Heatmap: Cluster_220 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_127401.1	-0.41	-0.46	-0.4	-0.24	0.18	0.31	0.05	0.12	-0.42	-0.3	-0.2	-0.24	0.55	0.58	0.37	0.12	-0.02	-0.02	-0.22	-0.3	-0.17	-0.07	0.37	-0.14	-0.18	-0.11	-0.16	-0.1	0.18	0.05	0.4
Lsat_1_v5_gn_1_14981.1 (Drg1-1)	-0.47	-0.51	-0.59	-0.65	0.25	0.53	-0.15	0.15	-0.52	-0.53	-0.59	-0.34	0.38	0.57	0.2	-0.14	-0.17	0.18	-0.37	-0.36	-0.26	-0.05	0.54	-0.13	-0.13	-0.12	-0.27	-0.21	0.38	0.43	1.02
Lsat_1_v5_gn_1_77501.1	-0.97	-0.87	-0.71	-0.66	-0.19	0.42	-0.62	-0.51	-0.38	-0.39	-0.2	-0.38	0.14	0.77	0.5	-0.22	-0.07	-0.22	-0.02	-0.52	-0.17	-0.12	0.84	-0.03	-0.05	-0.31	-0.11	-0.28	0.5	0.6	1.23
Lsat_1_v5_gn_2_108521.1 (TRM112b)	-1.1	-1.68	-1.4	-1.08	-0.15	0.17	-0.43	0.04	-0.73	-0.61	-0.56	-0.12	0.85	1.01	0.59	0.18	0.2	0.39	-0.54	-0.27	0.07	-0.03	0.85	0.18	-0.06	0.03	-0.46	-0.23	0.12	-0.0	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_111720.1	-0.46	-0.5	-0.58	-0.35	-0.04	0.34	-0.39	-0.15	-0.66	-0.66	-0.58	-0.23	0.22	0.58	0.36	-0.1	-0.25	-0.13	-0.29	-0.32	-0.08	0.1	0.62	0.08	0.18	0.04	-0.13	-0.3	0.43	0.35	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_119400.1	-0.48	-0.44	-0.36	-0.1	0.26	0.14	-0.07	0.23	-0.51	-0.31	-0.17	-0.34	0.49	0.76	0.5	0.09	-0.04	0.28	-0.12	-0.33	-0.31	-0.18	0.39	-0.21	-0.29	-0.2	-0.23	-0.42	0.08	0.03	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_132660.1 (ESP5)	-0.27	-0.3	-0.49	-0.45	0.06	0.09	-0.02	0.08	-0.33	-0.21	-0.17	-0.11	0.62	0.74	0.38	0.12	-0.01	-0.05	-0.2	-0.23	-0.22	-0.12	0.21	-0.25	-0.16	-0.07	-0.17	-0.25	0.1	0.05	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_4960.1	-0.61	-0.37	-0.77	-1.04	0.32	0.51	0.16	0.14	-0.35	-0.47	-0.19	-0.3	0.26	0.56	0.34	0.08	0.09	0.1	-0.08	-0.14	-0.15	-0.01	0.86	-0.17	-0.04	-0.03	0.02	-0.02	0.02	-0.09	-0.09
Lsat_1_v5_gn_2_87680.1	-0.76	-0.83	-0.78	-0.38	-0.04	0.29	0.02	0.32	-0.58	-0.42	-0.4	-0.1	0.66	0.67	0.32	0.11	0.1	-0.11	-0.55	-0.23	-0.09	-0.07	0.49	0.05	0.09	-0.02	-0.2	0.07	0.12	-0.03	0.63
Lsat_1_v5_gn_2_89661.1 (TRM1b)	-0.79	-0.73	-0.84	-0.43	0.26	0.34	0.1	0.5	-0.74	-0.65	-0.51	-0.44	0.71	1.07	0.72	0.15	0.13	0.02	-0.72	-0.41	-0.28	-0.21	0.68	-0.22	-0.2	-0.09	-0.42	-0.11	0.2	-0.21	0.37
Lsat_1_v5_gn_2_94421.1	-0.41	-0.42	-0.57	-0.44	0.21	0.44	0.03	0.24	-0.39	-0.24	-0.15	-0.19	0.43	0.49	0.4	0.11	-0.07	0.29	-0.15	-0.29	-0.2	-0.2	0.06	-0.09	-0.17	-0.12	-0.01	-0.25	0.11	0.05	0.54
Lsat_1_v5_gn_2_96641.1 (RE)	-0.64	-0.53	-0.58	-0.58	0.34	0.28	-0.18	0.2	-0.57	-0.44	-0.43	-0.11	0.57	0.69	0.16	-0.05	-0.08	0.04	-0.36	-0.45	-0.17	-0.15	0.81	0.15	-0.13	-0.04	-0.27	-0.09	0.24	-0.04	0.69
Lsat_1_v5_gn_3_107840.1 (PFK6)	0.1	-0.32	-0.7	-1.22	0.03	0.37	0.05	0.25	-0.51	-0.49	-0.36	-0.4	0.08	0.47	0.39	0.19	-0.06	0.65	0.13	-0.15	-0.11	0.02	0.7	-0.0	-0.11	-0.23	-0.1	0.11	-0.06	-0.19	-0.01
Lsat_1_v5_gn_3_51960.1	-0.27	-0.47	-0.62	-0.68	0.25	0.27	0.03	0.09	-0.32	-0.4	-0.21	-0.28	0.45	0.46	0.29	-0.05	-0.08	0.35	-0.07	-0.1	-0.13	-0.08	0.59	0.0	-0.04	-0.03	-0.09	0.05	-0.02	-0.0	0.19
Lsat_1_v5_gn_3_63961.1 (CI76)	0.01	-0.19	-0.41	-0.42	0.05	0.13	0.04	0.12	-0.26	-0.25	-0.17	-0.1	0.21	0.33	0.13	0.01	-0.02	0.03	0.07	-0.06	-0.02	0.03	0.47	-0.0	-0.01	-0.02	-0.0	0.01	-0.04	-0.05	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_111061.1 (ORRM4)	-0.25	-0.25	-0.64	-0.61	0.51	0.58	-0.29	0.3	-0.78	-0.72	-0.67	-0.4	0.53	0.72	0.11	-0.13	-0.22	0.18	-0.43	-0.55	-0.31	-0.11	0.3	0.13	-0.07	-0.18	-0.28	-0.02	0.46	0.2	0.8
Lsat_1_v5_gn_4_172061.1	-0.64	-0.98	-1.37	-0.51	0.21	0.34	0.2	0.23	-0.75	-0.56	-0.3	-0.29	0.71	0.59	0.24	0.07	-0.19	0.02	-0.4	-0.22	-0.0	-0.01	0.85	-0.04	-0.08	0.02	-0.41	-0.1	0.05	-0.1	0.89
Lsat_1_v5_gn_4_185421.1	-0.67	-0.59	-0.92	-0.61	0.25	0.39	-0.39	-0.2	-0.53	-0.53	-0.48	-0.45	0.52	0.79	0.41	-0.13	0.1	0.34	-0.29	-0.46	-0.28	-0.17	0.35	-0.11	-0.04	-0.14	-0.27	-0.48	0.63	0.48	0.98
Lsat_1_v5_gn_4_29561.1	-0.37	-0.83	-0.89	-0.84	0.17	0.44	-0.28	0.26	-0.96	-0.86	-0.89	-0.37	0.61	0.77	0.6	0.06	-0.02	0.39	-0.56	-0.41	-0.14	-0.08	1.06	-0.11	-0.18	-0.09	-0.35	-0.03	0.33	0.13	0.47
Lsat_1_v5_gn_4_33601.1 (RRP41)	-0.79	-0.66	-1.16	-0.91	-0.05	0.33	0.02	0.52	-0.62	-0.49	-0.4	-0.31	0.85	0.8	0.38	0.19	0.15	0.21	-0.32	-0.44	-0.31	-0.12	0.51	0.15	0.1	-0.15	-0.29	0.08	-0.13	-0.14	0.57
Lsat_1_v5_gn_4_34220.1	-0.36	-0.55	-0.63	-0.54	0.27	0.24	-0.3	-0.16	-0.32	-0.31	-0.3	-0.29	0.62	0.57	0.39	-0.01	-0.13	0.14	-0.33	-0.19	-0.14	0.05	0.63	-0.01	-0.05	-0.11	-0.1	0.14	0.11	0.04	0.44
Lsat_1_v5_gn_4_37061.1 (FUS6)	-0.49	-0.67	-0.57	-0.58	0.42	0.45	-0.1	0.19	-0.25	-0.36	-0.17	-0.27	0.44	0.51	0.32	-0.06	-0.07	0.08	-0.23	-0.2	-0.26	-0.12	0.45	-0.13	0.02	-0.13	-0.14	-0.06	0.09	0.05	0.65
Lsat_1_v5_gn_5_161741.1 (BTF3)	-0.6	-0.7	-0.54	-0.32	0.08	0.14	0.01	0.21	-0.12	-0.14	-0.0	0.01	0.52	0.37	0.28	0.23	0.08	-0.1	-0.33	-0.15	-0.11	-0.13	0.14	-0.05	-0.05	0.05	-0.01	-0.11	0.16	0.16	0.28
Lsat_1_v5_gn_5_172701.1 (SIRANBP)	-0.91	-0.88	-0.92	-0.64	0.34	0.4	-0.08	0.11	-0.47	-0.36	-0.35	-0.17	0.63	0.58	0.26	0.01	-0.02	0.09	-0.43	-0.29	-0.16	-0.03	0.72	-0.15	-0.03	-0.04	-0.08	0.05	0.2	0.1	0.61
Lsat_1_v5_gn_5_30781.1 (UAP56a)	-0.56	-0.47	-0.44	-0.16	0.34	0.27	-0.04	0.33	-0.46	-0.39	-0.29	-0.19	0.41	0.61	0.45	0.02	-0.12	0.24	-0.04	-0.15	-0.17	-0.13	-0.0	-0.2	-0.19	-0.17	-0.13	-0.11	0.09	-0.01	0.63
Lsat_1_v5_gn_5_45360.1 (TRM4B)	-0.52	-0.75	-1.07	-0.92	-0.02	0.35	-0.2	0.16	-0.7	-0.66	-0.46	-0.38	0.84	0.99	0.51	0.07	0.04	0.06	-0.4	-0.29	-0.24	-0.14	0.4	-0.12	-0.01	-0.1	-0.31	0.1	0.24	0.03	0.85
Lsat_1_v5_gn_5_82020.1 (ROS3)	-0.89	-0.93	-1.06	-0.61	0.16	0.14	0.05	0.39	-0.39	-0.24	-0.34	-0.2	0.54	0.57	0.64	0.25	-0.04	0.23	-0.17	-0.15	-0.14	-0.12	0.26	-0.05	-0.11	0.13	-0.05	-0.04	-0.03	-0.07	0.55
Lsat_1_v5_gn_6_13221.1	-1.01	-0.95	-0.81	-0.5	-0.06	0.09	-0.19	0.05	-0.43	-0.4	-0.29	-0.22	0.68	1.05	0.68	0.21	0.06	0.35	-0.24	-0.31	-0.32	-0.29	0.66	-0.09	-0.22	-0.16	-0.22	-0.39	0.13	0.05	0.63
Lsat_1_v5_gn_6_32361.1	-0.76	-0.99	-0.81	-0.68	0.11	0.36	0.16	0.64	-0.61	-0.62	-0.37	-0.34	0.59	0.98	0.68	0.13	0.04	-0.03	-0.34	-0.2	-0.19	0.05	0.35	0.03	-0.18	-0.0	-0.15	0.11	0.01	-0.29	0.08
Lsat_1_v5_gn_6_55820.1 (ECT2)	-1.06	-1.0	-1.09	-0.59	0.08	0.1	0.0	0.33	-0.64	-0.48	-0.46	-0.32	0.75	1.1	0.63	0.1	0.04	0.3	-0.45	-0.36	-0.27	-0.13	0.67	-0.38	-0.26	-0.11	-0.36	-0.29	0.31	0.07	0.72
Lsat_1_v5_gn_6_67760.1	-1.21	-1.42	-1.9	-1.5	0.1	0.65	-0.08	0.44	-1.16	-0.94	-0.95	-0.65	1.08	1.13	1.04	0.3	0.14	0.23	-0.1	-0.36	-0.28	-0.01	0.58	-0.26	-0.21	-0.11	-0.66	0.03	0.15	-0.32	0.53
Lsat_1_v5_gn_6_87641.1	-0.6	-0.62	-0.83	-0.89	-0.06	0.34	0.11	0.4	-0.69	-0.6	-0.12	-0.17	0.7	0.76	0.49	0.05	-0.38	0.46	-0.05	-0.32	-0.25	-0.1	0.47	-0.05	-0.06	-0.04	-0.42	-0.1	0.03	-0.16	0.63
Lsat_1_v5_gn_7_15980.1 (TRM5c)	-0.93	-0.7	-1.04	-0.74	0.14	0.38	-0.14	-0.04	-0.47	-0.51	-0.21	-0.22	0.53	1.0	0.42	0.04	-0.06	0.14	-0.32	-0.37	-0.29	-0.12	0.73	-0.02	-0.11	-0.0	-0.16	-0.15	0.14	0.11	0.71
Lsat_1_v5_gn_7_21081.1 (CABIN1)	-1.06	-0.83	-1.25	-1.03	-0.04	0.26	-0.09	-0.13	-0.88	-0.86	-0.72	-0.29	0.97	0.81	0.4	0.04	-0.13	0.37	-0.16	-0.29	-0.23	-0.14	0.36	-0.21	-0.21	-0.25	-0.44	-0.1	0.71	0.29	1.25
Lsat_1_v5_gn_7_89880.1	-0.56	-0.52	-0.77	-0.26	0.49	0.27	-0.26	0.22	-0.75	-0.95	-0.76	-0.38	0.71	1.16	0.5	0.08	-0.15	0.34	-0.4	-0.42	-0.18	-0.17	0.58	-0.1	-0.4	0.06	-0.43	-0.19	0.17	-0.04	0.48
Lsat_1_v5_gn_7_97420.1	-0.56	-0.69	-0.67	-0.78	0.09	0.44	-0.19	-0.16	-0.43	-0.5	-0.35	-0.24	0.66	0.83	0.39	-0.05	-0.09	0.16	-0.06	-0.12	-0.33	-0.02	0.47	-0.23	-0.07	-0.11	-0.28	-0.14	0.29	0.24	0.68
Lsat_1_v5_gn_8_101001.1 (G2p)	-1.01	-1.0	-1.28	-0.83	0.16	0.31	0.03	0.61	-0.72	-0.54	-0.42	-0.21	0.82	1.03	0.56	0.11	0.15	-0.18	-0.69	-0.25	-0.17	-0.06	0.45	0.03	0.01	-0.05	-0.27	0.07	0.09	-0.2	0.46
Lsat_1_v5_gn_8_103640.1 (ProRS-Cyt)	-0.64	-0.68	-0.71	-0.45	0.23	0.42	-0.09	0.15	-0.49	-0.36	-0.36	-0.22	0.54	0.47	0.23	0.11	-0.0	0.18	-0.34	-0.25	-0.11	0.01	0.82	-0.07	-0.02	-0.07	-0.13	0.04	-0.0	-0.01	0.42
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.