Heatmap: Cluster_139 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_300.1 (ERF1)	-2.36	-1.82	-1.41	-0.26	0.97	0.82	0.19	-0.43	-0.74	-0.51	-0.46	-0.57	-2.08	1.36	1.61	0.01	-0.01	1.1	1.1	0.09	-0.19	-0.51	-1.4	-0.31	-0.55	-0.47	-0.24	-0.25	-0.46	-0.75	-0.7
Lsat_1_v5_gn_0_45380.1	-0.62	-0.56	-0.6	-0.45	0.43	0.35	-0.09	-0.05	-0.2	-0.11	-0.13	-0.11	-0.35	0.52	0.47	0.04	-0.15	0.84	0.15	-0.22	-0.21	-0.08	0.61	-0.26	-0.36	-0.08	-0.03	-0.32	0.09	0.02	0.1
Lsat_1_v5_gn_0_45521.1	-1.76	-1.1	-1.53	-1.39	1.16	0.43	-1.56	-2.35	-0.86	-0.27	-0.19	-0.55	1.12	1.22	0.69	-0.19	-0.42	1.4	0.05	-0.57	-0.83	-0.83	0.33	-0.11	-0.19	-0.68	-0.76	-0.61	-0.97	-0.05	1.51
Lsat_1_v5_gn_0_4961.1 (EDR3)	-0.45	-0.42	-0.26	0.09	0.43	0.37	-0.39	-0.22	-0.25	-0.46	-0.15	-0.26	-0.36	0.43	0.35	-0.06	-0.45	0.78	0.62	-0.14	-0.36	-0.36	0.92	-0.32	-0.29	-0.33	-0.35	-0.51	0.06	0.08	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_10340.1	-0.65	-0.43	-0.9	-0.63	0.46	0.33	-0.5	-0.31	-0.6	-0.73	-0.52	-0.41	-0.2	0.93	0.79	-0.09	-0.42	1.33	0.22	-0.25	-0.3	-0.27	0.84	-0.33	-0.32	-0.25	-0.24	-0.55	0.08	0.21	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_10481.1 (OEX2)	-0.37	-0.42	-0.34	-0.32	0.24	0.43	-0.08	0.02	-0.46	-0.29	-0.37	-0.46	0.11	0.81	0.39	0.04	-0.26	0.67	-0.07	-0.47	-0.21	-0.16	0.28	-0.21	-0.23	-0.16	-0.2	-0.27	0.4	0.16	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_107441.1 (LBD9)	-0.88	-0.5	-1.26	-0.7	0.42	0.22	-0.33	-0.29	-0.28	-0.27	-0.31	-0.3	-0.1	1.02	0.73	-0.04	-0.26	1.15	0.34	-0.35	-0.2	-0.06	0.26	-0.4	-0.68	-0.18	-0.08	-0.66	0.2	0.28	0.46
Lsat_1_v5_gn_1_124521.1	-0.25	-0.36	-0.55	-0.58	0.76	0.52	-0.72	-1.14	-0.83	-0.85	-0.71	-0.79	-0.44	1.36	1.11	-0.3	-0.69	1.99	-0.27	-0.84	-0.74	-0.66	1.25	-0.82	-0.64	-0.67	-0.56	-0.57	-0.06	-0.32	-0.46
Lsat_1_v5_gn_1_127621.1	-0.45	-0.37	-0.38	-0.38	0.29	0.31	-0.38	-0.32	-0.48	-0.4	-0.25	-0.32	0.29	0.57	0.15	0.04	-0.3	1.25	-0.17	-0.5	-0.36	-0.26	0.76	-0.45	-0.15	-0.05	-0.04	-0.08	0.08	0.12	0.26
Lsat_1_v5_gn_1_129840.1 (NUDT2)	-0.7	-0.73	-0.85	-0.86	0.43	0.38	-0.24	-0.33	-0.52	-0.45	-0.16	-0.16	0.12	1.22	0.87	0.07	-0.16	0.5	0.13	-0.17	-0.14	-0.33	0.09	-0.13	-0.18	-0.25	-0.17	-0.24	0.05	0.02	0.47
Lsat_1_v5_gn_1_13480.1	-0.45	-0.63	-0.96	-0.57	0.4	0.16	-0.32	-0.09	-0.53	-0.51	-0.62	-0.37	0.42	0.66	0.57	-0.34	-0.33	1.48	-0.21	-0.64	-0.45	-0.05	1.01	-0.37	-0.22	-0.17	-0.28	-0.21	0.12	-0.04	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_13560.1	-0.4	-0.67	-0.69	-0.41	0.48	0.31	-0.43	-0.55	-0.37	-0.43	-0.38	-0.38	0.2	0.58	0.64	-0.05	-0.07	1.45	-0.28	-0.49	-0.33	-0.16	1.01	-0.48	-0.17	-0.29	-0.37	-0.35	0.08	-0.05	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_14320.1 (PRR1)	-2.53	-2.92	-3.19	-2.8	1.29	1.64	-2.25	-1.98	-1.6	-2.05	-1.34	-1.28	-0.28	2.49	0.87	0.23	-1.51	1.49	-0.01	-1.77	-1.02	-0.62	1.15	-0.45	-0.44	-0.93	-0.61	-1.54	-0.28	-0.34	0.28
Lsat_1_v5_gn_1_15440.1 (UGT89B1)	-0.24	-0.42	-1.52	-1.18	-0.14	-0.24	-0.83	-0.83	-0.87	-0.59	-0.75	-0.68	0.04	1.95	1.22	-0.03	-0.27	1.27	-0.02	-0.42	-0.44	-0.95	0.84	-0.59	-0.46	-0.46	-0.6	-0.91	0.0	0.08	0.77
Lsat_1_v5_gn_1_15541.1 (PK3)	-0.63	-0.58	-0.94	-0.83	0.3	0.25	-0.28	-0.49	-0.37	-0.29	-0.18	-0.33	0.29	0.79	0.65	0.03	-0.04	0.94	-0.08	-0.28	-0.28	-0.13	0.52	-0.17	-0.18	-0.24	-0.22	-0.31	0.28	0.27	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_17000.1 (CB5-E)	-0.52	-0.26	-0.28	-0.27	0.3	0.51	-0.3	-0.26	-0.35	-0.38	-0.4	-0.27	0.28	0.64	0.29	0.13	-0.13	0.81	-0.06	-0.22	-0.23	-0.15	-0.2	-0.34	-0.17	-0.02	-0.15	-0.15	0.3	0.17	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_20141.1	-0.88	-1.94	-3.31	-2.94	1.03	0.97	-1.2	-1.17	-1.32	-1.03	-1.17	-1.22	-0.36	1.9	1.52	-0.12	-0.87	1.93	0.33	-0.89	-0.36	-0.31	0.71	-0.64	-0.73	-0.56	-0.49	-0.65	-0.1	-0.6	-0.33
Lsat_1_v5_gn_1_20661.1 (PLP2)	-2.48	-2.42	-2.95	-3.66	1.31	1.04	-2.22	-2.27	-2.06	-2.28	-1.73	-2.45	-0.4	1.83	1.76	-0.77	-2.26	2.96	0.65	-1.72	-1.54	-1.47	1.49	-1.43	-1.45	-1.89	-1.18	-1.8	-1.25	-1.25	-1.72
Lsat_1_v5_gn_1_2440.1 (LOLITA)	-0.38	-0.34	-0.87	-0.51	0.32	0.39	-0.22	-0.15	-0.51	-0.38	-0.36	-0.43	0.13	0.68	0.41	0.02	-0.2	1.21	0.1	-0.15	-0.26	-0.16	0.46	-0.2	-0.39	-0.21	-0.19	-0.14	0.19	-0.13	0.29
Lsat_1_v5_gn_1_30101.1 (APC3)	-1.59	-1.29	-1.45	-0.74	0.98	0.65	-1.7	-1.46	-0.54	-0.8	-0.26	-0.3	0.47	1.15	0.56	-0.35	-0.79	1.3	-0.01	-0.71	-0.45	-0.48	0.84	-0.18	-0.39	-0.47	-0.32	-0.78	0.27	0.35	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_34061.1 (GA4)	-3.57	-2.71	-3.84	-3.21	1.13	1.34	-1.14	-1.44	-1.72	-1.66	-1.64	-1.47	0.76	2.81	0.93	-2.01	-2.29	1.71	-1.22	-2.62	-2.1	-2.44	2.15	-0.74	-0.82	-2.64	-1.73	-1.86	-0.59	-1.29	-0.03
Lsat_1_v5_gn_1_37160.1 (NF-YA8)	-1.46	-2.39	-1.63	-1.39	0.89	-0.07	-1.54	-2.25	-1.0	-1.57	-1.1	-1.96	-1.33	2.13	1.31	-1.02	-1.3	2.82	-0.13	-1.06	-1.32	-1.08	1.67	-0.76	-1.58	-0.9	-1.21	-1.24	-0.65	-1.17	-0.41
Lsat_1_v5_gn_1_38561.1 (RAP2.2)	-0.64	-0.94	-1.06	-1.18	0.15	0.23	-0.25	-0.32	-0.16	-0.24	-0.03	-0.21	0.34	1.3	1.06	-0.04	-0.07	0.67	0.16	0.01	-0.18	-0.16	0.15	-0.07	-0.42	-0.33	-0.23	-0.05	-0.26	-0.25	0.12
Lsat_1_v5_gn_1_40641.1 (ARFA1F)	-0.45	-0.61	-0.67	-0.81	0.21	0.31	0.07	-0.06	-0.33	-0.31	-0.38	-0.39	0.14	0.93	0.5	-0.12	-0.07	0.73	0.02	-0.12	-0.2	-0.0	0.15	-0.12	-0.16	-0.14	-0.07	0.01	0.24	0.05	0.17
Lsat_1_v5_gn_1_41201.1 (RAF11)	-1.02	-0.58	-0.91	-0.6	0.81	0.46	-0.61	-0.58	-0.37	-0.33	-0.24	-0.38	-0.53	1.36	0.96	-0.15	-0.49	0.82	-0.05	-0.58	-0.49	-0.42	0.6	-0.58	-0.57	-0.37	-0.38	-0.88	0.55	0.46	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_42920.1 (GOS11)	-0.19	-0.2	-0.31	-0.22	0.18	0.04	-0.05	-0.43	-0.37	-0.31	-0.25	-0.26	-0.05	0.79	0.64	-0.26	-0.22	0.91	0.0	-0.18	-0.16	-0.12	0.6	-0.4	-0.32	-0.18	-0.15	-0.34	0.15	0.05	0.2
Lsat_1_v5_gn_1_52821.1 (PBL37)	-0.47	0.04	-0.99	-0.67	0.91	0.75	-0.55	-0.87	-0.38	-0.57	-0.53	-0.87	-0.61	0.89	0.74	0.02	-0.62	1.73	-0.05	-0.57	-0.44	-0.39	1.07	-0.76	-0.42	-0.15	-0.19	-0.76	0.02	-0.13	-0.73
Lsat_1_v5_gn_1_54681.1 (PP2C.D4)	-1.5	-1.55	-1.22	-1.24	0.17	-0.17	-0.45	-0.9	-0.72	-0.03	-0.37	-0.1	0.05	1.2	1.22	0.24	-0.25	1.31	-0.14	-0.21	-0.24	-0.38	0.84	-0.26	-0.31	-0.38	0.0	-0.51	0.17	0.03	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_54721.1 (RSW7)	-1.88	-1.55	-1.78	-1.86	0.83	0.66	-1.18	-1.15	-0.94	-1.26	-0.93	-1.3	0.23	1.88	1.12	-0.51	-1.34	2.28	0.04	-1.11	-1.16	-0.95	1.11	-1.29	-1.04	-0.95	-1.02	-1.39	0.04	-0.3	0.97
Lsat_1_v5_gn_1_60200.1	-0.36	-2.59	-5.11	-3.95	1.74	1.42	-3.92	-3.45	-2.95	-2.21	-1.35	-2.26	-0.38	2.02	1.98	-0.08	-1.83	1.86	0.95	-1.1	-0.45	-0.33	-5.74	-0.89	-0.83	-0.86	-0.21	-0.19	-0.02	-0.61	-2.08
Lsat_1_v5_gn_1_69401.1	-0.66	-0.48	-0.4	-0.33	0.31	0.48	-0.05	-0.23	-0.28	-0.21	-0.1	-0.38	-0.21	0.52	0.39	0.03	-0.28	1.02	0.1	-0.28	-0.18	-0.12	0.39	-0.37	-0.23	-0.02	-0.02	-0.52	0.24	0.16	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_77340.1 (TRO)	-0.44	-0.81	-0.95	-0.52	0.67	0.35	-0.63	-0.49	-0.57	-0.53	-0.19	-0.35	0.09	0.95	0.78	0.16	-0.31	0.75	0.08	-0.34	-0.19	-0.25	0.68	-0.41	-0.27	-0.2	-0.23	-0.43	0.29	0.19	0.39
Lsat_1_v5_gn_2_101060.1	-1.18	-0.6	-0.83	-0.86	0.85	0.67	-0.28	-0.66	-0.63	-0.64	-0.45	-0.8	-0.84	1.23	1.27	0.36	0.0	1.5	0.72	-0.36	-0.36	-0.24	0.16	-0.89	-0.77	-0.69	-0.54	-0.94	-0.03	-0.0	-0.33
Lsat_1_v5_gn_2_104961.1 (SAP3)	-0.3	-0.33	-0.75	-1.4	0.84	0.43	-1.6	-2.0	-0.57	-0.92	-0.36	-1.14	-0.54	2.34	1.66	-0.14	-0.77	1.91	0.06	-0.71	-0.9	-0.8	-0.13	-0.96	-1.04	-0.81	-0.8	-0.86	-0.54	-1.01	-0.9
Lsat_1_v5_gn_2_106540.1 (PAL1)	-0.43	0.71	-1.06	-1.83	0.62	-0.31	0.18	0.36	-1.4	-1.46	-1.39	-1.65	0.2	1.03	1.26	-0.22	-0.24	2.24	0.63	-0.57	-0.88	-0.7	0.26	-0.74	-0.8	-0.6	-0.63	-0.93	-0.21	-0.76	-0.72
Lsat_1_v5_gn_2_107780.1 (ERF1)	-0.34	-0.85	-0.04	0.35	1.29	0.43	-0.44	-0.59	-0.68	-0.62	-0.38	-0.25	-1.85	1.47	1.27	-0.21	-0.27	1.03	0.26	-0.41	-0.49	-0.3	-0.53	-0.9	-0.97	-0.9	-0.51	-0.36	0.26	-0.09	-0.4
Lsat_1_v5_gn_2_110540.1 (LPEAT1)	-0.41	-0.5	-0.41	-0.17	0.55	0.42	-0.38	-0.55	-0.11	-0.07	0.06	-0.1	-0.15	0.59	0.53	0.04	-0.29	0.76	0.05	-0.34	-0.19	-0.11	-0.35	-0.33	-0.25	-0.07	-0.02	-0.2	0.27	0.12	0.33
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.