Heatmap: Cluster_63 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_19080.1 (WNK8)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_0_20520.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_0_27260.1 (YSL4)	-	2.27	-	1.67	-	-	-	-	2.42	-	-	-	0.63	0.99	-	-	-	1.52	-	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	2.19	-	1.54
Lsat_1_v5_gn_0_29480.1 (ERS)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_126780.1 (TOT3)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.11	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_62380.1 (BT1)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_107160.1 (GTA2)	-	-	-	-	-	3.86	-	-	4.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_133321.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.75	-	4.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_114341.1 (VAB2)	-	-	-	0.96	-	0.56	0.73	-	2.45	-	-	-	-	2.16	0.22	0.42	0.13	-	-	-	-	0.01	-	-0.16	-	-	0.17	1.44	1.02	1.89	-0.09
Lsat_1_v5_gn_3_136501.1 (ILA)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_139401.1 (TPPE)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.83	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.19	-	2.05
Lsat_1_v5_gn_3_35880.1	2.23	-	-	-	1.62	2.94	-	-	2.86	-	-	1.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_66921.1 (ZFP3)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.22	-	-	-	1.08	-	-	-	2.69	1.8	-	1.9	0.89	-	-	0.98	1.07	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_8480.1 (GH9B15)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_97641.1 (BOS1)	-	-	-	-	-	-	-	-	2.92	-	-	-	-	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.7	-	-	1.59	3.24	-
Lsat_1_v5_gn_4_122420.1 (IEN1)	-	-	-	-	-	-	2.04	-	2.09	-	-	-	2.19	3.29	-	2.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_124301.1 (SCPL27)	-	-	-	-	1.79	1.72	-	-	1.92	-	-	1.77	-	3.73	-	1.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_143541.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_156821.1 (CSI1)	-	-	-	-	-	-	-	3.41	3.33	-	3.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_70420.1 (ClpS1)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_72121.1 (MLK3)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_79581.1 (TOR)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_12101.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_125061.1 (PRXQ)	-	-	-	-	-	2.76	-	-	4.0	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_131580.1 (FADB)	-	-	-	-	-	2.18	-	2.4	3.93	-	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_140101.1	-	-	-	-	-	-	-	2.6	4.05	-	-	-	-	-	-	-	3.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_152640.1 (PSAB)	-	-	-	-	-	-	-	3.96	2.74	-	3.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_159520.1 (UPL2)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_173320.1 (BSL3)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.45	-	-	-	-	-	-	-	-	3.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_441.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_74260.1 (CYP81D8)	-	-	-	-	0.07	0.9	-	-	1.48	0.83	-	-	-	3.09	2.97	-	-	-	-	-0.84	-	0.47	-	1.3	-	-0.83	-0.52	-	-	-	0.58
Lsat_1_v5_gn_5_80261.1 (CYP716A1)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.1	-	-	3.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_84540.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_90100.1 (ARA1)	-	-	-	-	1.95	1.88	-	1.83	3.09	-	-	1.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.96	1.86	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_114740.1	-	-	-	-	2.69	-	-	-	4.1	-	-	-	-	-	-	-	-	2.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_13921.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_103021.1 (APC1)	-	-	-	-	2.04	-	2.65	-	3.51	-	-	-	-	-	-	1.29	-	1.95	-	-	-	-	1.52	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_29640.1 (RAO2)	-	-	1.85	-	-	-	-	-	2.7	-	-	-	-	2.7	1.74	-	-	-	-	-	1.48	-	-	1.47	-	-	1.35	-	1.55	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_102480.1 (PHS1)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.99	-	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.82	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_149240.1 (ATPF)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_156041.1 (GSTT3)	-	-	-	-	1.9	-	-	-	3.09	1.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.74	2.18	-	-	-	-	-	-	2.01	1.77	-
Lsat_1_v5_gn_8_57241.1 (GAUT13)	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_96061.1 (At12Cys-1)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.07	-	-	-	-	3.22	-	-	-	-	-	-	2.66	-	-	-	2.8	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_105640.1 (ET2)	-	-	-	-	-	2.51	-	-	4.07	-	-	-	-	3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_40401.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.11	-	-	-	3.3	-	-	-	-	1.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_72460.1 (EXO)	-	-	-	-	-1.62	0.31	-	-	2.18	1.05	-0.27	-	1.47	0.53	1.46	-0.49	1.86	0.24	0.89	0.01	-0.86	-1.36	-0.16	-1.18	-0.72	-1.8	-1.48	-	0.06	-1.69	0.84
Lsat_1_v5_gn_9_77261.1 (SPF1)	-	-	-	-	-	-	-	-	3.84	-	-	-	-	4.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_85200.1	-	-	-	-	-	-	2.94	-	3.06	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.03	-
Lsat_1_v5_gn_9_88261.1	-	-	-	-	-	-	-	3.48	0.48	-	3.08	-	-	-	0.77	-	-	-	-	0.4	-	-	-	-	-	-	-	0.31	-	0.46	2.11
Lsat_1_v5_gn_9_91161.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.