Heatmap: Cluster_72 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_16260.1 (ARC6)	-0.06	-0.14	0.02	0.17	0.13	0.17	-0.24	-0.05	-0.13	-0.13	0.08	-0.07	0.17	0.6	0.3	0.06	-0.04	-1.52	0.07	-0.1	-0.04	-0.04	-0.89	-0.0	-0.03	-0.02	-0.12	-0.1	0.28	0.17	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_18841.1 (ERDL6)	0.46	0.13	1.1	1.13	-0.09	0.23	0.21	0.54	-0.34	-0.24	-0.27	-0.24	0.56	-0.08	-0.31	0.0	-0.02	-0.6	-0.38	-0.54	-0.34	-0.26	-1.07	-0.62	-0.25	-0.21	-0.26	-0.04	-0.14	-0.25	-0.33
Lsat_1_v5_gn_1_19040.1	-0.02	0.19	0.17	0.12	-0.56	-0.47	0.26	0.27	0.16	0.02	-0.14	0.1	-0.43	-0.34	0.02	0.19	0.25	-1.08	0.07	0.16	0.04	-0.08	-3.98	0.07	0.15	-0.03	-0.08	-0.25	0.27	0.58	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_24560.1	0.49	0.74	-0.02	-0.2	-0.01	-0.45	0.54	1.43	0.35	0.19	0.26	0.64	-0.15	-0.86	-0.78	-0.43	-0.45	-1.95	-0.3	-0.07	-0.13	-0.19	-2.24	-0.06	-0.03	-0.22	-0.07	-0.14	-0.09	0.03	-0.21
Lsat_1_v5_gn_1_25540.1 (UGT85A2)	-1.49	-0.06	-1.25	-0.38	0.71	-0.3	1.29	2.35	0.27	-0.25	0.26	0.68	-1.51	-0.06	-0.77	-1.0	-1.85	-1.16	0.06	-0.33	-0.95	-0.93	-0.95	-0.06	-0.11	-1.71	-0.38	-1.54	-0.04	0.51	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_25820.1	-0.27	-0.24	-0.05	0.35	0.53	0.22	-0.32	0.41	0.16	0.2	0.42	0.59	-0.11	0.03	-0.1	0.06	0.06	-2.75	-0.01	-0.23	-0.32	-0.04	-3.9	0.12	-0.07	-0.09	0.02	0.11	-0.17	0.19	0.4
Lsat_1_v5_gn_1_28480.1 (CYP71A24)	0.35	0.51	-0.3	-1.49	0.05	0.55	0.76	0.66	-0.03	-0.16	-0.11	-0.36	-0.57	-1.54	-0.68	-0.03	-0.05	-1.08	-0.04	-0.24	0.03	-0.14	-0.33	0.13	-0.08	-0.0	-0.07	0.08	0.28	0.5	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_42040.1	-0.9	-1.36	-0.13	-0.62	-0.61	0.39	0.92	1.1	-0.28	-0.43	0.09	-0.3	0.15	-0.31	0.28	-0.12	-0.47	0.16	-0.55	-1.3	-0.82	-0.57	0.65	-0.41	-0.31	-0.26	-0.51	-0.89	0.22	0.8	1.44
Lsat_1_v5_gn_1_82941.1 (UGT85A5)	-0.15	-0.22	0.12	0.33	-0.22	0.2	0.59	1.27	-0.27	0.1	-0.03	0.21	0.19	-0.47	-0.71	-0.1	-0.05	-4.17	-0.65	-0.3	-0.21	-0.04	-1.0	0.36	0.18	0.06	-0.1	0.18	-0.13	0.0	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_83900.1 (SEC10)	-1.18	-0.26	-0.19	-0.41	-1.11	-0.95	0.96	0.84	-0.5	-0.4	-0.58	0.11	-0.3	-0.82	-1.32	0.05	0.16	-1.21	0.11	-0.66	-0.3	-0.19	-3.42	0.28	0.09	-0.34	0.03	-0.94	0.98	1.58	1.44
Lsat_1_v5_gn_1_9700.1 (AMK2)	0.14	0.26	0.2	0.02	-0.09	-0.27	0.11	0.31	0.22	0.22	0.27	0.4	0.03	-0.15	-0.16	-0.27	-0.11	-1.3	-0.15	-0.06	-0.13	-0.06	-0.9	0.08	-0.02	0.06	-0.07	-0.1	0.09	0.1	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_105800.1	-0.19	-0.36	0.01	0.13	-0.41	-0.17	0.02	0.16	0.22	0.16	0.53	0.29	0.11	-0.74	-0.31	0.1	-0.06	-1.85	0.04	0.0	0.14	-0.08	-1.82	0.24	0.2	0.13	0.28	0.1	-0.24	0.43	0.54
Lsat_1_v5_gn_2_111701.1 (ALB1)	0.18	-0.11	0.18	0.32	-0.22	0.01	0.2	0.12	0.07	0.15	0.22	0.24	0.62	-0.64	-0.55	0.28	0.35	-1.09	-0.29	-0.03	-0.07	-0.0	-2.25	0.15	0.16	-0.01	-0.06	0.3	-0.33	-0.08	0.02
Lsat_1_v5_gn_2_135080.1 (PLR1)	0.39	0.07	0.29	0.43	-0.55	-0.41	0.05	0.19	0.15	0.13	0.24	0.41	0.5	-0.28	-0.29	0.17	0.21	-1.79	-0.35	-0.01	-0.08	-0.03	-0.81	0.24	0.19	-0.08	-0.11	0.23	-0.47	-0.28	-0.09
Lsat_1_v5_gn_2_136301.1 (AME3)	-0.91	-0.57	-0.39	0.08	-0.74	0.0	0.44	1.04	-0.25	-0.44	0.03	-0.31	-0.55	0.82	0.58	0.09	-0.24	-0.35	0.16	-0.37	-0.39	-0.24	0.2	-0.48	-0.31	0.04	-0.06	-0.71	0.19	0.22	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_136381.1	0.33	0.12	0.45	0.42	-0.17	-0.1	0.4	0.25	0.0	0.07	0.02	-0.1	0.09	-0.44	-0.25	0.14	0.17	-1.26	-0.29	-0.21	-0.17	-0.18	-0.81	-0.27	-0.05	0.02	0.02	-0.06	0.18	0.32	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_15080.1	-0.03	-0.08	0.04	0.2	0.14	0.12	-0.09	-0.01	0.19	0.23	0.26	0.11	0.08	0.33	0.14	-0.06	-0.11	-1.67	-0.11	-0.08	-0.04	-0.02	-1.73	-0.04	-0.04	0.01	-0.05	-0.11	0.14	0.22	0.4
Lsat_1_v5_gn_2_36140.1 (PGR3)	0.34	0.07	-0.06	0.18	0.19	0.11	0.04	0.47	-0.1	-0.02	0.14	0.2	-0.13	0.23	-0.06	-0.16	-0.27	-1.8	-0.11	-0.42	-0.31	-0.11	-0.69	0.08	0.01	-0.2	-0.18	-0.15	0.12	0.35	0.71
Lsat_1_v5_gn_2_88141.1	0.43	-0.35	-0.28	0.12	-0.03	0.38	-0.18	-0.06	-0.02	-0.21	-0.14	0.1	-0.08	0.36	0.04	-0.3	-0.1	-1.21	-0.13	-0.27	-0.05	0.27	-0.68	0.17	0.17	-0.0	-0.03	0.19	0.09	0.22	0.53
Lsat_1_v5_gn_2_88200.1 (ENODL16)	-0.27	-0.22	-0.26	-0.34	-0.06	-0.11	0.02	0.43	0.28	0.11	0.0	-0.13	0.19	-0.53	-0.17	0.15	0.19	-1.53	0.34	-0.08	-0.26	-0.07	-2.1	0.03	-0.09	-0.05	-0.05	0.19	0.49	0.54	0.83
Lsat_1_v5_gn_2_9361.1	-0.47	-0.7	0.71	1.22	-0.5	-0.68	-0.4	-1.23	0.45	0.16	0.54	0.51	-0.33	-0.88	-0.89	-0.15	-0.01	-2.02	0.0	0.17	-0.09	-0.13	-0.67	0.19	-0.37	-0.12	-0.05	-0.65	0.47	0.34	1.08
Lsat_1_v5_gn_2_99761.1 (GET3b)	0.02	-0.2	1.39	0.98	-2.11	-1.0	-0.39	-0.64	-0.47	-0.13	-0.4	0.18	1.54	-1.61	-2.02	-0.22	0.16	0.25	-2.34	-0.78	-0.27	-0.8	-1.14	-0.03	-0.17	-0.45	-0.82	0.03	-0.43	-0.06	1.88
Lsat_1_v5_gn_3_111360.1 (PPR-AC)	-0.87	-1.3	-1.21	-1.99	-0.5	0.97	0.41	-0.09	0.15	-0.22	-0.1	-0.63	-0.2	0.24	0.23	-0.2	-0.1	-1.2	0.36	-0.4	0.04	0.47	-1.35	0.29	0.24	0.54	0.08	-0.01	0.33	0.68	0.86
Lsat_1_v5_gn_3_123101.1 (WDL1)	-0.03	0.02	0.84	0.89	0.18	-0.37	-0.55	-0.61	-0.15	-0.01	0.07	0.13	1.01	-1.08	-0.44	-0.1	-0.04	0.32	-0.23	-0.14	-0.45	-0.36	-2.75	-0.33	-0.37	-0.19	-0.44	-0.11	-0.07	0.09	1.11
Lsat_1_v5_gn_3_126140.1 (BGAL10)	-0.32	-0.87	0.53	0.69	-0.77	-0.69	-0.33	-0.31	0.08	0.27	0.19	0.5	0.94	-1.65	-0.99	0.18	0.22	-0.68	-0.84	-0.03	-0.31	-0.28	-1.0	0.22	0.22	0.02	0.03	-0.21	0.11	0.51	0.94
Lsat_1_v5_gn_3_126721.1	-0.07	-0.34	0.05	0.08	-0.37	-0.12	-0.05	0.29	-0.06	0.01	0.18	0.31	0.13	0.01	-0.29	-0.06	-0.04	-1.38	0.17	-0.18	-0.23	0.1	-0.29	0.21	0.14	0.02	0.0	-0.06	0.02	0.12	0.71
Lsat_1_v5_gn_3_129940.1 (ERF38)	-1.36	-2.27	0.53	0.91	-0.72	-1.72	-0.84	-1.41	-0.37	0.39	0.5	0.68	1.26	-3.1	-1.23	-0.22	1.18	-0.71	-0.29	0.4	-0.02	-0.47	-4.73	0.39	0.51	-0.01	-0.31	1.25	-1.24	-0.46	0.59
Lsat_1_v5_gn_3_134920.1 (UGT85A5)	0.96	0.53	1.1	1.13	-1.47	-1.72	0.54	0.52	-0.31	0.02	-0.22	0.01	0.21	-1.73	-0.25	0.31	0.67	-2.12	-0.57	0.14	0.08	-0.01	-4.65	-0.3	0.05	0.35	-0.18	0.18	-0.94	-0.74	-0.83
Lsat_1_v5_gn_3_29461.1 (GAPC2)	-0.63	-0.27	1.51	1.59	-0.34	-0.29	-0.75	-1.28	0.81	0.33	0.59	0.34	-0.88	-1.83	-1.12	-0.1	-1.0	-3.6	-1.35	-0.59	0.21	-0.15	-4.55	-0.12	0.05	0.14	-0.53	-1.67	0.69	0.89	0.83
Lsat_1_v5_gn_3_32621.1	0.2	0.17	0.25	0.22	-0.33	-0.58	0.27	0.26	0.38	0.48	0.4	0.48	0.32	-0.5	-0.25	-0.21	0.09	-2.37	-0.27	0.01	-0.14	-0.08	-1.03	0.17	-0.01	-0.15	-0.16	0.09	-0.18	0.11	0.07
Lsat_1_v5_gn_3_33121.1 (XTH5)	-0.66	-0.32	1.37	1.45	-1.0	-0.87	-0.52	-0.81	-0.24	-0.01	-0.08	0.18	0.81	-2.86	-1.74	0.03	0.21	0.35	-1.07	-0.25	-0.38	-0.33	-1.48	-0.08	0.28	0.19	0.04	-0.68	-0.01	0.43	0.89
Lsat_1_v5_gn_3_47760.1 (PIP3)	-1.05	-0.24	1.08	1.3	-1.14	-0.85	-0.41	-0.93	0.37	0.42	0.39	0.54	0.66	-3.49	-2.08	0.32	0.42	-1.62	-0.96	-0.11	-0.07	-0.05	-4.71	-0.04	0.27	0.47	0.25	-0.46	-0.64	0.19	0.94
Lsat_1_v5_gn_3_51421.1 (AMY3)	0.15	0.45	0.67	0.72	-0.03	-0.42	0.0	0.11	0.07	0.24	0.31	0.27	-0.09	-0.81	-0.57	-0.11	0.05	-2.5	0.03	-0.17	-0.37	-0.35	-2.74	-0.12	-0.15	-0.24	-0.34	-0.28	0.44	0.71	0.66
Lsat_1_v5_gn_3_55440.1 (CLE16)	-	-	-	-	-1.0	-0.79	1.1	2.73	-1.49	-0.58	-2.14	-0.9	-0.65	0.39	0.0	0.14	-0.18	-0.63	-0.54	-1.5	-0.72	-	-	0.41	0.11	0.38	-0.2	-3.31	1.27	0.39	1.89
Lsat_1_v5_gn_3_62580.1 (NDT2)	0.95	0.55	1.25	0.91	-0.7	-0.53	0.57	0.55	-0.34	-0.23	-0.13	-0.09	0.07	-0.96	-0.46	0.14	0.29	-1.95	-0.49	-0.22	-0.19	-0.25	-1.23	-0.34	-0.34	-0.25	-0.1	-0.15	-0.08	0.04	-0.38
Lsat_1_v5_gn_3_6660.1 (PIP1D)	-0.15	-0.1	0.41	0.77	-0.09	0.07	0.24	0.15	0.16	0.2	0.13	0.14	0.37	-0.59	-0.31	0.24	0.19	-0.82	-0.38	-0.11	-0.07	-0.03	-0.95	-0.25	-0.06	0.07	-0.02	-0.16	-0.2	-0.08	0.06
Lsat_1_v5_gn_3_72001.1 (MCA1)	-0.63	-0.47	0.22	0.61	-0.19	-0.11	-0.43	-0.72	0.1	0.16	0.41	0.15	0.26	-0.21	-0.04	0.1	0.05	-0.65	-0.21	-0.09	-0.19	-0.19	-1.32	0.07	-0.05	0.09	-0.04	-0.08	0.16	0.5	0.92
Lsat_1_v5_gn_3_7621.1 (SDP)	0.07	-0.02	-0.02	0.01	0.5	0.38	-0.22	0.34	0.02	0.08	0.27	0.28	-0.06	0.49	-0.08	-0.28	-0.5	-1.3	-0.17	-0.3	-0.31	-0.12	-1.33	0.02	-0.07	-0.0	0.03	0.0	0.12	0.25	0.39
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.