Heatmap: Cluster_189 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_37340.1	-0.28	0.1	-0.17	-0.21	1.01	0.78	-0.45	-0.44	-0.55	-0.89	-0.49	-0.87	-0.38	1.1	0.73	-0.27	-0.5	0.65	0.05	-0.8	-0.15	-0.34	0.41	-0.41	-0.4	-0.32	-0.46	-0.8	0.52	0.13	0.29
Lsat_1_v5_gn_0_42100.1	-0.14	-0.06	-0.37	-0.36	0.57	0.55	-0.19	-0.16	-0.18	-0.24	-0.07	-0.2	-0.29	0.74	0.52	0.09	-0.19	-0.14	0.07	-0.32	-0.27	0.01	0.34	-0.63	-0.32	-0.15	0.01	-0.05	0.34	0.11	-0.11
Lsat_1_v5_gn_0_45160.1 (WAK5)	-1.26	-	-	-	3.52	2.71	-	-	-3.27	-	-0.64	-4.42	-	1.83	0.55	-1.46	-	-	-0.11	-2.62	-0.9	-1.13	-3.94	0.22	-1.48	-1.88	-0.34	-2.83	-0.22	-0.72	-4.46
Lsat_1_v5_gn_0_47300.1	0.93	0.19	0.08	0.2	2.08	1.24	-1.58	-1.72	-0.63	-0.92	-0.51	-1.13	-0.81	0.64	0.92	-0.01	-1.08	-0.2	0.19	-1.03	-0.32	-0.26	-1.98	-0.69	-0.61	-0.43	-0.27	-0.3	0.26	0.01	-1.13
Lsat_1_v5_gn_1_11940.1 (CYP71A20)	-0.31	-2.22	-4.09	-5.18	2.61	2.16	-7.48	-2.67	-3.53	-4.97	-3.09	-4.9	-0.28	-0.14	0.49	-1.14	-3.26	2.0	-1.29	-5.09	-1.02	-0.68	2.68	-1.1	-0.64	-1.81	-1.17	-0.71	-1.0	-2.27	-3.86
Lsat_1_v5_gn_1_12561.1 (CYP71A20)	0.05	-2.52	-2.78	-3.22	2.64	2.17	-4.34	-2.93	-3.39	-3.54	-3.33	-3.7	-0.61	-0.34	0.63	-1.06	-3.22	2.17	-1.56	-4.26	-1.13	-0.73	2.54	-1.01	-0.93	-1.91	-0.96	-0.89	-1.34	-2.74	-4.62
Lsat_1_v5_gn_1_13801.1	-0.23	-0.13	-0.43	0.15	0.91	0.4	-0.26	-0.14	-0.0	0.03	0.03	-0.09	-0.34	0.81	0.46	-0.15	-0.48	-0.03	-0.15	-0.42	-0.21	-0.2	-0.11	-0.3	-0.4	-0.28	-0.26	-0.39	0.43	0.33	0.05
Lsat_1_v5_gn_1_19281.1 (PHX21)	0.26	0.17	-0.37	-0.27	2.42	1.1	-0.85	-1.56	-1.13	-1.15	-0.87	-1.39	-1.15	0.53	0.63	-0.66	-1.33	0.95	-0.13	-1.35	-0.6	-0.31	0.94	-1.09	-1.11	-0.99	-0.84	-1.12	0.89	-0.23	-0.76
Lsat_1_v5_gn_1_2061.1 (PUP1)	0.71	-0.3	-0.33	0.49	1.71	1.11	-0.93	-0.22	-0.65	-1.02	-0.71	-1.32	0.03	1.51	1.02	-0.2	-0.59	-1.34	-0.22	-1.11	-0.04	-0.45	-1.73	-0.58	-0.64	-0.46	-0.11	0.13	0.12	-0.42	-1.45
Lsat_1_v5_gn_1_33661.1 (XIW1)	-0.63	-0.55	-0.59	-0.24	1.01	1.03	-0.24	-0.05	-0.34	-0.38	-0.14	-0.22	-0.46	0.81	0.5	0.01	-0.01	-0.37	-0.02	-0.41	-0.03	0.12	-0.3	-0.19	-0.07	0.16	0.22	-0.28	-0.12	-0.26	-0.02
Lsat_1_v5_gn_1_37680.1	0.5	-0.42	-0.22	-0.74	2.6	0.82	-1.59	-1.05	-0.83	-0.9	-0.82	-0.62	-1.25	1.77	1.56	-0.09	-0.37	-1.31	-0.26	-0.85	-0.93	-1.03	-1.25	-1.76	-1.41	-1.32	-1.0	-0.67	-1.01	-0.78	0.52
Lsat_1_v5_gn_1_43561.1 (RH4)	0.65	-0.18	-0.38	-0.62	1.93	1.39	-1.35	-1.16	-0.54	-0.9	-0.4	-0.97	-1.26	1.4	1.19	-0.12	-1.3	-0.8	-0.1	-1.03	-0.28	-0.22	-0.34	-0.63	-0.41	-0.39	-0.18	0.02	0.01	-0.53	-1.12
Lsat_1_v5_gn_1_44081.1 (FIP2)	0.14	0.19	-0.07	-0.4	0.94	0.46	-0.32	-0.7	-0.25	-0.17	-0.09	-0.35	-0.35	0.65	0.64	0.21	-0.23	-0.31	-0.02	-0.4	-0.35	-0.14	0.0	-0.42	-0.25	-0.18	-0.16	-0.27	0.42	0.27	-0.01
Lsat_1_v5_gn_1_49321.1	-0.07	-2.42	-5.11	-4.26	1.24	1.74	-4.31	-2.63	-2.74	-3.32	-1.56	-4.02	0.11	1.03	1.58	0.11	-2.67	0.79	1.1	-1.36	0.57	0.69	-1.61	0.52	0.27	-0.01	0.16	-0.33	0.41	-0.21	-1.17
Lsat_1_v5_gn_1_50340.1 (ATU2AF35A)	-0.54	-0.44	-0.39	-0.02	0.37	0.3	-0.12	-0.24	-0.27	-0.13	-0.14	-0.12	0.15	0.8	0.61	0.09	-0.1	0.26	-0.28	-0.25	-0.13	-0.12	0.15	-0.22	-0.15	-0.08	-0.1	-0.11	0.19	-0.05	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_60360.1 (SPP1)	-0.43	-0.55	-0.34	-0.09	0.39	0.19	-0.25	-0.31	-0.02	-0.01	-0.05	-0.08	0.15	0.84	0.47	-0.13	-0.19	0.22	-0.1	-0.18	-0.22	-0.18	0.22	-0.36	-0.19	-0.16	-0.18	-0.21	0.23	0.18	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_61581.1	0.21	-0.49	-2.2	-4.97	2.73	1.22	-3.38	-1.86	-0.77	-1.81	-1.44	-1.99	-0.76	2.15	1.81	-0.71	-2.45	-3.77	-0.44	-2.35	-0.88	-1.22	-1.37	-0.53	-1.43	-1.21	-1.04	-1.93	0.77	0.37	0.12
Lsat_1_v5_gn_1_74180.1 (DMI1)	0.03	0.21	-0.55	-0.47	1.16	0.74	0.06	0.18	-0.32	-0.43	-0.17	-0.7	-1.01	0.99	0.87	0.11	-0.38	0.0	-0.0	-0.6	-0.29	-0.19	-0.28	-0.61	-0.39	-0.25	-0.1	-0.32	0.37	0.01	-0.64
Lsat_1_v5_gn_1_8480.1 (STY46)	-0.68	-0.75	-0.3	0.15	1.38	1.06	-1.02	-1.16	-0.46	-0.35	-0.34	-0.75	-0.97	1.7	1.37	-0.0	-0.72	-0.48	0.09	-0.49	-0.27	-0.21	-0.44	-0.66	-0.57	-0.18	-0.16	-0.26	0.04	-0.38	-0.43
Lsat_1_v5_gn_2_104201.1	0.33	-0.23	-1.16	-1.63	1.05	0.93	-0.59	-0.84	-0.14	-0.79	0.01	-0.75	-0.29	1.38	1.12	-0.36	-0.89	0.43	0.67	-0.18	-0.1	-0.25	-0.38	0.04	-0.53	-0.35	0.04	-0.24	-0.72	-0.91	0.04
Lsat_1_v5_gn_2_29880.1 (HERK2)	-0.02	-0.45	-0.12	0.05	1.01	0.56	-0.62	-0.53	-0.28	-0.26	-0.22	-0.2	-0.45	0.75	0.84	-0.02	-0.24	0.33	-0.05	-0.8	-0.37	-0.58	-0.03	-0.5	-0.42	-0.48	-0.31	-0.62	0.49	0.45	0.53
Lsat_1_v5_gn_2_39360.1	0.31	0.12	-0.17	-0.04	0.97	0.64	-0.47	-0.35	-0.33	-0.37	-0.19	-0.39	-0.22	0.87	0.65	-0.16	-0.44	0.08	-0.09	-0.6	-0.39	-0.26	-0.02	-0.55	-0.5	-0.36	-0.25	-0.39	0.47	0.18	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_46760.1 (RIN4)	-0.16	-0.2	-0.5	-0.31	1.21	0.76	-0.26	-0.27	-0.19	-0.15	-0.09	-0.28	-0.83	0.45	0.73	0.11	-0.26	-0.04	0.0	-0.36	-0.08	-0.0	-1.08	-0.48	-0.28	-0.12	0.07	0.11	0.53	0.16	-0.54
Lsat_1_v5_gn_2_71120.1	-0.4	-0.1	-0.45	-0.45	1.3	0.78	-0.99	-1.27	-0.29	-0.27	-0.17	-0.41	-0.7	0.87	0.82	0.32	-0.18	-0.24	0.14	-0.56	-0.19	-0.15	0.44	-0.73	-0.65	-0.35	-0.13	-0.35	0.39	0.42	-0.01
Lsat_1_v5_gn_2_72581.1 (CRPK1)	0.14	0.33	-0.34	-0.35	1.95	0.98	-1.31	-1.44	-0.35	-0.29	-0.21	-0.67	-2.24	0.66	1.39	0.34	-0.4	-0.91	0.08	-0.62	-0.34	-0.3	-1.11	-1.12	-0.97	-0.57	-0.24	-0.32	0.72	0.34	-1.28
Lsat_1_v5_gn_2_75980.1 (CPK16)	-0.49	-0.52	-1.08	-1.21	0.92	0.68	-0.27	-0.74	-0.32	-0.41	-0.34	-0.63	-0.49	1.39	1.21	0.13	-0.35	0.66	0.2	-0.38	-0.29	-0.23	-0.52	-0.38	-0.28	-0.23	-0.24	-0.49	0.3	0.08	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_82860.1 (IAMH2)	0.19	-0.38	-0.37	-0.32	0.9	0.58	-0.04	-0.02	-0.13	-0.23	-0.14	-0.4	-0.03	0.49	0.59	-0.04	-0.2	-0.4	-0.19	-0.21	-0.04	0.02	0.01	-0.09	-0.08	0.11	0.03	-0.09	-0.22	-0.26	-0.13
Lsat_1_v5_gn_2_92861.1	-0.3	-0.76	-0.51	-0.29	0.86	0.71	-0.36	-0.62	-0.29	-0.49	-0.32	-0.54	-0.74	1.43	0.96	-0.21	-0.34	-0.6	0.61	-0.23	-0.08	-0.06	-0.13	-0.1	-0.19	-0.19	0.08	-0.2	0.06	-0.17	-0.17
Lsat_1_v5_gn_2_96420.1	0.15	0.61	-0.33	-0.33	1.45	1.03	-1.33	-1.9	-0.88	-1.07	-0.87	-1.56	-1.42	1.13	1.23	-0.01	-0.58	-0.1	-0.17	-0.64	-0.3	-0.56	0.6	-1.11	-0.9	-0.13	-0.58	-0.83	0.31	0.65	0.51
Lsat_1_v5_gn_3_11081.1	-1.05	-1.71	-1.77	-1.54	1.89	0.83	-1.13	-0.68	-1.01	-1.42	-0.24	-0.88	-0.65	2.0	1.69	-0.16	-0.65	-0.62	0.3	-0.81	-0.41	-0.42	0.84	-1.18	-0.32	-0.25	-0.52	-0.49	-0.0	-0.42	-1.35
Lsat_1_v5_gn_3_120060.1	-0.08	-0.49	-1.21	-1.9	1.01	0.68	-0.71	-1.23	0.02	-0.23	-0.02	-0.21	-0.86	1.93	1.74	0.3	-0.05	-5.73	-0.3	-0.12	-0.06	-0.38	-6.34	-0.24	-0.39	-0.71	-0.46	-0.45	0.29	-0.04	0.05
Lsat_1_v5_gn_3_121041.1	0.9	-0.73	-1.9	-2.26	2.08	1.66	-2.18	-2.13	-1.16	-1.6	-1.13	-1.9	0.23	1.19	0.86	-0.47	-1.29	0.11	0.13	-1.26	-0.27	-0.07	1.3	-0.3	-0.33	-0.49	-0.13	-0.17	-0.36	-1.14	-3.0
Lsat_1_v5_gn_3_121081.1	0.75	0.39	-0.39	-0.51	1.44	1.39	-0.86	-0.81	-0.65	-0.87	-0.77	-1.05	-0.12	0.23	-0.07	-0.1	-0.65	-0.42	-0.17	-0.87	-0.19	-0.2	1.49	-0.23	-0.22	-0.4	-0.31	-0.38	0.11	-0.32	-0.88
Lsat_1_v5_gn_3_131400.1 (PTPMT1)	-0.56	-0.38	-0.51	-0.28	0.71	0.58	0.12	0.01	-0.2	-0.1	-0.03	-0.24	-0.35	0.81	0.83	0.15	-0.12	-0.45	0.21	-0.21	-0.21	-0.28	0.06	-0.35	-0.25	-0.13	-0.06	-0.22	0.1	0.01	-0.16
Lsat_1_v5_gn_3_13640.1 (OPT7)	0.02	0.03	-0.25	-0.41	1.05	0.67	-0.16	-0.09	-0.08	-0.32	0.02	-0.26	-1.22	1.64	1.34	0.22	-0.16	-2.71	-0.56	-0.33	-0.12	-0.22	-3.18	-0.42	-0.28	-0.24	-0.14	-0.46	-0.07	-0.32	-0.3
Lsat_1_v5_gn_3_30180.1 (MTV9)	-0.42	-0.32	-0.38	-0.17	0.35	0.21	-0.27	-0.3	-0.1	-0.2	-0.01	-0.05	0.12	0.65	0.34	-0.12	-0.19	0.22	-0.03	-0.2	-0.26	-0.04	0.29	-0.22	-0.09	-0.03	-0.08	-0.2	0.13	0.23	0.42
Lsat_1_v5_gn_3_35581.1 (RTNLB8)	-0.2	-0.03	-0.07	0.14	0.58	0.66	-0.11	-0.1	-0.4	-0.28	-0.27	-0.63	-0.25	0.92	0.73	0.16	-0.07	-0.4	0.02	-0.4	-0.24	-0.18	-0.3	-0.45	-0.33	-0.21	-0.1	-0.23	0.43	0.19	-0.14
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Lsat_1_v5_gn_9_39460.1 (WRKY70)	1.38	0.73	0.15	0.1	2.02	0.86	-1.09	-1.86	-0.43	-0.65	-0.39	-0.51	-2.37	0.73	1.26	-0.08	-0.84	-0.14	-0.37	-0.88	-0.62	-0.28	-1.0	-1.19	-1.12	-0.89	-0.64	-0.15	0.31	-0.49	-2.3
Lsat_1_v5_gn_9_54581.1 (CBF3)	-0.78	-0.11	-1.96	-1.86	2.35	1.4	-0.9	0.19	-1.14	-1.12	-0.66	-0.54	-0.57	1.97	1.25	-0.02	-0.64	0.27	-0.23	-0.52	-1.18	-1.1	-1.67	-1.39	-1.51	-0.69	-0.4	-1.07	-0.42	-0.89	-0.18
Lsat_1_v5_gn_9_69981.1	-0.12	-0.47	-0.87	-0.91	0.99	0.98	-0.25	-0.31	-0.29	-0.62	-0.32	-0.8	-0.85	1.63	1.33	0.16	-0.48	-0.13	0.47	-0.41	-0.33	-0.39	-1.67	-0.56	-0.46	-0.32	-0.17	-0.28	0.48	0.1	-0.96
Lsat_1_v5_gn_9_89580.1 (AAP7)	-0.84	-1.12	-2.06	-1.89	1.65	1.03	-1.65	-2.15	-0.89	-0.85	-0.69	-1.57	-1.66	2.45	2.03	0.18	-0.91	-1.22	-0.09	-1.14	-0.45	-0.38	-0.55	-0.74	-0.86	-0.54	-0.29	-0.84	0.52	-0.07	-0.83
Lsat_1_v5_gn_9_93420.1 (LSU)	0.5	0.87	-0.35	-1.56	1.55	1.27	-0.68	-0.71	-0.29	-0.91	-0.51	-1.23	-1.52	1.65	1.44	0.19	-1.0	-0.35	0.28	-0.9	-0.54	-0.36	-1.98	-1.1	-0.78	-0.82	-0.03	-0.24	0.04	-0.51	-1.63

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.