Heatmap: Cluster_7 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_1260.1 (LAZ4)	-0.18	-0.12	0.19	0.29	0.7	0.5	-0.24	-0.29	-0.31	-0.23	-0.16	-0.5	-0.18	0.84	0.6	-0.0	-0.32	-0.2	-0.18	-0.58	-0.45	-0.29	0.62	-0.61	-0.43	-0.28	-0.16	-0.37	0.22	0.14	0.29
Lsat_1_v5_gn_0_1340.1	-0.05	-0.27	-0.11	0.26	0.54	0.45	-0.2	-0.57	0.04	0.05	-0.05	-0.29	-0.21	0.64	0.43	-0.0	-0.21	-0.13	-0.24	-0.28	-0.19	-0.15	0.45	-0.25	-0.26	0.02	-0.02	-0.19	0.09	-0.04	-0.12
Lsat_1_v5_gn_0_33640.1 (ACR6)	-0.16	-0.89	0.32	0.65	1.25	0.53	-0.81	-1.09	-0.43	-0.58	-0.41	-0.63	-0.93	0.9	0.81	-0.34	-0.65	0.78	-0.31	-0.8	-0.35	-0.52	1.23	-0.65	-0.67	-0.64	-0.33	-0.75	0.35	-0.02	0.04
Lsat_1_v5_gn_0_39500.1 (SDRA)	-0.31	-0.01	0.25	0.26	0.37	0.45	-0.22	-0.2	-0.33	-0.24	-0.16	-0.16	-0.08	0.45	0.38	0.12	0.03	-0.2	0.09	-0.24	-0.26	-0.12	0.48	-0.36	-0.3	-0.21	-0.14	-0.2	0.19	0.03	-0.09
Lsat_1_v5_gn_0_44440.1 (YSL5)	0.34	0.51	0.47	0.41	0.93	0.33	-0.62	-0.71	-0.54	-0.46	-0.37	-0.73	-0.51	1.27	1.05	0.02	-0.36	-0.68	-0.21	-0.71	-0.62	-0.63	0.88	-0.63	-0.71	-0.65	-0.84	-0.59	0.07	0.08	-0.07
Lsat_1_v5_gn_1_101181.1 (BURNOUT1)	0.43	0.28	-0.24	-0.1	0.47	0.42	-0.21	-0.25	-0.51	-0.39	-0.24	-0.57	0.14	0.18	-0.01	-0.06	0.05	-0.78	-0.73	-0.54	-0.24	-0.26	1.43	-0.23	-0.11	-0.17	-0.2	-0.32	-0.15	0.18	0.48
Lsat_1_v5_gn_1_112541.1 (NILR2)	-0.1	-0.21	0.01	0.44	0.65	0.14	-0.54	-1.33	-0.14	-0.01	0.11	-0.09	-0.4	0.32	0.25	-0.14	-0.45	0.68	0.0	-0.36	-0.3	-0.12	0.9	-0.49	-0.41	-0.17	-0.16	-0.22	0.12	0.14	0.05
Lsat_1_v5_gn_1_12260.1 (SAC1)	0.09	-0.09	0.18	0.42	0.82	0.38	-0.46	-0.6	-0.12	-0.13	-0.08	-0.28	-0.06	0.53	0.43	-0.17	-0.46	0.43	-0.3	-0.57	-0.46	-0.36	0.74	-0.56	-0.54	-0.28	-0.31	-0.33	0.07	0.08	0.24
Lsat_1_v5_gn_1_130161.1 (PDS5)	-0.08	-0.16	0.17	0.11	0.21	-0.1	-0.51	-0.4	-0.34	-0.32	-0.25	-0.35	0.02	0.74	0.45	-0.17	-0.39	0.71	-0.24	-0.4	-0.48	-0.37	1.09	-0.51	-0.45	-0.3	-0.43	-0.52	0.2	0.23	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_14240.1	0.27	0.02	-0.04	-0.03	0.64	0.59	-0.28	-0.12	-0.43	-0.51	-0.37	-0.4	-0.02	0.58	0.12	-0.41	-0.39	0.34	-0.24	-0.31	-0.2	-0.08	0.73	-0.12	-0.11	-0.14	-0.06	-0.17	0.04	-0.12	0.02
Lsat_1_v5_gn_1_24721.1 (MO1)	0.25	0.59	0.19	0.56	1.3	0.9	-0.06	0.38	-0.41	-0.79	-0.21	-0.87	-1.46	0.16	0.3	-0.18	-0.78	-0.58	-0.52	-0.59	-0.53	-0.3	1.4	-0.75	-0.69	-0.41	-0.68	-0.4	0.28	0.14	-1.5
Lsat_1_v5_gn_1_35300.1 (GC5)	-0.2	0.04	-0.21	-0.17	0.68	0.46	-0.32	-0.45	-0.2	-0.1	-0.05	-0.24	-0.04	0.56	0.4	0.07	-0.2	-0.68	-0.16	-0.37	-0.32	-0.19	0.72	-0.36	-0.27	-0.19	-0.14	-0.27	0.33	0.24	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_36520.1 (CHMP1A)	-0.13	-0.33	-0.16	0.18	0.42	0.4	-0.11	-0.31	-0.11	-0.06	-0.02	-0.37	-0.36	0.56	0.48	-0.06	-0.19	0.12	-0.09	-0.3	-0.28	-0.25	0.67	-0.21	-0.23	-0.23	-0.09	-0.46	0.11	0.13	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_40801.1	-0.34	-1.2	0.04	0.25	1.07	0.89	-0.28	-0.31	-0.05	-0.14	-0.33	-0.61	-0.84	0.69	0.61	-0.05	-0.5	0.49	0.07	-0.58	-0.77	-0.37	0.64	-0.93	-0.45	-0.58	-0.21	-0.63	0.42	0.39	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_40980.1	-0.09	-0.46	-0.02	0.1	0.55	0.59	-0.18	-0.39	-0.15	-0.24	-0.17	-0.44	-0.22	1.03	0.63	-0.16	-0.43	-0.16	-0.01	-0.32	-0.34	-0.07	0.46	-0.31	-0.29	-0.15	-0.22	-0.49	0.15	0.04	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_47021.1	0.24	-0.51	0.33	-0.04	0.67	0.32	-0.89	-0.74	-0.5	-0.85	-0.19	-0.8	-0.78	1.35	0.81	-0.1	-0.2	0.51	0.08	-0.63	-0.8	-0.36	1.58	-0.97	-0.92	-0.53	-0.62	-0.76	-0.14	-0.19	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_51541.1 (ACR10)	-0.03	-0.3	0.08	0.47	0.89	0.71	-0.32	-0.68	-0.13	-0.11	-0.07	-0.43	-1.11	0.9	0.71	-0.06	-0.47	-0.94	-0.31	-0.66	-0.45	-0.27	0.68	-0.47	-0.31	-0.21	-0.23	-0.62	0.43	0.21	0.2
Lsat_1_v5_gn_1_55521.1 (AGD7)	-0.18	-0.11	0.06	0.23	0.44	0.32	-0.34	-0.53	-0.17	-0.19	-0.05	-0.25	0.15	0.63	0.27	0.02	-0.14	0.09	-0.31	-0.5	-0.28	-0.19	0.61	-0.42	-0.22	-0.1	-0.09	-0.35	0.12	0.16	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_72461.1 (KAB1)	-0.08	-0.19	0.32	0.31	0.24	0.55	-0.37	-0.39	-0.58	-0.48	-0.48	-0.44	0.27	0.53	0.09	0.11	-0.05	-0.06	-0.22	-0.47	-0.33	-0.16	1.13	-0.4	-0.12	-0.11	-0.12	-0.22	0.22	-0.05	-0.05
Lsat_1_v5_gn_1_77001.1 (LARP6b)	-0.05	-0.01	0.11	0.31	0.64	0.17	-0.72	-0.72	-0.36	-0.37	-0.11	-0.39	-0.01	0.85	0.59	-0.03	-0.33	0.56	-0.05	-0.4	-0.37	-0.42	0.74	-0.53	-0.48	-0.35	-0.37	-0.58	0.29	-0.01	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_94481.1	-0.32	0.49	0.3	-0.16	0.89	0.2	-1.2	-1.24	-0.84	-0.89	-1.09	-1.13	-0.43	1.17	0.02	-0.34	-1.11	1.44	-0.59	-1.55	-1.42	-0.75	2.0	-1.0	-1.0	-0.74	-1.09	-1.55	-0.03	-0.2	1.38
Lsat_1_v5_gn_1_95000.1 (RLM3)	-1.16	-0.64	-1.09	-1.3	1.21	0.67	-2.54	-0.78	-0.48	-1.34	-1.36	-1.2	-0.1	1.03	-0.16	-1.06	-2.12	1.99	-1.88	-2.14	-1.93	-1.95	2.42	-1.67	-0.78	-0.81	-1.52	-1.11	-0.5	-0.23	1.88
Lsat_1_v5_gn_2_100821.1 (SAP5)	0.1	-0.12	0.27	0.66	0.74	0.43	-0.47	-0.85	-0.01	0.04	-0.01	-0.44	-0.29	0.7	0.5	0.03	-0.44	-0.2	-0.54	-0.51	-0.24	-0.25	0.36	-0.39	-0.3	-0.05	-0.09	-0.49	0.11	0.08	-0.01
Lsat_1_v5_gn_2_103660.1 (CAT2)	0.33	0.05	0.39	0.43	0.59	0.52	-0.18	-0.41	0.02	-0.14	0.05	-0.35	-0.39	0.78	0.31	-0.19	-0.49	-0.18	-0.5	-0.63	-0.35	-0.29	0.44	-0.44	-0.37	-0.21	-0.25	-0.41	0.23	0.13	-0.01
Lsat_1_v5_gn_2_14340.1 (TN11)	-1.03	-0.6	-1.16	-0.5	0.72	0.07	-1.44	-0.28	0.06	-0.35	-0.44	-0.49	0.39	0.33	-0.45	-0.5	-1.07	1.72	-0.84	-0.44	-0.84	-1.18	2.09	-1.42	-1.34	-0.61	-0.64	-0.86	-0.29	0.05	1.46
Lsat_1_v5_gn_2_3981.1 (NAC097)	-0.13	-0.09	0.11	0.32	0.78	0.68	0.11	0.06	-0.34	-0.38	-0.17	-0.43	-0.44	0.72	0.39	-0.01	-0.29	-0.58	-0.31	-0.58	-0.33	-0.18	0.39	-0.54	-0.36	-0.18	-0.1	-0.19	0.25	-0.02	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_64281.1 (POP2)	0.24	-0.2	0.54	0.55	0.25	0.39	-0.64	-0.64	-0.37	-0.44	-0.25	-0.47	-0.06	0.72	0.32	-0.15	-0.39	-0.13	-0.04	-0.41	-0.28	-0.11	0.74	-0.27	-0.23	-0.21	-0.31	-0.32	0.17	0.14	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_6900.1	-0.1	-0.17	-0.2	-0.33	0.85	0.55	-0.27	-0.86	0.02	-0.03	-0.01	-0.4	-0.85	0.76	0.66	-0.06	-0.46	-0.12	0.07	-0.41	-0.26	-0.19	0.29	-0.34	-0.29	-0.28	-0.23	-0.49	0.45	0.41	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_74740.1	0.36	-0.05	0.65	0.64	0.86	0.19	-0.42	-0.37	-0.34	-0.39	-0.21	-0.14	-0.39	0.21	0.17	-0.28	-0.47	0.35	-0.51	-0.63	-0.39	-0.3	0.55	-0.77	-0.54	-0.6	-0.54	-0.5	0.48	0.45	0.55
Lsat_1_v5_gn_2_78101.1 (UBC15)	0.25	0.17	0.51	0.41	0.76	0.74	-0.17	-0.09	-0.61	-0.67	-0.5	-0.86	-0.87	0.9	0.44	-0.28	-0.57	0.53	-0.19	-0.56	-0.37	-0.29	1.07	-0.68	-0.66	-0.38	-0.37	-0.41	0.19	-0.23	-0.51
Lsat_1_v5_gn_2_80160.1	-0.56	-0.83	-0.58	-0.21	0.89	0.47	-0.82	-1.1	-0.18	-0.08	0.02	-0.2	-0.26	0.12	0.26	0.06	-0.15	0.33	-0.2	-0.32	-0.24	-0.16	0.96	-0.46	-0.14	-0.09	-0.07	-0.41	0.53	0.44	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_81521.1 (DEG7)	-0.03	-0.19	0.34	0.15	0.52	0.22	-0.38	-0.36	-0.46	-0.42	-0.15	-0.43	-0.03	0.84	0.63	-0.09	-0.3	0.06	-0.08	-0.46	-0.35	-0.34	0.76	-0.41	-0.3	-0.29	-0.33	-0.47	0.15	0.08	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_83120.1 (ASL39)	0.7	0.66	-0.34	-0.82	-0.39	0.55	-0.3	0.1	-0.41	-0.72	-0.41	-0.29	0.52	-3.84	-2.81	-0.39	-0.2	0.55	-0.31	-0.17	-0.26	-0.27	1.61	0.12	0.01	0.17	-0.1	-0.63	-0.36	-0.17	0.82
Lsat_1_v5_gn_2_88081.1	0.46	-0.13	0.64	0.59	0.77	0.53	-0.41	-0.55	-0.23	-0.1	-0.0	-0.22	-0.38	0.76	0.35	-0.31	-0.55	-0.61	-0.19	-0.64	-0.44	-0.32	0.44	-0.55	-0.4	-0.44	-0.37	-0.52	0.31	0.2	0.11
Lsat_1_v5_gn_2_98861.1	0.21	-0.2	0.53	0.31	0.33	0.17	-0.64	-0.87	-0.28	-0.16	-0.06	-0.22	-0.07	0.87	0.46	0.16	-0.01	-0.19	-0.28	-0.51	-0.36	-0.23	0.57	-0.29	-0.27	-0.12	-0.19	-0.32	0.07	0.1	0.06
Lsat_1_v5_gn_3_126420.1 (VAD1)	0.05	0.14	0.19	0.27	0.83	0.41	-0.55	-0.7	-0.33	-0.25	-0.17	-0.46	-0.48	0.72	0.55	-0.04	-0.34	0.1	-0.02	-0.53	-0.38	-0.33	0.87	-0.58	-0.49	-0.37	-0.26	-0.61	0.36	0.2	0.05
Lsat_1_v5_gn_3_137040.1 (BSK3)	0.26	0.28	0.25	0.2	1.0	0.6	-0.23	-0.23	-0.32	-0.48	-0.27	-0.35	-0.56	0.76	0.6	0.02	-0.44	-0.48	-0.34	-0.6	-0.34	-0.24	0.65	-0.45	-0.4	-0.39	-0.24	-0.26	0.23	0.01	-0.35
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.