Heatmap: Cluster_7 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.18 -0.12 0.19 0.29 0.7 0.5 -0.24 -0.29 -0.31 -0.23 -0.16 -0.5 -0.18 0.84 0.6 -0.0 -0.32 -0.2 -0.18 -0.58 -0.45 -0.29 0.62 -0.61 -0.43 -0.28 -0.16 -0.37 0.22 0.14 0.29
-0.05 -0.27 -0.11 0.26 0.54 0.45 -0.2 -0.57 0.04 0.05 -0.05 -0.29 -0.21 0.64 0.43 -0.0 -0.21 -0.13 -0.24 -0.28 -0.19 -0.15 0.45 -0.25 -0.26 0.02 -0.02 -0.19 0.09 -0.04 -0.12
-0.16 -0.89 0.32 0.65 1.25 0.53 -0.81 -1.09 -0.43 -0.58 -0.41 -0.63 -0.93 0.9 0.81 -0.34 -0.65 0.78 -0.31 -0.8 -0.35 -0.52 1.23 -0.65 -0.67 -0.64 -0.33 -0.75 0.35 -0.02 0.04
-0.31 -0.01 0.25 0.26 0.37 0.45 -0.22 -0.2 -0.33 -0.24 -0.16 -0.16 -0.08 0.45 0.38 0.12 0.03 -0.2 0.09 -0.24 -0.26 -0.12 0.48 -0.36 -0.3 -0.21 -0.14 -0.2 0.19 0.03 -0.09
0.34 0.51 0.47 0.41 0.93 0.33 -0.62 -0.71 -0.54 -0.46 -0.37 -0.73 -0.51 1.27 1.05 0.02 -0.36 -0.68 -0.21 -0.71 -0.62 -0.63 0.88 -0.63 -0.71 -0.65 -0.84 -0.59 0.07 0.08 -0.07
0.43 0.28 -0.24 -0.1 0.47 0.42 -0.21 -0.25 -0.51 -0.39 -0.24 -0.57 0.14 0.18 -0.01 -0.06 0.05 -0.78 -0.73 -0.54 -0.24 -0.26 1.43 -0.23 -0.11 -0.17 -0.2 -0.32 -0.15 0.18 0.48
-0.1 -0.21 0.01 0.44 0.65 0.14 -0.54 -1.33 -0.14 -0.01 0.11 -0.09 -0.4 0.32 0.25 -0.14 -0.45 0.68 0.0 -0.36 -0.3 -0.12 0.9 -0.49 -0.41 -0.17 -0.16 -0.22 0.12 0.14 0.05
0.09 -0.09 0.18 0.42 0.82 0.38 -0.46 -0.6 -0.12 -0.13 -0.08 -0.28 -0.06 0.53 0.43 -0.17 -0.46 0.43 -0.3 -0.57 -0.46 -0.36 0.74 -0.56 -0.54 -0.28 -0.31 -0.33 0.07 0.08 0.24
-0.08 -0.16 0.17 0.11 0.21 -0.1 -0.51 -0.4 -0.34 -0.32 -0.25 -0.35 0.02 0.74 0.45 -0.17 -0.39 0.71 -0.24 -0.4 -0.48 -0.37 1.09 -0.51 -0.45 -0.3 -0.43 -0.52 0.2 0.23 0.69
0.27 0.02 -0.04 -0.03 0.64 0.59 -0.28 -0.12 -0.43 -0.51 -0.37 -0.4 -0.02 0.58 0.12 -0.41 -0.39 0.34 -0.24 -0.31 -0.2 -0.08 0.73 -0.12 -0.11 -0.14 -0.06 -0.17 0.04 -0.12 0.02
0.25 0.59 0.19 0.56 1.3 0.9 -0.06 0.38 -0.41 -0.79 -0.21 -0.87 -1.46 0.16 0.3 -0.18 -0.78 -0.58 -0.52 -0.59 -0.53 -0.3 1.4 -0.75 -0.69 -0.41 -0.68 -0.4 0.28 0.14 -1.5
-0.2 0.04 -0.21 -0.17 0.68 0.46 -0.32 -0.45 -0.2 -0.1 -0.05 -0.24 -0.04 0.56 0.4 0.07 -0.2 -0.68 -0.16 -0.37 -0.32 -0.19 0.72 -0.36 -0.27 -0.19 -0.14 -0.27 0.33 0.24 0.32
-0.13 -0.33 -0.16 0.18 0.42 0.4 -0.11 -0.31 -0.11 -0.06 -0.02 -0.37 -0.36 0.56 0.48 -0.06 -0.19 0.12 -0.09 -0.3 -0.28 -0.25 0.67 -0.21 -0.23 -0.23 -0.09 -0.46 0.11 0.13 0.3
-0.34 -1.2 0.04 0.25 1.07 0.89 -0.28 -0.31 -0.05 -0.14 -0.33 -0.61 -0.84 0.69 0.61 -0.05 -0.5 0.49 0.07 -0.58 -0.77 -0.37 0.64 -0.93 -0.45 -0.58 -0.21 -0.63 0.42 0.39 0.18
-0.09 -0.46 -0.02 0.1 0.55 0.59 -0.18 -0.39 -0.15 -0.24 -0.17 -0.44 -0.22 1.03 0.63 -0.16 -0.43 -0.16 -0.01 -0.32 -0.34 -0.07 0.46 -0.31 -0.29 -0.15 -0.22 -0.49 0.15 0.04 0.23
0.24 -0.51 0.33 -0.04 0.67 0.32 -0.89 -0.74 -0.5 -0.85 -0.19 -0.8 -0.78 1.35 0.81 -0.1 -0.2 0.51 0.08 -0.63 -0.8 -0.36 1.58 -0.97 -0.92 -0.53 -0.62 -0.76 -0.14 -0.19 0.36
-0.03 -0.3 0.08 0.47 0.89 0.71 -0.32 -0.68 -0.13 -0.11 -0.07 -0.43 -1.11 0.9 0.71 -0.06 -0.47 -0.94 -0.31 -0.66 -0.45 -0.27 0.68 -0.47 -0.31 -0.21 -0.23 -0.62 0.43 0.21 0.2
-0.18 -0.11 0.06 0.23 0.44 0.32 -0.34 -0.53 -0.17 -0.19 -0.05 -0.25 0.15 0.63 0.27 0.02 -0.14 0.09 -0.31 -0.5 -0.28 -0.19 0.61 -0.42 -0.22 -0.1 -0.09 -0.35 0.12 0.16 0.33
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-0.05 -0.01 0.11 0.31 0.64 0.17 -0.72 -0.72 -0.36 -0.37 -0.11 -0.39 -0.01 0.85 0.59 -0.03 -0.33 0.56 -0.05 -0.4 -0.37 -0.42 0.74 -0.53 -0.48 -0.35 -0.37 -0.58 0.29 -0.01 0.33
-0.32 0.49 0.3 -0.16 0.89 0.2 -1.2 -1.24 -0.84 -0.89 -1.09 -1.13 -0.43 1.17 0.02 -0.34 -1.11 1.44 -0.59 -1.55 -1.42 -0.75 2.0 -1.0 -1.0 -0.74 -1.09 -1.55 -0.03 -0.2 1.38
-1.16 -0.64 -1.09 -1.3 1.21 0.67 -2.54 -0.78 -0.48 -1.34 -1.36 -1.2 -0.1 1.03 -0.16 -1.06 -2.12 1.99 -1.88 -2.14 -1.93 -1.95 2.42 -1.67 -0.78 -0.81 -1.52 -1.11 -0.5 -0.23 1.88
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0.33 0.05 0.39 0.43 0.59 0.52 -0.18 -0.41 0.02 -0.14 0.05 -0.35 -0.39 0.78 0.31 -0.19 -0.49 -0.18 -0.5 -0.63 -0.35 -0.29 0.44 -0.44 -0.37 -0.21 -0.25 -0.41 0.23 0.13 -0.01
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0.36 -0.05 0.65 0.64 0.86 0.19 -0.42 -0.37 -0.34 -0.39 -0.21 -0.14 -0.39 0.21 0.17 -0.28 -0.47 0.35 -0.51 -0.63 -0.39 -0.3 0.55 -0.77 -0.54 -0.6 -0.54 -0.5 0.48 0.45 0.55
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0.21 -0.2 0.53 0.31 0.33 0.17 -0.64 -0.87 -0.28 -0.16 -0.06 -0.22 -0.07 0.87 0.46 0.16 -0.01 -0.19 -0.28 -0.51 -0.36 -0.23 0.57 -0.29 -0.27 -0.12 -0.19 -0.32 0.07 0.1 0.06
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0.11 -0.25 0.38 0.52 0.32 0.17 -0.5 -0.41 -0.4 -0.37 -0.29 -0.42 -0.26 1.27 0.86 -0.24 -0.45 -0.3 -0.13 -0.62 -0.13 -0.27 0.99 -0.75 -0.51 -0.43 -0.25 -0.12 0.12 -0.03 -0.33
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-0.27 -0.46 -0.23 0.26 0.69 0.53 -0.1 -0.34 -0.09 -0.09 0.03 -0.29 -0.38 0.57 0.45 -0.09 -0.17 -0.03 -0.08 -0.2 -0.12 -0.12 0.26 -0.3 -0.34 -0.02 -0.16 -0.0 0.01 0.08 0.08
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0.64 0.36 0.3 0.2 0.92 0.58 0.21 -0.02 -0.17 -0.28 -0.3 -0.5 -0.14 -0.11 0.09 -0.25 -0.32 -0.82 -0.74 -0.32 -0.37 -0.38 1.19 -0.47 -0.47 -0.24 -0.36 -0.56 -0.27 0.12 0.05
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0.04 -0.68 0.15 -0.21 1.05 0.28 -1.32 -1.78 -0.83 -0.62 -0.38 -1.0 -0.76 1.31 0.93 -0.44 -0.49 1.14 -0.24 -1.27 -0.69 -0.45 1.77 -1.06 -0.7 -0.76 -0.42 -0.93 0.16 -0.0 0.24
-0.17 0.08 -0.18 -0.33 0.79 0.43 -0.4 -0.62 0.01 -0.07 0.02 -0.17 -0.11 0.75 0.59 0.01 -0.37 -0.44 -0.06 -0.47 -0.29 -0.27 0.64 -0.38 -0.3 -0.2 -0.19 -0.3 0.18 0.06 0.26
-0.05 -0.39 0.27 0.41 0.28 0.29 -0.34 -0.58 -0.13 -0.13 -0.02 -0.34 -0.12 0.65 0.47 0.08 -0.08 -0.08 -0.05 -0.32 -0.34 -0.28 0.29 -0.4 -0.37 -0.1 -0.13 -0.33 0.23 0.2 0.39
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0.15 0.18 0.51 0.51 0.66 0.36 -0.52 -0.43 -0.39 -0.32 -0.17 -0.38 -0.43 1.28 1.05 0.02 -0.28 -0.09 -0.24 -0.82 -0.51 -0.54 0.65 -0.7 -0.76 -0.53 -0.45 -0.81 -0.02 -0.03 -0.29
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0.31 -0.43 0.6 0.52 0.67 0.52 -0.43 -0.75 -0.15 0.01 0.02 -0.17 -0.54 0.34 0.42 -0.07 -0.34 0.03 -0.31 -0.38 -0.34 -0.31 0.29 -0.45 -0.31 -0.21 -0.18 -0.04 0.24 -0.05 0.06
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0.13 0.05 0.17 0.2 0.45 0.43 0.08 -0.05 -0.18 -0.11 -0.1 -0.14 -0.13 0.32 0.2 -0.06 -0.15 -0.17 -0.12 -0.17 -0.1 -0.05 -0.07 -0.19 -0.09 -0.03 0.01 0.14 -0.08 -0.2 -0.37
-0.62 -0.39 0.35 1.01 1.52 0.8 -1.21 0.37 -0.54 -0.31 -0.39 -0.11 -1.63 1.59 0.36 -0.97 -1.08 -0.48 -0.45 -0.98 -1.12 -0.62 1.25 -0.32 -0.48 -0.69 -0.81 -0.56 0.02 -0.22 -1.02
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0.18 0.21 0.54 0.69 0.8 0.35 -0.69 -0.5 -0.14 -0.21 -0.02 -0.1 -0.36 0.82 0.49 -0.19 -0.55 0.05 -0.43 -0.67 -0.39 -0.39 0.56 -0.61 -0.37 -0.35 -0.27 -0.52 0.19 -0.01 -0.28
-0.02 -0.03 0.07 0.09 0.4 0.44 -0.16 -0.38 -0.25 -0.31 -0.22 -0.72 -0.42 0.9 0.75 -0.11 -0.4 0.3 -0.09 -0.55 -0.3 -0.28 0.84 -0.49 -0.46 -0.24 -0.19 -0.48 0.33 0.18 -0.09
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0.23 -0.14 0.72 0.89 0.34 0.41 0.06 -0.14 -0.32 -0.77 -0.29 -0.3 -0.71 1.06 0.75 -0.26 -0.48 -0.36 -0.03 -0.7 -0.37 -0.49 0.61 -0.57 -0.6 -0.41 -0.3 -0.63 -0.01 0.05 -0.03
0.13 0.13 0.13 0.05 0.45 0.59 0.05 -0.03 -0.52 -0.58 -0.4 -0.58 -0.17 0.43 0.14 -0.1 -0.29 0.44 0.12 -0.37 -0.29 -0.18 0.72 -0.27 -0.23 -0.15 -0.11 -0.32 0.1 -0.05 -0.02
0.16 -0.14 0.3 0.6 0.72 0.39 -0.44 -0.58 -0.32 -0.27 0.04 -0.37 -0.13 0.63 0.54 0.06 -0.38 -0.1 -0.09 -0.37 -0.37 -0.2 0.39 -0.54 -0.44 -0.24 -0.15 -0.36 0.19 -0.04 0.05
0.1 0.05 0.26 0.45 0.53 0.39 -0.08 -0.22 -0.16 -0.09 0.01 -0.18 -0.27 0.52 0.32 0.03 -0.19 -0.63 -0.11 -0.39 -0.16 -0.07 0.24 -0.4 -0.27 -0.09 -0.09 -0.1 0.1 -0.14 -0.17
0.27 0.0 0.36 0.6 0.62 0.31 -0.47 -0.53 -0.31 -0.25 -0.2 -0.31 -0.65 0.65 0.53 -0.14 -0.39 0.01 -0.1 -0.65 -0.38 -0.33 0.77 -0.7 -0.51 -0.49 -0.52 -0.43 0.42 0.46 0.18
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-0.27 -0.28 -0.29 0.24 0.55 0.55 -0.33 -0.62 0.05 -0.08 -0.03 -0.35 -0.25 0.8 0.49 -0.06 -0.31 -0.15 -0.13 -0.33 -0.34 -0.09 0.38 -0.3 -0.23 0.07 -0.11 -0.4 0.18 0.06 0.35
-0.32 -0.77 -0.39 0.07 0.65 0.65 -0.08 -0.32 0.25 -0.03 0.18 -0.42 -0.93 1.0 0.61 -0.21 -0.54 -0.43 -0.13 -0.41 -0.12 -0.15 0.28 -0.18 -0.14 -0.08 -0.13 -0.21 0.23 0.16 0.02
-0.12 0.72 -0.4 -1.54 1.06 0.69 -0.25 -0.49 -0.25 -0.89 -0.65 -1.13 -1.63 0.95 0.68 -0.46 -0.99 -0.39 0.29 -1.01 -0.31 -0.25 1.39 -0.45 -0.35 -0.26 -0.2 -1.02 0.28 0.26 0.71

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.