Heatmap: Cluster_21 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.52 0.55 1.5 0.95 -1.06 -1.11 -1.51 -3.6 -0.0 0.19 0.14 0.46 0.16 0.09 0.6 1.02 1.24 -3.11 -0.38 0.08 -0.4 -0.34 -4.22 -0.7 -0.34 -0.14 -0.21 0.34 -3.25 -2.39 -0.03
0.4 0.51 0.43 0.61 0.3 -0.23 -0.01 -0.37 0.16 -0.06 0.18 0.33 -0.01 -1.06 -1.0 -0.32 -0.28 -1.22 -0.43 -0.05 0.02 0.2 -1.67 0.02 0.19 0.33 0.42 0.16 -0.34 -0.22 0.41
0.41 0.99 1.74 1.58 -1.07 -0.81 0.07 -0.01 -0.2 -0.09 0.07 0.41 -0.94 -3.2 -2.68 -0.26 -0.86 -1.73 -1.14 -0.61 -0.63 -0.2 -1.08 -0.43 -0.9 0.23 -0.33 -0.65 0.26 0.72 0.83
1.48 1.0 0.89 0.73 -0.0 -0.23 -1.27 -0.54 -0.55 -0.81 -0.16 -0.33 0.1 -2.6 -2.14 0.18 0.15 -0.08 -0.84 -0.25 -0.06 0.06 -1.21 -0.04 -0.05 0.25 0.34 -0.39 -0.98 -0.17 0.81
0.79 0.43 1.23 1.12 0.01 -0.25 -0.79 -1.54 0.06 0.26 0.22 0.5 0.52 -1.65 -1.21 0.0 0.01 -1.23 -0.76 -0.17 -0.18 -0.07 -0.72 -0.35 -0.16 0.07 -0.08 0.09 -0.41 -0.17 -0.15
0.44 0.39 0.61 0.6 0.01 0.15 -1.1 -2.39 -0.05 -0.15 0.27 0.15 -0.03 -1.59 -1.01 0.58 0.29 -1.26 -0.64 0.0 0.15 0.25 -1.42 -0.18 0.33 0.63 0.62 -0.06 -0.52 -0.07 0.3
1.1 1.29 1.5 1.21 -0.32 -0.39 -0.53 -0.99 0.24 0.32 0.33 0.31 0.19 -3.54 -2.03 -0.27 -0.36 -1.36 -1.19 -0.28 -0.36 -0.23 -2.35 -0.81 -0.4 -0.15 -0.27 -0.63 0.15 0.32 -0.04
0.56 0.4 0.77 0.39 -0.12 -0.28 -1.24 -1.52 -0.53 -0.26 -0.44 -0.2 0.53 0.61 0.24 0.33 0.42 -0.83 -0.19 0.07 -0.16 0.05 -1.07 -0.28 0.13 0.1 0.17 0.1 -0.52 -0.35 0.28
0.19 -0.4 1.16 0.78 -0.12 -0.44 -1.14 -1.14 -0.65 -0.22 -0.44 -0.14 0.95 -0.62 0.12 1.02 1.03 -0.42 -0.83 -0.0 0.04 -0.38 -1.38 -0.57 -0.16 0.29 0.21 0.36 -1.14 -0.66 -0.19
-0.3 -0.74 -0.82 -1.18 -1.13 0.02 0.3 -0.89 0.22 0.27 0.12 0.14 -0.43 -1.06 -0.48 -0.34 -0.37 -0.81 -0.07 0.15 0.45 0.55 0.41 0.3 0.58 0.56 0.75 0.2 0.1 0.39 0.09
0.56 0.71 1.37 1.2 0.5 -0.26 -1.62 -2.41 0.07 0.4 0.46 0.23 -0.87 -1.65 -0.56 0.32 -0.0 -1.82 -0.76 -0.15 -0.12 -0.11 -0.94 -0.62 -0.32 -0.3 -0.01 -0.25 -0.01 0.46 -0.13
0.34 0.32 0.27 -0.14 -0.19 -0.1 -0.37 -0.66 0.0 0.02 0.15 0.23 0.28 0.2 -0.08 0.45 0.48 -2.23 -0.19 -0.11 0.0 0.08 -1.98 -0.04 0.11 0.31 0.15 0.09 -0.31 -0.06 0.29
0.39 0.46 1.07 0.92 -0.46 -0.32 0.27 0.35 0.16 0.33 0.25 0.26 0.26 -1.45 -1.0 0.0 0.0 -1.59 -0.72 -0.36 -0.33 -0.34 0.05 -0.33 -0.12 -0.23 -0.41 -0.04 -0.19 -0.04 0.01
0.31 0.11 0.63 0.61 -0.36 0.15 -0.33 -0.68 -0.12 -0.03 0.02 0.05 0.64 -0.18 -0.09 0.42 0.24 -0.73 -0.41 -0.2 -0.05 0.02 -0.81 -0.15 0.0 0.05 0.02 -0.12 -0.3 -0.28 0.2
-1.36 -2.77 -0.36 -0.78 -1.49 -0.88 -0.42 -0.93 -0.67 0.21 -1.23 0.38 0.96 -1.88 -0.4 1.56 1.69 0.07 -0.16 0.63 0.02 0.46 - -0.56 0.23 0.72 0.35 0.11 -0.52 0.04 -0.36
0.46 0.6 0.84 0.53 -0.56 -0.35 -0.6 -1.2 -0.18 -0.07 0.05 0.23 0.46 0.75 0.07 0.31 0.34 -1.27 -0.35 -0.14 -0.1 -0.03 -2.86 -0.28 -0.09 0.15 0.01 0.02 -0.53 -0.24 0.08
-0.44 -0.26 -0.68 -0.56 -1.75 -1.28 -0.02 -0.85 -0.91 -0.43 -0.3 -0.46 0.54 -0.89 0.21 1.07 1.73 0.15 -0.0 0.48 0.01 -0.01 -4.43 0.28 0.0 0.26 0.69 0.39 -0.06 -0.18 -0.4
0.37 0.77 0.63 -0.37 -0.14 -0.28 -0.4 -0.71 -0.23 -0.16 -0.31 0.14 0.81 -0.79 -0.53 0.55 0.67 -1.0 -0.38 -0.01 -0.03 -0.2 -0.52 0.0 0.16 0.01 0.08 0.38 -0.76 -0.52 0.34
0.47 0.48 0.54 0.72 -0.98 -0.18 0.42 0.42 -0.09 0.06 -0.08 0.09 0.18 -2.7 -2.34 -0.05 0.03 -1.14 -1.18 -0.31 0.01 0.1 0.94 -0.39 0.15 0.34 0.05 0.51 -0.11 -0.13 -1.16
0.89 0.37 1.72 1.86 -0.62 -0.09 0.42 -1.02 0.22 0.37 0.22 0.5 0.08 -3.7 -2.56 0.25 0.28 -3.42 -1.54 -0.5 -0.41 -0.28 -3.6 -0.96 -0.35 -0.02 -0.27 0.46 -0.97 -0.77 -1.36
1.33 0.62 1.01 0.78 -0.39 -0.42 -0.42 -1.78 -0.08 0.1 -0.1 -0.25 -0.6 0.27 -0.31 -0.06 -0.28 -1.71 -0.53 -0.46 -0.19 -0.27 -0.52 -0.74 -0.26 0.21 -0.16 -0.03 0.17 0.56 0.3
0.83 0.35 0.8 0.74 -0.38 -0.16 -0.03 -0.34 -0.24 -0.15 0.07 0.07 0.18 -0.86 -0.56 0.24 0.12 -2.0 -0.33 -0.14 0.13 -0.05 0.12 -0.09 -0.16 0.22 0.21 0.36 -0.54 -0.43 -0.59
0.41 0.16 0.92 0.88 -1.77 -0.26 0.01 -1.09 0.04 0.14 0.12 -0.31 0.52 -6.79 -4.67 0.14 0.11 -1.53 -1.37 -0.09 0.22 0.49 0.23 -0.17 0.63 0.87 0.79 0.4 -0.6 -0.72 -0.9
-0.05 0.11 0.4 0.08 -0.07 -0.18 -0.58 -1.15 -0.23 -0.04 -0.07 0.13 0.47 0.35 0.11 0.39 0.42 -0.61 0.05 0.11 -0.11 -0.15 -1.81 -0.07 -0.04 0.17 0.18 0.34 -0.14 -0.03 0.18
0.77 0.58 1.39 0.99 -0.6 -1.04 -0.38 -0.98 -0.39 -0.4 -0.33 0.01 0.58 -1.12 -0.42 0.13 0.26 -0.69 -0.72 -0.23 -0.38 -0.36 0.42 -0.39 -0.1 0.02 -0.07 -0.36 -0.45 -0.19 0.52
0.14 0.12 0.2 -0.07 -0.09 0.12 -0.6 -1.26 -0.72 -1.05 -0.52 -0.53 0.2 0.39 0.28 0.19 -0.1 -0.98 0.18 0.38 0.27 0.33 -0.53 0.02 0.56 0.45 0.37 0.33 -0.03 -0.22 0.06
0.23 0.34 0.39 -0.1 -1.22 -1.07 -0.73 -0.86 -0.11 0.12 -0.29 0.22 0.92 -0.34 -0.18 0.52 0.51 -1.55 -0.1 0.33 0.14 0.37 -0.93 0.04 0.33 0.35 0.21 0.21 -0.63 -0.0 -0.18
0.21 0.09 0.04 -0.32 -0.94 -0.87 -0.71 -0.89 0.03 0.1 0.01 0.33 0.78 -0.2 0.03 0.7 0.89 -0.83 0.02 0.29 0.18 0.15 -1.21 -0.13 0.04 0.36 0.34 0.03 -0.62 -0.32 -0.21
1.33 0.82 1.72 1.96 -1.88 -1.87 -0.62 -0.52 0.63 0.7 0.59 0.91 0.17 -7.9 -4.8 -0.7 -0.34 -5.22 -1.65 -0.36 -0.62 -0.64 -9.24 -0.07 -0.15 -0.53 -0.62 -0.28 -0.81 -0.14 -0.77
0.67 0.74 1.68 2.1 -0.1 -0.32 -0.12 -0.95 0.06 0.38 0.13 -0.03 -0.12 -2.32 -0.68 0.17 -0.18 -1.27 -1.92 -0.92 -0.21 -0.6 -3.46 -1.31 -0.8 0.18 -0.27 -0.66 -0.17 -0.03 -0.64
-0.18 -0.31 -0.26 -0.07 -0.11 0.01 -0.09 -0.48 -0.08 0.2 0.01 0.06 0.08 -0.96 -0.44 0.14 0.12 -0.46 0.08 0.19 0.14 0.2 0.65 -0.06 0.1 0.29 0.19 0.23 -0.01 0.04 -0.03
0.92 0.37 0.72 0.77 0.45 0.35 -0.09 -0.19 0.14 0.17 0.03 0.07 -0.19 -0.67 -0.83 -0.28 -0.33 -0.59 -0.68 -0.45 -0.12 -0.15 -0.0 -0.46 -0.22 0.06 0.03 -0.22 -0.03 -0.22 -0.23
0.9 0.5 0.27 0.29 -0.77 -0.32 0.52 0.19 -0.15 -0.02 -0.14 -0.12 0.49 -0.89 -0.86 -0.36 -0.01 -0.65 -0.71 -0.13 -0.12 -0.04 0.71 -0.32 0.02 0.06 -0.05 0.21 -0.11 -0.01 -0.42
1.2 1.15 0.78 0.97 -2.21 -0.7 -0.03 -1.55 0.87 0.95 0.56 0.94 0.01 - -7.21 0.21 0.36 -7.32 -1.99 -0.26 0.24 0.11 -0.85 -0.96 -0.08 0.54 0.03 0.24 -0.81 -1.32 -4.24
0.28 0.45 0.26 -0.36 0.18 0.16 -0.39 -0.65 -0.28 -0.23 -0.17 -0.09 0.37 -0.21 -0.37 0.18 0.26 -0.54 -0.05 -0.06 0.07 0.2 -0.44 -0.09 0.11 0.38 0.34 0.26 -0.08 -0.09 -0.3
0.76 0.53 0.92 0.39 -0.36 0.36 -0.47 -1.68 0.14 0.26 0.29 0.26 0.19 -3.71 -2.04 0.61 0.43 -4.51 -0.41 0.1 0.24 0.48 -1.64 -0.2 0.24 0.67 0.53 0.37 -1.11 -0.8 -1.61
0.61 0.65 0.94 0.72 -1.24 -0.22 0.13 -0.53 0.04 0.06 0.11 -0.09 -0.41 -0.75 -0.68 0.47 0.33 -2.25 -0.16 -0.03 0.04 0.01 -2.25 -0.37 -0.02 0.43 0.33 -0.0 0.05 0.1 -0.41
0.62 0.99 0.66 0.11 0.1 -0.81 -1.22 -1.65 -0.26 -0.13 -0.34 0.2 0.74 0.13 -0.02 0.74 0.8 0.01 -0.65 -0.31 -0.37 -0.13 -1.57 -0.62 -0.22 0.02 0.01 -0.11 -0.72 -0.2 0.23
0.53 0.96 0.33 -0.14 -0.12 -0.08 -0.85 -1.05 -0.09 0.0 -0.16 0.07 0.4 -0.52 -0.62 0.18 0.06 -0.3 -0.15 -0.0 -0.05 0.1 -0.8 -0.09 0.1 0.34 0.13 -0.06 -0.2 0.1 0.28
1.09 0.53 1.42 0.48 -0.24 -0.67 -1.29 -2.31 -0.1 0.01 -0.0 0.22 -0.09 -1.38 -1.38 0.16 0.47 -2.62 -0.96 -0.05 0.19 0.27 -2.24 -0.24 0.02 0.44 0.27 0.15 0.03 0.16 0.11
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0.79 0.36 0.83 1.08 0.44 0.1 -0.54 -1.04 0.18 0.26 0.2 0.23 0.22 -0.85 -0.56 0.03 0.02 -0.54 -0.71 -0.23 -0.17 -0.18 -0.22 -0.45 -0.28 -0.14 -0.28 -0.06 -0.25 -0.19 -0.61
0.52 0.25 0.42 -0.33 0.01 -0.03 -0.32 -0.85 -0.37 -0.19 -0.19 0.01 0.66 -0.48 -0.48 -0.02 0.31 -0.68 0.14 0.13 -0.02 0.25 -2.02 0.14 0.18 0.23 0.22 0.51 -0.15 -0.13 0.11
0.32 0.44 0.54 0.65 -0.46 0.4 -0.33 -0.52 -0.2 -0.48 -0.43 -0.31 0.04 0.4 0.34 0.33 0.15 -0.54 -0.23 -0.49 -0.21 -0.07 0.41 -0.37 -0.51 0.03 -0.13 -0.36 0.1 -0.18 0.21
0.96 0.1 1.86 1.5 -1.16 -0.86 -0.85 -2.0 -0.06 0.12 0.32 0.55 -0.23 -3.43 -2.57 -0.64 -0.17 -1.3 -0.64 -0.39 -0.81 -0.14 -0.94 -0.09 -0.28 0.09 0.17 -0.28 -0.03 0.47 0.47
0.42 0.16 0.45 0.48 -0.65 0.01 -0.04 -0.51 -0.46 -0.58 -0.53 -0.63 0.25 0.69 0.56 0.72 0.71 -0.7 -0.33 -0.24 -0.09 -0.19 0.52 -0.35 -0.25 -0.02 -0.04 0.41 -0.95 -0.9 -0.54
0.88 0.6 1.23 1.08 -0.09 -0.54 -0.53 -1.12 0.26 0.4 0.56 0.85 -0.02 -0.23 -0.83 -0.27 0.13 -2.33 -0.93 -0.26 -0.06 0.07 -3.86 -0.38 -0.26 0.28 0.06 -0.14 -0.93 -0.73 -0.44
0.76 0.47 1.02 0.65 -0.26 -0.46 -0.49 -0.63 -0.16 -0.12 -0.19 -0.02 0.23 -0.78 -0.9 -0.05 0.16 -0.48 -0.42 -0.15 -0.18 -0.08 -0.17 -0.21 0.03 0.12 0.1 -0.04 -0.24 0.05 0.44
0.87 0.55 1.2 0.92 -0.3 -0.13 -0.63 -0.85 0.17 0.24 0.21 0.33 -0.54 -0.03 -0.46 -0.21 -0.39 -1.09 -0.67 -0.37 -0.08 -0.51 -0.31 -0.16 -0.37 -0.39 -0.23 -0.35 -0.05 0.15 0.47
0.64 0.03 0.64 0.48 -0.35 -0.33 -0.52 -0.78 0.04 -0.02 0.08 0.18 0.7 0.02 -0.28 0.36 0.47 -1.75 -0.43 0.02 -0.11 -0.06 -1.81 -0.13 -0.02 0.06 -0.01 0.17 -0.3 -0.05 0.27
1.22 0.36 0.71 0.53 -1.16 -0.19 0.97 0.02 -0.03 -0.13 -0.33 -0.16 0.66 -1.55 -0.92 -0.07 -0.03 -0.59 -1.08 -0.49 -0.17 -0.2 0.61 -0.45 -0.23 0.15 -0.22 0.3 -0.67 -0.51 -0.35
0.63 0.84 0.75 0.04 -0.35 -0.34 -0.23 -0.64 -0.16 -0.13 -0.12 0.08 0.6 -1.33 -0.61 0.41 0.46 -1.31 -0.11 0.13 0.06 -0.01 -4.01 0.05 0.18 0.15 0.18 -0.02 -0.22 -0.06 0.13
0.2 -0.24 0.53 -0.11 -0.75 -0.62 -0.45 -0.81 -0.16 0.06 -0.07 0.19 0.57 0.14 -0.22 0.75 0.92 -1.54 -0.42 0.1 -0.01 0.08 -1.89 -0.23 0.08 0.43 0.33 0.28 -0.51 -0.07 0.23
0.1 -0.02 0.29 0.27 0.09 0.38 0.28 0.34 -0.08 0.01 0.03 0.01 -0.11 -2.49 -1.86 0.21 0.13 -1.75 0.03 0.01 0.04 0.07 0.55 0.11 0.15 0.16 0.09 0.13 0.04 0.12 -0.7
0.52 0.56 0.91 0.87 -0.41 -0.19 -0.02 -0.23 0.18 0.18 0.21 0.32 0.41 -1.68 -1.27 0.34 0.2 -1.54 -0.87 -0.31 0.03 0.01 -0.68 -0.34 -0.05 0.14 -0.1 0.22 -0.46 -0.04 -0.42
0.4 -0.04 0.82 0.85 0.06 -0.1 -0.23 -0.78 0.54 0.58 0.47 0.5 -0.11 -0.41 -0.2 0.31 0.24 -5.76 -0.28 0.08 0.23 0.22 -5.36 -0.71 -0.31 0.01 0.06 0.03 -0.07 -0.23 -1.07
1.06 0.39 1.12 0.85 -0.38 -0.35 -0.46 -0.84 0.19 0.2 0.25 0.18 -0.09 -2.59 -1.71 0.25 0.12 -1.86 -0.42 -0.03 0.14 0.3 -1.86 -0.0 0.18 0.3 0.24 0.49 -0.79 -0.46 -0.67
0.58 0.54 0.55 -0.19 -0.52 -0.38 -0.67 -1.0 -0.31 -0.14 -0.05 0.32 0.2 0.59 -0.05 -0.05 0.3 -0.73 -0.17 -0.32 -0.21 -0.03 -0.49 -0.21 -0.22 0.21 -0.01 0.39 -0.02 0.14 0.31
0.8 0.36 0.85 0.74 0.06 0.02 -0.61 -1.35 0.28 0.14 0.45 0.12 -0.42 -0.52 -0.64 0.01 -0.3 -0.03 -0.48 -0.32 -0.09 -0.12 -0.31 -0.46 -0.42 -0.04 0.03 -0.59 0.1 0.27 0.21
1.36 0.72 1.3 0.78 -0.84 -0.33 0.04 -0.75 -0.19 0.06 -0.36 -0.15 0.47 -0.68 -1.1 0.1 0.28 -1.09 -0.99 -0.38 0.17 -0.05 -1.03 -0.35 0.02 0.02 -0.02 0.57 -0.25 -0.98 -1.64
0.25 0.37 0.6 0.08 0.07 0.0 -0.43 -0.75 -0.23 -0.01 -0.01 0.03 0.48 -0.01 -0.09 0.16 0.21 -0.51 -0.05 -0.05 -0.18 -0.09 -0.75 -0.09 -0.06 -0.0 0.03 -0.05 -0.01 0.02 0.21
0.53 1.04 0.77 0.57 -0.26 0.17 0.14 -0.34 0.49 0.26 0.17 0.2 0.16 -0.41 0.03 0.53 0.26 -2.01 -0.3 0.06 0.05 0.18 -1.12 -0.66 -0.32 -0.14 -0.3 -0.35 -1.32 -1.61 -0.58
0.51 0.7 0.39 0.17 -0.46 0.01 -0.07 -0.6 -0.36 -0.4 -0.19 -0.35 0.62 -0.31 -0.16 0.86 0.63 -0.8 -0.4 -0.21 0.22 0.17 -0.57 -0.31 -0.08 0.26 0.02 0.5 -0.93 -0.54 -0.69
0.59 0.23 1.0 1.1 -0.3 -0.15 -0.14 -0.69 0.49 0.56 0.34 0.38 0.13 -2.55 -1.33 0.2 0.16 -2.29 -0.6 -0.04 0.16 0.12 -2.66 -0.09 0.03 0.17 0.13 0.3 -0.57 -0.26 -1.23
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-0.21 -0.05 0.28 0.11 -0.48 -0.3 -0.22 0.02 -0.18 -0.21 -0.07 0.31 1.16 -0.03 -0.26 0.45 0.35 -0.25 -0.38 -0.33 -0.27 -0.27 -0.32 0.04 -0.23 -0.25 0.03 -0.07 -0.32 -0.05 0.6
0.79 0.55 1.05 1.23 -0.33 -0.18 0.33 0.11 0.21 0.37 0.27 0.37 -0.06 -2.8 -1.86 -0.14 -0.01 -3.25 -0.69 -0.2 -0.11 -0.06 -1.2 -0.23 -0.03 0.04 -0.13 0.08 -0.22 -0.06 -0.77
0.04 -0.18 0.68 -0.27 -0.52 -0.65 -0.53 -0.65 0.01 -0.04 0.07 0.32 1.07 -0.68 -0.34 0.91 0.95 -0.95 -0.69 -0.06 -0.12 -0.21 -1.81 -0.16 -0.05 0.18 0.05 0.11 -0.53 0.05 0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.