1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_159 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.57 0.25 0.31 0.19 -0.04 -0.3 0.07 -0.12 0.28 0.31 0.31 0.41 0.12 -0.78 -0.54 -0.1 0.13 -3.2 -0.06 0.11 0.05 0.07 -1.5 0.31 0.17 0.01 0.04 0.45 -0.31 -0.21 -0.44
0.73 0.41 0.31 0.08 -0.37 -0.28 0.13 -0.08 0.33 0.28 0.22 0.35 0.01 -1.13 -0.92 0.05 0.28 -4.21 -0.07 0.2 0.19 0.18 -3.34 0.35 0.25 0.11 0.14 0.42 -0.24 -0.14 -0.6
0.36 0.12 0.19 0.07 -0.27 -0.11 0.03 -0.05 0.2 0.18 0.23 0.34 0.17 -0.82 -0.54 0.22 0.34 -2.43 0.03 0.21 0.12 0.17 -1.89 0.21 0.19 0.05 0.09 0.45 -0.23 -0.07 -0.42
0.26 -0.0 -0.01 -0.05 -0.99 -0.8 0.18 0.35 0.3 0.26 0.36 0.51 0.54 -0.97 -0.47 -0.03 0.25 -2.33 -0.08 0.25 0.12 0.12 -3.42 0.36 0.26 0.13 0.14 0.41 -0.15 -0.05 -0.19
0.39 0.07 0.24 0.26 -0.32 -0.35 0.06 0.14 0.19 0.17 0.3 0.38 0.27 -0.36 -0.3 0.07 0.3 -2.9 -0.1 0.1 0.05 0.06 -1.82 0.16 0.12 0.08 0.03 0.38 -0.23 -0.09 -0.37
0.3 0.21 -0.01 -0.29 -1.31 -0.69 0.48 0.18 0.36 0.32 0.25 0.59 0.5 -0.6 -0.56 -0.07 0.34 -3.13 -0.52 0.15 0.19 0.24 -2.17 0.41 0.33 0.34 0.19 0.52 -0.58 -0.42 -0.37
0.33 0.05 0.03 0.17 -0.14 -0.24 0.03 -0.13 0.24 0.19 0.28 0.35 0.16 -0.42 -0.32 0.1 0.21 -3.06 -0.04 0.16 0.09 0.18 -1.82 0.3 0.26 0.12 0.17 0.24 -0.2 -0.09 -0.24
0.54 0.21 0.2 0.07 -0.48 -0.23 0.27 0.22 0.22 0.19 0.17 0.25 -0.02 -0.6 -0.42 0.12 0.25 -3.38 0.1 0.22 0.16 0.19 -2.83 0.23 0.17 0.09 0.07 0.43 -0.15 -0.13 -0.61
0.47 -0.2 -0.26 -0.42 -0.43 0.0 0.05 -0.15 0.1 0.11 0.2 0.27 0.47 -0.4 -0.41 0.01 0.16 -2.23 -0.07 0.22 0.14 0.32 -1.2 0.43 0.43 0.2 0.28 0.7 -0.54 -0.34 -0.57
0.49 0.07 -0.04 0.03 0.03 0.08 0.28 0.17 0.27 0.34 0.21 0.28 0.17 -0.47 -0.51 0.01 0.25 -3.54 -0.12 0.09 0.12 0.18 -2.5 0.28 0.26 0.06 0.16 0.49 -0.41 -0.42 -0.72
0.5 -0.05 0.03 0.13 -0.64 -0.59 0.09 -0.0 0.28 0.35 0.33 0.56 0.41 -0.85 -0.71 0.06 0.39 -2.55 -0.21 0.17 0.11 0.16 -2.88 0.42 0.33 0.17 0.11 0.63 -0.44 -0.31 -0.53
0.63 0.24 0.14 -0.02 -0.46 -0.45 0.19 0.15 0.33 0.3 0.2 0.34 0.08 -0.7 -0.43 -0.07 0.21 -2.23 -0.18 0.14 0.1 0.14 -1.94 0.35 0.2 0.08 0.06 0.25 -0.11 -0.06 -0.29
0.81 -0.13 -0.01 -0.05 -1.16 -0.76 -0.11 -0.18 0.29 0.32 0.26 0.59 0.39 -1.74 -1.42 0.03 0.45 -3.13 -0.24 0.45 0.33 0.29 -2.89 0.61 0.46 0.26 0.34 0.92 -0.71 -0.57 -0.97
0.85 0.05 0.05 -0.23 -1.06 -1.37 -0.26 -0.22 0.61 0.52 0.37 0.59 0.3 -2.97 -1.52 -0.1 0.31 -8.09 -0.0 0.6 0.48 0.39 -8.67 0.64 0.47 0.19 0.35 0.9 -0.86 -0.63 -1.17
0.84 0.39 0.36 0.04 -1.11 -1.14 0.13 0.18 0.5 0.36 0.25 0.43 0.08 -2.64 -1.27 -0.08 0.3 -9.27 0.0 0.48 0.36 0.27 -8.23 0.44 0.34 0.15 0.26 0.63 -0.53 -0.38 -0.83
0.55 -0.06 0.08 -0.08 -1.2 -1.16 -0.12 -0.19 0.43 0.42 0.35 0.63 0.48 -2.19 -1.18 0.09 0.47 -5.27 0.13 0.56 0.36 0.25 -7.5 0.63 0.41 0.13 0.26 0.64 -0.58 -0.31 -0.71
0.71 -0.01 0.17 0.13 -0.77 -1.16 0.02 -0.15 0.51 0.48 0.43 0.66 0.31 -2.6 -1.26 0.0 0.4 -5.26 -0.03 0.47 0.3 0.21 -7.6 0.51 0.37 0.1 0.23 0.64 -0.73 -0.38 -0.65
0.28 -0.0 0.19 0.16 -0.45 -0.55 0.17 0.07 0.35 0.37 0.41 0.49 0.2 -1.33 -0.53 0.17 0.37 -2.35 0.08 0.32 0.13 0.07 -2.17 0.19 0.15 0.14 0.14 0.29 -0.25 -0.13 -0.56
0.65 0.05 0.07 0.03 -0.13 -0.15 0.19 0.09 0.31 0.3 0.23 0.37 0.39 -0.95 -0.51 0.0 0.29 -3.64 -0.11 0.22 0.09 0.08 -3.24 0.34 0.15 0.02 0.11 0.54 -0.39 -0.25 -0.56
0.69 0.11 0.19 0.22 -0.74 -0.45 0.17 0.09 0.21 0.24 0.22 0.48 0.58 -1.23 -1.12 -0.01 0.28 -3.12 -0.22 0.15 0.11 0.11 -2.16 0.37 0.28 0.15 0.12 0.67 -0.56 -0.31 -0.44
0.31 -0.17 -0.26 -0.08 -0.86 -0.46 -0.04 0.11 0.29 0.29 0.26 0.32 0.53 -0.99 -0.81 -0.09 0.08 -2.63 -0.12 0.38 0.2 0.37 -2.17 0.46 0.4 0.3 0.33 0.56 -0.18 -0.07 -0.28
0.27 -0.03 0.07 0.03 -0.43 -0.31 0.08 0.02 0.19 0.25 0.26 0.32 0.19 -0.71 -0.44 0.08 0.24 -2.5 0.13 0.18 0.12 0.22 -1.37 0.27 0.21 0.14 0.11 0.38 -0.17 -0.0 -0.22
0.03 -0.16 -0.38 -0.41 -0.56 -0.42 -0.08 -0.15 0.45 0.44 0.43 0.56 0.5 -0.55 -0.68 -0.13 0.25 -2.35 0.0 0.18 0.1 0.06 -1.95 0.55 0.32 0.05 0.23 0.54 -0.38 -0.01 0.12
0.19 -0.55 -0.49 -0.35 0.04 0.01 -0.21 -0.09 0.17 0.15 0.28 0.43 0.69 -0.74 -0.63 0.23 0.28 -2.73 0.02 0.24 0.21 0.24 -2.58 0.52 0.42 0.1 0.19 0.84 -0.54 -0.43 -0.46
0.75 0.24 0.26 0.35 -0.05 -0.49 0.17 0.16 0.4 0.33 0.28 0.45 0.1 -0.73 -0.39 -0.13 0.16 -3.48 -0.09 0.13 0.04 0.06 -2.49 0.26 0.1 -0.09 -0.01 0.62 -0.42 -0.48 -0.8
0.53 0.13 0.19 0.13 -0.63 -0.53 0.02 -0.08 0.31 0.27 0.29 0.45 0.2 -1.09 -0.74 0.15 0.37 -3.25 0.01 0.3 0.21 0.14 -2.23 0.39 0.28 0.14 0.14 0.44 -0.32 -0.19 -0.51
0.12 -0.21 0.06 0.03 -1.39 -0.8 0.15 0.09 0.31 0.43 0.38 0.69 0.61 -2.57 -2.26 0.01 0.38 -2.9 -0.54 0.33 0.29 0.34 -2.85 0.58 0.52 0.42 0.33 0.6 -0.66 -0.18 -0.2
0.56 -0.0 -0.12 -0.03 -0.4 -0.12 0.13 0.12 0.04 0.14 0.27 0.33 0.47 -0.57 -0.54 0.04 0.28 -1.87 -0.1 0.06 -0.03 0.13 -1.79 0.35 0.21 0.18 0.09 0.44 -0.43 -0.2 -0.05
0.48 0.13 0.18 0.18 -0.3 -0.41 0.25 0.11 0.31 0.29 0.29 0.45 0.41 -0.49 -0.23 0.15 0.41 -3.46 -0.04 0.14 0.01 0.02 -2.8 0.19 0.13 -0.09 -0.06 0.33 -0.46 -0.31 -0.35
0.11 -0.1 0.09 0.18 -0.98 -0.95 0.16 0.13 0.32 0.43 0.38 0.56 0.47 -1.75 -0.97 0.05 0.4 -2.56 -0.09 0.39 0.11 0.13 -3.23 0.44 0.31 0.01 0.07 0.59 -0.26 0.03 -0.15
0.53 0.08 0.11 0.14 -0.19 -0.3 0.09 -0.04 0.31 0.3 0.36 0.45 0.38 -0.9 -0.7 -0.04 0.27 -3.91 -0.27 0.14 0.15 0.16 -2.65 0.42 0.3 0.06 0.12 0.61 -0.46 -0.29 -0.52
0.56 -0.04 -0.06 0.17 -0.13 -0.32 0.28 0.34 0.34 0.29 0.31 0.43 0.38 -0.53 -0.31 -0.01 0.25 -2.78 -0.2 0.09 0.06 0.09 -1.96 0.29 0.09 0.0 0.01 0.36 -0.47 -0.42 -0.46
0.25 -0.1 0.09 0.23 -0.47 -0.27 0.18 0.08 0.24 0.28 0.34 0.43 0.32 -1.01 -0.61 0.03 0.26 -2.56 -0.18 0.22 0.1 0.1 -2.36 0.31 0.25 0.17 0.19 0.5 -0.33 -0.1 -0.18
0.5 0.02 0.24 0.2 -0.54 -0.58 0.08 -0.15 0.57 0.46 0.5 0.59 0.27 -1.4 -0.56 0.15 0.29 -3.56 -0.23 0.18 0.05 0.09 -4.25 0.25 0.11 0.13 0.16 0.39 -0.47 -0.13 -0.15
0.53 0.08 0.11 0.03 -0.68 -0.32 0.42 0.35 0.22 0.25 0.27 0.39 0.1 -1.4 -1.0 -0.05 0.19 -3.14 -0.13 0.29 0.22 0.35 -2.24 0.33 0.3 0.22 0.23 0.67 -0.41 -0.34 -0.73
0.61 -0.1 0.09 0.16 -0.2 -0.35 0.03 -0.09 0.42 0.47 0.4 0.65 0.44 -1.35 -0.73 0.29 0.54 -4.04 -0.17 0.18 0.1 0.06 -3.43 0.31 0.26 -0.07 -0.07 0.62 -0.64 -0.41 -0.94
0.49 0.2 0.1 0.07 -0.17 -0.25 -0.02 -0.07 0.21 0.2 0.2 0.28 0.09 -0.36 -0.21 0.06 0.26 -3.23 0.27 0.17 0.15 0.12 -2.15 0.28 0.19 0.06 0.1 0.23 -0.08 -0.11 -0.56
0.54 -0.09 -0.09 -0.14 0.15 -0.18 0.13 -0.22 0.23 0.29 0.27 0.36 0.39 -0.86 -0.51 0.21 0.39 -2.42 0.04 0.22 0.13 0.16 -1.72 0.21 0.32 0.01 0.14 0.89 -0.81 -0.92 -0.87
0.46 0.02 0.04 0.04 -0.29 -0.25 0.12 -0.07 0.33 0.32 0.26 0.37 0.3 -0.79 -0.44 0.05 0.27 -3.17 0.02 0.19 0.11 0.14 -3.55 0.36 0.21 0.12 0.14 0.44 -0.26 -0.1 -0.36
0.69 0.21 0.18 0.11 -0.21 -0.19 0.16 0.01 0.19 0.17 0.1 0.25 0.29 -0.7 -0.61 0.05 0.3 -3.08 -0.01 0.17 0.11 0.17 -2.14 0.4 0.27 -0.06 0.04 0.56 -0.41 -0.32 -0.64
0.6 0.07 0.19 0.26 -0.77 -0.67 0.08 -0.05 0.36 0.36 0.38 0.53 0.35 -1.61 -0.92 0.18 0.47 -3.84 -0.18 0.28 0.17 0.15 -3.74 0.36 0.34 0.06 0.06 0.6 -0.54 -0.27 -0.43
0.35 0.02 -0.03 -0.15 -0.45 -0.35 -0.06 -0.3 0.29 0.27 0.26 0.4 0.43 -0.31 -0.31 0.01 0.33 -2.57 -0.04 0.1 0.11 0.13 -1.16 0.44 0.3 0.11 0.18 0.4 -0.4 -0.24 -0.29
0.57 0.08 0.02 0.04 -0.22 -0.14 0.09 -0.11 0.23 0.2 0.23 0.33 0.31 -0.54 -0.39 0.08 0.25 -2.88 0.4 0.26 0.11 0.12 -3.1 0.3 0.19 0.04 0.1 0.61 -0.39 -0.37 -0.95
0.42 0.0 0.03 -0.05 -0.38 -0.13 0.13 0.04 0.2 0.19 0.11 0.27 0.16 -0.39 -0.26 -0.02 0.2 -2.71 -0.05 0.23 0.16 0.14 -1.85 0.34 0.21 0.16 0.2 0.52 -0.25 -0.07 -0.41
0.34 -0.0 0.11 0.2 -0.27 -0.2 0.24 0.2 0.15 0.26 0.23 0.4 0.47 -1.03 -0.72 0.04 0.16 -2.4 -0.12 0.17 0.07 0.07 -2.08 0.37 0.22 0.03 0.05 0.38 -0.28 -0.11 -0.12
0.63 0.1 0.11 0.13 -0.29 -0.47 0.11 0.06 0.31 0.32 0.3 0.5 0.41 -0.57 -0.39 0.07 0.41 -3.84 -0.07 0.21 0.08 0.04 -4.5 0.38 0.24 -0.06 -0.01 0.53 -0.5 -0.37 -0.75
0.3 -0.15 -0.02 -0.07 -0.66 -0.42 0.22 0.18 0.31 0.28 0.26 0.46 0.28 -1.14 -0.78 0.1 0.34 -2.58 -0.07 0.32 0.21 0.2 -1.94 0.34 0.31 0.34 0.31 0.46 -0.32 -0.14 -0.74
0.6 0.06 -0.02 -0.11 -0.51 -0.04 0.18 -0.07 0.25 0.28 0.25 0.37 0.32 -1.06 -0.88 0.0 0.24 -3.4 -0.1 0.22 0.19 0.32 -2.76 0.34 0.24 0.28 0.33 0.76 -0.42 -0.42 -0.74
0.41 0.07 0.14 0.06 -0.46 -0.45 0.19 0.29 0.14 0.13 0.14 0.3 0.24 -0.38 -0.33 0.01 0.2 -2.0 0.02 0.14 0.12 0.12 -0.83 0.23 0.2 0.12 0.09 0.36 -0.26 -0.23 -0.57
0.21 -0.03 -0.17 -0.24 -0.35 -0.53 -0.13 -0.52 0.32 0.41 0.42 0.47 0.54 -0.29 -0.13 -0.17 0.25 -2.31 -0.09 0.15 -0.02 0.06 -2.61 0.52 0.3 0.06 0.04 0.5 -0.41 -0.13 0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.