Heatmap: Cluster_136 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.55 0.78 0.89 1.0 0.87 0.65 0.39 0.53 0.53 0.56 0.65 0.45 0.11 0.59 0.66 0.48 0.31 0.01 0.49 0.43 0.41 0.43 0.08 0.25 0.27 0.47 0.48 0.26 0.58 0.48 0.35
0.9 0.8 0.73 0.71 0.72 0.85 0.91 1.0 0.63 0.64 0.66 0.66 0.69 0.62 0.63 0.75 0.68 0.49 0.67 0.66 0.72 0.8 0.83 0.73 0.75 0.75 0.72 0.73 0.71 0.74 0.7
0.7 0.52 0.87 1.0 0.89 0.87 0.58 0.62 0.6 0.55 0.68 0.56 0.37 0.48 0.5 0.58 0.42 0.22 0.53 0.44 0.47 0.57 0.27 0.48 0.45 0.54 0.59 0.43 0.56 0.54 0.59
0.65 0.57 0.83 1.0 0.4 0.65 0.51 0.43 0.57 0.52 0.59 0.5 0.39 0.19 0.24 0.54 0.44 0.53 0.68 0.48 0.53 0.52 0.1 0.43 0.53 0.62 0.57 0.46 0.34 0.35 0.29
0.9 0.8 0.7 0.69 0.6 0.64 0.92 1.0 0.76 0.72 0.75 0.74 0.69 0.79 0.8 0.65 0.7 0.17 0.72 0.71 0.72 0.74 0.56 0.75 0.71 0.69 0.77 0.87 0.57 0.54 0.45
0.97 0.97 0.91 0.76 0.54 1.0 0.77 0.71 0.46 0.45 0.48 0.43 0.51 0.51 0.48 0.58 0.45 0.04 0.52 0.41 0.53 0.55 0.6 0.46 0.51 0.59 0.53 0.55 0.6 0.52 0.36
0.68 0.65 0.88 1.0 0.89 0.7 0.4 0.36 0.54 0.55 0.57 0.5 0.43 0.38 0.43 0.46 0.36 0.14 0.35 0.35 0.41 0.39 0.21 0.36 0.4 0.42 0.42 0.39 0.6 0.59 0.45
1.0 0.73 0.78 0.78 0.62 0.74 0.78 0.75 0.65 0.67 0.66 0.71 0.74 0.63 0.59 0.69 0.73 0.18 0.62 0.67 0.67 0.66 0.45 0.75 0.71 0.72 0.73 0.78 0.51 0.47 0.32
1.0 0.93 0.75 0.48 0.43 0.53 0.67 0.8 0.36 0.38 0.39 0.41 0.59 0.56 0.47 0.43 0.47 0.13 0.39 0.42 0.46 0.45 0.56 0.43 0.42 0.46 0.43 0.51 0.33 0.3 0.24
1.0 0.91 0.9 0.83 0.94 0.81 0.78 0.75 0.72 0.71 0.73 0.66 0.46 0.38 0.41 0.57 0.51 0.19 0.47 0.51 0.58 0.63 0.3 0.52 0.56 0.64 0.64 0.67 0.6 0.58 0.38
0.78 0.68 0.69 0.66 0.76 0.91 0.63 0.53 0.64 0.61 0.59 0.53 0.53 0.39 0.45 0.69 0.54 0.27 0.45 0.46 0.55 0.54 1.0 0.51 0.54 0.55 0.56 0.53 0.58 0.61 0.39
0.83 0.98 1.0 0.93 0.98 0.8 0.8 0.74 0.81 0.8 0.85 0.78 0.43 0.27 0.51 0.71 0.64 0.05 0.7 0.68 0.69 0.64 0.08 0.64 0.64 0.69 0.7 0.62 0.68 0.65 0.45
0.64 0.87 0.81 0.82 0.96 0.93 0.82 0.62 0.86 0.79 0.82 0.73 0.49 0.68 0.73 0.81 0.71 0.43 0.78 0.73 0.65 0.7 0.19 0.68 0.74 0.77 0.76 0.64 1.0 1.0 0.94
0.75 0.78 0.67 0.59 0.77 1.0 0.93 0.89 0.69 0.66 0.67 0.62 0.44 0.55 0.48 0.64 0.61 0.21 0.74 0.64 0.73 0.82 0.54 0.69 0.77 0.82 0.81 0.74 0.83 0.73 0.58
1.0 0.74 0.7 0.66 0.54 0.53 0.71 0.91 0.62 0.59 0.63 0.67 0.73 0.5 0.48 0.58 0.64 0.13 0.58 0.59 0.6 0.6 0.58 0.67 0.64 0.56 0.57 0.75 0.49 0.51 0.45
0.75 1.0 0.95 0.78 0.79 0.56 0.65 0.65 0.64 0.67 0.65 0.47 0.19 0.4 0.39 0.56 0.42 0.01 0.51 0.65 0.68 0.63 0.0 0.31 0.39 0.69 0.77 0.52 0.33 0.42 0.29
1.0 0.95 0.92 0.88 0.94 0.81 0.88 0.87 0.84 0.79 0.83 0.76 0.43 0.49 0.61 0.86 0.76 0.43 0.72 0.74 0.72 0.76 0.22 0.6 0.64 0.79 0.77 0.92 0.37 0.42 0.38
0.39 0.39 0.51 0.52 0.61 1.0 0.53 0.49 0.38 0.39 0.42 0.35 0.33 0.18 0.26 0.53 0.36 0.18 0.32 0.33 0.44 0.5 0.57 0.33 0.4 0.52 0.5 0.54 0.37 0.34 0.21
1.0 0.84 0.78 0.64 0.82 0.87 0.66 0.72 0.5 0.49 0.54 0.48 0.57 0.62 0.64 0.68 0.57 0.46 0.67 0.54 0.56 0.53 0.85 0.5 0.54 0.6 0.62 0.61 0.62 0.55 0.47
0.88 0.78 1.0 1.0 0.93 0.83 0.67 0.52 0.82 0.83 0.85 0.83 0.7 0.7 0.68 0.81 0.71 0.56 0.83 0.67 0.65 0.69 0.51 0.63 0.65 0.78 0.76 0.62 0.73 0.83 0.85
0.64 0.67 0.85 0.81 0.74 0.99 0.74 0.55 0.74 0.94 0.93 1.0 0.76 0.2 0.35 0.81 0.81 0.18 0.35 0.56 0.63 0.69 0.39 0.61 0.81 0.65 0.77 0.77 0.48 0.6 0.45
0.7 0.7 0.77 0.9 0.73 0.94 0.97 1.0 0.61 0.69 0.63 0.63 0.74 0.75 0.67 0.71 0.71 0.33 0.65 0.66 0.69 0.77 0.37 0.75 0.77 0.8 0.72 0.8 0.76 0.74 0.7
1.0 0.78 0.74 0.68 0.61 0.67 0.84 0.79 0.59 0.59 0.61 0.56 0.57 0.48 0.51 0.72 0.62 0.17 0.48 0.55 0.62 0.63 0.68 0.52 0.58 0.66 0.63 0.59 0.54 0.53 0.32
0.84 0.77 0.93 0.93 0.63 1.0 0.88 0.65 0.75 0.7 0.74 0.58 0.51 0.32 0.41 0.75 0.58 0.19 0.41 0.48 0.64 0.66 0.46 0.51 0.58 0.71 0.69 0.58 0.79 0.78 0.46
0.24 0.33 0.48 1.0 0.42 0.3 0.29 0.3 0.38 0.32 0.4 0.25 0.25 0.14 0.2 0.35 0.25 0.15 0.31 0.39 0.34 0.32 0.01 0.17 0.25 0.42 0.53 0.24 0.25 0.27 0.42
0.91 0.89 0.81 0.78 0.83 1.0 0.55 0.34 0.38 0.37 0.46 0.31 0.27 0.29 0.34 0.55 0.38 0.12 0.31 0.34 0.51 0.48 0.86 0.27 0.41 0.5 0.5 0.51 0.51 0.4 0.17
1.0 0.73 0.73 0.57 0.76 0.69 0.13 0.07 0.23 0.18 0.2 0.16 0.22 0.23 0.21 0.24 0.14 0.15 0.28 0.18 0.19 0.16 0.32 0.18 0.19 0.26 0.22 0.22 0.27 0.29 0.17
1.0 0.85 0.93 0.9 0.98 0.86 0.66 0.7 0.85 0.82 0.82 0.82 0.66 0.75 0.64 0.69 0.72 0.21 0.62 0.64 0.68 0.69 0.56 0.72 0.72 0.63 0.71 0.96 0.78 0.73 0.44
0.86 0.99 0.92 0.95 1.0 0.97 0.85 0.66 0.51 0.54 0.63 0.52 0.48 0.32 0.35 0.68 0.58 0.21 0.56 0.52 0.68 0.72 0.65 0.49 0.66 0.8 0.73 0.73 0.73 0.59 0.57
0.53 0.73 0.87 0.94 0.59 0.75 0.56 0.39 0.7 0.67 0.77 0.69 0.6 0.82 0.54 0.66 0.55 0.21 0.47 0.5 0.59 0.69 0.17 0.55 0.66 0.77 0.7 0.6 1.0 0.9 0.76
0.92 0.94 0.79 0.66 0.76 0.57 0.81 0.78 0.66 0.64 0.64 0.56 0.41 0.63 0.7 0.57 0.54 0.14 0.62 0.55 0.58 0.58 1.0 0.63 0.62 0.59 0.58 0.53 0.7 0.65 0.54
1.0 0.86 0.99 0.7 0.5 0.54 0.84 0.95 0.16 0.16 0.17 0.16 0.46 0.3 0.26 0.3 0.36 0.22 0.22 0.21 0.27 0.3 0.33 0.28 0.27 0.31 0.26 0.25 0.39 0.29 0.37
0.66 0.49 0.62 0.68 0.55 1.0 0.84 0.57 0.64 0.62 0.72 0.51 0.36 0.62 0.69 0.75 0.58 0.35 0.57 0.61 0.66 0.75 0.46 0.53 0.6 0.82 0.85 0.59 0.55 0.59 0.43
0.83 0.98 0.93 1.0 0.67 0.71 0.85 0.81 0.61 0.55 0.63 0.53 0.49 0.4 0.48 0.71 0.62 0.23 0.57 0.61 0.69 0.64 0.3 0.53 0.57 0.73 0.74 0.56 0.51 0.53 0.56
0.95 0.95 0.71 0.63 0.57 1.0 0.69 0.49 0.55 0.57 0.64 0.44 0.44 0.36 0.31 0.59 0.47 0.31 0.43 0.37 0.51 0.55 0.36 0.5 0.5 0.6 0.58 0.47 0.68 0.64 0.47
0.62 0.67 0.71 1.0 0.83 0.87 0.54 0.31 0.15 0.2 0.23 0.22 0.41 0.42 0.35 0.41 0.42 0.18 0.34 0.3 0.49 0.48 0.13 0.35 0.53 0.58 0.54 0.62 0.35 0.22 0.29
1.0 0.97 0.64 0.35 0.44 0.58 0.59 0.49 0.36 0.34 0.38 0.31 0.43 0.59 0.57 0.61 0.55 0.28 0.44 0.38 0.46 0.47 0.6 0.36 0.41 0.51 0.51 0.49 0.46 0.42 0.33
1.0 0.98 0.86 0.9 0.92 0.86 0.88 0.81 0.84 0.81 0.87 0.82 0.74 0.72 0.78 0.84 0.79 0.23 0.85 0.77 0.81 0.82 0.89 0.82 0.84 0.81 0.78 0.78 0.83 0.81 0.82
0.67 0.87 1.0 1.0 0.8 0.71 0.8 0.75 0.76 0.79 0.75 0.68 0.33 0.11 0.32 0.73 0.62 0.07 0.61 0.67 0.66 0.63 0.05 0.55 0.61 0.65 0.65 0.61 0.7 0.69 0.36
0.65 0.89 0.99 1.0 0.95 0.82 0.82 0.74 0.77 0.79 0.75 0.66 0.36 0.19 0.42 0.77 0.64 0.09 0.64 0.68 0.67 0.65 0.05 0.59 0.65 0.67 0.66 0.62 0.84 0.83 0.47
0.91 0.7 0.72 0.76 0.6 0.87 0.6 0.52 0.52 0.53 0.53 0.57 0.54 0.65 0.44 0.58 0.48 0.49 0.59 0.52 0.63 0.61 1.0 0.7 0.64 0.7 0.65 0.64 0.71 0.64 0.54
1.0 0.93 0.91 0.82 0.81 0.94 0.97 0.87 0.72 0.72 0.75 0.69 0.74 0.74 0.68 0.75 0.68 0.48 0.63 0.6 0.71 0.73 0.96 0.66 0.72 0.77 0.71 0.76 0.76 0.74 0.7
0.71 0.75 0.9 1.0 0.86 0.99 0.76 0.57 0.78 0.73 0.85 0.6 0.38 0.7 0.72 0.71 0.47 0.21 0.58 0.62 0.69 0.61 0.22 0.54 0.59 0.72 0.75 0.58 0.85 0.8 0.54
0.52 0.81 0.82 1.0 0.47 0.46 0.46 0.32 0.39 0.42 0.47 0.33 0.18 0.1 0.13 0.18 0.13 0.22 0.57 0.52 0.45 0.36 0.16 0.36 0.38 0.5 0.48 0.26 0.26 0.22 0.25
0.76 0.85 0.92 1.0 0.94 0.89 0.94 0.86 0.78 0.79 0.84 0.74 0.57 0.61 0.69 0.81 0.74 0.29 0.54 0.63 0.69 0.71 0.9 0.56 0.66 0.66 0.72 0.67 0.78 0.77 0.6
1.0 0.72 0.85 0.7 0.69 0.68 0.55 0.51 0.44 0.42 0.45 0.45 0.53 0.6 0.61 0.58 0.48 0.18 0.41 0.41 0.43 0.47 0.37 0.41 0.42 0.46 0.5 0.48 0.5 0.49 0.52
0.73 0.59 0.67 0.96 0.71 1.0 0.76 0.54 0.56 0.55 0.51 0.48 0.62 0.52 0.38 0.68 0.61 0.38 0.48 0.6 0.63 0.62 0.46 0.59 0.65 0.75 0.7 0.84 0.6 0.66 0.59
0.35 0.6 0.75 1.0 0.31 0.21 0.19 0.12 0.35 0.32 0.27 0.24 0.13 0.09 0.09 0.17 0.17 0.08 0.5 0.49 0.33 0.33 0.26 0.39 0.42 0.41 0.45 0.35 0.3 0.33 0.53
0.97 0.93 0.94 1.0 0.88 0.87 0.78 0.72 0.81 0.8 0.83 0.72 0.55 0.52 0.65 0.78 0.75 0.12 0.91 0.75 0.76 0.79 0.14 0.76 0.75 0.84 0.79 0.75 0.94 0.86 0.67
0.79 0.87 0.94 1.0 0.51 0.64 0.84 0.72 0.8 0.86 0.83 0.75 0.57 0.18 0.31 0.67 0.65 0.14 0.53 0.6 0.67 0.67 0.14 0.55 0.63 0.75 0.68 0.66 0.63 0.64 0.39
0.82 0.82 1.0 0.93 0.5 0.82 0.83 0.71 0.62 0.66 0.62 0.6 0.55 0.26 0.35 0.74 0.62 0.06 0.43 0.5 0.64 0.65 0.27 0.57 0.65 0.67 0.65 0.73 0.46 0.46 0.26
0.78 0.82 0.93 1.0 0.99 0.91 0.48 0.61 0.72 0.7 0.8 0.76 0.51 0.76 0.77 0.73 0.65 0.37 0.6 0.63 0.69 0.68 0.19 0.59 0.62 0.77 0.8 0.58 0.95 0.85 0.72
0.65 0.66 0.92 1.0 0.66 0.68 0.42 0.29 0.69 0.63 0.57 0.55 0.31 0.58 0.5 0.5 0.46 0.23 0.36 0.45 0.48 0.47 0.49 0.44 0.45 0.45 0.43 0.5 0.47 0.51 0.46
0.87 0.93 0.92 0.87 1.0 0.96 0.82 0.82 0.7 0.7 0.68 0.63 0.46 0.49 0.58 0.67 0.64 0.1 0.84 0.7 0.74 0.73 0.23 0.69 0.71 0.7 0.72 0.68 0.81 0.78 0.54
0.75 0.86 0.81 0.89 1.0 0.9 0.52 0.57 0.6 0.51 0.67 0.47 0.6 0.58 0.68 0.69 0.58 0.35 0.65 0.62 0.57 0.61 0.37 0.51 0.69 0.72 0.63 0.64 0.56 0.56 0.54
0.46 0.81 0.89 1.0 0.66 0.9 0.97 0.94 0.82 0.71 0.79 0.53 0.18 0.13 0.25 0.68 0.61 0.01 0.62 0.62 0.77 0.79 0.0 0.53 0.71 0.98 0.87 0.53 0.72 0.7 0.45
0.72 0.88 0.59 0.96 0.9 0.93 0.96 1.0 0.84 0.8 0.83 0.91 0.98 0.6 0.63 0.71 0.72 0.26 0.67 0.69 0.81 0.8 0.6 0.77 0.89 0.91 0.83 0.97 0.76 0.64 0.55
1.0 0.78 0.72 0.55 0.44 0.75 0.73 0.78 0.41 0.4 0.43 0.43 0.62 0.46 0.36 0.57 0.54 0.15 0.49 0.46 0.55 0.57 0.47 0.54 0.58 0.58 0.54 0.7 0.41 0.42 0.3
0.86 0.66 0.55 0.83 0.65 0.99 1.0 0.99 0.54 0.57 0.69 0.52 0.49 0.36 0.23 0.61 0.51 0.15 0.54 0.59 0.66 0.71 0.1 0.59 0.57 0.65 0.7 0.6 0.68 0.58 0.3
0.69 0.68 0.82 0.94 0.79 0.93 0.57 1.0 0.59 0.69 0.65 0.7 0.32 0.49 0.44 0.78 0.54 0.07 0.66 0.58 0.69 0.81 0.14 0.6 0.68 0.9 0.9 0.78 0.85 0.74 0.35
1.0 0.79 0.8 0.73 0.54 0.6 0.86 0.98 0.69 0.68 0.72 0.77 0.77 0.52 0.56 0.67 0.69 0.31 0.62 0.7 0.68 0.67 0.76 0.77 0.69 0.65 0.63 0.73 0.62 0.69 0.64
0.96 0.74 1.0 0.62 0.43 0.63 0.6 0.65 0.45 0.43 0.52 0.54 0.46 0.63 0.51 0.61 0.58 0.25 0.48 0.42 0.45 0.48 0.64 0.43 0.48 0.55 0.52 0.54 0.53 0.53 0.53
1.0 0.73 0.64 0.56 0.59 0.45 0.68 0.85 0.49 0.48 0.52 0.52 0.52 0.51 0.43 0.39 0.43 0.2 0.49 0.46 0.5 0.52 0.67 0.49 0.48 0.47 0.47 0.66 0.42 0.35 0.23
0.75 0.78 0.91 0.99 0.77 0.95 0.92 0.96 0.73 0.81 0.71 0.75 1.0 0.68 0.48 0.73 0.85 0.55 0.62 0.67 0.73 0.81 0.52 0.69 0.82 0.9 0.85 0.95 0.72 0.75 0.64
1.0 0.84 0.75 0.71 0.64 0.62 0.77 0.88 0.65 0.65 0.68 0.69 0.71 0.68 0.71 0.65 0.63 0.36 0.73 0.66 0.66 0.67 0.74 0.67 0.67 0.64 0.63 0.78 0.63 0.59 0.54
0.96 0.92 0.97 1.0 0.89 0.85 0.54 0.39 0.51 0.53 0.58 0.49 0.42 0.55 0.55 0.55 0.49 0.34 0.48 0.4 0.47 0.53 0.82 0.41 0.46 0.54 0.57 0.57 0.58 0.51 0.54
0.59 0.38 0.79 0.99 0.83 0.72 0.51 0.46 0.63 0.92 0.82 0.6 0.79 0.61 0.74 0.94 0.7 0.22 0.61 0.49 0.6 0.7 0.15 0.53 0.58 0.65 0.81 0.54 1.0 0.93 0.87
0.64 0.62 0.75 0.88 0.86 1.0 0.67 0.55 0.77 0.76 0.69 0.65 0.78 0.59 0.57 0.83 0.69 0.37 0.5 0.61 0.67 0.76 0.5 0.58 0.76 0.83 0.81 0.79 0.58 0.62 0.62
0.83 0.67 0.81 0.88 0.61 1.0 0.78 0.48 0.83 0.84 0.82 0.68 0.56 0.34 0.38 0.78 0.74 0.27 0.52 0.64 0.83 0.76 0.35 0.65 0.76 0.74 0.82 1.0 0.57 0.6 0.44
1.0 0.62 0.52 0.68 0.23 0.33 1.0 0.8 0.13 0.34 0.14 0.11 0.2 0.08 0.17 0.38 0.3 0.14 0.19 0.23 0.51 0.3 0.03 0.34 0.31 0.47 0.3 0.47 0.19 0.14 0.01
0.92 1.0 0.96 0.72 0.87 0.96 0.93 0.9 0.7 0.73 0.73 0.63 0.39 0.38 0.64 0.73 0.62 0.39 0.73 0.65 0.71 0.74 0.02 0.55 0.54 0.67 0.67 0.74 0.54 0.4 0.19
0.94 0.93 0.96 0.96 0.83 1.0 0.81 0.73 0.64 0.62 0.71 0.61 0.63 0.74 0.74 0.79 0.65 0.22 0.64 0.55 0.67 0.67 0.46 0.6 0.65 0.74 0.72 0.63 0.78 0.74 0.65
1.0 0.82 0.66 0.52 0.58 0.57 0.62 0.66 0.53 0.49 0.52 0.51 0.41 0.38 0.43 0.45 0.44 0.38 0.5 0.47 0.52 0.56 0.72 0.51 0.5 0.54 0.55 0.56 0.46 0.44 0.4
0.85 0.87 0.96 0.96 1.0 0.81 0.72 0.51 0.99 0.97 0.94 0.86 0.52 0.19 0.37 0.8 0.78 0.21 0.74 0.82 0.81 0.91 0.14 0.74 0.74 0.81 0.75 0.8 0.79 0.76 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)