84 0.93 0.11 0.82 0.52 -0.26 -0.4 -0.69 -0.68 -0.47 -0.6 -0.15 0.18 0.02 -0.22 -0.53 0.5 -0.32 -0.7 -0.61 -0.38 0.79 -0.65 -0.35 -0.41 -0.37 -0.36 0.06 -0.13 -0.45
1.42 1.9 1.84 0.89 0.2 -0.83 -1.03 -1.64 -1.11 -0.83 -0.62 -0.75 -0.54 -0.57 -0.59 -0.54 -0.57 1.57 -1.32 -1.22 -0.99 -1.25 1.19 -1.38 -0.94 -1.04 -0.87 -1.11 -0.96 -0.63 -1.22
1.45 1.32 1.34 0.75 1.35 0.02 -1.59 -1.79 -1.27 -1.21 -1.07 -1.39 -0.4 0.48 0.5 -0.37 -0.82 1.03 -0.93 -1.39 -1.27 -1.32 1.73 -1.49 -1.47 -1.26 -1.15 -1.28 -0.71 -0.82 -0.96
0.88 0.71 0.95 0.33 0.23 -0.07 -0.95 -0.68 -0.47 -0.61 -0.51 -0.41 0.18 0.53 0.24 -0.41 -0.57 1.46 -0.64 -0.65 -0.59 -0.7 1.34 -0.92 -0.77 -0.6 -0.98 -1.16 -0.42 -0.28 -0.13
0.81 0.96 0.54 -0.69 0.31 -0.37 -0.15 0.11 -0.61 -0.54 -0.5 -0.43 0.3 0.22 0.03 0.03 0.04 1.03 -0.38 -0.35 -0.54 -0.56 0.94 -0.48 -0.45 -0.36 -0.42 -0.35 -0.41 -0.48 -0.22
0.56 0.98 0.59 0.34 0.64 -0.21 -0.59 -0.24 -0.54 -0.5 -0.38 -0.34 0.34 0.0 -0.23 -0.29 -0.29 0.98 -0.69 -0.6 -0.48 -0.49 0.81 -0.47 -0.45 -0.41 -0.27 -0.46 -0.1 -0.07 0.05
0.94 0.7 0.84 0.3 0.16 -0.39 -0.34 -0.58 -0.26 -0.33 -0.04 -0.23 0.25 -0.25 0.01 -0.04 -0.07 0.53 -0.07 -0.39 -0.53 -0.67 0.25 -0.21 -0.52 -0.36 -0.33 -0.58 -0.31 0.08 0.43
1.56 1.41 1.33 0.35 -0.38 -1.01 -1.16 -1.26 -0.73 -0.6 -0.54 -0.45 0.96 -0.35 -0.18 -0.11 -0.21 -0.14 -0.92 -0.65 -0.81 -0.69 0.84 -0.64 -0.5 -0.45 -0.72 -0.87 -0.67 -0.29 0.74
1.44 1.27 1.02 0.24 0.05 -0.72 -0.24 0.16 -1.01 -0.9 -0.75 -0.62 -0.59 0.31 -0.01 -0.43 -0.45 1.53 -0.93 -1.08 -0.82 -1.1 1.17 -1.02 -0.87 -0.76 -1.04 -0.77 -0.59 -0.4 0.15
1.58 1.78 1.47 0.38 1.02 -0.24 -1.53 -1.86 -1.09 -1.06 -0.86 -1.38 -0.71 0.43 -0.02 -0.73 -1.25 1.11 -0.91 -1.61 -1.26 -1.08 1.73 -1.49 -1.21 -1.17 -1.02 -1.31 -0.63 -0.87 -0.7
2.38 1.83 1.62 -1.27 -1.39 -1.88 -3.06 -3.09 -6.03 - -3.89 -4.1 -1.6 0.24 -2.9 -2.27 -0.66 3.04 -2.97 -3.74 -3.03 -2.93 2.38 -3.01 -2.63 -1.92 -2.38 -2.42 -4.32 -4.05 -1.77
0.94 1.61 0.97 0.96 1.19 0.5 -0.96 -1.46 -1.74 -1.61 -1.23 -2.12 -0.83 0.72 1.03 -0.2 0.26 0.43 -1.27 -1.79 -1.13 -1.38 1.96 -2.46 -2.14 -1.47 -0.7 -1.3 -0.89 -0.91 -1.66
1.19 1.59 -0.16 -1.24 1.74 0.05 -1.58 -1.34 -1.12 -1.07 -0.64 -1.08 -0.36 0.7 0.15 -0.43 -1.26 1.49 -0.36 -1.61 -1.29 -1.39 1.75 -1.74 -1.09 -1.08 -1.22 -1.15 -0.42 -0.14 -0.48
0.59 0.38 0.61 0.07 0.29 0.18 -0.44 -0.36 -0.32 -0.29 -0.18 -0.31 0.1 0.02 -0.14 0.08 -0.14 0.22 -0.39 -0.37 -0.21 -0.07 0.71 -0.4 -0.19 0.05 -0.05 -0.11 -0.19 -0.13 -0.04
1.84 1.55 1.14 -0.08 1.28 -0.07 -1.91 -2.24 -1.46 -1.55 -1.25 -1.43 -0.51 0.29 0.03 -0.71 -1.23 1.95 -1.13 -1.56 -1.45 -1.25 1.71 -1.6 -1.6 -1.36 -0.93 -1.4 -1.08 -1.11 -1.26
0.57 0.67 0.21 -0.06 0.6 0.18 -0.22 -0.17 -0.47 -0.44 -0.34 -0.51 0.08 0.17 0.22 -0.17 -0.35 0.29 -0.34 -0.52 -0.48 -0.44 1.41 -0.6 -0.48 -0.4 -0.43 -0.52 -0.07 -0.09 0.2
0.94 0.95 0.32 0.18 0.75 0.07 -0.38 -0.31 -0.52 -0.51 -0.41 -0.53 -0.35 0.54 0.36 -0.06 -0.19 -0.07 -0.33 -0.57 -0.5 -0.45 1.01 -0.49 -0.45 -0.41 -0.39 -0.2 -0.2 -0.24 -0.26
1.88 1.18 0.44 -0.42 1.64 0.51 -1.68 -1.38 -0.81 -0.82 -0.63 -1.0 -1.18 -0.11 0.33 -0.34 -0.68 1.32 -0.46 -0.97 -0.59 -0.45 0.33 -1.08 -0.8 -0.37 -0.23 -0.06 -0.55 -1.01 -2.36
1.22 1.86 1.21 0.35 0.58 0.06 -1.38 -2.24 -1.24 -1.5 -0.96 -1.59 -0.06 0.34 -0.12 -0.3 -0.83 -0.23 -0.65 -1.43 -1.04 -0.98 2.13 -1.66 -1.23 -0.76 -1.02 -1.66 -0.02 -0.13 -0.2
0.94 0.85 0.68 -0.16 0.91 0.28 -0.39 -0.43 -0.57 -0.57 -0.47 -0.83 -0.26 0.64 0.28 -0.16 -0.56 0.42 -0.35 -0.79 -0.55 -0.51 1.28 -0.77 -0.63 -0.44 -0.4 -0.59 -0.23 -0.29 -0.31
0.19 0.41 0.43 0.38 0.21 0.08 0.05 -0.12 -0.25 -0.3 -0.23 -0.3 -0.24 0.12 0.07 -0.0 -0.04 0.02 -0.27 -0.38 -0.1 -0.21 0.8 -0.27 -0.12 -0.08 -0.15 -0.1 -0.01 -0.17 -0.19
0.72 1.04 1.18 0.86 0.77 0.15 -0.91 -1.64 -0.08 0.12 -0.05 0.1 -0.5 0.47 0.4 -0.33 -0.4 -0.36 -0.5 -0.76 -0.59 -0.51 0.24 -1.12 -0.7 -0.48 -0.42 -0.18 0.18 -0.37 -0.8
1.42 1.95 1.26 -0.22 0.29 -0.84 -1.56 -1.84 -1.14 -1.1 -0.89 -0.89 0.67 0.7 -0.21 -0.64 -0.76 1.14 -1.37 -1.2 -1.24 -1.36 1.34 -1.22 -1.05 -0.99 -1.1 -1.16 -0.74 -0.5 0.56
1.1 1.1 0.78 -0.2 0.51 0.13 -0.59 -0.43 -0.81 -0.88 -0.84 -0.88 -0.08 0.64 0.42 -0.31 -0.42 0.47 -0.42 -0.71 -0.61 -0.46 1.59 -0.76 -0.75 -0.8 -0.64 -0.48 -0.22 -0.45 -0.45
0.76 0.79 -0.23 -0.56 0.67 0.7 -0.58 -0.81 -0.56 -0.58 -0.49 -0.6 0.3 0.4 0.13 -0.2 -0.61 0.46 -0.22 -0.61 -0.38 -0.36 1.59 -0.61 -0.59 -0.3 -0.32 -0.58 -0.08 -0.3 -0.17
2.1 2.41 1.37 -0.06 0.66 -0.2 -1.22 -1.02 -1.47 -1.49 -1.41 -1.6 0.1 -0.96 -1.08 -0.95 -1.26 0.29 -1.45 -1.73 -1.58 -1.61 2.21 -1.45 -1.32 -1.15 -1.49 -1.52 -1.72 -1.57 -1.59
1.32 1.36 0.81 -0.1 0.42 -0.37 -0.92 -1.19 -0.55 -0.86 -0.38 -0.65 0.29 0.76 0.44 -0.19 -0.29 0.76 -0.31 -0.92 -0.85 -0.8 1.23 -0.86 -0.86 -0.65 -0.7 -0.79 -0.48 -0.61 -0.39
1.6 2.12 1.44 1.28 -0.28 -0.96 -1.97 -3.26 -1.35 -1.3 -1.02 -1.11 0.26 -0.39 -0.55 -0.35 -0.39 0.99 -1.08 -1.41 -1.3 -1.21 1.77 -1.78 -1.49 -0.94 -1.05 -0.86 -1.03 -1.17 -0.7
0.8 0.57 0.46 0.35 0.64 0.56 -0.19 -0.27 -0.44 -0.42 -0.3 -0.44 -0.45 0.29 0.17 -0.21 -0.6 0.18 -0.12 -0.56 -0.44 -0.2 0.75 -0.47 -0.37 -0.26 -0.26 -0.36 0.02 -0.1 -0.27
1.02 1.41 -0.39 -1.0 0.32 0.43 0.31 0.56 -0.95 -1.14 -0.83 -1.25 -0.32 0.94 0.13 -0.56 -0.62 0.21 -0.39 -0.99 -0.73 -0.65 1.87 -0.66 -0.6 -0.61 -0.55 -0.64 -0.31 -0.58 -0.8
1.04 1.17 0.32 -0.56 0.97 0.12 -0.78 -0.73 -0.62 -0.62 -0.39 -0.58 0.05 0.43 0.31 -0.19 -0.52 0.87 -0.23 -0.82 -0.66 -0.55 1.26 -0.8 -0.72 -0.61 -0.55 -0.75 -0.28 -0.3 -0.15
0.12 1.55 -1.11 -3.08 1.7 1.84 -2.29 -1.69 -1.93 -2.53 -2.3 -2.58 -0.01 0.23 0.09 -0.74 -2.43 1.49 -1.1 -1.93 -1.89 -1.89 2.88 -1.56 -1.23 -0.45 -1.76 -2.74 -1.3 -1.5 -2.89
1.01 0.8 0.84 0.26 -0.15 -0.13 0.07 0.11 -0.59 -0.53 -0.55 -0.54 0.38 -0.0 -0.04 -0.22 -0.09 0.16 -0.53 -0.45 -0.41 -0.39 0.91 -0.27 -0.29 -0.28 -0.28 -0.16 -0.31 -0.37 -0.31
-0.05 1.23 -0.34 -2.24 1.61 1.05 -2.05 -4.15 -1.76 -1.76 -1.31 -1.47 0.78 -0.15 0.11 -0.37 -1.45 2.08 -1.12 -1.54 -1.15 -1.31 2.48 -1.95 -1.19 0.22 -1.66 -1.08 -1.56 -1.31 -2.0
1.43 1.66 1.5 0.88 0.87 0.38 -1.16 -2.27 -0.7 -0.46 -0.33 -0.22 -0.59 0.72 0.8 -0.16 -0.73 -0.14 -0.47 -0.58 -0.51 -0.42 -0.56 -1.85 -1.7 -1.01 -1.25 -0.87 -0.55 -0.84 -1.25
1.21 1.02 0.65 -0.02 0.24 0.1 -0.22 -0.38 -0.53 -0.51 -0.36 -0.59 0.19 0.09 0.12 -0.17 -0.45 0.68 -0.54 -0.55 -0.64 -0.63 1.26 -0.68 -0.58 -0.33 -0.45 -0.62 -0.27 -0.35 -0.48
1.58 0.4 -2.1 -0.98 1.95 1.37 -4.2 -1.28 -2.24 -1.12 -0.52 -1.29 0.22 0.65 -0.0 -0.44 -2.09 1.65 -0.02 -1.68 -0.51 -0.76 0.98 -2.17 -1.1 -1.22 -0.27 -1.27 -0.52 -0.61 0.17
0.74 1.32 0.41 -0.67 0.89 0.73 -0.9 -1.75 -0.51 -0.54 -0.31 -0.83 -0.2 0.48 0.27 0.02 -0.67 0.36 -0.41 -1.09 -0.75 -0.74 1.88 -1.08 -1.01 -0.46 -0.6 -1.39 0.04 -0.13 -0.71
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1.25 0.96 0.99 0.41 0.18 -0.26 -0.46 -0.54 -0.76 -0.64 -0.6 -0.66 0.19 0.32 -0.07 -0.51 -0.51 1.2 -0.59 -1.08 -0.73 -0.57 0.96 -0.71 -0.91 -0.44 -0.74 -0.66 -0.2 -0.21 0.28
0.33 0.38 0.01 0.14 0.93 0.68 -0.82 -1.28 -1.2 -0.87 -0.96 -1.44 -0.23 1.02 0.97 -0.05 -0.18 1.27 0.15 -0.62 -0.55 -0.79 1.97 -1.52 -0.93 -1.07 -0.85 -0.51 -1.06 -0.98 -1.49
-1.13 0.08 -1.71 -0.82 1.3 1.28 -1.62 -2.38 -0.02 -0.79 -0.45 -0.55 -0.97 -0.11 -0.14 -0.77 -1.13 0.4 -0.2 -0.53 -0.26 -0.44 2.48 -0.43 -0.17 0.65 -0.3 -0.89 -0.17 -0.15 -1.12
1.0 1.36 0.49 -0.2 1.39 0.33 -1.34 -1.62 -1.02 -1.13 -1.05 -1.08 -0.36 0.5 0.37 -0.63 -1.06 1.51 -0.85 -1.39 -1.1 -1.27 2.09 -1.33 -1.15 -0.91 -1.12 -0.96 -0.81 -0.67 -0.81
0.04 0.29 -0.06 -0.35 0.46 0.35 -0.28 -0.26 -0.24 -0.48 -0.13 -0.23 0.39 0.37 0.26 -0.07 -0.26 -0.1 -0.19 -0.33 -0.22 -0.3 1.28 -0.32 -0.29 -0.12 -0.22 -0.25 -0.08 -0.19 0.01
1.35 2.21 1.26 -0.57 0.73 -0.7 -1.47 -1.54 -0.88 -1.54 -0.85 -1.41 0.67 0.3 0.16 -0.55 -0.21 -0.05 -1.09 -0.99 -1.03 -0.83 0.01 -0.94 -0.95 -0.7 -0.89 -1.37 -0.3 -0.31 1.18
1.15 1.1 0.26 0.53 1.71 0.49 -1.41 -1.33 -1.17 -1.18 -0.85 -1.2 -1.01 0.67 0.56 -0.6 -1.07 0.84 -0.42 -1.37 -1.02 -0.93 1.73 -1.17 -1.27 -1.09 -0.85 -1.05 -0.03 -0.45 -0.65
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1.73 1.49 1.05 -0.05 1.25 -0.1 -1.47 -2.07 -0.94 -1.0 -0.82 -1.01 -0.39 0.34 0.4 -0.47 -0.94 0.84 -0.37 -1.05 -0.77 -1.0 1.13 -1.27 -1.03 -0.92 -0.82 -0.71 -0.4 -0.49 -0.26
0.57 1.05 0.14 -0.05 0.27 0.15 -0.67 -1.0 -0.8 -0.7 -0.58 -0.65 0.05 0.81 0.28 -0.05 -0.24 1.28 -0.46 -0.76 -0.83 -0.72 1.37 -0.96 -0.86 -0.5 -0.53 -0.78 -0.2 -0.09 0.34
0.87 0.43 0.46 0.05 0.37 -0.11 0.04 0.08 -0.89 -0.67 -0.63 -0.55 0.41 0.33 0.05 -0.38 -0.16 1.17 -0.63 -0.65 -0.78 -0.53 1.19 -0.39 -0.54 -0.59 -0.69 -0.44 -0.27 -0.32 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.