Heatmap: Cluster_177 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_15460.1	-0.66	-0.7	-1.18	-1.14	-0.15	0.37	0.26	0.8	-0.15	-0.31	-0.02	-0.05	0.25	0.27	0.24	0.26	0.24	-1.26	0.13	0.05	0.03	0.15	-0.04	0.14	0.26	0.13	0.16	0.25	-0.16	-0.26	0.05
Lsat_1_v5_gn_0_15880.1 (CW14)	-0.48	-0.49	-0.36	-0.12	0.05	0.18	0.13	0.06	0.03	0.06	0.16	0.26	-0.01	-0.14	-0.06	0.06	0.0	-0.12	-0.08	-0.07	-0.16	-0.02	0.69	-0.17	-0.12	0.01	-0.01	0.13	-0.09	-0.1	0.24
Lsat_1_v5_gn_0_22641.1 (AK2)	-0.34	-0.31	-0.46	-0.42	-0.23	0.03	0.17	0.42	-0.2	-0.12	-0.15	0.07	0.48	-0.88	-0.69	0.06	0.17	-0.92	-0.13	-0.09	0.11	0.15	0.67	0.23	0.21	0.21	0.03	0.23	0.06	0.13	0.21
Lsat_1_v5_gn_0_45201.1 (TIR1)	-1.01	-0.98	-1.12	-0.8	-0.15	0.41	0.31	0.28	0.1	0.05	0.11	0.09	-0.05	-0.29	-0.05	0.33	0.23	-1.42	0.29	0.18	0.11	0.23	-0.92	0.33	0.3	0.27	0.3	0.1	0.19	0.19	0.06
Lsat_1_v5_gn_0_7900.1 (GNAT10)	-0.39	-0.33	-0.86	-1.04	-0.63	0.15	0.52	0.63	0.05	0.03	0.07	-0.15	-0.03	-0.13	0.15	0.28	0.27	-1.59	0.26	0.17	0.18	0.17	-1.33	0.1	0.23	0.27	0.21	0.3	0.06	0.12	-0.04
Lsat_1_v5_gn_0_9261.1 (NTMC2T5.2)	-0.97	-0.62	-1.35	-1.07	-0.26	0.24	0.67	0.93	-0.16	-0.06	-0.04	-0.05	0.15	0.23	0.27	0.17	0.31	-0.76	0.14	0.06	0.01	0.09	-0.33	0.02	0.05	0.1	0.15	0.04	-0.09	0.01	-0.01
Lsat_1_v5_gn_0_9740.1	-1.06	-0.66	-1.5	-1.76	-0.08	0.92	0.77	0.74	-0.09	-0.37	-0.12	-0.68	-0.45	0.04	0.36	0.25	-0.08	-1.3	0.51	0.08	0.24	0.27	-1.87	0.17	0.2	0.35	0.44	0.3	0.24	-0.05	-0.41
Lsat_1_v5_gn_1_118321.1 (scpl1)	-0.43	-0.33	-0.58	-1.06	-0.37	0.05	0.64	1.01	-0.36	-0.27	-0.36	-0.18	0.36	-0.15	-0.06	0.03	0.18	0.2	0.29	0.07	-0.15	-0.0	-0.95	0.12	0.13	-0.03	0.02	0.04	0.11	0.05	0.26
Lsat_1_v5_gn_1_125881.1	-0.73	-0.48	-1.19	-0.76	0.46	1.13	0.52	0.27	-0.49	-0.7	-0.2	-0.35	-0.26	0.55	0.41	-0.14	-0.31	-0.87	0.01	-0.41	0.13	0.16	1.32	-0.37	-0.02	-0.0	0.12	0.04	-0.08	-0.41	-0.94
Lsat_1_v5_gn_1_21201.1	-1.06	-0.95	-1.13	-0.81	-0.13	0.19	0.22	0.17	-0.06	-0.02	0.19	-0.1	-0.32	0.22	0.15	0.18	0.08	-0.29	0.14	0.08	0.11	0.29	-0.27	0.29	0.17	0.42	0.32	0.21	0.2	0.04	-0.02
Lsat_1_v5_gn_1_33780.1 (NTT2)	-0.2	-0.72	-1.1	-1.08	-0.74	-0.37	0.36	1.13	-0.36	-0.31	-0.23	0.08	0.62	0.37	0.05	-0.08	0.12	-0.45	0.22	0.08	-0.03	-0.0	-0.3	0.3	0.06	-0.03	-0.2	-0.19	-0.19	-0.02	0.81
Lsat_1_v5_gn_1_39760.1 (SRF7)	-0.59	-0.35	-0.76	-1.1	-0.36	0.25	0.42	0.61	-0.25	-0.28	-0.13	-0.16	0.14	0.47	0.31	0.4	0.33	-1.06	0.07	-0.12	0.03	0.04	0.14	-0.06	0.11	0.1	0.08	0.09	-0.0	0.04	0.06
Lsat_1_v5_gn_1_49860.1 (MVP17)	-0.4	-0.17	-0.4	-0.72	-0.15	0.17	0.32	0.78	-0.06	-0.13	-0.01	-0.09	0.64	-0.15	-0.16	-0.12	0.01	-0.2	-0.04	0.01	0.15	0.16	-0.15	0.06	0.08	0.01	-0.13	0.22	-0.21	-0.21	0.02
Lsat_1_v5_gn_1_54060.1 (LPPgamma)	-2.0	-0.9	-3.58	-2.46	-0.83	0.42	0.8	1.19	-0.33	-0.16	-0.19	-0.05	0.48	-0.58	-0.22	0.29	0.63	-0.87	0.3	0.22	0.53	0.44	-0.94	0.15	0.24	0.53	0.43	0.34	-0.42	-0.41	-0.61
Lsat_1_v5_gn_1_69221.1 (ROF1)	-0.46	-0.47	-1.4	-1.77	-0.61	0.38	0.82	0.9	-0.11	-0.08	0.08	0.17	0.63	0.05	-0.01	0.33	0.41	-3.37	-0.07	0.05	0.05	0.04	-3.46	0.3	0.27	0.21	0.21	0.21	-0.19	0.03	0.05
Lsat_1_v5_gn_1_781.1	-1.28	-1.04	-1.93	-1.78	-0.85	0.04	0.59	1.24	-0.42	-0.34	-0.34	-0.03	0.64	0.08	-0.3	0.12	0.19	-1.15	-0.14	0.05	0.06	0.25	-0.39	0.51	0.22	0.18	0.1	-0.05	-0.3	0.18	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_100160.1	-0.28	-0.18	-0.73	-0.56	0.23	0.4	0.51	0.63	-0.25	-0.15	-0.07	-0.27	0.03	0.39	0.27	0.13	-0.06	-0.64	-0.24	-0.3	-0.2	-0.12	0.2	-0.15	-0.23	0.02	-0.0	-0.15	0.15	0.11	0.42
Lsat_1_v5_gn_2_104640.1 (DAP2)	0.0	-0.18	-0.05	0.02	-0.14	0.02	0.14	0.26	0.09	0.19	0.09	0.23	0.59	-0.28	-0.32	0.11	0.12	-1.65	-0.46	-0.13	-0.02	-0.09	0.13	0.08	0.11	-0.02	0.0	0.2	-0.17	-0.1	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_109661.1 (CRM3)	-1.68	-1.14	-2.86	-2.26	-0.48	0.82	0.67	0.89	-0.4	-0.31	-0.34	-0.43	-0.18	0.56	0.53	0.18	-0.01	-1.45	0.52	-0.01	0.06	0.19	1.14	0.07	-0.02	0.04	0.12	-0.07	-0.2	-0.22	-0.11
Lsat_1_v5_gn_2_109721.1 (SIMP1)	-1.02	-0.44	-1.5	-1.82	-0.14	0.2	0.47	0.45	-0.07	-0.1	-0.17	-0.28	-0.17	0.34	0.71	0.42	0.4	-1.94	0.2	0.08	0.03	0.09	-0.73	0.02	0.1	0.15	0.27	-0.14	0.35	0.4	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_109741.1 (TOE1)	-0.6	-0.29	-1.18	-1.48	-0.12	0.34	0.53	0.5	-0.05	-0.21	-0.09	-0.34	-0.08	0.61	0.74	0.17	0.09	-1.84	0.27	0.04	0.07	0.2	-1.56	0.1	0.03	0.28	0.29	-0.01	0.31	0.09	-0.13
Lsat_1_v5_gn_2_113440.1	-0.07	-0.36	-2.23	-2.23	-0.97	0.02	0.44	1.31	-0.51	-0.26	-0.04	-0.23	0.57	0.47	0.17	-0.25	0.12	-1.82	0.19	0.05	-0.2	0.05	-1.91	0.69	0.06	0.11	0.31	0.04	-0.08	0.12	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_114861.1 (PIP2D)	-0.67	-0.51	-0.8	-1.03	-1.44	-0.35	0.87	0.97	-0.22	-0.32	-0.24	-0.27	0.39	-0.69	-0.34	0.56	0.6	-1.38	-0.28	0.21	0.32	0.36	-2.13	0.28	0.46	0.51	0.4	0.15	0.01	0.03	0.02
Lsat_1_v5_gn_2_116080.1 (TPR6)	-0.81	-0.75	-0.86	-0.92	-0.32	0.15	0.35	1.01	-0.3	-0.35	0.05	-0.13	0.07	-0.5	-0.33	-0.16	-0.34	-0.15	0.09	-0.14	-0.11	0.07	0.79	0.33	-0.01	-0.03	0.02	-0.19	0.26	0.48	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_128901.1	-0.63	-0.39	-0.68	-1.12	-0.82	0.45	0.69	0.88	0.07	-0.05	0.07	-0.24	-0.24	-0.11	0.16	0.35	0.31	-2.38	0.32	0.12	0.18	0.31	-5.17	0.19	0.24	0.33	0.44	0.16	-0.34	-0.05	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_129860.1 (CYP704A2)	-0.9	-0.49	-1.34	-1.51	-0.39	0.65	0.54	0.27	0.06	-0.14	0.07	-0.28	-0.15	0.17	0.22	0.35	0.15	-1.96	0.26	0.04	0.23	0.3	-0.89	0.08	0.21	0.32	0.28	0.24	0.33	0.25	-0.19
Lsat_1_v5_gn_2_19660.1	-0.47	-0.47	-0.94	-1.03	-0.1	0.41	0.57	0.61	-0.08	-0.11	-0.04	-0.27	0.0	0.38	0.46	0.3	0.17	-1.03	0.02	-0.08	-0.09	0.01	-0.16	-0.09	-0.08	0.05	0.06	-0.02	0.11	0.22	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_2161.1 (PMI1)	-0.35	-0.27	-0.97	-1.04	-0.07	0.51	0.49	0.57	-0.3	-0.37	-0.18	-0.39	0.06	0.77	0.58	0.33	0.14	-1.71	0.23	-0.15	0.02	0.13	-0.22	-0.04	0.04	0.08	0.02	-0.02	-0.03	0.01	-0.15
Lsat_1_v5_gn_2_21620.1 (RAT4)	-0.51	0.19	-1.65	-2.68	-0.29	-0.36	0.92	1.12	-1.0	-1.3	-1.03	-0.95	0.02	0.69	1.32	0.57	0.89	-0.92	0.33	-0.44	-0.27	-0.43	-2.9	-0.02	-0.2	-0.41	0.1	-0.4	0.81	0.29	0.02
Lsat_1_v5_gn_2_21801.1 (RAT4)	-0.8	0.09	-1.99	-2.41	-0.37	-0.09	0.74	0.91	-0.66	-0.63	-0.79	-0.62	-0.43	0.33	1.13	0.53	0.91	-2.27	0.84	-0.05	-0.15	0.16	-2.5	-0.04	0.2	-0.08	0.26	-0.53	0.36	0.27	0.05
Lsat_1_v5_gn_2_28161.1	-1.19	-1.97	-1.56	-0.88	-0.17	0.5	0.44	0.55	-0.04	0.14	0.3	-0.08	-0.35	-0.13	0.29	0.06	-0.19	-0.53	0.18	0.14	0.27	0.05	0.31	0.01	-0.13	0.33	0.31	0.12	0.18	0.17	0.09
Lsat_1_v5_gn_2_29261.1	-0.09	-0.39	-0.78	-0.76	0.05	0.13	0.3	0.66	-0.45	-0.47	-0.17	-0.27	0.42	0.25	0.26	0.08	0.18	-0.36	-0.0	-0.23	-0.14	0.04	0.61	-0.01	-0.06	-0.09	-0.03	-0.02	-0.11	-0.12	0.37
Lsat_1_v5_gn_2_32180.1 (SCAB1)	-0.09	-0.09	-0.42	-0.58	-0.07	0.18	0.39	0.52	-0.23	-0.27	-0.16	-0.28	-0.2	0.36	0.48	0.17	0.08	-0.71	0.22	-0.05	-0.02	0.09	-0.41	-0.01	0.03	0.05	-0.02	-0.0	0.16	0.04	0.05
Lsat_1_v5_gn_2_38080.1 (CIPK3)	-0.23	-0.24	-0.31	-0.54	-0.54	0.26	0.62	0.84	-0.23	-0.2	-0.05	-0.23	0.32	-0.23	-0.28	0.14	0.12	-0.59	0.35	0.08	-0.01	0.05	-0.76	-0.06	0.03	0.07	0.01	0.01	0.05	0.1	0.22
Lsat_1_v5_gn_2_41221.1 (CHM)	-0.95	-0.63	-1.98	-2.55	-0.61	0.46	0.7	1.38	-0.42	-0.49	-0.19	-0.3	-0.12	0.6	0.22	0.12	0.01	-1.58	-0.16	0.18	0.07	0.29	-0.74	0.28	0.11	0.11	0.02	-0.22	-0.06	0.06	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_42020.1	-0.29	-0.51	-0.51	-0.33	-0.29	0.07	0.44	0.48	-0.05	-0.03	0.02	-0.14	0.04	-0.21	-0.27	0.18	0.21	-1.37	0.07	0.16	0.15	0.14	0.04	0.29	0.2	0.25	0.3	0.14	-0.09	-0.1	-0.08
Lsat_1_v5_gn_2_42120.1 (GATA1)	-0.42	-0.34	-0.71	-0.34	0.05	0.07	0.32	0.81	-0.19	-0.22	-0.07	-0.08	0.35	0.07	0.31	0.29	0.15	-0.47	0.09	-0.08	0.04	0.03	-0.31	0.14	0.07	-0.01	0.01	-0.22	-0.22	-0.08	0.06
Lsat_1_v5_gn_2_47140.1 (VC2)	-1.07	-0.62	-1.18	-1.25	-1.38	-0.79	1.07	1.02	-0.04	0.09	-0.17	0.09	0.43	-0.25	-0.08	0.16	0.36	-1.64	0.45	0.31	0.1	0.2	-4.04	0.43	0.24	0.15	0.2	0.36	0.32	0.06	-0.25
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Lsat_1_v5_gn_9_97161.1 (AGAP1)	-0.75	-0.19	-0.99	-0.77	-0.17	0.27	0.39	0.44	-0.08	-0.15	-0.07	-0.09	0.18	-0.01	0.12	0.46	0.33	-1.57	0.12	0.14	0.08	0.19	-1.5	0.31	0.21	0.2	0.17	0.02	0.07	0.16	0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.