Heatmap: Cluster_177 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.66 -0.7 -1.18 -1.14 -0.15 0.37 0.26 0.8 -0.15 -0.31 -0.02 -0.05 0.25 0.27 0.24 0.26 0.24 -1.26 0.13 0.05 0.03 0.15 -0.04 0.14 0.26 0.13 0.16 0.25 -0.16 -0.26 0.05
-0.48 -0.49 -0.36 -0.12 0.05 0.18 0.13 0.06 0.03 0.06 0.16 0.26 -0.01 -0.14 -0.06 0.06 0.0 -0.12 -0.08 -0.07 -0.16 -0.02 0.69 -0.17 -0.12 0.01 -0.01 0.13 -0.09 -0.1 0.24
-0.34 -0.31 -0.46 -0.42 -0.23 0.03 0.17 0.42 -0.2 -0.12 -0.15 0.07 0.48 -0.88 -0.69 0.06 0.17 -0.92 -0.13 -0.09 0.11 0.15 0.67 0.23 0.21 0.21 0.03 0.23 0.06 0.13 0.21
-1.01 -0.98 -1.12 -0.8 -0.15 0.41 0.31 0.28 0.1 0.05 0.11 0.09 -0.05 -0.29 -0.05 0.33 0.23 -1.42 0.29 0.18 0.11 0.23 -0.92 0.33 0.3 0.27 0.3 0.1 0.19 0.19 0.06
-0.39 -0.33 -0.86 -1.04 -0.63 0.15 0.52 0.63 0.05 0.03 0.07 -0.15 -0.03 -0.13 0.15 0.28 0.27 -1.59 0.26 0.17 0.18 0.17 -1.33 0.1 0.23 0.27 0.21 0.3 0.06 0.12 -0.04
-0.97 -0.62 -1.35 -1.07 -0.26 0.24 0.67 0.93 -0.16 -0.06 -0.04 -0.05 0.15 0.23 0.27 0.17 0.31 -0.76 0.14 0.06 0.01 0.09 -0.33 0.02 0.05 0.1 0.15 0.04 -0.09 0.01 -0.01
-1.06 -0.66 -1.5 -1.76 -0.08 0.92 0.77 0.74 -0.09 -0.37 -0.12 -0.68 -0.45 0.04 0.36 0.25 -0.08 -1.3 0.51 0.08 0.24 0.27 -1.87 0.17 0.2 0.35 0.44 0.3 0.24 -0.05 -0.41
-0.43 -0.33 -0.58 -1.06 -0.37 0.05 0.64 1.01 -0.36 -0.27 -0.36 -0.18 0.36 -0.15 -0.06 0.03 0.18 0.2 0.29 0.07 -0.15 -0.0 -0.95 0.12 0.13 -0.03 0.02 0.04 0.11 0.05 0.26
-0.73 -0.48 -1.19 -0.76 0.46 1.13 0.52 0.27 -0.49 -0.7 -0.2 -0.35 -0.26 0.55 0.41 -0.14 -0.31 -0.87 0.01 -0.41 0.13 0.16 1.32 -0.37 -0.02 -0.0 0.12 0.04 -0.08 -0.41 -0.94
-1.06 -0.95 -1.13 -0.81 -0.13 0.19 0.22 0.17 -0.06 -0.02 0.19 -0.1 -0.32 0.22 0.15 0.18 0.08 -0.29 0.14 0.08 0.11 0.29 -0.27 0.29 0.17 0.42 0.32 0.21 0.2 0.04 -0.02
-0.2 -0.72 -1.1 -1.08 -0.74 -0.37 0.36 1.13 -0.36 -0.31 -0.23 0.08 0.62 0.37 0.05 -0.08 0.12 -0.45 0.22 0.08 -0.03 -0.0 -0.3 0.3 0.06 -0.03 -0.2 -0.19 -0.19 -0.02 0.81
-0.59 -0.35 -0.76 -1.1 -0.36 0.25 0.42 0.61 -0.25 -0.28 -0.13 -0.16 0.14 0.47 0.31 0.4 0.33 -1.06 0.07 -0.12 0.03 0.04 0.14 -0.06 0.11 0.1 0.08 0.09 -0.0 0.04 0.06
-0.4 -0.17 -0.4 -0.72 -0.15 0.17 0.32 0.78 -0.06 -0.13 -0.01 -0.09 0.64 -0.15 -0.16 -0.12 0.01 -0.2 -0.04 0.01 0.15 0.16 -0.15 0.06 0.08 0.01 -0.13 0.22 -0.21 -0.21 0.02
-2.0 -0.9 -3.58 -2.46 -0.83 0.42 0.8 1.19 -0.33 -0.16 -0.19 -0.05 0.48 -0.58 -0.22 0.29 0.63 -0.87 0.3 0.22 0.53 0.44 -0.94 0.15 0.24 0.53 0.43 0.34 -0.42 -0.41 -0.61
-0.46 -0.47 -1.4 -1.77 -0.61 0.38 0.82 0.9 -0.11 -0.08 0.08 0.17 0.63 0.05 -0.01 0.33 0.41 -3.37 -0.07 0.05 0.05 0.04 -3.46 0.3 0.27 0.21 0.21 0.21 -0.19 0.03 0.05
-1.28 -1.04 -1.93 -1.78 -0.85 0.04 0.59 1.24 -0.42 -0.34 -0.34 -0.03 0.64 0.08 -0.3 0.12 0.19 -1.15 -0.14 0.05 0.06 0.25 -0.39 0.51 0.22 0.18 0.1 -0.05 -0.3 0.18 1.03
-0.28 -0.18 -0.73 -0.56 0.23 0.4 0.51 0.63 -0.25 -0.15 -0.07 -0.27 0.03 0.39 0.27 0.13 -0.06 -0.64 -0.24 -0.3 -0.2 -0.12 0.2 -0.15 -0.23 0.02 -0.0 -0.15 0.15 0.11 0.42
0.0 -0.18 -0.05 0.02 -0.14 0.02 0.14 0.26 0.09 0.19 0.09 0.23 0.59 -0.28 -0.32 0.11 0.12 -1.65 -0.46 -0.13 -0.02 -0.09 0.13 0.08 0.11 -0.02 0.0 0.2 -0.17 -0.1 0.16
-1.68 -1.14 -2.86 -2.26 -0.48 0.82 0.67 0.89 -0.4 -0.31 -0.34 -0.43 -0.18 0.56 0.53 0.18 -0.01 -1.45 0.52 -0.01 0.06 0.19 1.14 0.07 -0.02 0.04 0.12 -0.07 -0.2 -0.22 -0.11
-1.02 -0.44 -1.5 -1.82 -0.14 0.2 0.47 0.45 -0.07 -0.1 -0.17 -0.28 -0.17 0.34 0.71 0.42 0.4 -1.94 0.2 0.08 0.03 0.09 -0.73 0.02 0.1 0.15 0.27 -0.14 0.35 0.4 0.29
-0.6 -0.29 -1.18 -1.48 -0.12 0.34 0.53 0.5 -0.05 -0.21 -0.09 -0.34 -0.08 0.61 0.74 0.17 0.09 -1.84 0.27 0.04 0.07 0.2 -1.56 0.1 0.03 0.28 0.29 -0.01 0.31 0.09 -0.13
-0.07 -0.36 -2.23 -2.23 -0.97 0.02 0.44 1.31 -0.51 -0.26 -0.04 -0.23 0.57 0.47 0.17 -0.25 0.12 -1.82 0.19 0.05 -0.2 0.05 -1.91 0.69 0.06 0.11 0.31 0.04 -0.08 0.12 0.61
-0.67 -0.51 -0.8 -1.03 -1.44 -0.35 0.87 0.97 -0.22 -0.32 -0.24 -0.27 0.39 -0.69 -0.34 0.56 0.6 -1.38 -0.28 0.21 0.32 0.36 -2.13 0.28 0.46 0.51 0.4 0.15 0.01 0.03 0.02
-0.81 -0.75 -0.86 -0.92 -0.32 0.15 0.35 1.01 -0.3 -0.35 0.05 -0.13 0.07 -0.5 -0.33 -0.16 -0.34 -0.15 0.09 -0.14 -0.11 0.07 0.79 0.33 -0.01 -0.03 0.02 -0.19 0.26 0.48 0.58
-0.63 -0.39 -0.68 -1.12 -0.82 0.45 0.69 0.88 0.07 -0.05 0.07 -0.24 -0.24 -0.11 0.16 0.35 0.31 -2.38 0.32 0.12 0.18 0.31 -5.17 0.19 0.24 0.33 0.44 0.16 -0.34 -0.05 0.12
-0.9 -0.49 -1.34 -1.51 -0.39 0.65 0.54 0.27 0.06 -0.14 0.07 -0.28 -0.15 0.17 0.22 0.35 0.15 -1.96 0.26 0.04 0.23 0.3 -0.89 0.08 0.21 0.32 0.28 0.24 0.33 0.25 -0.19
-0.47 -0.47 -0.94 -1.03 -0.1 0.41 0.57 0.61 -0.08 -0.11 -0.04 -0.27 0.0 0.38 0.46 0.3 0.17 -1.03 0.02 -0.08 -0.09 0.01 -0.16 -0.09 -0.08 0.05 0.06 -0.02 0.11 0.22 0.1
-0.35 -0.27 -0.97 -1.04 -0.07 0.51 0.49 0.57 -0.3 -0.37 -0.18 -0.39 0.06 0.77 0.58 0.33 0.14 -1.71 0.23 -0.15 0.02 0.13 -0.22 -0.04 0.04 0.08 0.02 -0.02 -0.03 0.01 -0.15
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-0.23 -0.24 -0.31 -0.54 -0.54 0.26 0.62 0.84 -0.23 -0.2 -0.05 -0.23 0.32 -0.23 -0.28 0.14 0.12 -0.59 0.35 0.08 -0.01 0.05 -0.76 -0.06 0.03 0.07 0.01 0.01 0.05 0.1 0.22
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-0.29 -0.51 -0.51 -0.33 -0.29 0.07 0.44 0.48 -0.05 -0.03 0.02 -0.14 0.04 -0.21 -0.27 0.18 0.21 -1.37 0.07 0.16 0.15 0.14 0.04 0.29 0.2 0.25 0.3 0.14 -0.09 -0.1 -0.08
-0.42 -0.34 -0.71 -0.34 0.05 0.07 0.32 0.81 -0.19 -0.22 -0.07 -0.08 0.35 0.07 0.31 0.29 0.15 -0.47 0.09 -0.08 0.04 0.03 -0.31 0.14 0.07 -0.01 0.01 -0.22 -0.22 -0.08 0.06
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-0.32 -0.47 -0.64 -0.62 -0.22 0.27 0.35 0.56 -0.02 -0.08 -0.14 -0.07 0.37 0.36 0.22 0.07 0.04 -1.13 0.17 -0.1 -0.06 -0.11 -0.08 0.07 -0.1 -0.05 -0.06 -0.1 0.09 0.14 0.5
-1.44 -1.16 -0.47 -0.49 0.18 0.27 -0.2 -0.47 -0.1 0.03 -0.0 -0.03 -0.18 -0.2 0.14 0.42 0.29 -0.13 0.22 0.28 -0.01 0.14 0.55 -0.13 0.09 0.09 0.15 -0.18 0.45 0.24 0.07
Lsat_1_v5_gn_2_75740.1 (PDH-E1 ALPHA)
-0.15 -0.3 -0.16 -0.07 -0.18 0.09 0.27 0.29 -0.11 -0.07 -0.03 0.0 0.31 0.02 -0.11 0.21 0.2 -0.46 -0.07 0.07 0.0 0.07 -0.53 0.07 0.11 0.08 0.03 0.25 -0.03 -0.09 -0.14
-0.4 -0.37 -0.81 -1.0 -0.07 0.36 0.39 0.65 -0.25 -0.29 -0.27 -0.18 0.45 0.2 0.04 -0.06 0.08 -0.09 -0.02 -0.03 -0.07 0.0 0.06 0.19 0.01 0.07 0.16 0.15 -0.1 0.01 0.13
-0.58 -0.6 -1.19 -0.95 -0.66 0.2 0.59 0.52 0.1 0.03 -0.03 -0.22 0.18 -0.31 0.2 0.42 0.39 -2.58 0.33 0.34 0.29 0.22 -0.71 0.18 0.21 0.37 0.24 0.37 -0.07 -0.07 -0.59
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-0.72 -0.58 -1.18 -1.05 -0.27 0.44 0.7 1.0 -0.16 -0.2 -0.11 -0.26 0.27 0.16 0.3 0.23 0.03 -0.77 -0.05 -0.03 -0.03 0.09 0.3 -0.07 0.01 0.17 0.14 0.21 -0.12 -0.2 -0.38
-0.18 -0.15 -0.33 -0.56 -0.36 0.07 0.28 0.36 -0.0 -0.15 -0.14 -0.11 0.17 0.36 0.34 0.2 0.04 -0.87 -0.02 0.03 0.1 -0.05 -0.25 0.05 0.1 0.16 0.13 -0.0 -0.03 -0.02 0.13
-0.73 -1.03 -2.21 -2.46 -0.78 0.05 0.74 1.35 -0.41 -0.24 -0.44 -0.07 0.41 0.49 0.24 0.12 0.41 -1.01 0.17 0.26 0.17 0.1 -1.28 0.27 0.22 0.14 0.18 0.37 -0.39 -0.15 0.06
-0.9 -0.27 -1.36 -1.09 -0.05 0.36 0.63 0.68 -0.29 -0.23 -0.23 -0.08 0.29 -0.08 -0.16 0.04 0.13 -0.06 0.01 -0.05 -0.03 0.2 -0.26 0.04 0.11 0.17 0.14 0.12 0.11 0.17 0.26
-1.06 -0.73 -0.83 -1.0 0.02 0.21 0.35 1.01 -0.42 -0.37 -0.11 -0.45 0.57 0.55 -0.04 0.03 0.22 -0.69 -0.07 -0.07 -0.47 -0.09 0.84 0.14 -0.17 0.03 -0.29 -0.09 -0.29 0.16 0.52
0.02 -0.38 -0.21 -0.01 0.06 0.04 0.15 0.32 0.01 0.11 0.11 0.11 0.47 0.06 -0.09 0.03 0.07 -0.35 -0.24 -0.05 -0.09 -0.14 -0.12 0.05 -0.02 0.01 -0.05 0.13 -0.22 -0.13 0.07
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0.07 -0.01 -0.4 -0.78 -0.12 0.31 0.34 0.42 -0.35 -0.18 -0.14 -0.23 0.25 0.41 0.21 0.03 0.02 -1.14 0.06 -0.01 0.12 0.22 -0.54 0.15 0.14 0.04 0.15 0.2 -0.12 -0.08 -0.15
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0.02 -0.29 -0.88 -0.86 -0.0 0.52 0.53 0.74 -0.48 -0.56 -0.47 -0.48 -0.06 0.37 0.09 0.18 0.01 -0.49 0.06 -0.01 0.07 0.29 0.4 0.02 0.14 0.14 0.2 0.22 -0.16 -0.34 -0.51
-0.33 -0.73 -1.27 -1.28 -0.68 -0.09 0.4 0.9 -0.37 -0.3 -0.3 -0.05 0.59 -0.02 -0.08 0.14 0.35 -0.89 0.18 0.21 0.14 0.3 -0.08 0.27 0.27 0.23 0.09 0.38 -0.18 -0.16 0.03
-0.5 -0.57 -1.18 -1.07 -0.07 0.48 0.5 0.49 -0.2 -0.28 -0.07 -0.14 0.19 0.33 0.28 0.38 0.32 -1.48 0.08 0.13 0.26 0.3 -1.16 -0.03 0.16 0.35 0.34 0.57 -0.33 -0.37 -0.44
0.0 -0.16 -0.42 -0.41 -0.57 -0.08 0.3 0.12 0.04 0.02 0.08 -0.03 0.31 -0.02 0.19 0.14 0.13 -0.84 0.07 0.14 0.13 0.09 -1.42 0.06 0.14 0.26 0.16 0.14 -0.02 0.1 0.21
-0.23 -0.35 -0.85 -1.02 -0.09 0.24 0.36 0.48 0.01 -0.09 0.02 -0.18 -0.1 0.33 0.48 0.27 0.13 -1.05 0.17 0.05 0.1 0.13 -0.82 0.11 0.1 0.14 0.21 0.17 0.12 0.03 -0.38
-1.19 -0.4 -2.15 -2.64 -0.56 0.28 0.91 1.08 -0.24 -0.41 -0.27 -0.29 0.06 -0.44 -0.17 0.42 0.39 -0.48 0.22 0.17 0.28 0.29 -0.24 0.23 0.23 0.31 0.36 -0.02 -0.07 0.08 -0.32
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-2.31 -1.91 -2.21 -1.43 -0.05 0.44 0.44 0.51 0.02 0.12 0.19 -0.07 -0.68 -0.1 0.4 0.32 0.15 -0.47 0.29 0.26 0.26 0.32 -0.18 0.09 0.12 0.2 0.31 0.03 0.22 0.16 0.13
-2.07 -1.06 -3.12 -2.2 -0.45 0.37 0.65 1.14 -0.03 -0.49 -0.04 -0.37 -0.04 0.58 0.46 0.16 -0.03 -0.49 0.33 0.05 0.2 0.3 -1.27 0.26 0.25 0.15 0.36 -0.08 0.0 0.18 0.14
-0.3 -0.24 -1.33 -1.51 0.11 0.47 0.53 0.75 -0.34 -0.3 -0.33 -0.33 0.4 0.61 0.47 0.19 0.13 -0.86 -0.04 -0.25 -0.15 -0.03 0.58 -0.1 -0.13 -0.05 -0.06 -0.13 0.04 -0.04 -0.14
-2.39 -1.88 -1.91 -1.74 0.05 0.36 0.71 0.03 0.2 0.07 0.18 -0.12 -0.71 -0.03 0.19 0.04 -0.09 -0.89 0.37 0.32 0.39 0.53 0.14 0.11 0.1 0.09 0.04 -0.19 0.61 0.32 0.27
-0.88 -0.48 -2.82 -3.83 0.11 1.24 0.91 0.78 0.07 -0.22 -0.08 -0.6 -1.0 -0.6 0.06 0.52 0.05 -3.32 0.51 0.22 0.4 0.45 -1.95 0.17 0.27 0.36 0.39 0.26 0.02 -0.08 -0.78
0.08 -0.04 -0.47 -0.85 0.2 0.28 0.47 0.27 -0.33 -0.31 -0.26 -0.33 0.07 0.27 0.47 0.24 0.21 -0.17 0.11 -0.01 -0.04 -0.04 -0.73 -0.01 0.03 -0.09 -0.07 0.05 0.06 0.08 -0.04
-1.36 -0.93 -1.51 -0.54 -0.01 0.5 0.49 0.46 -0.01 -0.0 0.08 0.08 -0.3 -0.17 0.23 0.49 0.42 -2.27 0.13 0.11 0.07 0.23 -2.51 0.06 0.28 0.32 0.31 0.43 -0.21 0.21 0.3
-0.44 -0.56 -0.85 -0.67 -0.33 0.08 0.23 0.6 -0.16 -0.16 -0.05 0.04 0.45 0.47 0.14 0.13 0.13 -0.62 -0.07 -0.09 -0.09 -0.05 0.09 0.21 0.09 0.01 -0.06 -0.02 -0.12 0.04 0.49
-0.75 -0.19 -0.99 -0.77 -0.17 0.27 0.39 0.44 -0.08 -0.15 -0.07 -0.09 0.18 -0.01 0.12 0.46 0.33 -1.57 0.12 0.14 0.08 0.19 -1.5 0.31 0.21 0.2 0.17 0.02 0.07 0.16 0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.