Heatmap: Cluster_48 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_29161.1 (ACR8)	0.48	-0.36	0.5	0.87	-0.02	0.1	-0.37	-0.08	-0.2	-0.18	-0.11	0.12	0.53	0.33	-0.31	-0.11	0.02	-1.23	-0.56	-0.14	-0.11	-0.16	-0.96	0.04	-0.07	0.17	-0.13	0.17	-0.29	-0.2	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_17680.1	0.06	0.21	0.26	0.09	0.18	-0.01	-0.86	-0.78	-0.1	-0.24	0.05	-0.18	0.61	0.45	0.22	-0.06	-0.45	0.35	-0.26	-0.3	-0.29	-0.08	0.58	-0.25	-0.38	-0.24	-0.27	-0.48	-0.18	0.05	0.8
Lsat_1_v5_gn_1_24581.1	-0.41	-0.75	-0.01	0.39	-0.03	-0.15	-0.34	-0.55	-0.2	-0.16	-0.13	-0.04	0.42	0.33	0.25	0.24	0.25	-0.07	-0.07	0.02	-0.08	-0.03	-0.07	-0.2	-0.06	0.09	0.03	0.14	0.05	0.13	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_27020.1 (HT1)	0.29	0.51	1.1	0.97	0.62	0.47	-0.99	-1.11	-0.9	-0.31	-0.82	-0.56	0.97	0.22	0.87	0.47	0.24	-0.76	0.3	-0.84	-0.69	-0.65	-0.95	-0.94	-0.83	-0.67	-0.53	0.29	0.14	-0.17	-0.98
Lsat_1_v5_gn_1_58400.1	-0.4	-0.33	-0.04	0.09	0.04	0.04	-0.35	-0.54	-0.2	-0.07	-0.03	-0.03	0.23	0.34	0.06	0.11	0.06	0.19	-0.02	-0.09	-0.18	-0.04	0.15	-0.24	-0.07	-0.0	0.07	-0.04	0.2	0.2	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_58580.1 (WDL4)	-0.18	-0.35	0.5	0.48	0.27	0.48	-0.56	-0.45	-0.37	-0.2	-0.14	-0.49	0.06	0.63	0.53	0.03	-0.21	-0.17	-0.07	-0.35	-0.44	-0.24	-0.08	-0.49	-0.3	-0.19	-0.09	-0.57	0.2	0.27	0.85
Lsat_1_v5_gn_1_70060.1 (CIL2)	0.5	0.0	0.74	0.51	0.73	0.39	-0.71	-0.82	-0.16	-0.08	0.03	0.35	-0.51	0.3	-0.2	0.58	0.37	-1.22	-0.61	-0.49	-0.35	-0.19	-0.66	-0.45	-0.19	-0.01	0.14	-0.05	-0.33	-0.02	0.13
Lsat_1_v5_gn_1_7940.1	-0.34	-0.53	0.1	0.13	0.24	0.24	-0.49	-0.65	-0.07	-0.11	0.05	-0.01	0.5	0.35	0.2	-0.01	0.13	-0.08	-0.3	-0.04	-0.2	-0.1	-0.27	-0.02	0.01	0.16	0.09	-0.19	-0.17	0.09	0.5
Lsat_1_v5_gn_2_10861.1	0.02	-1.13	0.56	0.54	0.05	-0.38	-0.78	-1.37	0.18	0.17	0.17	0.05	-0.1	0.43	0.71	0.43	0.61	-0.68	-0.22	0.26	0.15	0.07	-1.95	-0.26	-0.24	0.15	0.01	0.17	-0.47	-0.46	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_125480.1	-0.63	-0.02	0.4	0.81	-0.01	-0.02	-0.99	-1.52	-0.04	0.29	0.02	-0.18	-0.71	0.72	0.8	0.47	-0.22	-0.34	-0.21	-0.51	-0.33	-0.56	-0.21	-0.51	-0.42	-0.16	-0.48	-0.86	0.44	0.52	1.02
Lsat_1_v5_gn_2_135941.1 (ECD1)	-0.24	-0.35	0.16	0.15	0.11	0.01	-0.37	-0.62	-0.1	-0.32	-0.13	-0.13	-0.23	0.81	0.45	-0.14	-0.22	-0.85	0.14	-0.14	-0.27	-0.12	-0.93	-0.01	0.05	0.06	-0.25	-0.37	0.47	0.5	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_21401.1 (DML1)	0.0	-0.33	0.46	0.84	0.37	-0.12	-0.95	-1.31	-0.2	-0.12	-0.01	-0.0	0.21	0.43	0.24	-0.08	-0.28	-0.5	-0.1	-0.27	-0.4	-0.24	0.77	-0.48	-0.3	-0.18	-0.28	-0.19	0.04	0.18	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_47620.1 (HOG1)	0.44	0.36	0.16	-0.26	-0.03	-0.55	-0.25	-0.31	-0.06	-0.25	-0.05	0.12	0.08	-0.13	0.35	-0.18	0.16	-0.57	0.06	0.0	-0.13	-0.14	-1.26	0.1	0.08	-0.05	-0.14	0.01	0.12	0.5	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_54800.1 (GIR1)	0.56	-0.45	0.84	0.94	-0.24	0.01	-0.16	0.01	0.06	-0.24	0.0	0.05	0.65	0.26	0.32	0.05	-0.19	-0.41	-0.6	-0.18	-0.45	-0.49	-1.77	-0.44	-0.19	-0.13	-0.25	-0.27	-0.48	-0.04	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_67280.1 (DWF2)	0.02	-0.07	0.36	0.43	0.28	0.19	-0.71	-1.01	-0.06	0.01	0.17	-0.08	-0.26	0.77	0.42	0.25	0.01	-0.99	0.01	-0.27	-0.11	-0.16	-1.27	-0.35	-0.2	0.01	-0.02	-0.29	0.23	0.31	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_67780.1 (CSI1)	-0.18	-0.38	0.33	0.2	-0.06	-0.1	-0.46	-0.71	-0.17	-0.07	-0.0	0.13	0.64	0.43	0.17	0.23	0.29	-0.9	-0.11	-0.23	-0.3	-0.2	-0.51	-0.2	-0.1	-0.11	-0.12	-0.05	0.2	0.4	0.67
Lsat_1_v5_gn_2_72540.1 (ARF8)	-0.29	0.12	0.38	0.54	0.31	-0.49	-0.56	-0.59	-0.08	0.08	0.06	0.17	0.38	0.43	0.24	-0.38	-0.34	0.5	-0.31	-0.29	-0.52	-0.51	0.32	-0.54	-0.54	-0.42	-0.37	-0.68	0.14	0.24	1.0
Lsat_1_v5_gn_2_85701.1 (IRX14)	-0.49	-0.06	-0.12	0.12	0.08	-0.06	-0.58	-0.46	-0.13	-0.19	-0.0	0.03	0.64	0.46	0.2	0.23	0.27	0.02	-0.12	-0.12	-0.19	-0.07	0.19	-0.33	-0.14	-0.03	-0.06	0.08	-0.24	0.01	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_94020.1	-0.22	-0.71	0.43	0.79	-0.02	-0.11	-1.06	-1.77	-0.1	0.02	0.12	0.13	0.61	0.62	0.32	0.17	0.18	-0.24	-0.14	-0.41	-0.43	-0.39	0.11	-0.19	-0.16	-0.18	-0.14	0.1	-0.24	-0.06	0.62
Lsat_1_v5_gn_2_97741.1 (TZF8)	-0.15	0.05	0.51	0.34	-0.02	0.29	-0.27	-0.13	-0.14	-0.14	0.3	0.06	-0.18	0.39	0.2	0.14	-0.2	-0.27	-0.17	-0.54	-0.3	-0.31	0.45	-0.6	-0.39	-0.25	-0.16	-0.87	0.28	0.36	0.5
Lsat_1_v5_gn_3_101681.1 (HB23)	-0.48	-0.38	0.46	0.06	-0.43	-0.48	-0.53	-1.17	-0.27	-0.15	-0.07	-0.09	0.72	0.54	0.44	0.39	0.4	-0.26	-0.07	-0.12	-0.3	-0.44	0.38	-0.04	-0.16	-0.17	-0.11	-0.39	-0.12	0.11	0.85
Lsat_1_v5_gn_3_12700.1 (CMU1)	-0.08	0.03	0.35	0.17	0.25	0.27	-0.36	-0.65	-0.14	-0.1	-0.01	-0.05	0.18	0.34	0.27	0.35	0.09	-0.61	-0.03	-0.22	-0.18	-0.13	-1.2	-0.22	-0.11	0.01	0.02	-0.22	0.22	0.23	0.44
Lsat_1_v5_gn_3_130901.1 (HB4)	-0.17	-0.04	0.39	0.69	0.19	0.17	0.12	-0.06	-0.05	0.09	-0.02	0.05	0.24	0.25	0.33	0.29	0.08	-0.58	-0.14	-0.19	-0.54	-0.5	-1.4	-0.17	-0.37	-0.39	-0.33	-0.56	0.03	0.14	0.77
Lsat_1_v5_gn_3_135300.1 (LGT1)	-0.17	-0.33	0.18	0.28	0.1	-0.07	-0.3	-0.53	-0.06	0.07	0.18	0.08	0.15	0.52	0.3	-0.07	-0.17	-0.95	0.01	-0.21	-0.19	0.0	-0.36	-0.15	-0.1	-0.05	-0.19	-0.16	0.26	0.38	0.58
Lsat_1_v5_gn_3_15721.1 (CLSY3)	0.17	0.02	-0.2	-0.66	0.86	0.44	-0.56	-0.85	-0.47	-0.22	-0.23	-0.37	0.48	0.65	0.57	-0.08	-0.19	-0.01	0.04	-0.18	-0.46	-0.56	-0.11	-0.36	-0.17	-0.4	-0.27	-0.79	0.12	0.21	1.11
Lsat_1_v5_gn_3_29721.1 (PUB45)	-0.0	-0.45	0.12	0.4	0.3	0.17	-0.3	-0.7	-0.02	0.11	0.15	-0.06	-0.12	0.37	0.37	0.0	-0.03	-0.05	-0.06	-0.29	-0.15	-0.1	-0.68	-0.2	-0.21	-0.02	-0.17	-0.21	0.35	0.33	0.34
Lsat_1_v5_gn_3_33561.1 (MAP3KE1)	0.41	0.5	0.51	-0.07	-0.26	-0.14	-0.19	-0.29	-0.07	-0.01	-0.23	-0.19	0.73	-0.39	0.23	-0.22	0.16	-0.54	0.19	-0.59	-0.74	-0.07	-0.93	-0.04	-0.55	-0.05	-0.55	-0.77	0.24	0.4	1.17
Lsat_1_v5_gn_3_43161.1 (XTH9)	-0.06	-0.16	0.82	0.87	-0.38	-0.34	-1.17	-1.72	-0.74	-0.54	-0.62	-0.35	1.52	1.46	1.12	0.59	0.48	0.23	-0.82	-0.67	-0.94	-0.84	-3.17	-0.85	-0.76	-0.41	-0.67	-0.63	-0.83	-0.55	0.89
Lsat_1_v5_gn_3_45801.1	-0.41	-0.38	0.09	0.13	0.67	0.82	-0.85	-0.93	-0.45	-0.49	0.39	0.51	0.56	0.78	0.14	-0.21	-0.28	-0.46	-0.32	-0.71	-0.35	-0.12	-1.92	-0.06	-0.26	-0.17	-0.42	-0.35	0.24	0.18	1.06
Lsat_1_v5_gn_3_62921.1	-0.56	-0.41	-0.08	0.06	0.14	0.13	0.01	-0.37	0.04	0.13	0.11	-0.05	-0.19	0.46	0.55	0.33	0.27	-0.15	0.25	0.11	-0.04	-0.04	-2.89	-0.33	-0.17	0.04	-0.02	-0.27	0.24	0.18	0.19
Lsat_1_v5_gn_3_98441.1 (WRKY3)	-0.15	-0.39	0.78	1.17	0.17	-0.03	-0.69	-1.68	-0.13	0.02	0.07	0.25	-0.61	0.55	1.01	0.67	0.72	-1.94	-0.05	0.25	0.15	0.19	-4.08	-0.71	-0.46	-0.08	-0.03	0.14	-1.66	-1.03	-0.16
Lsat_1_v5_gn_3_98801.1	0.09	0.28	0.22	-0.1	0.22	-0.24	-0.84	-1.4	-0.26	-0.39	-0.19	-0.08	0.85	0.46	0.41	-0.04	0.02	0.84	-0.31	-0.31	-0.48	-0.5	0.33	-0.62	-0.52	-0.17	-0.21	-0.68	-0.03	-0.05	0.99
Lsat_1_v5_gn_4_104861.1	-0.75	-1.18	-0.02	0.38	-1.22	-0.52	-0.47	-0.98	0.37	0.55	0.33	0.65	0.25	0.92	0.83	0.23	0.65	-2.31	0.16	0.54	-0.01	-0.21	-5.11	0.03	-0.16	0.02	-0.08	0.36	-0.73	-0.34	-0.09
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Lsat_1_v5_gn_4_146600.1 (PCK1)	0.38	-0.06	0.24	-0.17	-0.16	-0.73	-0.01	-0.27	-0.11	0.08	-0.05	0.1	0.18	-0.52	0.76	0.15	-0.12	-1.45	-0.1	0.18	-0.09	-0.58	-	-0.16	-0.03	0.34	-0.06	0.05	0.33	0.63	0.84
Lsat_1_v5_gn_4_175061.1 (NIK1)	-0.14	-0.37	0.62	0.69	0.42	0.17	-0.83	-1.1	-0.37	-0.08	-0.05	-0.05	-0.01	0.88	0.15	-0.01	0.14	-0.8	-0.28	-0.3	-0.2	-0.14	-0.63	-0.21	-0.11	0.07	0.01	0.27	-0.08	0.02	0.41
Lsat_1_v5_gn_4_30860.1	0.02	-0.08	-0.08	0.07	0.46	0.48	-0.41	-0.39	0.07	0.02	-0.12	-0.04	-0.47	0.37	0.45	0.1	-0.17	-0.5	0.25	-0.07	-0.05	-0.1	-0.06	-0.09	-0.13	-0.12	-0.01	-0.22	0.19	-0.02	0.01
Lsat_1_v5_gn_4_31641.1 (CEV1)	-0.01	-0.26	0.29	0.11	0.16	-0.05	-0.58	-0.73	-0.41	-0.33	-0.28	-0.1	0.58	0.65	0.21	0.2	0.29	-0.39	0.03	-0.22	-0.22	-0.11	0.2	-0.32	-0.16	-0.06	-0.05	0.11	0.12	0.14	0.21
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.