Heatmap: Cluster_118 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_18260.1	-0.85	-0.86	-0.83	-0.77	0.41	0.26	-0.35	-0.7	-0.02	0.09	0.07	0.13	0.09	0.82	0.75	-0.15	-0.17	0.28	0.23	-0.09	-0.19	-0.06	-1.14	-0.3	-0.15	-0.1	-0.05	-0.35	0.4	0.42	0.73
Lsat_1_v5_gn_0_20821.1	-2.48	-2.27	-3.26	-1.73	0.53	0.61	-0.9	-0.84	0.06	-0.2	0.07	-0.1	0.24	1.16	0.82	-0.27	-0.15	0.25	0.38	-0.13	0.29	0.54	-1.78	-0.56	-0.01	0.29	0.02	-0.28	0.52	0.29	0.66
Lsat_1_v5_gn_0_27421.1 (SEC14)	-1.23	-1.05	-1.4	-0.53	0.25	0.14	-0.35	-0.38	0.1	0.2	0.2	0.01	-0.15	0.76	0.81	0.22	-0.09	0.98	0.43	-0.25	-0.38	-0.17	-0.44	-0.49	-0.13	-0.15	-0.26	-0.57	0.12	0.37	0.45
Lsat_1_v5_gn_0_5721.1	-1.71	-1.28	-1.54	-1.44	0.31	0.62	-0.4	-0.29	-0.28	-0.18	-0.09	-0.18	0.55	0.84	0.76	0.06	-0.1	0.47	0.26	-0.12	-0.15	-0.06	-1.04	-0.3	-0.08	-0.11	-0.28	-0.47	0.38	0.33	1.1
Lsat_1_v5_gn_1_105621.1 (CPH)	-2.45	-1.74	-1.04	-1.2	0.31	0.01	-0.72	-1.0	-0.21	0.22	-0.14	-0.0	0.16	1.15	1.0	0.16	0.14	1.06	0.43	0.08	-0.34	-0.35	-1.37	-0.27	-0.59	-0.15	-0.21	-0.97	0.41	0.49	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_10621.1	-3.56	-2.84	-3.81	-2.6	0.18	-0.02	-0.41	-0.65	-0.12	-0.4	0.05	-0.29	0.17	0.87	1.14	0.08	-0.36	1.09	0.37	0.15	-0.47	-0.61	-2.75	-0.17	0.15	0.06	0.06	-0.76	0.29	0.63	1.59
Lsat_1_v5_gn_1_112881.1 (GGL7)	-2.9	-0.9	0.07	0.81	0.47	-0.18	-0.63	-0.41	0.12	0.48	0.5	0.3	-0.06	-1.81	-0.79	-0.11	-0.39	1.0	-0.38	-0.14	-0.28	0.19	-4.61	-0.49	-0.08	0.09	0.01	-0.03	0.39	0.52	1.06
Lsat_1_v5_gn_1_45081.1 (RSW1)	-0.98	-0.83	-0.75	-0.64	0.13	0.25	-0.26	-0.71	-0.06	-0.04	0.0	0.02	0.34	0.78	0.58	0.2	0.11	-0.08	0.34	-0.11	-0.25	-0.09	-0.94	-0.19	-0.08	-0.07	-0.01	-0.26	0.35	0.38	0.76
Lsat_1_v5_gn_1_59501.1 (RAC6)	-1.59	-1.48	-0.68	-0.8	0.65	0.51	0.04	-0.48	0.27	0.57	0.27	0.44	-0.11	-0.63	-0.17	0.24	-0.41	0.89	-0.19	-0.27	-0.23	-0.22	-0.17	-0.7	-0.49	0.26	0.24	-0.87	0.1	0.32	0.99
Lsat_1_v5_gn_1_72000.1 (ERD2B)	-0.65	-0.53	-0.49	-0.59	0.09	0.43	-0.12	-0.2	-0.29	-0.18	0.0	0.04	0.24	0.11	0.12	-0.02	-0.15	0.43	0.15	-0.1	-0.1	0.07	0.13	-0.04	-0.17	0.05	0.07	-0.0	0.12	0.27	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_75260.1 (arpc2b)	-1.35	-0.97	-0.8	-0.92	0.13	0.22	0.13	-0.14	-0.2	-0.14	-0.07	-0.11	-0.03	0.83	0.55	0.15	0.16	0.02	0.03	-0.05	-0.1	-0.14	-0.79	-0.03	0.1	-0.04	0.05	-0.46	0.31	0.49	0.83
Lsat_1_v5_gn_1_90121.1 (DSC1)	-0.52	-0.83	-0.59	-0.13	0.7	0.73	-0.68	-0.88	-0.19	-0.25	-0.24	-0.29	-0.33	1.09	0.65	-0.1	-0.31	0.23	0.08	-0.42	-0.22	-0.09	-0.08	-0.3	-0.34	-0.18	0.05	-0.63	0.42	0.24	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_90161.1 (XI-6)	-0.82	-0.51	-0.91	-0.63	0.72	0.47	-0.78	-0.55	-0.29	-0.31	-0.25	-0.38	0.04	1.01	0.77	0.02	-0.36	0.26	0.11	-0.21	-0.14	-0.16	-0.4	-0.47	-0.19	-0.16	0.02	-0.62	0.4	0.4	0.99
Lsat_1_v5_gn_1_91801.1 (PFD6)	-0.64	-0.76	-0.77	-0.55	0.1	0.34	-0.17	0.09	-0.41	-0.42	-0.22	-0.11	0.44	0.6	0.22	0.01	-0.21	0.23	-0.06	-0.09	0.0	0.03	0.45	-0.08	-0.03	0.03	0.07	0.1	0.08	0.09	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_94321.1 (ALP2)	-0.59	-0.67	-0.88	-0.85	-0.05	0.11	-0.19	-0.1	0.12	0.1	0.08	-0.06	-0.09	0.72	0.53	0.06	0.07	0.54	0.23	-0.09	-0.19	-0.16	-0.2	-0.26	-0.36	-0.06	-0.05	-0.45	0.25	0.46	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_1901.1 (CFK2)	-1.59	-1.55	-1.1	-0.82	0.08	0.41	-0.1	-0.23	-0.4	-0.54	-0.12	-0.64	0.23	0.96	0.86	0.19	0.03	0.37	0.24	-0.27	0.02	-0.25	-0.47	-0.14	-0.03	-0.02	0.08	-0.53	0.36	0.35	0.96
Lsat_1_v5_gn_2_35880.1 (EIN3)	-1.29	-1.59	-0.61	-0.26	-0.13	0.14	-0.33	-0.55	-0.2	-0.29	-0.07	-0.11	-0.09	1.0	0.81	0.19	0.03	0.59	0.46	-0.18	-0.1	-0.08	-0.32	-0.01	-0.13	-0.13	-0.08	-0.49	0.04	0.17	0.81
Lsat_1_v5_gn_2_75201.1	-1.19	-1.52	-1.13	-0.6	0.28	0.93	0.29	0.18	-0.07	-0.13	-0.1	-0.55	-0.7	-0.18	0.06	0.09	-0.42	1.03	0.82	0.14	-0.18	-0.1	0.52	-0.22	-0.17	-0.25	-0.04	-0.51	0.37	0.17	-0.06
Lsat_1_v5_gn_2_98041.1 (ARF4)	-1.88	-1.81	-2.3	-1.79	0.45	0.27	-0.49	-0.85	-0.11	0.01	0.04	-0.28	0.23	0.97	0.83	0.02	-0.0	0.41	0.39	-0.01	-0.02	0.05	-1.34	-0.26	-0.03	-0.07	0.22	-0.25	0.58	0.53	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_106581.1 (UBDK GAMMA 7)	-0.99	-0.77	-0.89	-0.73	0.49	0.44	-0.51	-0.69	-0.27	-0.22	-0.06	-0.16	-0.3	0.61	0.42	0.11	-0.07	0.35	0.43	-0.11	-0.03	-0.08	-0.28	-0.24	0.05	-0.04	-0.05	-0.46	0.4	0.4	0.96
Lsat_1_v5_gn_3_121740.1	-2.93	-2.3	-1.28	-1.33	1.18	0.81	-0.61	-1.64	-0.27	-0.15	-0.32	-0.25	-0.45	1.07	0.7	-0.14	0.04	0.93	0.11	-0.17	-0.32	-0.09	-0.65	-0.97	-0.44	0.32	0.07	-1.12	0.19	0.46	1.22
Lsat_1_v5_gn_3_135740.1	-1.65	-1.63	-1.63	-0.79	0.07	0.27	-0.27	-0.71	-0.13	0.13	-0.32	-0.19	0.71	1.04	0.96	0.08	0.01	0.21	0.18	0.04	-0.29	-0.14	-0.72	-0.11	-0.08	-0.11	-0.38	-0.52	-0.0	0.32	1.15
Lsat_1_v5_gn_3_138061.1	-0.63	-0.47	-0.39	-0.3	0.22	0.48	-0.08	0.05	-0.21	-0.01	-0.0	-0.26	0.38	0.27	0.07	0.08	0.04	0.35	-0.16	0.02	0.01	0.05	-0.48	-0.18	-0.17	0.15	0.16	-0.07	0.12	-0.07	0.34
Lsat_1_v5_gn_3_29601.1 (LOX6)	-2.05	-1.66	-1.39	-1.24	0.42	0.21	-0.21	-0.13	-0.2	-0.32	-0.1	-0.28	-0.33	0.93	1.06	0.26	0.05	0.55	0.45	-0.09	-0.44	-0.3	0.07	0.05	-0.16	-0.17	-0.0	-0.55	0.12	0.38	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_31540.1 (KIS)	-0.56	-0.6	-0.52	-0.66	0.52	0.62	-0.22	-0.3	-0.36	-0.21	-0.18	-0.3	0.28	0.75	0.51	0.02	-0.15	0.13	-0.04	-0.06	-0.17	-0.15	-0.55	-0.05	-0.07	0.1	0.02	-0.18	0.14	0.13	0.61
Lsat_1_v5_gn_3_3580.1	-2.08	-1.98	-1.74	-1.27	0.18	0.22	0.06	-0.14	-0.34	-0.14	-0.16	-0.23	0.19	1.23	1.24	0.15	-0.04	0.28	0.2	0.12	-0.45	-0.39	-1.18	-0.05	-0.2	-0.22	-0.25	-0.51	0.06	0.26	1.2
Lsat_1_v5_gn_3_37940.1 (PP4R2L)	-0.26	-0.41	-0.47	-0.57	0.09	0.32	-0.04	0.02	-0.4	-0.3	-0.24	-0.17	0.29	0.58	0.35	0.19	0.13	0.26	0.08	-0.09	-0.13	0.02	-0.04	-0.17	-0.09	0.01	0.0	0.02	0.13	0.01	0.19
Lsat_1_v5_gn_3_49860.1	-1.05	-0.78	-1.14	-0.75	0.0	0.3	-0.14	0.13	-0.31	-0.32	-0.24	-0.28	0.24	0.77	0.46	0.14	0.11	0.39	0.03	0.03	0.11	0.12	-0.04	0.04	0.02	0.03	0.0	-0.01	0.18	0.07	0.27
Lsat_1_v5_gn_3_50980.1 (ATHB13)	-1.81	-1.41	-1.3	-0.76	0.75	0.24	-0.47	-1.01	0.0	0.1	0.13	0.11	-0.03	0.66	0.72	0.14	0.04	0.22	0.26	0.09	-0.14	-0.0	-0.19	-0.5	-0.28	-0.12	-0.16	-0.32	0.56	0.26	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_51700.1 (EMB166)	-0.92	-0.9	-0.85	-0.73	0.33	0.46	0.04	-0.09	-0.24	-0.02	-0.28	-0.25	-0.05	0.75	0.57	0.16	-0.12	0.22	0.3	-0.22	-0.13	-0.06	0.38	-0.34	-0.1	0.01	-0.02	-0.36	0.17	0.12	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_61260.1	-1.19	-2.2	-1.63	-1.16	0.54	0.55	-1.14	-1.64	-0.55	-0.52	-0.27	-0.49	0.5	0.67	0.96	0.36	0.33	0.06	0.47	0.1	-0.25	-0.09	-0.87	-0.05	-0.01	0.05	0.05	-0.12	0.06	0.38	1.23
Lsat_1_v5_gn_3_85401.1 (BAM1)	-1.88	-1.39	-1.47	-0.7	0.0	0.18	-0.61	-0.6	-0.05	0.17	0.27	0.22	0.61	1.07	0.94	0.06	-0.05	-0.26	0.28	-0.02	-0.19	-0.03	-2.38	-0.06	-0.11	-0.09	-0.04	-0.29	0.11	0.11	1.03
Lsat_1_v5_gn_3_88541.1	-2.16	-1.71	-2.29	-2.27	0.65	0.45	-1.09	-1.35	-0.41	-0.3	-0.45	-0.4	-0.15	1.21	1.38	0.29	0.08	0.68	0.5	0.07	-0.16	-0.22	-0.54	-0.2	-0.02	0.05	0.27	-0.08	0.07	0.1	0.52
Lsat_1_v5_gn_4_105600.1	-0.93	-0.39	-0.5	0.05	0.27	0.14	-0.28	-0.39	0.04	0.14	0.31	0.35	0.03	-0.18	-0.01	0.47	0.32	0.76	-0.01	0.03	-0.08	-0.21	-1.43	-0.15	-0.2	0.03	-0.22	-0.08	-0.02	0.32	0.26
Lsat_1_v5_gn_4_109621.1 (FT1)	-1.73	-1.54	-1.14	-1.05	0.27	0.2	-0.3	-0.57	-0.2	-0.07	-0.04	0.01	0.59	0.74	0.77	-0.05	0.22	0.74	0.37	-0.29	-0.2	-0.08	-1.26	-0.18	-0.2	-0.07	-0.3	-0.36	0.24	0.41	0.97
Lsat_1_v5_gn_4_124681.1 (SEC20)	-1.17	-1.21	-1.22	-0.4	-0.13	-0.12	-0.27	-0.08	-0.09	0.1	0.14	0.03	0.21	1.13	0.69	-0.14	-0.15	0.69	-0.22	-0.15	-0.36	-0.03	0.18	-0.41	-0.15	-0.43	-0.18	-0.47	0.31	0.37	0.69
Lsat_1_v5_gn_4_128621.1	-3.74	-3.06	-1.71	-2.66	-0.5	-0.51	-0.48	-1.05	-0.16	-0.19	0.1	-0.46	0.51	1.56	1.44	-0.2	0.33	1.07	0.1	-0.17	-1.04	-0.51	-3.84	0.47	-1.51	-0.06	0.36	-0.86	0.51	0.35	1.28
Lsat_1_v5_gn_4_159961.1 (GRF2)	-1.6	-0.94	-1.44	-1.42	-0.04	0.04	-0.66	-1.14	-0.22	-0.16	-0.11	-0.02	0.75	0.96	0.97	0.21	-0.07	0.32	0.55	0.03	-0.09	-0.1	-1.18	-0.23	-0.28	-0.05	-0.16	-0.56	0.33	0.32	1.13
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.